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当前共找到 34800 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2025-12-14 |
CD9-positive tumor-associated macrophages promote renal cell carcinoma progression by activating the orphan nuclear receptor Nor1/Nr4a3
2025-Dec-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04060-x
PMID:41388297
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD9阳性肿瘤相关巨噬细胞通过激活孤儿核受体Nor1/Nr4a3促进肾细胞癌进展 | 首次在肾细胞癌肿瘤组织中鉴定出CD9巨噬细胞亚群，并揭示其通过激活Nor1/Nr4a3通路促进肿瘤发展的新机制 | 研究样本量较小（仅3例患者），且机制研究主要依赖体外和体内实验，临床验证不足 | 探究肾细胞癌肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用机制 | 肾细胞癌患者肿瘤组织、外周血免疫细胞及体外培养的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例肾细胞癌患者的肿瘤组织及匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1342 | 2025-12-14 |
Nuclear PD-L1 drives IFN-γ-promoted lung metastasis of triple-negative breast cancer via POLR2A-mediated transcriptional activation of LY6E
2025-Dec-12, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02193-5
PMID:41388312
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研究论文 | 本文揭示了核PD-L1通过POLR2A介导的LY6E转录激活，驱动IFN-γ促进的三阴性乳腺癌肺转移的新机制 | 发现了IFN-γ-核PD-L1/POLR2A-LY6E信号轴在TNBC肺转移中的关键作用，揭示了PD-L1在免疫检查点功能之外的转录调控新角色 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证有限，且机制细节如HDAC2介导的去乙酰化具体过程需进一步探索 | 探究PD-L1在免疫检查点功能之外对三阴性乳腺癌肺转移的影响及机制 | 三阴性乳腺癌细胞系（小鼠和人类）、免疫健全和免疫缺陷小鼠模型、TNBC患者样本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、染色质免疫沉淀测序、CRISPR/Cas9基因编辑、共免疫沉淀、生物信息学分析 | NA | 测序数据、蛋白质相互作用数据、体内实验数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及TNBC肺转移的scRNA-seq数据、细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 1343 | 2025-12-14 |
Orthologous genes of the red flour beetle Tribolium castaneum and the vinegar fly Drosophila melanogaster
2025-Dec-12, BMC genomic data
IF:1.9Q3
DOI:10.1186/s12863-025-01397-0
PMID:41388371
|
研究论文 | 本文通过OrthoFinder平台和eggNOG数据库分析，生成了赤拟谷盗和黑腹果蝇之间超过9,000个直系同源基因的列表，为比较基因组学研究提供资源 | 首次系统性地编译了赤拟谷盗和黑腹果蝇之间的直系同源基因列表，结合自动推断和手动系统发育树分析验证结果 | 分析基于参考蛋白质组数据，可能未涵盖所有基因变体或物种特异性基因 | 为赤拟谷盗和黑腹果蝇的比较基因组学和基因功能研究提供直系同源基因资源 | 赤拟谷盗和黑腹果蝇的基因组和蛋白质组数据 | 比较基因组学 | NA | 系统发育直系同源推断，手动系统发育树分析 | NA | 蛋白质组数据 | 两个物种的参考蛋白质组 | NA | NA | OrthoFinder平台，eggNOG 6.0数据库 | 使用OrthoFinder平台进行直系同源推断，结合eggNOG 6.0数据库进行结果评估 |
| 1344 | 2025-12-14 |
Multimodal analysis reveals potential association of CDH13 with endothelial cells and its overexpression in hepatocellular carcinoma
2025-Dec-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03667-0
PMID:41388436
|
研究论文 | 本研究通过多组学策略系统探讨了CDH13在肝细胞癌中的表达、调控机制及潜在功能 | 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9基因编辑等多模态方法，系统揭示了CDH13通过FOXA1-CDH13轴促进血管生成、免疫逃逸和代谢重编程的新机制 | 研究主要基于回顾性队列和体外细胞实验，缺乏前瞻性临床验证和体内动物模型实验 | 探索CDH13在肝细胞癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织样本、肝癌细胞系、内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 转录组学、蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫组化、CRISPR/Cas9基因编辑、ChIP-seq、WGCNA、GSVA、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 | 5145个HCC样本（mRNA分析），165个公共样本和476个临床配对样本（蛋白质分析），包括361个来自广西医科大学和115个来自玉林红十字医院的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1345 | 2025-12-14 |
Tumor-stromal crosstalk and macrophage enrichment are associated with chemotherapy response in bladder cancer
2025-Dec-12, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70179
PMID:41388608
|
研究论文 | 本研究通过功能性离体膀胱癌组织切片模型结合空间转录组学，揭示了肿瘤-基质相互作用和巨噬细胞富集与膀胱癌化疗反应的关系 | 首次使用功能性离体膀胱癌组织切片模型结合空间转录组学分析，发现SPP1基因作为潜在预测生物标志物，并揭示了巨噬细胞招募在化疗耐药中的新机制 | 样本量相对较小（n=64），且为离体模型，可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肿瘤-基质相互作用和巨噬细胞招募在膀胱癌化疗耐药中的作用机制 | 肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）患者组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 64个空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1346 | 2025-12-14 |
Systemic immune activity occurs during human immune system maturation
2025-Dec-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.10.003
PMID:41161316
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，分析了321个样本中2,868,420个免疫细胞，揭示了人类免疫系统在妊娠中期成熟过程中的系统性免疫活动 | 发现了胸腺外CD4 T细胞亚群介导TOX2前体细胞向成熟初始CD4 T细胞的转变，挑战了胎儿免疫静默的现有范式，揭示了跨器官共享的记忆/活化T细胞和驻留记忆克隆，并识别了两种抑制胎儿T细胞活化的耐受机制 | NA | 探究人类免疫系统在妊娠中期的成熟过程和耐受机制 | 人类胎儿和成人组织中的免疫细胞，包括23个器官的样本 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体测序数据 | 321个样本，涵盖23个器官，包括成人组织作为对照 | NA | 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 1347 | 2025-12-14 |
RoCK and ROI: single-cell transcriptomics with multiplexed enrichment of selected transcripts and region-specific sequencing
2025-Dec-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66248-z
PMID:41372142
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RoCK和ROI的单细胞转录组测序工作流程，通过靶向捕获和选择性引物技术增强关键转录本和特定区域的检测 | 开发了RoCKseq和ROIseq两种技术，能够在单细胞转录组测序中富集关键转录本并定向测序特定区域，同时不损害整体转录组信息 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 提高单细胞转录组测序中特定转录本和转录区域的检测率，以更好地理解细胞生物学 | 单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），靶向捕获，选择性引物 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1348 | 2025-12-14 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Dec-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101035
PMID:41061702
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于深度神经网络的方法DeepScence，用于在单细胞和空间转录组数据中准确识别衰老细胞 | 开发了DeepScence方法，结合了自建的衰老相关基因集CoreScence，在单细胞和空间转录组数据中显著优于现有方法 | NA | 研究衰老细胞的空间和分子特征 | 衰老细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 深度神经网络 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1349 | 2025-12-14 |
Protocol for reconstructing spatially aware receptor-TF-target signaling cascades using spatial transcriptomics
2025-Dec-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104237
PMID:41385380
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用SpaGRN框架从空间转录组学数据重建空间感知的受体-转录因子-靶标调控级联的协议 | 通过整合细胞外信号和空间依赖性，克服了传统方法忽视空间约束的局限，实现了信号通路的系统映射 | NA | 开发一种从空间转录组学数据推断基因调控网络的方法 | 复杂组织如发育胚胎和肿瘤中的信号通路 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 统计框架（SpaGRN） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1350 | 2025-12-14 |
Ketogenic diet impairs NK cell cytotoxic function in colorectal cancer liver metastasis by inducing ferroptosis via suppression of the p62-Keap1-Nrf2 pathway
2025-Dec-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103969
PMID:41385828
|
研究论文 | 本研究揭示了生酮饮食通过诱导铁死亡损害NK细胞功能，从而促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次阐明生酮饮食通过p62-Keap1-Nrf2通路诱导NK细胞铁死亡，进而促进癌症转移的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人体临床验证尚不充分 | 探究生酮饮食对结直肠癌肝转移及抗肿瘤免疫的影响 | 结直肠癌肝转移小鼠模型、NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、非靶向代谢组学、免疫荧光染色 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | 小鼠模型及患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1351 | 2025-12-14 |
Deep profiling of human T cells defines compartmentalized clones and phenotypic trajectories across blood and tonsils
2025-Dec-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.025
PMID:41308653
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序深入分析了人类T细胞在血液和扁桃体中的克隆分布和表型轨迹 | 首次大规模比较血液和扁桃体T细胞的单细胞数据，揭示了组织特异性克隆扩增模式和年龄相关的克隆共享变化 | 研究仅聚焦于扁桃体组织，未涵盖其他组织类型，样本量相对有限（10名捐赠者） | 探究T细胞在血液和组织中的分布差异及其对T细胞受体（TCR）库多样性的影响 | 人类T细胞，来自10名捐赠者的血液和扁桃体样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 570万个T细胞，来自10名捐赠者的血液和扁桃体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1352 | 2025-12-14 |
Multimodal mass spectrometry imaging for plaque- and region-specific neurolipidomics in Alzheimer's disease mouse models
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65956-w
PMID:41365882
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研究论文 | 本文开发了一种多模态质谱成像框架，用于研究阿尔茨海默病小鼠模型中斑块和区域特异性的神经脂质组学 | 整合了MALDI-2质谱成像、离子淌度谱和荧光显微镜，提高了检测能力和空间化学分辨率，并开发了多模态图像配准计算流程 | 研究仅使用雌性小鼠模型，且机制探索依赖于现有空间转录组数据的整合 | 探究阿尔茨海默病中Aβ斑块形成相关的脂质改变及其生化机制 | 雌性5xFAD和APP转基因小鼠的大脑组织 | 质谱成像 | 阿尔茨海默病 | MALDI-2质谱成像、离子淌度谱、荧光显微镜 | NA | 质谱成像数据、荧光图像 | 雌性5xFAD和APP小鼠（具体数量未明确） | NA | 质谱成像 | NA | NA |
| 1353 | 2025-12-14 |
Microbial production of short-chain fatty acids attenuates long-term neurologic impairment after traumatic brain injury
2025-Dec-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03615-z
PMID:41366428
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研究论文 | 本研究探讨了通过饮食促进微生物产生短链脂肪酸（SCFA）对创伤性脑损伤（TBI）后长期神经功能障碍的缓解作用及其单细胞水平的机制 | 首次在TBI模型中结合高SCFA饮食、纵向肠道微生物组分析和单细胞RNA测序，揭示了SCFA通过重塑肠道菌群、促进神经发生和抑制神经炎症来减轻长期神经损伤的机制 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；且仅关注了乙酸和丁酸，未涵盖其他SCFA；长期饮食干预的临床转化潜力需进一步验证 | 探究SCFA在TBI后长期神经功能障碍中的保护作用及其分子机制 | C57BL6/J小鼠，使用控制性皮质撞击（CCI）模型模拟TBI | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 16S rRNA扩增子测序、宏基因组测序、单细胞RNA测序 | 控制性皮质撞击（CCI）小鼠模型 | 测序数据、行为学数据、组织学数据 | C57BL6/J小鼠，具体数量未在摘要中明确，但涉及多个时间点（基线、1个月、6个月）的样本收集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 遵循10x Genomics协议进行单细胞RNA测序 |
| 1354 | 2025-12-14 |
Identification of a super enhancer associated gene signature for the prognosis prediction and regulatory mechanism exploration in breast cancer
2025-Dec-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26694-7
PMID:41360825
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研究论文 | 本研究构建了一个基于超级增强子相关基因的临床预测模型，用于乳腺癌患者的预后预测和调控机制探索 | 首次结合超级增强子相关基因、Cox回归和LASSO算法构建Super-Enhancer-Related Score (SERS)，并整合临床特征建立高精度预测模型，同时利用单细胞RNA测序数据深入探索调控机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅通过免疫组化确认了核心基因TFF1，缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 探索超级增强子相关基因对乳腺癌预后的影响及其潜在调控机制 | 乳腺癌患者与健康对照的基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | Cox回归、LASSO算法、机器学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1355 | 2025-12-14 |
Uncovering the prognostic implications and immunological roles of transmembrane protein 208 in bladder cancer by multi omics analysis and experimental verification
2025-Dec-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11796-z
PMID:41360826
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，探讨了跨膜蛋白208（TMEM208）在膀胱癌中的预后意义和免疫学作用 | 首次系统性地将TMEM208与膀胱癌的临床特征、免疫浸润、肿瘤微环境及细胞功能联系起来，并结合空间转录组学和单细胞测序技术进行验证 | 研究主要基于公共数据库（TCGA和GEO）的回顾性数据，需要更多前瞻性临床样本和体内实验进一步验证 | 揭示TMEM208在膀胱癌中的生物学功能、预后价值及作为治疗靶点的潜力 | 膀胱癌（BLCA） | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 多组学分析、基因集富集分析（GSEA）、免疫浸润分析、空间转录组学、单细胞测序、细胞实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、蛋白质相互作用数据 | TCGA数据库及15个GEO数据集中的膀胱癌样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 1356 | 2025-12-14 |
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046316
PMID:41366959
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 | 首次将PI3K/Akt/mTOR通路与宫颈癌肿瘤浸润免疫细胞联系起来，并利用单细胞RNA-seq技术鉴定出表达ACTR3的特定免疫细胞亚群 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认ACTR3在肿瘤微环境中的具体功能机制 | 确定ACTR3过表达是否影响宫颈癌患者生存，并探索其对肿瘤免疫微环境的影响 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌（CESC）患者 | 生物信息学 | 宫颈癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | LASSO Cox回归, 预后模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1357 | 2025-12-14 |
Safranal accelerates diabetic wound healing by suppressing ferroptosis through modulation of transcription factor Forkhead Box O3
2025-Dec-05, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157675
PMID:41385950
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研究论文 | 本研究探讨了藏红花醛通过抑制铁死亡促进糖尿病伤口愈合的机制 | 首次揭示藏红花醛通过FOXO3/SLC7A11通路抑制铁死亡来促进糖尿病伤口愈合 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化潜力尚需进一步验证 | 探索藏红花醛对糖尿病伤口愈合的治疗效果及其分子机制 | 糖尿病伤口模型、高糖刺激的人脐静脉内皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病并发症 | 单细胞测序、转录组分析、网络药理学、分子对接、基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1358 | 2025-12-14 |
Unveiling the genetic overlap and causal links between gastroesophageal reflux disease and asthma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003283
PMID:40932390
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研究论文 | 本研究通过遗传学方法揭示了胃食管反流病与哮喘之间的遗传重叠和因果联系 | 识别了GERD与哮喘之间新的共享遗传位点和候选基因，包括51个新发现的共享风险位点和3个新共享基因 | 研究基于GWAS汇总统计数据，可能受限于样本异质性和统计功效 | 探究胃食管反流病与哮喘之间的遗传关联和潜在因果机制 | 胃食管反流病和哮喘患者及对照人群的遗传数据 | 遗传学 | 胃食管反流病和哮喘 | GWAS, LDSC, Mendelian randomization, scRNA-seq | 统计遗传学模型 | 遗传汇总统计数据、单细胞RNA测序数据 | GERD: 71,522病例和261,079对照；哮喘: 56,167病例和352,255对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1359 | 2025-12-14 |
Homocysteine Exacerbates Pulmonary Fibrosis via Orchestrating Syntaxin 17 Homocysteinylation of Alveolar Type II Cells
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507803
PMID:40990430
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研究论文 | 本研究揭示了同型半胱氨酸通过诱导肺泡II型细胞中Syntaxin 17的同型半胱氨酸化，加剧肺纤维化的新机制 | 首次发现同型半胱氨酸通过STX17同型半胱氨酸化-泛素化级联反应，破坏自噬流并促进肺纤维化，建立了Hcy-STX17-蛋白质稳态轴 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，临床转化效果需进一步验证 | 探究高同型半胱氨酸血症在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者样本、小鼠模型、肺泡II型上皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 特发性肺纤维化患者与健康对照的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1360 | 2025-12-14 |
Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509351
PMID:40995682
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研究论文 | 本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞，从而加剧肾纤维化的分子机制 | 首次阐明了NAFLD通过肝脏来源的ANGPTL8远程调控肾脏特异性巨噬细胞亚群（CCR2+PIRB+），并破坏亚油酸代谢，从而加剧肾纤维化的跨器官信号轴 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类中的普适性有待验证；机制研究虽深入，但尚未进行临床干预试验 | 探究非酒精性脂肪肝病加剧肾纤维化的具体作用和分子机制 | 小鼠模型（UUO手术结合高脂饮食诱导的NAFLD）、原代肾脏巨噬细胞、共培养模型 | 单细胞组学与代谢组学 | 非酒精性脂肪肝病、慢性肾病 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、流式细胞术、免疫荧光 | 动物模型、细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型及细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |