单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 13581 - 13600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13581 | 2024-08-07 |
Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2024-Feb-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030529
PMID:38540141
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研究论文 | 本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能 | 本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色 | 评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13582 | 2024-08-04 |
A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Feb-26, Biology
DOI:10.3390/biology13030145
PMID:38534415
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研究论文 | 这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况 | 本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别 | 这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性 | 旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制 | 研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13583 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment
2024-Feb-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030506
PMID:38540119
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研究论文 | 本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应 | NA | 提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针 | 脑肿瘤微环境的转录组结构 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 六种脑肿瘤类型的细胞群体 |
| 13584 | 2024-08-04 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
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研究论文 | 本研究揭示了SPINK1在肝细胞癌治疗抵抗中的作用 | 首次阐明了SPINK1在肝细胞癌化疗抵抗中的关键角色，并确定其作为潜在治疗靶点 | 对SPINK1影响的机制理解仍然有限，尚需进一步的研究 | 探究SPINK1对肝细胞癌化疗抵抗的影响 | 肝细胞癌患者的细胞和组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 来自两个肝细胞癌队列的单细胞样本 |
| 13585 | 2024-08-04 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-Feb-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 该研究探讨了系统性红斑狼疮患者皮肤纤维母细胞的炎症反应与瘢痕生成之间的关系 | 揭示了系统性红斑狼疮纤维母细胞在炎症反应中的不同表现，为治疗皮肤损伤提供了新靶点 | 研究仅限于小样本量且主要集中在皮肤样本上 | 旨在理解红斑狼疮皮肤纤维母细胞的炎症机制及其在瘢痕疾病中的作用 | 对22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照的皮肤纤维母细胞进行分析 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照 |
| 13586 | 2024-08-04 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
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研究论文 | 本研究调查了在脓疱性汗腺炎（HS）皮损中B细胞的动态和微环境互动 | 首次在HS皮损中识别了三级淋巴结构，并描述了T细胞、B细胞、抗原呈递细胞和皮肤基质之间的有组织互动 | 本研究主要集中在皮损区域，未能广泛评估HS的全身反应 | 探讨B细胞在脓疱性汗腺炎发病机制中的作用及其微环境 | 研究了脓疱性汗腺炎患者皮损中B细胞的活动 | 数字病理学 | 脓疱性汗腺炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 涉及多个脓疱性汗腺炎皮损样本 |
| 13587 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上，可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 |
| 13588 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
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研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒（HCV）感染肝干细胞并干扰其正常功能，导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞，并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 |
| 13589 | 2024-08-04 |
Robust enhancer-gene regulation identified by single-cell transcriptomes and epigenomes
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100342
PMID:37492103
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组数据识别增强子与基因之间的调控关系 | 提出了一种基于非参数置换的程序，以控制增强子-基因关联研究中的假阳性风险 | 未提及具体的样本大小和多样性限制 | 研究如何通过单细胞测序数据实现增强子与基因的稳健链接 | 包括小鼠和人脑的多种组织的大规模转录组和表观基因组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13590 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后，并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 |
| 13591 | 2024-08-04 |
MediMer: a versatile do-it-yourself peptide-receptive MHC class I multimer platform for tumor neoantigen-specific T cell detection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294565
PMID:38239352
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MediMer的平台，用于肿瘤新抗原特异性T细胞的检测 | MediMer是一个多功能自制的pMHC-I多聚体平台，能够以较少的操作时间定制并生产用于个体化肿瘤患者的新抗原检测 | 未提及具体的局限性 | 提高针对个体肿瘤患者新抗原的T细胞受体的发现能力 | 主要研究人类抗原特异性T细胞，特别是针对黑色素瘤患者的新抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 重组MHC分子 | NA | 细胞 | 黑色素瘤患者血液样本中发现稀有T细胞亚群 |
| 13592 | 2024-08-07 |
A tumor microenvironment-specific gene expression signature predicts chemotherapy resistance in colorectal cancer patients
2021-Feb-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00142-x
PMID:33580207
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研究论文 | 本研究利用肿瘤微环境（TME）特异性基因表达特征来预测结直肠癌（CRC）患者的化疗耐药性 | 构建了一个名为SFM的特征，能够区分TME和药物敏感性，并通过K-means聚类在三个独立队列中验证 | NA | 研究TME特异性基因表达特征在预测结直肠癌化疗耐药性中的作用 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和化疗耐药性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | K-means聚类 | RNA测序数据 | 总共2269个'bulk' RNA测序数据集和四个单细胞RNA测序数据集 |
| 13593 | 2024-08-07 |
Mutated clones driving leukemic transformation are already detectable at the single-cell level in CD34-positive cells in the chronic phase of primary myelofibrosis
2021-Feb-04, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00144-9
PMID:33542466
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研究论文 | 研究通过单细胞基因组学和转录组学分析，揭示了原发性骨髓纤维化（PMF）向急性髓系白血病（AML）转化过程中的克隆演化和基因突变模式 | 首次在单细胞水平上检测到驱动白血病转化的突变克隆，并揭示了Ruxolitinib对干扰素信号的抑制作用及其免疫抑制效应 | 研究仅基于单一患者样本，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 探讨骨髓增生性肿瘤疾病进展的基因组复杂性，并评估单细胞分析在预测疾病演变和个性化治疗中的应用 | 原发性骨髓纤维化患者的CD34阳性细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞基因组学和转录组学 | NA | 基因组和转录组数据 | 单一患者样本 |
| 13594 | 2024-08-07 |
Clonal evolution in liver cancer at single-cell and single-variant resolution
2021-02-02, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01036-y
PMID:33531041
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研究论文 | 本文基于单细胞突变谱重构了人类肝癌的单变异分辨率克隆进化 | 首次重构了人类肝癌的单细胞和单变异克隆进化，并解析了遗传和表型异质性的关系 | NA | 研究肝癌的克隆进化及其与遗传和表型异质性的关系 | 人类肝癌的克隆进化及其遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞突变谱 | NA |
| 13595 | 2024-08-07 |
Tumour heterogeneity and intercellular networks of nasopharyngeal carcinoma at single cell resolution
2021-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21043-4
PMID:33531485
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序技术，分析了10对鼻咽癌肿瘤-血液样本中的176,447个细胞，揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，特别是发现了LAMP3树突状细胞、调节性T细胞和耗竭的CD8 T细胞之间的密集相互作用 | NA | 揭示鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，为鼻咽癌的精准治疗提供新的见解 | 鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 176,447个细胞来自10对鼻咽癌肿瘤-血液样本 |
| 13596 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
2021-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-00955-z
PMID:33526011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年小鼠造血干细胞的转录组，揭示了老化过程中造血干细胞分化和细胞周期的延迟现象 | 本研究首次在单细胞尺度上重新审视了小鼠造血干细胞在老化过程中的转录可塑性，并揭示了老化导致造血干细胞分化延迟的潜在机制 | NA | 探讨老化过程中造血干细胞的分化及细胞周期变化 | 小鼠的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15,000个年轻和老年小鼠的转录组 |
| 13597 | 2024-08-07 |
Melanoma Single-Cell Biology in Experimental and Clinical Settings
2021-Feb-01, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10030506
PMID:33535416
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术深入研究了恶性黑色素瘤的细胞异质性及其对治疗反应和耐药性的影响 | 揭示了免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的预后亚型，以及检查点抑制剂治疗耐药性的免疫细胞特征和新的可靶向的细胞内信号通路 | NA | 深入了解黑色素瘤的生物学特性，特别是肿瘤异质性和转录可塑性的作用 | 恶性黑色素瘤的单细胞生物学特性，包括免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13598 | 2024-08-07 |
Patient-tailored design for selective co-inhibition of leukemic cell subpopulations
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe4038
PMID:33608276
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研究论文 | 本文提出了一种基于机器学习的方法，通过结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为急性髓系白血病（AML）患者定制药物组合，以实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | 本文的创新点在于利用机器学习方法，结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为患者定制药物组合，实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | NA | 本文的研究目的是设计个性化组合治疗方案，以利用患者特定的治疗脆弱性，选择性地靶向驱动疾病的细胞亚群。 | 本文的研究对象是急性髓系白血病（AML）患者及其白血病细胞亚群。 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个诊断期和两个难治性急性髓系白血病（AML）患者病例 |
| 13599 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics following ischemic injury identifies a role for B2M in cardiac repair
2021-01-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01636-3
PMID:33514846
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，分析了心肌缺血损伤后不同时间点心脏主要细胞类型的基因表达数据，揭示了细胞和转录异质性及心脏重塑过程中的细胞功能变化 | 研究首次证实心肌细胞在缺血损伤后表达和分泌高水平的β2微球蛋白，通过旁分泌方式激活成纤维细胞，为心脏修复提供了新的治疗靶点 | NA | 深入理解心肌缺血损伤后修复过程中的细胞间信号传导机制，以促进治疗应用 | 心肌缺血损伤后的心脏修复过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同时间点的心脏主要细胞类型 |
| 13600 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SARS-CoV-2 infection dynamics in lungs of African green monkeys
2021-01-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe8146
PMID:33431511
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了非洲绿猴肺部SARS-CoV-2感染的动态过程 | 开发了新的分析方法，用于无偏倚地靶向宿主对SARS-CoV-2感染反应中的重要细胞 | NA | 揭示SARS-CoV-2感染的病毒和宿主因素，以及其在COVID-19发病机制中的作用 | 非洲绿猴肺部细胞及肺引流纵隔淋巴结细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非洲绿猴 |