单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 13741 - 13760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13741 | 2024-08-07 |
Single Cell Analysis of Lung Lymphatic Endothelial Cells and Lymphatic Responses during Influenza Infection
2024-Mar, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.35534/jrbtm.2024.10003
PMID:38529320
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研究论文 | 研究了流感感染期间肺淋巴内皮细胞和淋巴反应的单细胞分析 | 发现了流感感染期间肺淋巴内皮细胞中存在的新的PD-L1亚群 | NA | 探讨感染期间淋巴系统的重塑过程 | 肺淋巴内皮细胞和淋巴反应 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13742 | 2024-08-04 |
Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316871121
PMID:38346184
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研究论文 | 本文研究了在双膦酸盐治疗失败的骨质疏松患者中通过单细胞转录组学揭示异质的骨免疫特征 | 研究首次揭示了骨质疏松患者中免疫细胞的异质性及其与双膦酸盐治疗失败的相关性 | 样本量可能有限，未深入探讨其他可能影响结果的生物标志物 | 探讨骨质疏松症中的免疫细胞异质性及其在双膦酸盐治疗中的作用 | 选取不同骨质疏松症状态的绝经后女性，包括非骨质疏松、经过治疗改善的患者及治疗失败者 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 三组共涉及多名绝经后女性样本，具体样本量未详细说明 |
| 13743 | 2024-08-04 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2024-Feb-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87866
PMID:38319699
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研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序，探索小鼠大脑中的逆行标记和跨突触标记 | 本研究首次将条形码狂犬病毒与高通量的单细胞RNA测序和原位测序相结合，以实现神经元类型的广泛映射 | 目前条形码狂犬病毒的应用仅限于映射非神经元细胞的相互作用和培养神经元的突触连接 | 研究各种神经元类型的连接性，从而理解神经电路的结构和功能 | 小鼠大脑中的目标神经元及其突触连接 | 数字神经解剖学 | NA | RNA条形码测序 | NA | 转录组数据 | 对96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞进行了单细胞RNA测序，对4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞进行了原位测序 |
| 13744 | 2024-08-07 |
Association Between Diverse Cell Death Patterns Related Gene Signature and Prognosis, Drug Sensitivity, and Immune Microenvironment in Glioblastoma
2024-Jan-12, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-023-02181-4
PMID:38214842
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研究论文 | 本研究基于多种程序性细胞死亡模式相关基因构建了一个新的预测胶质母细胞瘤（GBM）预后的模型，并探讨了该模型与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 首次整合了11种程序性细胞死亡模式相关基因，构建了一个新的预后模型，并验证了其在不同数据集中的有效性 | 需要进一步的研究来验证该模型在更大规模样本和不同人群中的应用效果 | 开发一个有效的工具来预测GBM的预后，并探讨其与药物敏感性和免疫微环境的关系 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者的预后、药物敏感性和免疫微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-GBM、REMBRANDT、CGGA和GSE162631数据集的GBM病例的bulk和单细胞转录组数据及临床数据 |
| 13745 | 2024-08-07 |
Single-cell disulfidptosis regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to kidney renal clear cell carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1288240
PMID:38292868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾透明细胞癌中的硫化物凋亡调控因子模式，揭示了其在肿瘤微环境中对细胞间通讯的影响及其与疾病进展和免疫治疗的关系 | 首次详细探讨了硫化物凋亡在肿瘤微环境中的具体作用，并揭示了其与肾透明细胞癌生物特性和预后的关联 | 研究样本量相对较小，且仅限于肾透明细胞癌，可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨硫化物凋亡调控因子在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对疾病进展和免疫治疗的影响 | 肾透明细胞癌的肿瘤微环境中的单细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | RNA | 41,784个单细胞，来自7个肾透明细胞癌样本 |
| 13746 | 2024-08-07 |
Cytotoxic CD8+ Temra cells show loss of chromatin accessibility at genes associated with T cell activation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1285798
PMID:38370415
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研究论文 | 研究探讨了人类衰老过程中记忆T细胞的扩张及其与CMV感染的关系，特别是Temra细胞的表观遗传模式和细胞异质性 | 通过单细胞转录组分析和ATAC-seq技术，揭示了Temra细胞与Tcm/em细胞在染色质可及性方面的差异，并发现了与基因表达相关的染色质可及性位点 | 研究主要集中在Temra细胞与Tcm/em细胞的比较，未涉及其他T细胞亚群的全面分析 | 探究衰老和CMV感染对CD8 Temra细胞分子和细胞异质性的影响 | CD8 Temra细胞及其与CMV感染的关系 | 免疫学 | NA | ATAC-seq, 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 涉及多个个体，具体数量未在摘要中明确 |
| 13747 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies cancer cell-intrinsic RARRES1 as a predictor of prognosis and immune response in triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1360507
PMID:38533207
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）中肿瘤微环境（TME）的细胞组成异质性，并识别了与TME相关的基因RARRES1，该基因表达与TNBC患者的预后和免疫检查点抑制剂（ICIs）反应呈正相关 | 本研究提出了一种定量评估TME免疫特征的方法，并提供了一个框架，通过综合分析识别与TME相关的癌细胞内在特征 | NA | 揭示三阴性乳腺癌中癌细胞与肿瘤微环境之间的关系，并识别预测治疗反应和预后的生物标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 13748 | 2024-08-07 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
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研究论文 | 本文探讨了基因组印记及其在哺乳动物亲代抚育中的调控作用 | 利用单细胞RNA测序数据支持了印记基因与母体抚育质量之间更为深思熟虑的关系 | NA | 研究基因组印记在哺乳动物亲代抚育中的作用及其对人类健康的潜在影响 | 基因组印记及其在母体抚育中的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 13749 | 2024-08-04 |
Interferon-independent processes constrain measles virus cell-to-cell spread in primary human airway epithelial cells
2023-Sep-19, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01361-23
PMID:37724882
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研究论文 | 本研究探讨了麻疹病毒在主要人类气道上皮细胞中的细胞间传播机制 | 这项研究揭示了IFN信号在麻疹病毒细胞间传播中并不是限制因素，强调了IFN独立过程的重要性 | 研究未能完全理解阻止麻疹病毒传播的机制 | 了解麻疹病毒在气道上皮细胞中的传播特征和机制 | 主要人类气道上皮细胞(Hae)和麻疹病毒(MeV)突变体 | NA | NA | 深度测序、定量RT-PCR和单细胞RNA测序 | NA | 细胞模型 | 主要人类气道上皮细胞的培养 |
| 13750 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型，以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型，揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 |
| 13751 | 2024-08-07 |
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02181-8
PMID:36702949
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研究论文 | 本研究进行了一项单臂2期临床试验，评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 | 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制，为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 | 尽管研究达到了主要终点，但总体反应率仍然较低，且缺乏持久性 | 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 | 37名BRAFV600E结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 |
| 13752 | 2024-08-04 |
Corrigendum: Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1345222
PMID:38116015
|
更正 | 本文更正了关于单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用的文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13753 | 2024-08-04 |
Identification of TRDV-TRAJ V domains in human and mouse T-cell receptor repertoires
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286688
PMID:38077312
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研究论文 | 本文描述了在人类和小鼠T细胞受体库中识别含有TRDV基因的两种T细胞受体 | 首次在小鼠和人类中识别到包括TRDV基因的TRA链，展示了这些TRDV基因对TRA多样性的贡献 | TRDV-TRA链在最终结果中被排除，可能导致对其丰富性的低估 | 研究TRDV基因在T细胞受体中的角色及其对TRA多样性的影响 | 人类和小鼠的T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个来自人类和23个来自小鼠的单细胞RNA-seq数据集 |
| 13754 | 2024-08-04 |
Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1285540
PMID:37965341
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综述 | 本文总结了单细胞测序及肿瘤微环境分析的最新进展 | 结合单细胞测序和肿瘤微环境分析为揭示肿瘤发展和进展的分子机制提供了独特机会 | NA | 探讨单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用 | 肿瘤微环境及其与单细胞测序的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组，转录组和表观基因组 | NA |
| 13755 | 2024-08-04 |
Examining the function of macrophage oxidative stress response and immune system in glioblastoma multiforme through analysis of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288137
PMID:38274828
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研究论文 | 该论文探讨了巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的氧化应激反应和免疫系统的功能 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞在胶质母细胞瘤微环境中的中心角色及其潜在的极化机制 | 对现有巨噬细胞在胶质母细胞瘤作用机制的理解仍然有限 | 旨在重新定义胶质母细胞瘤肿瘤核心和周边区域内的细胞景观 | 研究对象为胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及其相关亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 13756 | 2024-08-04 |
Genetic and immunological insights into COVID-19 with acute myocardial infarction: integrated analysis of mendelian randomization, transcriptomics, and clinical samples
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286087
PMID:38022594
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19与急性心肌梗死之间的遗传和免疫学关联 | 采用两样本孟德尔随机化和机器学习发现TLR4和ABCA1作为相关性中心基因，具有高诊断价值 | 未能确认COVID-19与急性心肌梗死之间的直接因果关系 | 理解COVID-19与急性心肌梗死之间的分子机制 | 研究COVID-19患者中急性心肌梗死的遗传和免疫特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组数据, 临床血样本 | 在研究中包含了多样本的RNA-seq数据和临床血液样本 |
| 13757 | 2024-08-07 |
Crosstalk of disulfidptosis-related subtypes, establishment of a prognostic signature and immune infiltration characteristics in bladder cancer based on a machine learning survival framework
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1180404
PMID:37152941
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研究论文 | 本研究探讨了胱硫醚病相关基因（DRGs）对膀胱癌（BLCA）预后的影响，并开发了一种基于机器学习生存框架的预测模型，用于评估患者的预后、免疫特征和治疗反应 | 本研究首次将胱硫醚病相关基因与膀胱癌的预后和免疫浸润特征联系起来，并开发了一种新的预测模型 | NA | 研究胱硫醚病相关基因在膀胱癌中的作用，并开发一种新的预测模型以指导临床管理和个性化治疗 | 膀胱癌患者及其胱硫醚病相关基因的表达和突变特征 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-Seq数据 | 三个膀胱癌队列 |
| 13758 | 2024-08-07 |
Spatial modelling of the tumor microenvironment from multiplex immunofluorescence images: methods and applications
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288802
PMID:38179056
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研究论文 | 本文探讨了通过多重免疫荧光（mIF）图像的空间建模方法来研究肿瘤微环境（TME）中的细胞相互作用及其在临床应用中的潜力 | 本文引入了多种数学模型，这些模型最初用于景观生态学和地理信息研究，现在应用于肿瘤微环境分析，以评估细胞群的空间聚集性 | NA | 提高基于免疫疗法的临床试验的成功率 | 肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光（mIF） | 数学模型 | 图像 | 组织样本来自基线和治疗期间不同时间点的患者 |
| 13759 | 2024-08-07 |
An integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome and bidirectional mendelian randomization analysis identified C1Q as a novel stimulated risk gene for Atherosclerosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1289223
PMID:38179058
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量转录组数据，并使用双向孟德尔随机化分析，确定了C1Q作为动脉粥样硬化的新风险基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定了C1Q相关的关键基因，并使用双向孟德尔随机化分析验证了C1Q与动脉粥样硬化的关联 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定C1Q相关的关键基因，以更有效地诊断和预测动脉粥样硬化患者，并研究C1Q与动脉粥样硬化（缺血性中风）的关联 | C1Q相关基因在人类动脉粥样硬化斑块中的作用 | 基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自RAW264.7巨噬细胞和apoE-/-小鼠的样本 |
| 13760 | 2024-08-07 |
Deciphering Cell Fate Decision by Integrated Single-Cell Sequencing Analysis
2020-07, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
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综述 | 本文综述了通过综合单细胞测序分析来解读细胞命运决策的方法和工具 | 介绍了利用单细胞RNA测序和其他测序模式来阐明谱系特化的分子基础，并讨论了计算工具在重建谱系轨迹、量化细胞命运偏倚和进行数据降维可视化方面的新机制见解 | NA | 深入理解细胞命运选择在发育、再生、稳态和疾病中的调控机制 | 细胞分化过程及其在健康和疾病中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |