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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2026-03-18 |
Single-Cell Transcriptome and RNA Sequencing Reveal Immune-Related Markers of Preeclampsia
2025-08, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01843-5
PMID:40216654
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研究论文 | 本研究通过单细胞和RNA测序技术，比较了先兆子痫与非先兆子痫胎盘样本的免疫微环境，旨在发现调控先兆子痫的关键靶基因 | 首次在单细胞水平上对先兆子痫胎盘的免疫微环境进行系统分析，并识别出巨噬细胞中调控先兆子痫的7个关键靶基因（SLC9A9、SH2B3、SDC3、RCC2、F13A1、CCL2、CBLB） | 研究样本量未明确说明，且分析主要基于公共数据集，需要进一步实验验证这些靶基因的功能 | 探索先兆子痫胎盘免疫微环境中的关键调控基因 | 先兆子痫与非先兆子痫患者的胎盘组织 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | Scenic包用于转录因子分析，伪时间分析，细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1362 | 2026-03-18 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究衰老相关细胞变化中的应用，总结了衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性群体变化的影响 | 通过整合过去十年的单细胞研究数据，系统性地总结了衰老对哺乳动物全身细胞类型特异性群体的影响，并探讨了性别和抗衰老干预对细胞群体动态的影响 | NA | 阐明衰老对哺乳动物细胞类型特异性群体变化的影响，为衰老和年龄相关疾病提供潜在治疗靶点 | 哺乳动物器官中的细胞类型特异性群体 | 基因组学 | 老年疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1363 | 2026-03-18 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
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研究论文 | 本研究利用PS19小鼠模型，通过空间转录组学分析揭示了tau蛋白病前期海马和皮层区域的代谢功能障碍 | 首次在PS19小鼠模型中，通过空间转录组学技术，在可检测的tau缠结病理出现前，识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调，揭示了代谢失调与区域脆弱性的关联 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性，且样本量有限 | 探究tau蛋白病中区域脆弱性与tau驱动转录组变化之间的关系，特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 | PS19转基因小鼠模型的海马和皮层区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1364 | 2026-03-18 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白（GBPs）在宿主防御利什曼原虫感染中的作用，特别是在调节巨噬细胞中iNOS/Arg-1平衡以控制寄生虫方面的机制 | 首次系统研究了GBPs在皮肤利什曼病中的功能，揭示了其通过平衡iNOS和Arg-1表达来调节巨噬细胞免疫反应，从而影响寄生虫控制的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况；且GBPs的具体作用通路仍需进一步探索 | 探究GBPs在宿主防御利什曼原虫感染中的免疫调节作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠模型 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1365 | 2026-03-18 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 | 研究主要基于猪模型，结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 | 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1366 | 2026-03-18 |
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280
PMID:40079140
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣细胞异质性，揭示了出生时瓣膜内皮细胞和间质细胞的新亚群 | 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中发现新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未被认识的瓣膜间质细胞亚群（原始型、重塑型和生物活性型），并通过谱系追踪揭示了原始型间质细胞在出生后成熟过程中的时空轨迹 | 研究仅针对出生后第1天的小鼠主动脉瓣，未涵盖更广泛的发育阶段或人类样本，可能限制了结果的普遍性 | 探究主动脉瓣在出生后成熟过程中建立结构-功能关系的细胞机制 | 新生小鼠（出生后第1天）的主动脉瓣结构 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1367 | 2026-03-18 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 本文通过整合单细胞数据集，研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 | 利用单细胞组成数据分析（scCODA）揭示细胞类型组成变化，并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联，识别了关键转录因子（如YY1） | 研究依赖于现有数据集整合，可能受样本来源和技术差异影响，且新队列数据（HRA001742）的相似性评估仅基于逻辑回归模型 | 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性，为靶向治疗提供基础 | 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化（IHC） | 逻辑回归模型 | 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集，包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 1368 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并首次系统评估了水平整合（scRNA与snRNA-seq）和垂直整合（snRNA-seq与snATAC-seq）策略在复杂组织中的效果 | 研究仅针对肾脏皮质组织，未验证在其他复杂组织中的普适性 | 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 | 人类肾脏皮质组织 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习（scOMM工具） | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1369 | 2026-03-18 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制，并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 | 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1370 | 2026-03-18 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
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综述 | 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 | 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素，并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 | 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物，且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 | 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库，以实现HIV治愈 | HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 | NA | HIV感染 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1371 | 2026-03-18 |
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55434-0
PMID:39747095
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler，用于识别单细胞测序中的双联体 | 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别，相比传统基于基因组模拟数据的方法，F1分数至少提升33.1% | 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据，在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 | 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 | 单细胞测序数据中的双联体（两个或多个细胞被一起测序） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 图像识别模型 | 图像 | NA | Fluidigm | 单细胞测序 | NA | Fluidigm单细胞测序图像数据 |
| 1372 | 2026-03-18 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
