单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 13781 - 13800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13781 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Dynamic Stromal Niche That Supports Tumor Growth
2020-05-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107628
PMID:32433953
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠黑色素瘤及其引流淋巴结在肿瘤发展不同阶段的间质成分 | 发现了三种时间上不同的间质细胞群，这些细胞群在鼠和人类肿瘤中显示出独特的功能特征，并揭示了间质细胞在疾病早期就能调节免疫环境的能力 | NA | 探索肿瘤发展过程中间质细胞的动态变化及其对肿瘤生长的支持作用 | 小鼠黑色素瘤及其引流淋巴结中的间质细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13782 | 2024-08-07 |
Spatiotemporal immune zonation of the human kidney
2019-09-27, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aat5031
PMID:31604275
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了人类肾脏的时空免疫拓扑结构 | 揭示了在成熟和胎儿肾脏中免疫基因的解剖学定义表达模式，以及组织驻留的髓系和淋巴系免疫细胞网络 | NA | 探讨组织驻留免疫细胞在器官稳态和防御中的作用 | 人类肾脏的免疫细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13783 | 2024-08-07 |
How to Find a Resident Kidney Macrophage: the Single-Cell Sequencing Solution
2019-May, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019030245
PMID:30948628
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13784 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics of Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation
2019-02-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.01.001
PMID:30737144
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠皮肤和结肠中的CD4调节性T细胞和记忆T细胞，揭示了这些细胞在非淋巴组织中的适应性轨迹 | 首次详细描述了调节性T细胞在非淋巴组织中的亚群及其在不同组织中的适应性轨迹，并通过体内模型验证了预测的基因动力学 | NA | 探讨调节性T细胞在非淋巴组织中的表型和发育 | 小鼠皮肤和结肠中的CD4调节性T细胞和记忆T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35,000个CD4调节性T细胞和记忆T细胞 |
| 13785 | 2024-08-04 |
Label-free single-cell analysis in microdroplets using a light-scattering-based optofluidic chip
2024-Jun-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116148
PMID:38428071
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的基于光散射的微滴单细胞分析方法 | 采用光散射技术实现对微滴中单细胞的无标签检测和特征分析 | 未提及具体实验数据和临床应用的验证 | 开发一种高通量、无标签的微滴单细胞分析平台 | 主要研究微滴中单细胞的光散射特性 | 数字病理 | NA | 光散射 | NA | NA | 研究中涉及到的微滴单细胞及其人工合成的胶珠 |
| 13786 | 2024-08-04 |
Identity and nature of neural stem cells in the adult human subventricular zone
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109342
PMID:38495819
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研究论文 | 本文探讨了成人人体旁脑室区的神经干细胞的存在及其特征 | 本研究首次通过单细胞转录组学揭示了成人旁脑室区存在多种神经干细胞状态并提供了单细胞细胞图谱 | 研究主要基于新鲜的神经外科样本，可能限制了样本的代表性 | 旨在确认成人人体旁脑室区神经干细胞的存在和特性 | 成人旁脑室区的神经干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 新鲜的神经外科样本 |
| 13787 | 2024-08-04 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
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研究论文 | 这篇文章探讨了MYBL2通过上调RAN维持骨肉瘤癌干细胞样细胞群体的机制 | 本研究揭示了MYBL2-RAN通路在骨肉瘤癌干细胞自我更新和异质性肿瘤发生中的新作用 | 没有提供具体的临床试验数据来支持MYBL2-RAN通路的治疗潜力 | 理解癌干细胞在异质性肿瘤复发过程中的调控机制 | 骨肉瘤癌干细胞及其衍生的异质性肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 13788 | 2024-08-07 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫化学染色，发现ATM与PD-L1在三阴性乳腺癌中的负相关关系，并通过体外实验和动物实验证实ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负调控PD-L1表达 | 揭示了ATM通过下调JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负调控PD-L1的新机制 | NA | 探讨ATM在三阴性乳腺癌中对PD-L1表达的调控机制 | 三阴性乳腺癌细胞和临床样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个三阴性乳腺癌临床样本和86个三阴性乳腺癌样本 |
| 13789 | 2024-08-07 |
odd skipped-related 2 as a novel mark for labeling the proximal convoluted tubule within the zebrafish kidney
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27582
PMID:38496848
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研究论文 | 本文通过分析成年斑马鱼肾脏的单细胞转录组数据，发现odd-skipped-related 2（Osr2）在近端卷曲小管（PCT）中的表达，并生成了一种表达增强绿色荧光蛋白（EGFP）的转基因斑马鱼系，用于研究PCT的形态发生。 | 首次识别并利用Osr2作为标记物来标记斑马鱼肾脏中的PCT，并成功生成了一种转基因斑马鱼系，该系可以用于PCT的遗传和化学分析。 | 文章未明确提及研究的具体局限性。 | 研究近端卷曲小管（PCT）的形态发生及其在斑马鱼肾脏中的功能。 | 斑马鱼肾脏中的近端卷曲小管（PCT）。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼肾脏的单细胞样本 |
| 13790 | 2024-08-07 |
Temporospatial hierarchy and allele-specific expression of zygotic genome activation revealed by distant interspecific urochordate hybrids
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46780-0
PMID:38493164
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研究论文 | 本文通过研究两种深度分化（1.2亿年前）的栉水母物种的杂交后代，揭示了合子基因组激活（ZGA）的时空层次结构和等位基因特异性表达 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了ZGA的两个协调波，分别代表早期发育和管家基因的重新激活，并展示了空间异质性和细胞命运的显著相关性 | NA | 研究合子基因组激活（ZGA）的机制及其在早期胚胎发生中的作用 | 两种深度分化的栉水母物种的杂交后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13791 | 2024-08-04 |
Holistic exploration of CHGA and hsa-miR-137 in colorectal cancer via multi-omic data Integration
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27046
PMID:38495181
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合，探索了与结直肠癌相关的mRNA-miRNA网络 | 提出了hsa-miR-137和Chromogranin A作为有前景的结直肠癌生物标志物 | 尽管蛋白质组分析未能直接相关，但多方面的方法提供了对结直肠癌复杂调控机制的全面理解 | 揭示与结直肠癌发病机制有关的复杂mRNA-miRNA网络 | 结直肠癌相关转录组和关键基因，其中特别关注Chromogranin A和hsa-miR-137 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微阵列、Bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | WGCNA | 转录组数据 | 多种数据集的综合，具体样本数量未明确提及 |
| 13792 | 2024-08-07 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for sepsis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27379
PMID:38495196
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析，识别了铜依赖性细胞死亡（cuproptosis）在脓毒症中的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次揭示了cuproptosis在脓毒症免疫特征中的作用，并识别了关键的差异表达cuproptosis相关基因（DECuGs）和潜在的新药 | 研究依赖于已有的公开数据集，未涉及临床试验验证 | 探索cuproptosis在脓毒症中的免疫特征和潜在的治疗靶点 | 脓毒症患者的免疫细胞和cuproptosis相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个脓毒症数据集（GSE9960和GSE134347），具体样本数量未详细说明 |
| 13793 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating CD8+ sub-populations in primary and recurrent glioblastoma: An in-silico study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27329
PMID:38495199
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研究论文 | 研究分析了原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞的亚群，并探讨了其在肿瘤微环境中的作用 | 提供了原发性和复发性胶质母细胞瘤中CD8+ TILs亚群的详细图谱，为未来的精准免疫治疗提供了概念验证 | NA | 研究CD8+ TILs亚群在原发性和复发性胶质母细胞瘤中的分布及其在肿瘤微环境中的作用 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤中的肿瘤浸润性CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13794 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the heterogeneity and microenvironment of vestibular schwannoma
2024-03-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad201
PMID:37862593
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤的异质性和微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了前庭神经鞘瘤的微环境，并发现了与快速生长相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于少数样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探究前庭神经鞘瘤的细胞异质性和微环境，以增进对该疾病临床表型的理解 | 前庭神经鞘瘤及其正常神经样本 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 7个前庭神经鞘瘤样本和2个正常神经样本 |
| 13795 | 2024-08-07 |
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-Mar, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202403_35618
PMID:38497886
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别出五个与卵巢癌预后相关的标志性基因，并据此将患者分为五个亚型，分析了各亚型的临床预后和治疗反应 | 首次通过单细胞测序数据识别出五个影响卵巢癌预后的标志性基因，并据此进行患者亚型分类，为临床决策提供指导 | NA | 旨在识别预测卵巢癌临床预后的生物标志物，特别是针对免疫治疗和化疗的预后分组 | 卵巢癌患者的基因标志物和预后亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | TCGA-OV数据库中的患者样本 |
| 13796 | 2024-08-07 |
A comprehensive database of exosome molecular biomarkers and disease-gene associations
2024-Feb-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03015-7
PMID:38360815
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研究论文 | 开发了一个综合数据库ExMdb，包含外泌体核酸生物标志物与疾病-基因关联信息 | 首次系统地整合了外泌体核酸生物标志物与疾病-基因关联的数据，并提供了大量的高通量数据支持 | NA | 探索复杂疾病的调控机制并促进诊断和治疗生物标志物的开发 | 外泌体核酸生物标志物及其与疾病基因的关联 | NA | NA | RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集 | 4,586个实验支持的基因-疾病关联，13,768个诊断和治疗生物标志物，312,049个核酸亚细胞定位，164个高通量数据集 |
| 13797 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell transcriptomics with cellular phenotypes: cell morphology, Ca2+ imaging and electrophysiology
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01174-2
PMID:38495444
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组学与细胞表型结合的最新技术进展 | 提出了一系列新的方法将scRNAseq与生物物理测量结合，为转录组数据与细胞功能之间的联系提供了生理学见解 | 文章中未明确提及具体的技术限制或挑战 | 旨在探讨如何通过结合单细胞转录组学和细胞表型来理解细胞状态及其功能 | 研究对象包括细胞形态、钙信号和电生理学等细胞功能指标 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 转录组数据与生物物理测量数据 | 强调在具有可兴奋细胞类型的组织中的应用，例如大脑、胰岛和视网膜，但具体样本数未说明 |
| 13798 | 2024-08-04 |
DOT1L promotes expression of CD44 through the Wnt/β-catenin signaling pathway in early gastric carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.90170
PMID:38495505
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研究论文 | 本研究评估了DOT1L基因在胃癌组织中的表达及其促进癌症干细胞介导的上皮-间质转化的功能 | 发现DOT1L通过Wnt/β-连环蛋白信号通路促进CD44的表达，揭示了其在胃癌干细胞调节中的重要性 | 样本量相对较小，限制了结果的广泛适用性和外推性 | 研究DOT1L在早期胃癌中的作用及其机制 | 通过单细胞测序分析早期胃癌和低级别上皮内瘤变的组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 24个样本（来自8名患者的3个阶段，其中每个阶段各8个样本） |
| 13799 | 2024-08-04 |
Identification of T-cell exhaustion-related genes and prediction of their immunotherapeutic role in lung adenocarcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92839
PMID:38495503
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研究论文 | 本文探讨了与T细胞耗竭相关的基因及其在肺腺癌免疫治疗中的预测作用 | 构建了一个基于T细胞耗竭的模型，用于评估肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 未提及具体的实验限制 | 探讨T细胞耗竭对肿瘤微环境的影响及其在肺腺癌中的作用 | 肺腺癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq)，RNA-seq | LASSO-Cox分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO的LUAD患者数据，涉及多个验证队列 |
| 13800 | 2024-08-04 |
Unravelling spatial gene associations with SEAGAL: a Python package for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad431
PMID:37436699
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SEAGAL的Python包，用于分析和可视化空间转录组数据。 | SEAGAL包能够在单基因和基因集水平上检测和可视化空间基因相关性，突破了传统共表达分析的局限。 | 尚未提及具体局限性。 | 旨在通过空间转录组分析揭示基因的空间相关性。 | 对空间转录组数据集中的基因表达和空间坐标进行分析。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |