单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 13641 - 13660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13641 | 2024-08-07 |
Single Cell ADNP Predictive of Human Muscle Disorders: Mouse Knockdown Results in Muscle Wasting
2020-Oct-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9102320
PMID:33086621
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，探讨了ADNP蛋白在人类肌肉疾病中的作用及其治疗潜力 | 首次通过单细胞转录组学揭示ADNP在人类肌肉发育和疾病中的关键作用，并验证了ADNP片段NAP的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体试验验证 | 探究ADNP在肌肉疾病中的作用及开发个性化诊断和治疗方法 | ADNP蛋白及其在肌肉疾病中的作用 | NA | 肌肉疾病 | 单细胞转录组学 | CRISPR-Cas9 | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和人类肌肉细胞 |
| 13642 | 2024-08-07 |
Developmental scRNAseq Trajectories in Gene- and Cell-State Space-The Flatworm Example
2020-10-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11101214
PMID:33081343
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，结合自组织映射机器学习方法，研究了扁形动物组织发育过程中的基因状态空间轨迹，并生成了RNA速度的发育“矢量场”，以预测表达景观中RNA丰度的变化。 | 本文创新性地将细胞状态空间的发展轨迹与基因状态空间的轨迹相结合，更清晰地揭示了细胞发育过程中转录程序的变化。 | NA | 研究细胞发育过程中转录程序的变化，并预测RNA丰度的变化。 | 扁形动物的组织发育。 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 自组织映射 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 13643 | 2024-08-07 |
Stem cells and lung regeneration
2020-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00036.2020
PMID:32783658
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综述 | 本文综述了干细胞在肺再生中的应用，讨论了已知的干细胞/祖细胞群体及其在慢性肺病中的作用和治疗前景 | 介绍了新的谱系追踪动物模型和单细胞RNA测序技术，这些技术提供了关于干细胞亚型、过渡状态、细胞标记物和复杂分化途径的关键信息 | 对人类肺发育机制、肺干细胞和祖细胞类型的精确身份和功能以及肺命运的遗传和表观遗传控制的理解仍有限 | 探讨干细胞在肺再生中的应用，以及如何利用内源性干细胞作为治疗肺疾病的方法 | 人类肺干细胞和祖细胞类型及其在肺再生和慢性肺病中的作用 | NA | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 13644 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific promoters for C. elegans glia
2020 Sep-Dec, Journal of neurogenetics
IF:1.8Q4
DOI:10.1080/01677063.2020.1781851
PMID:32696701
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研究论文 | 本文比较了C. elegans神经胶质细胞类型特异性启动子的特异性、亮度和一致性 | 本文识别了一组用于研究七种神经胶质细胞类型的启动子，并展示了一种利用现有单细胞测序数据前瞻性识别细胞类型特异性神经胶质启动子的方法 | 一些启动子的表达依赖于外部条件或生物体的内部状态，如发育阶段，这表明神经胶质的可塑性 | 旨在解码神经胶质功能 | C. elegans的神经胶质细胞类型特异性启动子 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 七种神经胶质细胞类型 |
| 13645 | 2024-08-07 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
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研究论文 | 本文开发了一种螺旋微血管模型，能够精确控制曲率和扭转，并支持厘米尺度上的均匀组织灌注 | 首次展示了3D曲率诱导的旋转和混合在层流中的作用，以及对内皮细胞表型和转录变化的独特影响 | NA | 探讨异质性血管结构在不同发育和发病机制中的作用，并提供改进组织血管化和再生的工具 | 内皮细胞在螺旋微血管中的基因表达和表型变化 | 生物工程 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13646 | 2024-08-07 |
Integrative analyses of single-cell transcriptome and regulome using MAESTRO
2020-08-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02116-x
PMID:32767996
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MAESTRO的综合开源计算工作流程，用于整合来自多个平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | MAESTRO通过在单细胞水平上建模基因调控潜力，改进了现有方法在scRNA-seq和scATAC-seq之间整合细胞簇的性能 | NA | 开发一种新的计算工作流程，用于整合和分析单细胞转录组和调控组数据 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据，调控组数据 | NA |
| 13647 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Spike Protein Interacts with Multiple Innate Immune Receptors
2020-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.07.29.227462
PMID:32766577
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2的刺突蛋白与多种先天免疫受体的相互作用 | 首次展示了SARS-CoV-2刺突蛋白通过其糖基化与多种先天免疫受体相互作用 | NA | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与先天免疫受体的相互作用及其在治疗干预中的潜在应用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与先天免疫受体的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13648 | 2024-08-07 |
Genome-wide studies reveal the essential and opposite roles of ARID1A in controlling human cardiogenesis and neurogenesis from pluripotent stem cells
2020-07-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02082-4
PMID:32646524
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研究论文 | 本文报道了ARID1A在人类胚胎干细胞中调控神经发生和心脏发生的相反作用 | 首次揭示了ARID1A在人类胚胎干细胞中调控心脏发生和神经发生的分子机制 | NA | 探究ARID1A在人类胚胎干细胞中调控心脏发生和神经发生的分子机制 | 人类胚胎干细胞中的心脏发生和神经发生 | 干细胞生物学 | 先天性心脏缺陷 | scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 人类胚胎干细胞 |
| 13649 | 2024-08-07 |
Circulating immune cell phenotype dynamics reflect the strength of tumor-immune cell interactions in patients during immunotherapy
2020-07-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918937117
PMID:32571915
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研究论文 | 研究探讨了免疫治疗期间外周血免疫细胞表型动态变化与肿瘤内免疫活性的关系 | 通过生态种群模型和单细胞RNA测序分析，揭示了响应患者中肿瘤与循环免疫细胞的强相互作用及其表型变化 | 研究仅限于胃肠道癌症患者，且样本来自单一临床试验 | 探讨外周血免疫细胞表型在癌症治疗前后及早期如何反映肿瘤内免疫活性 | 胃肠道癌症患者在接受化疗和免疫治疗期间的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | 生态种群模型 | 临床数据和基因组数据 | 一批晚期胃肠道癌症患者 |
| 13650 | 2024-08-07 |
Integrated Transcriptome and Network Analysis Reveals Spatiotemporal Dynamics of Calvarial Suturogenesis
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107871
PMID:32640236
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研究论文 | 本研究通过综合转录组和网络分析，揭示了颅骨缝合生成的时空动态特征 | 本研究首次在组织和单细胞水平上对小鼠额缝进行了胚胎日E16.5和E18.5的转录组分析，并结合共表达网络分析，验证了调控成骨细胞分化的关键驱动基因 | NA | 研究颅面异常中涉及的缝合组织的发育机制 | 小鼠额缝及其在Saethre-Chotzen和Apert综合征中的模型 | 数字病理学 | 颅面异常 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠额缝组织和单细胞样本 |
| 13651 | 2024-08-07 |
Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation
2020-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02058-4
PMID:32611441
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研究论文 | 本研究利用人多能干细胞分化系统和单细胞转录组学在体外重现内皮-造血转化过程，并揭示了内皮细胞如何生成早期造血细胞的机制 | 首次揭示了细胞周期调控在内皮-造血转化中的关键作用，特别是CDK4/6和CDK1在转化过程中的重要作用 | 研究主要基于体外模型，可能与人体内的实际情况存在差异 | 探究内皮-造血转化的分子机制 | 内皮细胞和造血干细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 13652 | 2024-08-07 |
Artificial-cell-type aware cell-type classification in CITE-seq
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa467
PMID:32657383
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研究论文 | 本文提出了一种名为CITE-sort的人工细胞类型感知表面标记聚类方法，用于CITE-seq数据中的细胞类型分类 | CITE-sort能够识别并分离由多重细胞引起的人工细胞类型，提高了细胞表面表型的自动化分析准确性 | NA | 旨在解决CITE-seq数据中多重细胞导致的人工细胞类型问题，提高细胞类型分类的准确性 | CITE-seq数据中的细胞类型分类 | 单细胞测序 | NA | CITE-seq | 聚类方法 | 单细胞转录组数据 | 使用了真实和模拟的CITE-seq数据集进行验证 |
| 13653 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals profibrotic roles of distinct epithelial and mesenchymal lineages in pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1972
PMID:32832598
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺纤维化中不同上皮和间质细胞系的促纤维化作用 | 发现了在肺纤维化中，外周肺上皮细胞表型的显著变化，并识别出几种先前未被认识的上皮细胞表型，包括在肺纤维化中高度富集的病理性和产生细胞外基质的上皮细胞群体 | NA | 全面定义驱动肺纤维化中纤维化重塑的细胞类型、机制和介质 | 肺纤维化中的上皮和间质细胞系 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10个非纤维化对照肺和20个肺纤维化肺的单细胞悬液，共分析了114,396个细胞 |
| 13654 | 2024-08-07 |
Discovery of CD80 and CD86 as recent activation markers on regulatory T cells by protein-RNA single-cell analysis
2020-06-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00756-z
PMID:32580776
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，同时定量单细胞中的mRNA和蛋白质表达，以解析人类免疫细胞群体的异质性 | 首次使用多组学方法在单细胞水平上同时检测mRNA和蛋白质表达，并发现了CD80和CD86作为调节性T细胞的近期激活标志 | NA | 研究旨在通过多组学方法解析人类免疫细胞群体的异质性 | 人类初级CD4+ T细胞及其分化轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和抗体偶联的寡核苷酸（AbSeq） | NA | mRNA和蛋白质 | 43,656个初级CD4+ T细胞和31,907个CD45+细胞 |
| 13655 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic and anatomic atlas of mouse dorsal raphe Pet1 neurons
2020-06-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55523
PMID:32568072
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研究论文 | 本文通过高吞吐量和针对背侧中缝核（DR）亚域的单细胞转录组学以及交叉遗传工具，绘制了DR-Pet1神经元的分子和解剖多样性图谱 | 本文描述了多达十四种神经元亚型，其中许多显示出偏向于DR的细胞体分布，并展示了DR神经元的独特传出投射和电生理特性 | NA | 旨在通过分子异质性的表征及其与解剖结构的关联，理解背侧中缝核的功能组织，并为治疗情感障碍提供潜在的疗法信息 | 小鼠背侧中缝核中的Pet1神经元 | 数字病理学 | 情感障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 13656 | 2024-08-07 |
Deconvolution of bulk blood eQTL effects into immune cell subpopulations
2020-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03576-5
PMID:32532224
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Decon2的新方法，用于从批量血液样本中估计细胞比例并解卷积细胞类型eQTL效应 | Decon2方法能够从批量血液eQTL中检测细胞类型交互效应，为确定特定复杂疾病最相关的细胞类型提供了有效手段 | NA | 开发一种新方法来解释疾病相关遗传风险因素的功能，并揭示eQTL调控效应的细胞类型背景 | 批量血液样本中的细胞类型eQTL效应 | 遗传学 | NA | eQTL分析 | Decon2 | 表达谱 | 3194个样本 |
| 13657 | 2024-08-07 |
Dermal Adipocyte Lipolysis and Myofibroblast Conversion Are Required for Efficient Skin Repair
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.03.013
PMID:32302523
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研究论文 | 本文探讨了皮肤中的脂肪细胞在损伤后炎症反应和修复过程中的关键作用 | 首次揭示了皮肤脂肪细胞通过脂解作用调节炎症和修复的机制，并发现脂肪细胞能转变为产生细胞外基质的肌成纤维细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究脂肪细胞在皮肤组织稳态和修复中的作用 | 皮肤中的脂肪细胞及其在损伤后的功能 | NA | NA | 遗传学实验、组织学、超微结构分析、脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠 |
| 13658 | 2024-08-07 |
Targeted Perturb-seq enables genome-scale genetic screens in single cells
2020-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0837-5
PMID:32483332
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研究论文 | 本文介绍了一种名为targeted Perturb-seq（TAP-seq）的新方法，该方法通过聚焦单细胞RNA测序覆盖感兴趣的基因，显著提高了遗传筛选的灵敏度和规模 | TAP-seq是一种敏感、低成本且平台独立的方法，能够在一个实验中常规分析数千个CRISPR介导的扰动，检测弱效应和低表达基因，并将测序需求减少高达50倍 | NA | 克服单细胞转录组学在遗传筛选中的实验和统计限制 | 单细胞转录组学中的遗传筛选 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | CRISPR | 转录组 | 1,778个增强子在人类基因组的2.5%范围内 |
| 13659 | 2024-08-07 |
Application of information theoretical approaches to assess diversity and similarity in single-cell transcriptomics
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.05.005
PMID:32728406
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综述 | 本文综述了16种信息论方法在单细胞转录组数据中评估多样性和相似性的应用 | 总结了16种信息论方法，并提供了一个R包来辅助研究者进行单细胞转录组研究 | NA | 探讨信息论方法在单细胞转录组数据多样性和相似性评估中的应用 | 单细胞转录组数据的多样性和相似性 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13660 | 2024-08-07 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Vaccinology
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8624963
PMID:32802896
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在预防性疫苗开发中的应用，特别是针对传染病如COVID-19 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析细胞免疫反应，为系统免疫学的新时代提供了可能性 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在疫苗学中的应用 | 单细胞RNA测序技术在预防性疫苗开发中的应用，特别是针对传染病 | 数字病理学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限体积的样本 |