单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 13401 - 13420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13401 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 13402 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 13403 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
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综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现，包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA |
| 13404 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 13405 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 13406 | 2024-08-07 |
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6245
PMID:38229567
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研究论文 | 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 | 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未在临床试验中验证 | 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 | SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38个髓母细胞瘤组织样本 |
| 13407 | 2024-08-07 |
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912
PMID:38458566
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研究论文 | 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用，特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 | 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白，参与调节骨骼肌细胞外基质的组成，这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 | 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用，以及其作为治疗干预的潜力。 | 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 | 使用后肢卸载和重载的小鼠模型，研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 | NA | NA | qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 细胞外液蛋白组 | 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 |
| 13408 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2024-04-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57714-7
PMID:38561388
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于NK细胞标记基因的新型特征，用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证，未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证 | 旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征，为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 共分析了1560个样本 |
| 13409 | 2024-08-07 |
Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening
2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03027-6
PMID:38561797
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研究论文 | 本研究通过大规模CRISPRi筛选，识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子 | 发现了一系列遗传修饰因子，如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1，这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果，并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用 | NA | 提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效 | 胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CRISPRi筛选 | NA | RNA测序数据 | 大规模细胞系 |
| 13410 | 2024-08-07 |
Monocytes Release Pro-Cathepsin D to Drive Blood-to-Brain Transcytosis in Diabetes
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323622
PMID:38420756
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞释放的前胱天蛋白酶D在糖尿病中驱动血液到大脑的转胞吞作用中的作用 | 发现了循环中的前胱天蛋白酶D在糖尿病脑微血管病变发病机制中的新作用 | NA | 确定2型糖尿病进展中微血管并发症的潜在机制 | 人类单核细胞样本和表达人胱天蛋白酶D的转基因小鼠 | NA | 糖尿病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA | 控制组和糖尿病患者的单核细胞样本 |
| 13411 | 2024-08-07 |
Versican Promotes Cardiomyocyte Proliferation and Cardiac Repair
2024-03-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 首次揭示了versican作为心脏成纤维细胞来源的促进增殖的蛋白聚糖，并阐明了其在促进成年心脏修复中的作用 | NA | 探究versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 新生和成年小鼠的心脏 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、液相色谱-质谱分析、Western blot、免疫染色、定量逆转录聚合酶链反应、Masson三色染色、超声心动图 | NA | NA | 新生和成年小鼠 |
| 13412 | 2024-08-07 |
DESP demixes cell-state profiles from dynamic bulk molecular measurements
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100729
PMID:38490205
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research paper | 本文介绍了一种名为DESP的算法，该算法利用单细胞RNA测序等独立估计的细胞状态比例，解析细胞状态对批量分子测量（特别是定量蛋白质组学）的相对贡献 | DESP算法能够从批量分子测量中准确重建细胞状态特征，为研究细胞状态水平的蛋白质组和其他分子谱提供了一个可推广的计算框架 | NA | 开发一种算法，用于解析细胞状态对批量分子测量的贡献，并提供对细胞状态水平分子谱的研究方法 | 细胞状态对批量分子测量的贡献，特别是蛋白质组和转录组的测量 | machine learning | NA | single-cell RNA sequencing, quantitative proteomics | DESP algorithm | proteome, transcriptome | NA |
| 13413 | 2024-08-07 |
Anchored-fusion enables targeted fusion search in bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100733
PMID:38503288
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Anchored-fusion的高灵敏度融合基因检测工具，该工具能够锚定感兴趣的基因并恢复传统算法通常过滤掉的短读序列匹配 | Anchored-fusion包含基于深度学习层次结构的模块，采用自蒸馏学习（HVLD）有效过滤假阳性融合片段，同时保持真实融合基因 | NA | 开发一种高灵敏度的融合基因检测工具，适用于低测序深度的应用 | 融合基因的检测 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA |
| 13414 | 2024-08-04 |
EIF2Ss, a Novel c-Myc-Correlated Gene Family, is Associated with Poor Prognosis and Immune Infiltration in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Mar-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2903119
PMID:38538250
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研究论文 | 本研究分析了EIF2S基因家族在胰腺腺癌中的诊断、预后和治疗中的作用 | 发现EIF2S在胰腺腺癌组织中高表达，并与不良预后和免疫浸润相关 | 尚未报告EIF2S在PAAD中的具体功能机制 | 探讨EIF2S基因家族与胰腺腺癌的关系 | 胰腺腺癌患者的基因表达和生存情况 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，免疫共沉淀，质谱分析，西方印迹 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA数据库，具体样本数未提供 |
| 13415 | 2024-08-04 |
Construction of an immune predictive model and identification of TRIP6 as a prognostic marker and therapeutic target of CRC by integration of single-cell and bulk RNA-seq data
2024-Mar-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03658-w
PMID:38430268
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研究论文 | 本研究构建了一个免疫预测模型，并识别了TRIP6作为结直肠癌的预后标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和总RNA测序数据构建了结直肠癌的分子免疫预测模型 | 未能深入探讨模型的临床应用效果 | 识别结直肠癌患者的免疫状态，并构建预后模型以预测患者结果 | 结直肠癌患者的免疫细胞浸润和关键基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 包含来自GEO的结直肠癌单细胞RNA-seq数据和UCSC Xena的总RNA-seq数据 |
| 13416 | 2024-08-04 |
Proteomic and transcriptomic profiling of brainstem, cerebellum and olfactory tissues in early- and late-phase COVID-19
2024-Mar, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01573-y
PMID:38366144
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研究论文 | 本文分析了不同阶段COVID-19患者脑干、脑小脑和嗅觉组织的蛋白质组和转录组特征 | 首次通过单核RNA测序和空间转录组学整合分析COVID-19不同阶段的神经炎症反应 | 研究对象为已故个体，可能会影响结果的临床适用性 | 探讨COVID-19过程中神经系统的免疫反应及其对神经功能的影响 | 不同阶段的COVID-19患者的脑干组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 不同阶段的已故COVID-19患者脑干组织 |
| 13417 | 2024-08-04 |
Mutational signature and prognosis in adenocarcinoma of the bladder
2024-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6239
PMID:38180342
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研究论文 | 本文揭示了膀胱腺癌的突变和转录组特征，并评估了其与预后的关系 | 首次报告了膀胱腺癌中与化学致癌物相关的突变特征，并与预后相关联 | 样本数量较少，仅包含23名患者，可能限制结果的广泛适用性 | 揭示膀胱腺癌的突变和转录组特征 | 23名膀胱腺癌患者，包括16名原发性膀胱腺癌患者和7名尿管腺癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序、全基因组测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 23个样本，包含16个原发性膀胱腺癌和7个尿管腺癌 |
| 13418 | 2024-08-07 |
The collagen landscape in cancer: profiling collagens in tumors and in circulation reveals novel markers of cancer-associated fibroblast subtypes
2024-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6207
PMID:37728068
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研究论文 | 本研究旨在通过分析肿瘤和循环中的胶原蛋白表达，识别癌症相关成纤维细胞亚型的潜在标志物 | 发现了特定胶原蛋白亚型与癌症相关成纤维细胞亚型（如iCAFs和myCAFs）的关联，并揭示了这些胶原蛋白在不同实体瘤中的表达失调与生存率的关联 | NA | 识别癌症生物标志物并探索新的治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞及其胶原蛋白表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开的单细胞RNA测序数据集和TCGA数据库中的肿瘤样本，以及癌症患者的血清样本 |
| 13419 | 2024-08-07 |
Transcriptional profile of human thymus reveals IGFBP5 is correlated with age-related thymic involution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322214
PMID:38318192
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研究论文 | 研究通过收集和整合公开的人类单细胞转录组测序数据，构建了人类胸腺细胞图谱，并发现了与年龄相关的胸腺退化相关的关键调节因子IGFBP5 | 首次系统地探索了早期胸腺细胞的细胞间通讯和调节因子，以及年龄相关的人类胸腺差异，并通过生物信息学和实验验证，揭示了IGFBP5作为胸腺退化的功能标记 | NA | 研究人类胸腺中与年龄相关的退化机制 | 人类胸腺的细胞和分子机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 350,678个细胞来自36个样本 |
| 13420 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type-specific immune regulation associated with human neuromyelitis optica spectrum disorder
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322125
PMID:38440735
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）患者的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了NMOSD患者外周血单个核细胞的免疫特征 | NA | 探讨视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）的外周免疫特征 | NMOSD患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |