单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价10元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 27574 篇文献,本页显示第 13601 - 13620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
13601 2024-08-07
Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology
2021-01-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
research paper 本文介绍了Aging Atlas数据库,这是一个多组学数据库,旨在支持衰老生物学研究。 Aging Atlas数据库整合了多种高通量组学技术产生的基因表达和调控数据,为衰老研究提供了前所未有的详细和多维度的数据资源。 NA 本文的研究目的是建立一个开放且集成的数据库,以支持广泛的衰老生物学研究。 研究对象包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和药物基因组学等多组学数据。 生物信息学 NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 药物保护化合物分析 NA 基因表达数据 NA
13602 2024-08-07
A cell atlas of the chick retina based on single-cell transcriptomics
2021-01-04, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了鸡视网膜的细胞图谱 首次在鸟类中进行分子层面的视网膜细胞类型鉴定,并比较了鸡、鼠和灵长类视网膜细胞类群和类型的关系 NA 揭示鸡视网膜的细胞结构和功能,并为鸟类视觉系统的解剖学、生理学、进化和发育研究提供基础 鸡视网膜的细胞类型及其分布 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 136种细胞类型及14种位置或发育中间体
13603 2024-08-07
scMC learns biological variation through the alignment of multiple single-cell genomics datasets
2021-01-04, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scMC的方法,用于在整合和比较不同实验的单细胞基因组数据集时,区分并保留生物学变异,同时去除技术变异 scMC方法通过方差分析学习生物学变异,以无监督方式推断并去除技术变异,从而能够准确对齐并检测共享和特定上下文的生物信号 NA 开发一种方法,能够在整合单细胞基因组数据时,有效区分并保留生物学变异,去除技术变异 单细胞RNA测序和ATAC测序实验的数据集 基因组学 NA 单细胞RNA测序(RNA-seq)和ATAC测序 NA 基因组数据 NA
13604 2024-08-07
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal wall in women with severe anterior vaginal prolapse
2021-01-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术构建了前阴道壁的转录组图谱,并分析了前阴道脱垂(AVP)中的细胞类型和基因表达异常 首次构建了前阴道壁的单细胞转录组图谱,并揭示了AVP中的细胞异质性和分子机制 NA 揭示前阴道脱垂(AVP)的细胞异质性和分子机制 前阴道壁的单细胞转录组 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组 81,026个单细胞样本
13605 2024-08-07
Transcriptional and morphological profiling of parvalbumin interneuron subpopulations in the mouse hippocampus
2021-01-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,对形态学上已鉴定的小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元(PV-INs)进行了转录组状态的分析 研究首次结合形态学信息和转录组数据,探讨了PV-INs在形态学、生理学和发展领域的转录组状态 研究主要集中在PV-INs的转录组分析,未涉及其他神经元类型的比较 探讨神经元身份是否可以从遗传信息中推断出来,并分析PV-INs的转录组和形态学特征 小鼠海马体中的parvalbumin中间神经元(PV-INs) 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
13606 2024-08-07
The scRNA-seq Expression Profiling of the Receptor ACE2 and the Cellular Protease TMPRSS2 Reveals Human Organs Susceptible to SARS-CoV-2 Infection
2021-01-02, International journal of environmental research and public health
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平,评估了SARS-CoV-2感染的风险 首次发现胆囊和输卵管易受SARS-CoV-2感染,并对易感器官进行了风险分级 NA 深入理解SARS-CoV-2的病理机制 31个器官中ACE2和TMPRSS2的表达水平 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 31个器官的细胞类型
13607 2024-08-07
Statistical and Bioinformatics Analysis of Data from Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Experiments
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
review 本文综述了在处理、质量控制和分析批量及单细胞RNA测序数据时使用的各种生物信息学和统计方法 NA NA 探讨高吞吐量测序技术在研究人类转录组,特别是与癌症相关的应用 批量和单细胞RNA测序数据 生物信息学 癌症 RNA测序 NA RNA NA
13608 2024-08-07
KLF4 (Kruppel-Like Factor 4)-Dependent Perivascular Plasticity Contributes to Adipose Tissue inflammation
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 研究探讨了KLF4依赖的周围血管可塑性对脂肪组织炎症的贡献 首次揭示了KLF4在周围血管细胞中的作用,及其对饮食诱导肥胖相关脂肪组织炎症和代谢功能障碍的影响 研究使用了特定的转基因小鼠模型,结果的普遍性和适用性可能受限 验证周围血管细胞在KLF4依赖性条件下转化为类似巨噬细胞的细胞,从而加剧脂肪组织炎症和代谢功能障碍的假设 周围血管细胞、脂肪组织炎症、代谢功能障碍 NA 肥胖 流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 细胞 使用了Myh11-CreERT2 eYFP小鼠和Myh11-DreERT2tdTomato小鼠进行实验
13609 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous tumor and immune cell populations in early-stage lung adenocarcinomas harboring EGFR mutations
2021-01, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了携带EGFR突变的早期肺腺癌中的肿瘤和免疫细胞异质性 首次在单细胞分辨率下探讨了携带EGFR突变的早期肺腺癌的肿瘤内和肿瘤间异质性 NA 揭示早期肺腺癌中肿瘤细胞、基质细胞和免疫浸润细胞之间的复杂相互作用 携带EGFR突变的早期肺腺癌样本及其邻近肺组织 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 125,674个细胞,来自7个早期肺腺癌样本和5个肿瘤邻近肺组织
13610 2024-08-07
Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts
2021-01, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本文通过比较小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据,揭示了再生纤维母细胞在伤口诱导的毛囊新生中的不同空间组织。 发现了在再生伤口条件下过度表达Crabp1蛋白的新型上部伤口纤维母细胞,并提供了计算测试来映射这些细胞在大伤口中的空间位置。 NA 研究大伤口中更具再生能力的真皮细胞和分子成分,以及纤维母细胞系在伤口诱导的毛囊新生中的作用。 小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个样本
13611 2024-08-07
Transcript assembly improves expression quantification of transposable elements in single-cell RNA-seq data
2021-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文建立了一个适用于多种技术平台生成的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的转座元件(TE)表达定量流程 首次开发了针对TE的scRNA-seq定量工具,提高了TE表达量测定的准确性 NA 解决目前缺乏针对TE的scRNA-seq定量工具的问题,以解析单细胞分辨率的TE表达动态 转座元件(TE)及其在单细胞RNA测序数据中的表达 RNA测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 包括小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育阶段的scRNA-seq数据
13612 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals regulation of fetal ovary development in the monkey (Macaca fascicularis)
2020-Dec-29, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了12,471个来自整个胎儿卵巢的细胞,探讨了原始生殖细胞与微环境细胞之间的相互作用 首次在单细胞分辨率下描绘了胎儿卵巢发育的两个生发波,并发现ZGLP1在猴子和老鼠中的表达模式不同,表明其在灵长类动物中可能参与减数分裂的进入而非激活生发程序 NA 揭示灵长类动物胎儿卵巢发育的分子和细胞基础 胎儿卵巢中的原始生殖细胞和微环境细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 12,471个细胞
13613 2024-08-07
Gamete binning: chromosome-level and haplotype-resolved genome assembly enabled by high-throughput single-cell sequencing of gamete genomes
2020-12-29, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文开发了一种基于单细胞测序的配子分箱方法,用于生成异源合子基因组的染色体水平和单体型解析的基因组组装 提出了配子分箱方法,通过单细胞测序的单倍体配子实现全基因组测序读数的单体型特异性读数集分离 NA 解决生成异源合子基因组的染色体水平和单体型解析组装的挑战 异源合子基因组的染色体水平和单体型解析组装 基因组学 NA 单细胞测序 NA 基因组数据 445个单个花粉粒
13614 2024-08-07
Glioblastoma epigenome profiling identifies SOX10 as a master regulator of molecular tumour subtype
2020-12-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过多组学分析60个胶质母细胞瘤原发肿瘤,识别出38个亚型主调控因子,并发现SOX10作为RTK I亚型肿瘤的主调控因子 首次识别出SOX10作为RTK I亚型胶质母细胞瘤的主调控因子,并展示了其在肿瘤细胞内在和微环境中的作用 NA 识别胶质母细胞瘤亚型的主调控因子 胶质母细胞瘤 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 60个胶质母细胞瘤原发肿瘤样本
13615 2024-08-07
NDRindex: a method for the quality assessment of single-cell RNA-Seq preprocessing data
2020-Dec-16, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文提出了一种名为NDRindex的方法,用于评估单细胞RNA测序预处理数据的质量 NDRindex方法通过计算数据聚集程度来衡量聚类前的数据质量,填补了预处理路径选择上的空白 NA 旨在评估单细胞RNA测序预处理数据的质量 单细胞RNA测序数据 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 五个单细胞RNA测序数据集
13616 2024-08-07
Using DenseFly algorithm for cell searching on massive scRNA-seq datasets
2020-Dec-16, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文探讨了使用DenseFly算法在单细胞RNA测序数据集中进行细胞搜索的可行性 DenseFly算法受果蝇嗅觉系统的启发,是一种局部敏感哈希算法,在分类任务中优于FlyHash和SimHash等基准方法 NA 开发一种基于DenseFly算法的方法,用于跨单细胞RNA测序数据集的细胞映射 单细胞RNA测序数据集中的细胞搜索 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 DenseFly算法 高维数据 大规模
13617 2024-08-07
scTenifoldNet: A Machine Learning Workflow for Constructing and Comparing Transcriptome-wide Gene Regulatory Networks from Single-Cell Data
2020-Dec-11, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 本文介绍了一种基于主成分回归、低秩张量近似和流形对齐的机器学习工作流程scTenifoldNet,用于从单细胞RNA测序数据构建和比较单细胞基因调控网络(scGRNs) scTenifoldNet通过比较构建的scGRNs揭示样本间基因表达的调控变化,并能在实际数据中识别与不同生物过程相关的特定基因表达程序 NA 开发一种新的机器学习工作流程,用于从单细胞数据构建和比较转录组范围的基因调控网络 单细胞基因调控网络的构建和比较 机器学习 NA 单细胞RNA测序 主成分回归、低秩张量近似、流形对齐 单细胞RNA测序数据 NA
13618 2024-08-07
Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks Underlying Murine Neonatal Heart Regeneration at Single-Cell Resolution
2020-12-08, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究探讨了小鼠新生心脏在心肌梗塞后不同时间点的单细胞转录反应,通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示了心脏再生过程中的基因调控网络。 首次在单细胞分辨率下揭示了新生小鼠心脏再生过程中的细胞类型特异性基因调控网络和开放染色质景观的动态变化。 NA 阐明小鼠新生心脏在心肌梗塞后的转录反应,并探索增强心脏功能的治疗策略。 小鼠新生心脏在心肌梗塞后的不同细胞类型及其转录反应。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞数据 多个时间点的小鼠新生心脏样本
13619 2024-08-07
Single-cell transcriptome profiling of an adult human cell atlas of 15 major organs
2020-12-07, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组测序技术,构建了一个包含15个主要器官的成人人类细胞图谱 首次系统地描绘了成人多个器官的单细胞转录组图谱,并发现了新的细胞亚型和标记基因 研究仅基于一个成人捐赠者的样本,可能存在个体差异的影响 揭示人体器官细胞的异质性及其调控网络,为理解健康和疾病相关的生物学机制提供基础 成人15个主要器官的细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 84,363个细胞,来自一个成人捐赠者的15个组织器官
13620 2024-08-07
Three-Dimensional Human Alveolar Stem Cell Culture Models Reveal Infection Response to SARS-CoV-2
2020-12-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文开发了一种无饲养层、长期的三维(3D)培养技术,用于从人肺组织中提取的人肺泡II型细胞(hAT2),并研究了其对SARS-CoV-2感染的反应 首次开发了一种无饲养层的三维培养技术,用于长期培养hAT2细胞,并揭示了SARS-CoV-2感染后的快速病毒复制和免疫反应 NA 研究SARS-CoV-2在hAT2细胞中的发病机制,并为呼吸系统疾病提供3D hAT2培养模型 人肺泡II型细胞(hAT2)及其对SARS-CoV-2感染的反应 数字病理学 呼吸系统疾病 三维(3D)培养技术 NA 图像和单细胞转录组 从人肺组织中提取的hAT2细胞
回到顶部