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研究论文 | 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法，用于更有效地捕获HIV转录本，并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞，揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 | 开发了HIV-seq方法，通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列，提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%，并结合CITE-seq进行表面表型分析，首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 | 样本量相对较小，仅基于配对血液样本，可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞，且方法依赖于自定义捕获序列的设计，可能对HIV变异株的覆盖不完全 | 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异，特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较，以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 | HIV感染者的血液样本，包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面表型数据 | 配对血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 | NA | NA |
| 1373 | 2026-03-18 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 本研究通过BCR受体克隆、表达及单细胞转录组学分析，探讨了人类对普遍存在的N-乙酰-D-葡萄糖胺（GlcNAc）表位的B细胞库，并揭示了抗糖抗体在生发中心依赖的亲和力成熟过程 | 结合BCR克隆表达与单细胞转录组学，首次系统分析了人类抗GlcNAc B细胞库的免疫系统发育史，揭示了其在早期儿童期通过生发中心进行亲和力成熟的新机制 | 研究主要关注GlcNAc表位，可能未全面覆盖其他糖类抗原；样本队列和年龄范围可能限制结论的普遍性 | 解析人类抗体库对碳水化合物抗原的广泛反应性机制，特别是针对GlcNAc表位的B细胞选择与成熟过程 | 人类队列中的循环抗GlcNAc B细胞及其BCR受体 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据 | 人类队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1374 | 2026-03-18 |
Single-cell multidimensional profiling of tumor cell heterogeneity in supratentorial ependymomas
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.07.607066
PMID:41738029
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和活细胞成像技术，系统描绘了幕上室管膜瘤的肿瘤细胞异质性、空间组织和动态行为 | 首次在单细胞和空间维度上整合分析了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间架构及微环境影响，揭示了肿瘤内两种不同的祖细胞样状态，并发现了脑内常驻细胞对肿瘤细胞向神经元样表型转化的新作用 | 未明确说明样本数量及具体技术平台细节，且研究聚焦于特定亚型，结论的普适性有待进一步验证 | 解析幕上室管膜瘤的肿瘤异质性、空间组织模式及其与神经微环境的相互作用 | 幕上室管膜瘤（一种儿童侵袭性脑肿瘤）的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤（幕上室管膜瘤） | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 活细胞成像 | NA | 转录组数据, 空间位置数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1375 | 2026-03-18 |
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573939
PMID:38260306
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研究论文 | 本研究开发了一种使用顶端向外人类气道类器官进行高通量抗病毒药物筛选的标准化方法 | 引入了具有反向双极性的气道类器官，实现了单类器官每孔的高通量培养和分析，提高了病毒感染效率和药物筛选的标准化水平 | 研究主要作为SARS-CoV-2的概念验证应用，尚未广泛扩展到其他病毒或疾病模型 | 开发标准化的类器官平台用于抗病毒药物发现和评估 | 人类气道类器官和SARS-CoV-2病毒株 | 数字病理学 | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 类器官模型 | 转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1376 | 2026-03-18 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 | 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术，以全面表征黑色素瘤免疫微环境 | 作为综述文章，未提供原始实验数据或新方法验证，主要总结现有研究 | 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 | 黑色素瘤患者，特别是II-IV期患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱分析，空间转录组学，人工智能图像分析 | NA | 图像，文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1377 | 2026-03-18 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 | 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用，发现了一个新的上皮细胞亚群，并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证；部分分子相互作用机制尚未完全阐明 | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 | 表观遗传学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1378 | 2026-03-18 |
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
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研究论文 | 提出了一种名为MIOFlow的方法，用于从稀疏时间点采集的静态快照样本中学习随机、连续的群体动态 | 结合动态模型、流形学习和最优传输，通过训练神经常微分方程在静态群体快照之间进行插值，并利用流形地面距离的最优传输进行惩罚 | 未在摘要中明确说明 | 从静态快照样本推断连续群体动态轨迹 | 模拟数据（含分叉与合并）和scRNA-seq数据（胚状体分化和急性髓系白血病治疗） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq | 神经常微分方程（Neural ODE）、自编码器（GAE） | 单细胞RNA测序数据、模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1379 | 2026-03-17 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomic reveals S100A16+ tumor endothelial cells drive angiogenesis and immunosuppression in hepatocellular carcinoma
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218335
PMID:41722834
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了S100A16+肿瘤内皮细胞在肝细胞癌中驱动血管生成和免疫抑制的关键作用 | 首次在肝细胞癌中鉴定出S100A16+肿瘤内皮细胞亚群，并阐明其通过CCL20和TGF-β2促进血管生成和Treg分化、导致免疫抑制的双重机制 | 样本量相对有限（49个单细胞样本，12个空间样本），临床验证队列规模较小，机制研究主要在体外和动物模型中进行 | 探究肝细胞癌中肿瘤相关内皮细胞的分子特征、功能及其在肿瘤进展中的作用 | 肝细胞癌组织、正常肝组织、肿瘤边界区域、人脐静脉内皮细胞、内皮细胞特异性敲除小鼠 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，RNA测序，多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，临床数据 | 49个样本（145,692个高质量单细胞），12个空间样本（49,091个空间点），90对配对HCC样本的组织微阵列，一个免疫治疗晚期HCC队列 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1380 | 2026-03-17 |
Aflatoxin B1 accelerates diabetic nephropathy progression via ITGA11/LTBP1-dependent oxidative and fibrotic pathways: Evidence from multi-omics and molecular simulations
2026-May-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111974
PMID:41722833
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研究论文 | 本研究通过多组学和分子模拟揭示了黄曲霉毒素B1通过ITGA11/LTBP1依赖的氧化和纤维化通路加速糖尿病肾病进展的机制 | 首次系统性地整合了批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学及分子模拟技术，全面解析了AFB1在糖尿病肾病中的分子调控网络，并识别出ITGA11和LTBP1作为关键分子介导物 | 研究主要基于计算和模拟分析，缺乏体内或体外实验验证AFB1与ITGA11/LTBP1的直接相互作用及其功能影响 | 阐明AFB1在糖尿病肾病进展中的作用机制，识别相关的分子通路和细胞间通讯轴 | 糖尿病肾病相关的分子和细胞通路，特别是AFB1响应的基因和蛋白 | 计算生物学 | 糖尿病肾病 | 批量转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫去卷积, 细胞间通讯推断, 伪时间轨迹分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间数据, 模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |