单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 13761 - 13780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13761 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征，以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 |
| 13762 | 2024-08-07 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了锌补充剂对人类视网膜色素上皮细胞转录组变化的影响，以理解年龄相关性黄斑变性的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究锌补充剂对视网膜色素上皮细胞转录组的影响，并揭示了锌处理后与年龄相关性黄斑变性相关的多个生物途径的基因表达变化 | 研究仅限于体外细胞培养，未涉及临床试验，且锌补充剂对视网膜色素上皮细胞的长期影响仍需进一步研究 | 探讨锌补充剂对年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及2周、9周和19周的细胞培养样本，以及1周和18周的锌补充处理样本 |
| 13763 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠中，PD-1和TIM-3如何不同地调节产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 首次展示了肺部Vγ4+和Vγ6+细胞在肿瘤和非肿瘤状态下表达不同的细胞表面分子和共抑制分子，并发现这些分子抑制其扩张 | NA | 研究γδ T细胞亚群在稳态和癌症中的调控机制 | 小鼠中产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞表面分子表达数据 | 肿瘤和非肿瘤小鼠的肺部Vγ4+和Vγ6+细胞 |
| 13764 | 2024-08-04 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
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研究论文 | 本研究发现LRRC15是一种伴随因子，与SARS-CoV-2的刺突蛋白相互作用 | 本研究首次揭示了LRRC15作为SARS-CoV-2刺突蛋白的附加结合因子，与已知的结合机制不同 | LRRC15单独并不足以引发病毒进入，需要进一步研究其在感染中的作用 | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞之间的相互作用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与人类细胞因子LRRC15的相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白组学与单细胞转录组学 | 细胞基因表达模型 | NA | 人类肺血管细胞和成纤维细胞的分析 |
| 13765 | 2024-08-07 |
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/resp.14401
PMID:36414410
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研究论文 | 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响，并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 | 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成，并验证了该方法的有效性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 | 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 | 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞解卷积 | RNA测序数据 | 共149名参与者，包括56名慢性阻塞性肺疾病患者，77名无慢性阻塞性肺疾病参与者，以及16名停止吸烟一年的参与者 |
| 13766 | 2024-08-07 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为熵排序（ES）的数学框架，用于从单细胞RNA测序数据中区分出指示细胞身份的基因，并在人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据中成功识别出内细胞团（ICM）。 | ES方法无需用户定义的显著性阈值，通过量化特征间观察到的相关性是更可能由于随机机会还是依赖关系来区分基因，实现了无监督的细胞身份基因识别。 | NA | 解决单细胞基因表达分析中区分技术或生物噪声与有意义的细胞异质性的挑战。 | 人类胚胎植入前阶段的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13767 | 2024-08-04 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞和空间转录组学深入分析了健康人类肺部的组织结构和免疫微环境 | 本文发现了新的与腺体相关的免疫细胞栖息地，并对其在呼吸健康中的重要性进行了验证 | 研究主要集中于健康人类肺部，可能不适用于肺病患者的分析 | 重新定义人类肺部和气道的组织结构 | 健康人类肺部的不同位置的单细胞类型及其空间背景 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | 五个健康人类肺部近远区域的位置 |
| 13768 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
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研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 |
| 13769 | 2024-08-04 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
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review | 本综述详细介绍了卵巢储备的建立和维持的关键阶段 | 本文突出了几个重大的单细胞测序研究，这些研究显著推动了我们对卵巢储备新分子调节因子的知识 | NA | 探索与卵巢储备建立和维持相关的细胞和分子动态 | 卵巢中的原始卵泡及其相关阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 13770 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
|
研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 13771 | 2024-08-07 |
Into the multiverse: advances in single-cell multiomic profiling
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.015
PMID:35537880
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research paper | 本文介绍了单细胞多组学分析方法的最新进展，这些方法能够同时测量细胞的基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组，从而更全面地理解细胞类型和状态及其在健康和疾病中的功能。 | 本文介绍了能够同时测量单个细胞中基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组的多组学分析方法，这是对传统单细胞转录组学方法的重要扩展。 | NA | 本文旨在探索和揭示细胞行为背后的调控和功能机制，特别是在健康发育和疾病中的应用。 | 本文主要研究单细胞水平上的多组学数据，包括基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | 数千个细胞 |
| 13772 | 2024-08-07 |
Phosphodiesterase type 5 inhibitors enhance chemotherapy in preclinical models of esophageal adenocarcinoma by targeting cancer-associated fibroblasts
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100541
PMID:35732148
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研究论文 | 研究通过靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）的肿瘤促进功能，使用磷酸二酯酶5型抑制剂（PDE5i）增强食管腺癌（EAC）的化疗效果 | 首次证明PDE5i可以防止正常成纤维细胞向CAF的转变，并消除已建立的EAC CAF的肿瘤促进功能，从而增强标准化疗的疗效 | NA | 研究如何通过靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞来增强食管腺癌的化疗效果 | 食管腺癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 磷酸二酯酶5型抑制剂（PDE5i） | NA | 蛋白质组学和单细胞RNA测序数据 | NA |
| 13773 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02373-2021
PMID:35604813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13774 | 2024-08-07 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了35,250个人类单细胞的转录组，以识别驱动Dupuytren病的关键细胞和分子途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出Dupuytren病特异性的病原性PDPN/FAP间充质细胞群，并揭示了调控该病特异性肌成纤维细胞表型的关键分子途径 | NA | 旨在识别驱动Dupuytren病的关键细胞和分子途径，以开发新的有效治疗方法 | Dupuytren病、非病理性筋膜和健康真皮的单细胞 | 数字病理学 | Dupuytren病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 35,250个人类单细胞 |
| 13775 | 2024-08-07 |
Non-parametric modelling of temporal and spatial counts data from RNA-seq experiments
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab486
PMID:34213536
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research paper | 本文介绍了GPcounts包，它使用负二项似然函数的GP回归方法来建模计数数据，通过变分贝叶斯推断提高计算效率。 | GPcounts包通过使用负二项似然函数和变分贝叶斯推断，能够处理大规模的单细胞和空间转录组数据，并能更好地识别过度分散的计数数据中的变化。 | NA | 开发一种能够有效处理大规模单细胞和空间转录组数据的非参数模型。 | 单细胞和空间转录组数据中的计数数据。 | machine learning | NA | RNA-seq | Gaussian process (GP) regression | counts data | NA |
| 13776 | 2024-08-07 |
Congenital heart disease risk loci identified by genome-wide association study in European patients
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI141837
PMID:33201861
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研究论文 | 本文通过全基因组关联研究（GWAS）在欧洲患者中识别与先天性心脏病（CHD）相关的遗传风险位点，并进行功能分析。 | 首次在欧洲患者群体中通过GWAS识别出与CHD相关的多个遗传风险位点，并通过体外和单细胞RNA测序分析揭示这些基因在心脏发育中的功能作用。 | 研究样本主要集中在欧洲患者，可能限制了结果的普遍性。 | 识别与先天性心脏病相关的遗传风险因素，并进行功能分析。 | 先天性心脏病患者和健康对照组的遗传变异。 | 遗传学 | 先天性心脏病 | 全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因数据 | 4034名白人CHD患者和8486名健康对照 |
| 13777 | 2024-08-07 |
Transcriptomic profiling across the nonalcoholic fatty liver disease spectrum reveals gene signatures for steatohepatitis and fibrosis
2020-12-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aba4448
PMID:33268509
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研究论文 | 本研究通过大规模多中心研究，分析了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展至肝硬化过程中的转录组变化，以识别潜在的循环标志物 | 本研究首次识别了25个差异表达基因，这些基因在纤维化脂肪肝炎进展中具有一致性表达，并通过独立验证和整合分析进一步确认了这些基因的贡献 | NA | 揭示非酒精性脂肪肝病进展过程中的基因特征，并寻找潜在的疾病进展标志物 | 非酒精性脂肪肝病患者的肝脏组织 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 206名NAFLD患者样本用于发现队列，175名患者样本用于验证队列 |
| 13778 | 2024-08-07 |
Combinatorial expression of GPCR isoforms affects signalling and drug responses
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2888-2
PMID:33149304
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研究论文 | 本文通过整合人类组织层面转录组、GPCR序列和结构、蛋白质组学、单细胞转录组学、全人群遗传关联研究及药理学实验数据，探讨了GPCR基因如何多样化成具有不同信号传导特性的几种亚型，以及不同组织中独特的亚型组合如何产生不同的信号状态。 | 本文首次系统地研究了GPCR亚型的组合表达如何影响信号传导和药物反应，强调了从传统观点向特定情境观点转变的必要性。 | NA | 研究GPCR亚型的组合表达如何影响信号传导和药物反应。 | GPCR亚型的组合表达及其对信号传导和药物反应的影响。 | 生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、遗传关联研究、药理学实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、遗传数据、药理学数据 | 涉及人类组织的多种数据集 |
| 13779 | 2024-08-07 |
Inflammatory Bowel Disease Through the Lens of Single-cell RNA-seq Technologies
2020-10-23, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaa089
PMID:32386055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在炎症性肠病（IBD）研究中的关键进展和计算分析的重要方面 | 利用多模态单细胞技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），能够精确绘制组织结构图，鉴定先前被忽视的稀有细胞类型，并定义单细胞水平的功能 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何重塑我们对炎症性肠病复杂性的理解，并考虑其潜在的临床应用 | 肠道黏膜的细胞组成及其在炎症性肠病中的作用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 13780 | 2024-08-07 |
Tumors induce de novo steroid biosynthesis in T cells to evade immunity
2020-07-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17339-6
PMID:32680985
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤通过诱导T淋巴细胞中的从头类固醇生成来逃避抗肿瘤免疫的机制 | 首次展示了肿瘤诱导T细胞中的从头类固醇生成以逃避免疫反应，并证明了抑制类固醇生成途径足以恢复抗肿瘤免疫 | NA | 探讨肿瘤逃避免疫反应的复杂机制 | T淋巴细胞中的从头类固醇生成 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 使用转基因类固醇生成报告小鼠品系进行研究 |