单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 13801 - 13820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13801 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies cancer cell-intrinsic RARRES1 as a predictor of prognosis and immune response in triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1360507
PMID:38533207
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）中肿瘤微环境（TME）的细胞组成异质性，并识别了与TME相关的基因RARRES1，该基因表达与TNBC患者的预后和免疫检查点抑制剂（ICIs）反应呈正相关 | 本研究提出了一种定量评估TME免疫特征的方法，并提供了一个框架，通过综合分析识别与TME相关的癌细胞内在特征 | NA | 揭示三阴性乳腺癌中癌细胞与肿瘤微环境之间的关系，并识别预测治疗反应和预后的生物标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 13802 | 2024-08-07 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
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研究论文 | 本文探讨了基因组印记及其在哺乳动物亲代抚育中的调控作用 | 利用单细胞RNA测序数据支持了印记基因与母体抚育质量之间更为深思熟虑的关系 | NA | 研究基因组印记在哺乳动物亲代抚育中的作用及其对人类健康的潜在影响 | 基因组印记及其在母体抚育中的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 13803 | 2024-08-04 |
Interferon-independent processes constrain measles virus cell-to-cell spread in primary human airway epithelial cells
2023-Sep-19, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01361-23
PMID:37724882
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研究论文 | 本研究探讨了麻疹病毒在主要人类气道上皮细胞中的细胞间传播机制 | 这项研究揭示了IFN信号在麻疹病毒细胞间传播中并不是限制因素，强调了IFN独立过程的重要性 | 研究未能完全理解阻止麻疹病毒传播的机制 | 了解麻疹病毒在气道上皮细胞中的传播特征和机制 | 主要人类气道上皮细胞(Hae)和麻疹病毒(MeV)突变体 | NA | NA | 深度测序、定量RT-PCR和单细胞RNA测序 | NA | 细胞模型 | 主要人类气道上皮细胞的培养 |
| 13804 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型，以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型，揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 |
| 13805 | 2024-08-07 |
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02181-8
PMID:36702949
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研究论文 | 本研究进行了一项单臂2期临床试验，评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 | 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制，为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 | 尽管研究达到了主要终点，但总体反应率仍然较低，且缺乏持久性 | 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 | 37名BRAFV600E结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 |
| 13806 | 2024-08-04 |
Corrigendum: Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1345222
PMID:38116015
|
更正 | 本文更正了关于单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用的文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13807 | 2024-08-04 |
Identification of TRDV-TRAJ V domains in human and mouse T-cell receptor repertoires
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286688
PMID:38077312
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研究论文 | 本文描述了在人类和小鼠T细胞受体库中识别含有TRDV基因的两种T细胞受体 | 首次在小鼠和人类中识别到包括TRDV基因的TRA链，展示了这些TRDV基因对TRA多样性的贡献 | TRDV-TRA链在最终结果中被排除，可能导致对其丰富性的低估 | 研究TRDV基因在T细胞受体中的角色及其对TRA多样性的影响 | 人类和小鼠的T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个来自人类和23个来自小鼠的单细胞RNA-seq数据集 |
| 13808 | 2024-08-04 |
Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1285540
PMID:37965341
|
综述 | 本文总结了单细胞测序及肿瘤微环境分析的最新进展 | 结合单细胞测序和肿瘤微环境分析为揭示肿瘤发展和进展的分子机制提供了独特机会 | NA | 探讨单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用 | 肿瘤微环境及其与单细胞测序的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组，转录组和表观基因组 | NA |
| 13809 | 2024-08-04 |
Examining the function of macrophage oxidative stress response and immune system in glioblastoma multiforme through analysis of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288137
PMID:38274828
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研究论文 | 该论文探讨了巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的氧化应激反应和免疫系统的功能 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞在胶质母细胞瘤微环境中的中心角色及其潜在的极化机制 | 对现有巨噬细胞在胶质母细胞瘤作用机制的理解仍然有限 | 旨在重新定义胶质母细胞瘤肿瘤核心和周边区域内的细胞景观 | 研究对象为胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及其相关亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 13810 | 2024-08-04 |
Genetic and immunological insights into COVID-19 with acute myocardial infarction: integrated analysis of mendelian randomization, transcriptomics, and clinical samples
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286087
PMID:38022594
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19与急性心肌梗死之间的遗传和免疫学关联 | 采用两样本孟德尔随机化和机器学习发现TLR4和ABCA1作为相关性中心基因，具有高诊断价值 | 未能确认COVID-19与急性心肌梗死之间的直接因果关系 | 理解COVID-19与急性心肌梗死之间的分子机制 | 研究COVID-19患者中急性心肌梗死的遗传和免疫特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组数据, 临床血样本 | 在研究中包含了多样本的RNA-seq数据和临床血液样本 |
| 13811 | 2024-08-07 |
Crosstalk of disulfidptosis-related subtypes, establishment of a prognostic signature and immune infiltration characteristics in bladder cancer based on a machine learning survival framework
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1180404
PMID:37152941
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研究论文 | 本研究探讨了胱硫醚病相关基因（DRGs）对膀胱癌（BLCA）预后的影响，并开发了一种基于机器学习生存框架的预测模型，用于评估患者的预后、免疫特征和治疗反应 | 本研究首次将胱硫醚病相关基因与膀胱癌的预后和免疫浸润特征联系起来，并开发了一种新的预测模型 | NA | 研究胱硫醚病相关基因在膀胱癌中的作用，并开发一种新的预测模型以指导临床管理和个性化治疗 | 膀胱癌患者及其胱硫醚病相关基因的表达和突变特征 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-Seq数据 | 三个膀胱癌队列 |
| 13812 | 2024-08-07 |
Spatial modelling of the tumor microenvironment from multiplex immunofluorescence images: methods and applications
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288802
PMID:38179056
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研究论文 | 本文探讨了通过多重免疫荧光（mIF）图像的空间建模方法来研究肿瘤微环境（TME）中的细胞相互作用及其在临床应用中的潜力 | 本文引入了多种数学模型，这些模型最初用于景观生态学和地理信息研究，现在应用于肿瘤微环境分析，以评估细胞群的空间聚集性 | NA | 提高基于免疫疗法的临床试验的成功率 | 肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光（mIF） | 数学模型 | 图像 | 组织样本来自基线和治疗期间不同时间点的患者 |
| 13813 | 2024-08-07 |
An integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome and bidirectional mendelian randomization analysis identified C1Q as a novel stimulated risk gene for Atherosclerosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1289223
PMID:38179058
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量转录组数据，并使用双向孟德尔随机化分析，确定了C1Q作为动脉粥样硬化的新风险基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定了C1Q相关的关键基因，并使用双向孟德尔随机化分析验证了C1Q与动脉粥样硬化的关联 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定C1Q相关的关键基因，以更有效地诊断和预测动脉粥样硬化患者，并研究C1Q与动脉粥样硬化（缺血性中风）的关联 | C1Q相关基因在人类动脉粥样硬化斑块中的作用 | 基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自RAW264.7巨噬细胞和apoE-/-小鼠的样本 |
| 13814 | 2024-08-07 |
Deciphering Cell Fate Decision by Integrated Single-Cell Sequencing Analysis
2020-07, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
|
综述 | 本文综述了通过综合单细胞测序分析来解读细胞命运决策的方法和工具 | 介绍了利用单细胞RNA测序和其他测序模式来阐明谱系特化的分子基础，并讨论了计算工具在重建谱系轨迹、量化细胞命运偏倚和进行数据降维可视化方面的新机制见解 | NA | 深入理解细胞命运选择在发育、再生、稳态和疾病中的调控机制 | 细胞分化过程及其在健康和疾病中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 13815 | 2024-08-07 |
Random Parametric Perturbations of Gene Regulatory Circuit Uncover State Transitions in Cell Cycle
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101150
PMID:32450514
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研究论文 | 本文使用芽殖酵母细胞周期作为模型系统，研究基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 提出了一种通用的随机电路扰动方法，用于包含异质调控类型的电路，并分析了从随机动力学参数的电路模型集合中得到的稳态和振荡状态 | NA | 探索基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 芽殖酵母细胞周期 | 生物信息学 | NA | 随机电路扰动方法 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 13816 | 2024-08-07 |
CB2 improves power of cell detection in droplet-based single-cell RNA sequencing data
2020-06-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02054-8
PMID:32513247
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研究论文 | 本文介绍了一种基于聚类的方法CB2，用于区分单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | CB2利用了数据集中存在的强细胞间相关性，相较于现有方法，能更有效地识别真实细胞 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类方法 | RNA测序数据 | NA |
| 13817 | 2024-08-07 |
Systematic assessment of tissue dissociation and storage biases in single-cell and single-nucleus RNA-seq workflows
2020-06-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02048-6
PMID:32487174
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研究论文 | 本文系统比较了单细胞和单核RNA测序工作流程中组织解离和存储方法的相对偏差和优势 | 首次系统比较了不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 研究仅限于成年小鼠肾脏组织，可能不适用于其他组织类型 | 旨在揭示不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 成年小鼠肾脏组织的单细胞和单核RNA测序 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠肾脏组织 |
| 13818 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the tumor microenvironment and facilitates strategic choices to circumvent treatment failure in a chemorefractory bladder cancer patient
2020-05-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00741-6
PMID:32460812
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了一位化疗耐药性膀胱癌患者的肿瘤微环境，并基于此分析提出了个性化治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了化疗耐药性膀胱癌患者的肿瘤微环境和细胞类型特异性转录组变化，为个性化治疗提供了新思路 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可复制性有待进一步验证 | 探索化疗耐药性膀胱癌的肿瘤微环境，并开发个性化治疗策略 | 化疗耐药性转移性肌肉浸润性尿路上皮膀胱癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例及其对应的病人源性异种移植模型（PDX） |
| 13819 | 2024-08-07 |
Data-based RNA-seq simulations by binomial thinning
2020-May-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3450-9
PMID:32448189
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研究论文 | 本文开发了一种基于真实RNA-seq数据添加信号的方法，用于生成更真实的模拟数据，以评估和比较RNA-seq分析方法 | 提出了一种基于真实数据的RNA-seq模拟方法，该方法能够生成具有真实数据特征的模拟数据，用于评估在非理想（模型违反）场景下的RNA-seq分析方法 | NA | 开发更真实的RNA-seq数据模拟技术，以评估和比较RNA-seq分析方法 | RNA-seq数据模拟方法 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 13820 | 2024-08-07 |
Single-cell Transcriptome Analysis Indicates New Potential Regulation Mechanism of ACE2 and NPs signaling among heart failure patients infected with SARS-CoV-2
2020-May-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.04.30.20081257
PMID:32511460
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了在心衰患者中，ACE2和脑钠肽（BNP）及心房钠尿肽（ANP）信号通路的新潜在调控机制。 | 首次在单细胞水平上揭示了心衰心脏中ACE2的细胞分布及其与BNP和ANP的相互作用，以及这些变化如何影响SARS-CoV-2的感染。 | 研究样本来自单一中心，可能影响结果的普遍性；未涉及长期随访数据。 | 探讨心衰患者中ACE2和BNP/ANP信号通路在SARS-CoV-2感染中的调控机制。 | 心衰患者的心脏组织，特别是心肌细胞中的ACE2表达及其与BNP和ANP的相互作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 91名COVID-19患者 |