单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 13541 - 13560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13541 | 2024-08-04 |
Crosstalk between alternative splicing and inflammatory bowel disease: Basic mechanisms, biotechnological progresses and future perspectives
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1479
PMID:37983927
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综述 | 这篇文章总结了替代剪接与炎症性肠病之间的关系，以及相关的生物技术进展和未来的前景 | 这是首个评估替代剪接事件在炎症性肠病中潜在调控机制的综述 | 文章未详细讨论所有潜在的异常剪接基因及其机制 | 探讨替代剪接在炎症性肠病发病机制中的作用 | 涉及炎症性肠病中的异常替代剪接事件及其相关分子 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 下一代测序（NGS）、微阵列、第三代测序（TGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 数据 | NA |
| 13542 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of multi-region resolves geospatial architecture and therapeutic target of endothelial cells in esophageal squamous cell carcinoma
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1487
PMID:37987158
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13543 | 2024-08-04 |
A unified pipeline for FISH spatial transcriptomics
2023-Sep-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100384
PMID:37719153
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研究论文 | 本文提出了一个名为PIPEFISH的统一分析管道，用于FISH空间转录组学的转录注释 | PIPEFISH是一个半自动化且可推广的管道，改进了已有的starfish库，以解决空间转录组学数据分析缺乏标准化工具的问题 | 该论文未提及PIPEFISH在特定情况下的性能限制或适用範围 | 旨在提供一种标准化的工具来分析FISH空间转录组学数据 | 使用PIPEFISH对来自三种不同FISH图像实验的真实数据集进行转录注释 | 数字病理学 | NA | FISH | NA | 图像 | 三个不同类型的FISH图像实验的真实数据集 |
| 13544 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the multiple patterns of immune escape in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1315
PMID:37349991
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研究论文 | 该研究揭示了鼻咽癌微环境中免疫逃逸的多种模式。 | 首次识别了特定于鼻咽癌微环境的CD8+自然杀伤细胞集群，并展示了肿瘤细胞中主要组织相容性复合体分子的丧失等免疫逃逸机制。 | 该技术未能捕捉到上皮/肿瘤细胞，限制了对肿瘤异质性和免疫逃逸的进一步研究。 | 分析鼻咽癌肿瘤细胞的转录组和空间特性。 | 鼻咽癌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA/snRNA-seq和成像质谱细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13545 | 2024-08-04 |
Prioritization of Monogenic Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract Candidate Genes with Existing Single-Cell Transcriptomics Data of the Human Fetal Kidney
2023, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000531770
PMID:37499630
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研究论文 | 本研究利用人类胎儿肾脏的单细胞转录组学数据，优先考虑单基因先天性肾脏和尿道异常（CAKUT）候选基因。 | 提出了通过时间轴上的共表达模式来优先选择CAKUT候选基因的独立方法，识别出新的CAKUT候选基因 | 仅分析了已知CAKUT基因的共表达，可能未考虑所有潜在的候选基因 | 优先考虑人类先天性肾脏和尿道异常的候选基因 | 已知的40个CAKUT基因及其在肾脏发育中的共表达模式 | 数字病理学 | 先天性肾脏和尿道异常 | 单细胞mRNA转录组学 | NA | RNA数据 | 研究了40个已知基因和100个在肾小管祖细胞中高表达的基因 |
| 13546 | 2024-08-04 |
Stemness-related genes revealed by single-cell profiling of naïve and stimulated human CD34+ cells from CB and mPB
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1175
PMID:36683248
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自脐带血和动员外周血的人类CD34+细胞中的干性相关基因 | 揭示了干性相关基因与细胞来源和培养时间的关系，并发现了小分子药物对扩展HSCs的有效性 | 本研究中样本数量相对较少，可能影响结果的普遍性 | 深入理解不同来源的造血干细胞的特性及其干性维持机制 | 脐带血和动员外周血的人类CD34+细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 超过16000个高质量单细胞数据 |
| 13547 | 2024-08-07 |
Cell Type- and Age-Specific Expression of lncRNAs across Kidney Cell Types
2024-Apr-15, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000354
PMID:38621182
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研究论文 | 本研究采用靶向单细胞RNA测序方法，分析了不同细胞类型和年龄阶段肾脏细胞中长非编码RNA（lncRNA）的表达情况 | 首次构建了不同细胞类型中lncRNA的转录组图谱，并探讨了lncRNA在肾脏老化中的功能角色 | lncRNA的功能仍不完全清楚，需要进一步的研究来阐明其在细胞分化和稳态中的具体作用 | 揭示lncRNA在肾脏细胞类型和年龄特异性表达中的作用 | 肾脏细胞中的长非编码RNA（lncRNA） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括正常和老龄小鼠的多种组织 |
| 13548 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03187-2
PMID:38589415
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 | 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集，有助于更好地理解失调的免疫反应 | NA | 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本，以及5份匹配的肝脏活检样本 |
| 13549 | 2024-08-04 |
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00738-y
PMID:38291129
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研究论文 | 本研究探讨了H3K9ac在食道鳞状细胞癌（ESCC）进展和转移中的特定作用 | 识别了ESCC中H3K9ac特异性的表观遗传重编程及其与肿瘤发生和转移的关系 | 仅分析了三个ESCC患者的样本，样本量较小 | 揭示H3K9ac在食道鳞状细胞癌进展和转移中的作用 | 食道鳞状细胞癌（ESCC）患者的配对正常组织、原发肿瘤和转移淋巴结组织 | 数字病理 | 食道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 3名食道鳞状细胞癌患者的配对样本 |
| 13550 | 2024-08-07 |
Granzyme K- and amphiregulin-expressing cytotoxic T cells and activated extrafollicular B cells are potential drivers of IgG4-related disease
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.916
PMID:38092138
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体及B细胞受体测序，全面、无偏倚地观察了IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞 | 首次揭示了Granzyme K和amphiregulin表达的细胞毒性T细胞及激活的外滤泡B细胞在IgG4相关疾病中的潜在驱动作用 | NA | 探索IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞的全面、无偏倚的视图 | IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞和B细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 68名IgG4相关疾病患者和30名Sjögren综合征患者 |
| 13551 | 2024-08-07 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究通过构建携带肿瘤的小鼠模型，探讨了放射治疗（RT）诱导的肿瘤微环境（TME）变化及其对肿瘤远处效应的影响机制 | 首次揭示了肿瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进I型干扰素分泌，增强CD8 T细胞的抗肿瘤免疫反应 | NA | 探究放射治疗诱导的肿瘤远处效应的详细机制 | 肿瘤微环境（TME）及其对肿瘤远处效应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光原位杂交（FISH） | NA | RNA | 携带肿瘤的小鼠模型 |
| 13552 | 2024-08-04 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-Mar-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
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研究论文 | 本研究提供了一种单细胞和单核转录组分析的新方法，适用于脑类器官的研究 | 通过使用单核而非完整细胞进行测序，克服了难以分离细胞类型的限制，使转录组分析具有更广泛的适用性 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在推动脑类器官研究中的单细胞转录组学应用 | 关注于脑类器官中的神经元和非神经元细胞类型 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13553 | 2024-08-04 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cell activity during biofilm infection is regulated by a glycolysis/HIF1a axis
2024-Feb-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174051
PMID:38421730
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研究论文 | 这篇文章探讨了糖酵解/HIF1a轴对粒细胞来源的抑制细胞在生物膜感染中的作用 | 该研究揭示了糖酵解和HIF1a在促进粒细胞来源抑制细胞抗炎活性和生物膜持续性中的重要性 | 文章未提及特定的实验局限性 | 研究糖酵解和HIF1a在生物膜相关的假体关节感染中的作用 | 粒细胞来源的抑制细胞与金黄色葡萄球菌假体关节感染的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 包括PJI患者的粒细胞样本 |
| 13554 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes ILC3s secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.29.555436
PMID:37693430
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研究论文 | 本文研究了间歇性禁食如何促进ILC3分泌IL-22，从而促进白色脂肪组织的变褐。 | 提出了ILC3/IL-22/IL-22R轴在间歇性禁食代谢益处中的作用机制。 | 未涉及潜在的临床转化和人类研究 | 探讨间歇性禁食对代谢益处的机制。 | 研究了小鼠肠道内的ILC3细胞和其对白色脂肪组织变褐的影响。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 饮食诱导肥胖小鼠 |
| 13555 | 2024-08-04 |
Intratumoral CXCR4hi neutrophils display ferroptotic and immunosuppressive signatures in hepatoblastoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363454
PMID:38487536
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研究论文 | 本研究发现肝母细胞瘤中的CXCR4高表达中性粒细胞表现出铁死亡和免疫抑制特征 | 揭示了肝母细胞瘤内不同发展阶段的中性粒细胞及其在肿瘤免疫抑制中的作用 | 未提及具体的临床试验数据或长期结果 | 探讨肝母细胞瘤中肿瘤浸润中性粒细胞的功能特征 | 肝母细胞瘤中的肿瘤浸润中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 研究中分析了不同发育阶段的中性粒细胞的样本 |
| 13556 | 2024-08-04 |
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1360687
PMID:38464521
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 | 通过GWAS和单细胞转录组学分析，揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 | 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 | 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 | 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序，基因组宽关联研究(GWAS) | NA | 基因表达数据 | 2,171名60岁以上的老年人 |
| 13557 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
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研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术（mIHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了结直肠癌（CRC）组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义，并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析，揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性，并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 |
| 13558 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
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研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库，鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1，并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物，并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制，并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 |
| 13559 | 2024-08-07 |
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363517
PMID:38562923
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞（MSCs）在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 | 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式，并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 | NA | 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 | 3D培养的人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞和批量RNA测序 | 机器学习预测模型 | RNA测序数据 | 使用了125种组合算法进行筛选，并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 |
| 13560 | 2024-08-07 |
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1364082
PMID:38562924
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研究论文 | 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响，并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 | 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系，并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 | NA | 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用，并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 | 头颈鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Lasso回归 | 基因数据 | 184个调控糖基化的基因 |