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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2026-06-01 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
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研究论文 | 提出q-diffusion框架,利用单细胞转录组中基因共表达的完整维度,提升数据分析效果 | 首次提出能捕获整个基因库共表达结构的q-diffusion框架,在统计显著性、分类精度和聚类效果上超越现有方法 | 未明确说明局限 | 开发一种能充分利用单细胞RNA测序数据全维度信息的方法,以增强细胞生物学理解 | 转移性结直肠癌患者、外周血单个核细胞(PBMC)、人类皮层组织 | 机器学习 | 转移性结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | q-diffusion | 基因表达数据 | CALGB/SWOG 80405临床试验样本、体外PBMC数据集、Tabula Sapiens人类图谱、空间scRNAseq人皮层组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1322 | 2026-06-01 |
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172449
PMID:37751306
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白测序,研究了人类胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的自身抗体及其靶向抗原 | 首次鉴定了胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的抗体靶向的三种细胞内自身抗原(F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1),并发现这些自身抗体在患者血浆中显著升高 | 样本量较小(仅7个原发性胰腺导管腺癌样本),且自身抗体在胰腺导管腺癌发生发展中的具体作用机制尚不明确 | 探究胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原,并研究浆细胞分泌的抗体反应性 | 人类胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是浆细胞和B细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白测序 | NA | 基因表达数据, 免疫球蛋白序列数据 | 7个原发性胰腺导管腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1323 | 2026-06-01 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 利用空间转录组学分析银屑病(PsO)皮肤活检样本,揭示健康与发炎皮肤之间免疫微环境的显著差异,以及疾病严重程度分层的组织生态系统特征 | 首次通过空间转录组学对银屑病的组织生态系统进行系统性分类,发现轻度和重度银屑病具有不同的分子特征,且重度银屑病可能从分子水平改变远端未受累皮肤区域 | 样本量较小(25例活检样本),且未提及空间转录组学的分辨率限制或潜在批次效应;单细胞数据的整合可能受公共数据异质性影响 | 探究银屑病(一种炎症性皮肤病)的组织空间特征及其与疾病严重程度和系统性表现的关系 | 银屑病患者和健康对照者的皮肤活检样本(包括活动性皮损、临床未受累皮肤和健康皮肤) | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学(ST)、单细胞转录组学整合分析 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 25例皮肤活检样本(包括健康、活动性皮损和临床未受累皮肤) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1324 | 2026-06-01 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 开发一种抗原特异性双微颗粒系统,可逆转晚期多发性硬化症小鼠模型的后肢瘫痪 | 首次证明抗原特异性双微颗粒疗法能在临床晚期阶段逆转实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠的瘫痪,且不引起广泛免疫抑制 | 未明确说明局限性 | 评估抗原特异性双微颗粒系统在晚期多发性硬化症小鼠模型中的治疗效果及其免疫机制 | 患有晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎的小鼠 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用(小鼠样本,具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 1325 | 2026-06-01 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 优化分散胰岛细胞的冻存方法,并通过单细胞转录组分析验证其功能完整性 | 提出了一种优化的梯度冷冻方法,能够维持冻存后分散胰岛细胞的膜完整性、分子和功能表型,为糖尿病研究和细胞治疗提供了可靠细胞来源 | 未提及冻存过程中可能存在的细胞亚群偏好性损伤或长期稳定性数据 | 优化分散胰岛细胞的冻存技术,获得可用于单细胞转录组研究的活性细胞 | 分散的人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胰岛细胞样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1326 | 2026-06-01 |
High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling
2019-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0548-y
PMID:31501547
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研究论文 | 开发了一种高分辨率空间转录组学技术,用于原位组织分析 | 利用密集空间条形码微珠阵列,实现了2微米分辨率下捕获组织切片中的RNA,可同时获取空间位置和分子信息 | 未提及技术局限性 | 开发高分辨率空间转录组学方法,实现对组织切片的空间分子图谱分析 | 小鼠大脑和原发性乳腺癌组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像和转录组数据 | 小鼠大脑和原发性乳腺癌组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 高密度空间条形码微珠阵列,2微米分辨率 |
| 1327 | 2026-05-31 |
Integrating gene-microbiome interactions and single-cell transcriptomics reveals therapeutic strategies for aortic aneurysm
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115939
PMID:42211118
|
研究论文 | 通过整合基因-微生物组相互作用与单细胞转录组学,揭示主动脉瘤的潜在治疗策略 | 首次利用孟德尔随机化方法鉴定出肠道菌属对主动脉瘤风险的保护性因果效应,并结合单细胞RNA测序揭示血管平滑肌细胞中基因缺陷如何通过CXCL12-CXCR4信号轴招募中性粒细胞并促进中性粒细胞胞外陷阱形成,为肠道微生物、宿主遗传与血管炎症之间的机制联系提供了单细胞分辨率的见解 | 未提及具体局限性 | 探究肠道微生物与宿主基因相互作用在主动脉瘤发展中的机制,并寻找治疗靶点 | 主动脉瘤患者及肠道菌群相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1328 | 2026-05-31 |
Targeting CIRP and IL-6R-mediated microglial inflammation to improve outcomes in intracerebral hemorrhage
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.012
PMID:40934970
|
研究论文 | 本研究探讨了冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)通过IL-6受体(IL-6R)信号通路激活小胶质细胞炎症,从而影响脑出血预后的机制,并评估了靶向CIRP与IL-6R的肽抑制剂治疗潜力 | 首次揭示神经元来源的CIRP通过IL-6R/STAT3通路驱动小胶质细胞炎症的机制,并设计了一种新型肽抑制剂Tat-CIRP-CMA同时靶向CIRP和IL-6R,在体内外模型中验证其抗炎和神经保护作用 | 该研究主要在动物模型中进行,人类样本量有限,且未对肽抑制剂的长期安全性和临床转化可能性进行深入探讨 | 阐明CIRP在脑出血后神经炎症中的作用机制,并评估靶向CIRP与IL-6R的治疗策略 | 脑出血后神经元释放的CIRP及小胶质细胞的炎症反应 | 数字病理学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠脑出血模型、小胶质细胞特异性IL-6Rα敲除小鼠模型、人类脑出血患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1329 | 2026-05-31 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1基因敲除在缺血诱导视网膜病变中减轻穆勒胶质细胞病理激活和视网膜神经退行性变的作用及其机制 | 首次揭示Epac1通过调节穆勒细胞中VEGF信号促进OIR小鼠模型视网膜神经退行性变的新角色 | 仅使用小鼠OIR模型,未在人类样本中验证;Epac1敲除对血管修复的影响机制仍需进一步研究 | 研究Epac1在缺血诱导视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变模型中的视网膜神经元和穆勒胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫染色,qPCR,Western blot,邻近连接实验 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠模型,未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 1330 | 2026-05-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Informs Precision Targeting of Monogenic Lupus Associated With IKZF1 Haploinsufficiency
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70017
PMID:41392616
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析IKZF1单倍剂量不足所致的单基因狼疮患者的免疫失调机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示IKZF1单倍剂量不足导致Breg细胞几乎完全缺失和幼稚CD4+ T细胞比例增加,并识别出与狼疮相关的基因模块 | 研究仅基于一例单基因狼疮患者,样本量有限,结论的普适性需进一步验证 | 探究IKZF1单倍剂量不足导致单基因狼疮的免疫失调机制 | IKZF1单倍剂量不足患者、无已知基因突变的狼疮患者和健康对照者的外周免疫细胞 | 机器学习 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例IKZF1单倍剂量不足患者,若干狼疮患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1331 | 2026-05-31 |
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Uncover Distinct Fibroblast-Macrophage Crosstalk in Human Hip Synovium Between Patients With Femoroacetabular Impingement and Osteoarthritis
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示股骨髋臼撞击症与骨关节炎患者人类髋关节滑膜中独特的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 首次在髋关节滑膜中识别出EREG+衬里成纤维细胞与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞之间的FGF2-SDC4特异性相互作用,并发现EREG+CCL20+MMP3hi衬里成纤维细胞是髋关节骨关节炎特有的细胞类型 | 样本量较小(每种疾病6例),且未进行功能验证实验来确认FGF2-SDC4相互作用的因果关系 | 探究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎中滑膜细胞组成、转录组谱及细胞-细胞相互作用的改变 | 股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的髋关节滑膜组织 | 自然语言处理 | 骨关节炎, 股骨髋臼撞击症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 伪时间分析 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 12例(每组6例,性别匹配) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1332 | 2026-05-31 |
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
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研究论文 | 通过整合eQTL-GWAS和单细胞分析,构建系统生物学框架揭示头晕/眩晕的多层次遗传调控机制 | 首次将GWAS与脑单细胞类型、免疫细胞等多种组织的eQTL数据整合,并结合听觉神经单细胞RNA测序来解析头晕/眩晕的因果基因和细胞类型特异性调控网络 | 未明确提及具体局限性,但可能受限于样本来源的异质性和因果推断的统计效力 | 阐明头晕/眩晕的分子遗传机制并发现潜在治疗靶点 | 头晕/眩晕的遗传因果基因及其在单细胞类型中的表达调控 | 机器学习 | 神经系统疾病 | eQTL分析、GWAS、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、基因-基因相互作用网络、药物靶点筛选 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、文本数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于听觉神经单细胞转录组分析 |
| 1333 | 2026-05-31 |
Integrating bulk and single-cell transcriptome profiling to uncover diagnostic biomarkers and regulatory mechanisms of oxidative stress in spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00693
PMID:41673791
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研究论文 | 整合批量转录组和单细胞转录组分析,揭示脊髓损伤中氧化应激的诊断标志物和调控机制 | 首次通过整合批量与单细胞转录组数据,系统识别脊髓损伤中与氧化应激相关的诊断标志物、动态表达模式及调控网络,并筛选潜在治疗药物 | 仅基于GEO数据库的人类血液样本和小鼠脊髓组织数据,缺乏独立临床队列验证;结果需进一步在人体组织中确认 | 探索氧化应激相关基因在脊髓损伤中的表达与调控机制,以改善诊断和治疗 | 人类血液样本(来自GEO数据库)和损伤小鼠脊髓组织 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 脊髓损伤 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 定量聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的人类血液样本和损伤小鼠脊髓组织(具体样本量未提及) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1334 | 2026-05-31 |
Single-Cell Analysis Reveals Peripheral Helper T Cells in Rheumatoid Arthritis-Related Interstitial Lung Disease
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70066
PMID:41629202
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎相关间质性肺病的细胞和转录组特征,发现外周辅助T细胞在疾病中的独特作用 | 首次揭示类风湿关节炎相关间质性肺病肺部存在外周辅助T细胞,并发现肺组织Tph细胞与滑膜Tph细胞在激活、细胞毒性和耗竭特征上存在器官特异性差异 | NA | 阐明类风湿关节炎相关间质性肺病的上皮细胞和免疫细胞的细胞及转录组景观 | 类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名对照者、3名非类风湿关节炎结缔组织病相关间质性肺病患者和5名类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 荧光激活细胞分选后对上皮细胞和免疫细胞进行单细胞RNA测序 |
| 1335 | 2026-05-31 |
SMAD7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension Via the TGF-β1-SMAD2/3 Pathway
2026-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002832
PMID:41886369
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化方法,探讨SMAD7通过TGF-β1-SMAD2/3通路调控肺动脉高压中铁死亡的机制 | 首次揭示SMAD7作为铁死亡负调控因子参与肺动脉高压肺血管重塑,并整合多组学与孟德尔随机化方法提供多层次证据 | 仅提供初步证据,需进一步验证SMAD7在不同PAH模型中的普适性及长期治疗效果 | 阐明肺动脉高压中铁死亡的调控机制及SMAD7的作用 | 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 单细胞转录组测序数据(具体数量和来源未提供)、大鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1336 | 2026-05-31 |
Innate lymphoid cells in rheumatoid arthritis as mediators of pathology and resolution
2026-Jun, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-026-01375-5
PMID:42115769
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研究论文 | 探讨先天淋巴样细胞在类风湿关节炎中作为病理和缓解中介的作用 | 首次系统综述ILC亚群在RA中的双重作用,包括ILC3促进炎症和ILC2促进修复,并探讨CAR-ILC2等新型细胞疗法 | 该领域仍处于临床前阶段,缺乏大规模临床验证 | 阐明先天淋巴样细胞在类风湿关节炎病理与缓解中的调控机制及治疗潜力 | 先天淋巴样细胞及其亚群(ILC2、ILC3、LTi细胞) | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 高维免疫表型分析、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 1337 | 2026-05-31 |
Abnormal Stress Reduced miR-330 Supplementation Alleviates Osteoarthritis Progression by Suppressing Osteochondral Catabolism
2026-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70553
PMID:42212804
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研究文章 | 该研究揭示miR-330在异常机械应力下表达降低,并通过抑制CTGF、FGFR1、EPOR及炎症因子缓解骨关节炎进展,补充miR-330具有治疗作用 | 首次发现miR-330作为机械响应性miRNA在骨关节炎中发挥保护作用,并揭示其在软骨细胞和破骨细胞中的双重调控机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索异常机械应力下调控骨关节炎进展的关键因子,特别是miR-330的作用及治疗潜力 | 颞下颌关节紊乱病患者滑液、骨关节炎临床标本及动物模型中的软骨和软骨下骨组织 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 96名颞下颌关节紊乱病患者滑液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1338 | 2026-05-31 |
A clinically relevant SLC2A1-associated malignant epithelial cell state predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-May-29, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01897-x
PMID:42209795
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析,在肺腺癌中识别出一种与预后和免疫治疗反应相关的SLC2A1阳性恶性上皮细胞状态 | 首次利用整合多组学方法结合Scissor算法,在肺腺癌中鉴定出与预后和免疫治疗反应相关的恶性上皮细胞状态,并构建了基于该状态的风险评分模型SERS | 主要依赖于公开数据集和回顾性分析,功能性实验验证范围有限,SLC2A1-CAF-胶原信号轴的机制尚未完全阐明 | 探索肺腺癌中恶性上皮细胞异质性对预后和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本(包括单细胞、空间转录组和批量转录组数据) | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组分析 | Scissor算法、风险评分模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个独立队列,包含免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1339 | 2026-05-31 |
A gene signature derived from leukemia associated macrophages provides a compelling risk stratification for human AML patients
2026-May-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00944-w
PMID:42210435
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研究论文 | 本研究基于FGFR1驱动的小鼠白血病模型,鉴定出白血病相关巨噬细胞(LAMs)的32个基因特征,并将其应用于人类AML患者的风险分层 | 首次利用单细胞RNA测序分析白血病相关巨噬细胞,开发出32基因特征评分系统,并将其整合到现有的欧洲白血病网风险分组标准中,为AML风险分层提供了独立的预后价值 | 未提及 | 开发一个基于白血病相关巨噬细胞基因特征的评分系统,用于急性髓系白血病患者的风险分层 | FGFR1驱动的小鼠白血病模型和838名新诊断的AML患者(接受CALGB/Alliance治疗方案) | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 838名新诊断的AML患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1340 | 2026-05-31 |
Mesenchymal Stromal Cell-Mediated Intercellular Communication: Mapping the Interactome for Skeletal Muscle Homeostasis and Regeneration
2026-May-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507444
PMID:42210793
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研究论文 | 构建间充质基质细胞在骨骼肌稳态和再生过程中的相互作用图谱 | 采用系统生物学方法整合单细胞RNA测序图谱与先进计算分析,构建了全面的FAP相互作用组 | 未提及具体局限性 | 解析FAP在骨骼肌稳态和再生中的调控信号网络 | 骨骼肌中的纤维脂肪生成祖细胞(FAPs) | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |