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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2026-04-02 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in primary and lymph node-metastatic small cell lung cancer
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102713
PMID:41916294
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了小细胞肺癌原发灶和淋巴结转移灶中肿瘤微环境的异质性 | 首次在小细胞肺癌中应用单细胞空间转录组学技术,系统描绘了淋巴结转移过程中的空间细胞生态系统,并识别了与免疫排斥相关的恶性亚群及血管-免疫互作机制 | 研究样本主要来自特定患者群体,可能无法完全代表所有小细胞肺癌亚型;空间转录组学技术分辨率虽高,但仍受限于检测通量和基因覆盖度 | 探究小细胞肺癌淋巴结转移过程中肿瘤微环境的空间异质性及其对预后的影响 | 75名小细胞肺癌患者的105个原发灶和转移淋巴结样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 105个组织标本,超过600,000个细胞 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪 |
| 1322 | 2026-04-02 |
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.006
PMID:41916284
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研究论文 | 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍,发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂,其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 | 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台,首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍,揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 | 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据,体内实验验证可能受模型特异性限制,未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 | 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍,以提高心肌细胞诱导效率,促进心脏再生 | 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程,特别是在心肌梗死后的病理微环境中 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及140个潜在障碍的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制化Perturb-seq平台,适用于复杂病理环境 |
| 1323 | 2026-04-02 |
mRNA lipid-nanoparticle-mediated mitochondrial apoptosis augments adoptive T cell immunotherapy
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102706
PMID:41916290
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研究论文 | 本研究开发了一种基于mRNA脂质纳米颗粒的组合策略,通过编码激活型蛋白的BH3结构域触发线粒体凋亡,以增强过继性T细胞免疫疗法的抗肿瘤效果 | 利用mRNA脂质纳米颗粒递送BH3结构域来特异性诱导肿瘤细胞的免疫原性细胞死亡,并重塑免疫抑制微环境,与过继性T细胞疗法协同增强疗效 | NA | 增强过继性T细胞免疫疗法对实体瘤的治疗效果 | 肿瘤细胞和过继性T细胞 | NA | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1324 | 2026-04-02 |
Robust transcriptomic hallmarks targeting intratumor heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102708
PMID:41916296
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研究论文 | 本研究通过整合多区域、单区域和单细胞RNA测序数据,系统表征了肝内胆管癌的基因表达瘤内异质性,并开发了一种瘤内异质性不敏感的分类系统 | 识别了低瘤内异质性/高瘤间变异性基因集,并基于此定义了五个具有不同临床和分子特征的亚组,提供了新的生物标志物和治疗策略 | 未明确说明样本来源的多样性或潜在的技术偏差 | 克服肝内胆管癌中瘤内异质性对转录组分层的影响,建立稳健的分子分类框架 | 肝内胆管癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 多组学数据整合、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1325 | 2026-04-02 |
Taming Autoimmunity: Alpha-1 Antitrypsin Overexpressing Mesenchymal Stem/Stromal Cells Promote Regulatory T Cell Crosstalk to Reverse Diabetes
2026-Mar-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
|
研究论文 | 本研究探讨了过表达α-1抗胰蛋白酶的间充质干细胞/基质细胞(AAT-MSCs)如何通过调节T细胞反应来逆转小鼠糖尿病 | 首次结合单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析,系统揭示了AAT-MSCs通过增强调节性T细胞(Tregs)的细胞间通讯来抑制自身免疫反应的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞的体外实验结果仍需体内验证,且长期疗效和安全性未评估 | 阐明AAT-MSCs在1型糖尿病治疗中的免疫调节机制,为其临床转化提供依据 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的胰腺淋巴结和胰岛细胞,以及小鼠和人类的体外细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 未明确样本数量,但涉及NOD小鼠模型及体外小鼠/人类细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1326 | 2026-04-02 |
Association between craniosynostosis and phospholipid metabolism: Insights from single-cell and transcriptomic analysis
2026-Mar-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048030
PMID:41894269
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了颅缝早闭与磷脂代谢之间的关联 | 首次从磷脂代谢角度系统研究颅缝早闭的发病机制,并结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和网络药理学方法 | 样本量有限导致统计显著性受限,遗传证据尚属探索性 | 阐明颅缝早闭的发病机制,探索潜在治疗靶点 | 儿童颅缝早闭患者和实验小鼠的颅缝组织 | 数字病理学 | 颅缝早闭 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 临床样本和实验小鼠组织,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学 | NA | NA |
| 1327 | 2026-04-02 |
Circulating exhausted CD8+ effector memory cells differentiate immune checkpoint inhibitor-induced liver injury from other acute immune-mediated liver injuries
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014178
PMID:41895713
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,鉴定了一种循环耗竭CD8+效应记忆T细胞亚群,可作为区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导性肝损伤的潜在生物标志物 | 首次系统性地比较了免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他免疫介导性肝损伤的免疫特征差异,并鉴定出具有诊断潜力的特异性循环T细胞亚群 | 样本量相对有限,且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证生物标志物的临床实用性 | 寻找能够区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导性肝损伤的生物标志物 | 接受免疫治疗的癌症患者(包括发生和未发生肝损伤者)、健康对照者、药物性肝损伤患者、自身免疫性肝炎患者 | 免疫学 | 肝损伤 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、细胞因子分析、共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、蛋白质表达数据、细胞图像数据 | 多个队列的患者样本,包括急性肝损伤期、治疗前及治疗后12周的样本,以及健康对照和疾病对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1328 | 2026-04-02 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-Mar-27, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠ICI相关心肌炎模型,发现内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇,揭示了ICI心肌炎的新免疫病理机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出ICI心肌炎中由Cxcl9和Cxcl10共表达的巨噬细胞亚群,并发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴驱动其聚集,为靶向治疗提供了新方向 | 研究基于小鼠模型,人类临床样本验证尚缺;单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和基因检测灵敏度 | 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠心脏组织中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1329 | 2026-04-02 |
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.053
PMID:41895464
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术,构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱,揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术,高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态,明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉,并发现CD4谱系是转录默认程序,而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;空间转录组学分辨率有限,可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 | 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱,以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 | 小鼠胸腺中的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1330 | 2026-04-02 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Mar-25, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
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研究论文 | 本研究结合网络毒理学与实验验证,探索了环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制,并识别出核心免疫基因MMP9作为关键介质 | 首次通过整合网络毒理学、机器学习筛选与分子模拟,系统性地识别并验证了MMP9作为TCDD暴露相关动脉粥样硬化的核心免疫介质,并揭示了其通过结合TCDD调控炎症反应和血管基质重塑的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型,缺乏体内动物实验或临床样本的直接验证;分子对接和动力学模拟的结果需要进一步的实验证实 | 探索环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化发生发展的分子联系,识别关键免疫基因及其调控通路 | 动脉粥样硬化相关转录组数据集、TCDD暴露相关基因表达谱、人脐静脉内皮细胞(HUVEC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习诊断模型(结合多种基础算法)、SHAP分析、WGCNA | 转录组数据、基因表达谱、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1331 | 2026-04-02 |
Targeting SPP1 +TAMs associated with liver metastasis reverses immunosuppression and synergizes with immunotherapy in colorectal cancer
2026-Mar-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014128
PMID:41881501
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序揭示了结直肠癌中SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的空间和代谢异质性,并验证了靶向该亚群联合免疫疗法可逆转免疫抑制并抑制肿瘤生长与转移 | 首次在结直肠癌中系统描绘了SPP1+ TAMs在原发性肿瘤和转移灶(尤其是肝转移)中的空间分布、发育轨迹和代谢异质性,并发现其两个代谢亚型(糖酵解型ATP5F1E+和氧化磷酸化主导型MT-CO1+)具有组织特异性,且MT-CO1+亚型特异富集于肝转移灶的富氧侵袭边缘 | 研究主要基于观察性数据和临床前模型,其治疗策略在人体中的有效性和安全性仍需进一步临床试验验证 | 阐明结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在原发性肿瘤和转移微环境中的空间与代谢异质性,并探索靶向特定TAM亚群以增强免疫治疗效果的策略 | 结直肠癌患者的原发性肿瘤组织、癌旁正常组织、肝转移灶、淋巴结转移灶以及外周血样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,空间转录组学 | UMAP聚类,伪时间推断,RNA速率,CellChat | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化图像数据 | 来自多中心队列的998,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1332 | 2026-04-02 |
Targeted inhibition of Nrf2 potentiates antitumor immunity and enhances the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010841
PMID:41876134
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研究论文 | 本研究揭示了靶向抑制Nrf2可增强肝细胞癌的抗肿瘤免疫,并通过下调PD-L1、上调MHC-I表达以及促进CD8+ T细胞浸润,提高PD-1抗体和CAR-T细胞疗法的疗效 | 首次将Nrf2确定为肿瘤免疫微环境的新调控因子,并证明其特异性抑制剂Brusatol可通过双重机制(下调PD-L1和上调MHC-I)克服肝细胞癌的免疫治疗耐药 | 研究主要基于小鼠同种异体移植肿瘤模型,尚未在人体临床试验中验证;单细胞RNA测序分析的样本规模和细节未明确说明 | 探究Nrf2抑制在肝细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制,并评估其与现有免疫疗法(PD-1抗体和CAR-T)联合的治疗潜力 | 肝细胞癌(HCC)小鼠模型、肿瘤细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、生化检测 | NA | RNA测序数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1333 | 2026-04-02 |
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology
IF:3.3Q2
DOI:10.1136/bmjgast-2025-002153
PMID:41871904
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研究论文 | 本研究通过多组学方法详细评估了古塞奇尤单抗诱导治疗在中重度活动性溃疡性结肠炎患者中的临床疗效及相关的细胞和分子变化 | 首次详细描述了通过拮抗IL-23p19亚基选择性抑制IL-23在炎症性肠病中产生临床疗效的分子变化,并整合了bulk RNA测序、单细胞RNA测序和流式细胞术等多种技术进行多组学分析 | 研究样本量相对有限(单细胞RNA测序n=52,流式细胞术n=30),且为短期诱导研究(12周),缺乏长期疗效数据 | 评估古塞奇尤单抗治疗溃疡性结肠炎的临床疗效及其分子机制 | 中重度活动性溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 血清蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 313名患者(随机分组),其中bulk RNA测序257例,单细胞RNA测序52例,流式细胞术30例,血清蛋白质组学302例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1334 | 2026-04-02 |
Frequency-domain kernels enable atlas-scale detection of spatially variable genes
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
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研究论文 | 本文提出了一种名为FLASHS的新方法,用于在空间转录组学中检测空间可变基因,该方法通过频域核实现高精度、良好校准和大规模计算 | FLASHS方法将空间测试移至频域,利用随机傅里叶特征和稀疏草图技术,无需构建距离矩阵即可在零膨胀数据上进行多尺度核测试,并通过峰度校正零假设保持校准 | NA | 开发一种准确、校准良好且可扩展的方法,用于识别空间转录组学中的空间可变基因 | 空间转录组学数据,包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞和人类心脏组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 频域核方法 | 空间转录组数据 | 50个数据集,覆盖9个平台,包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1335 | 2026-04-02 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ITEC的无监督方法,用于高保真地自动重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图 | 提出ITEC方法,通过迭代追踪与错误校正实现无监督的细胞谱系重建,在斑马鱼胚胎数据中达到超过99.7%的准确率 | NA | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图,以探索发育生物学中的关键形态发生过程 | 斑马鱼、小鼠等胚胎的细胞 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 四个跨物种数据集,包括斑马鱼和小鼠胚胎,总计1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1336 | 2026-04-02 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
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研究论文 | 本文提出了一个名为UniST的统一生成式人工智能框架,用于从稀疏的连续切片中计算重建密集且连续的三维空间转录组学景观 | 提出了一个统一的生成式AI框架,整合了核点卷积与交叉注意力层、基于光流的插值以及图自编码器与隐式神经表示三个互补模块,以解决稀疏、异质的三维ST数据重建问题,而无需改变底层实验技术 | 未明确提及该计算框架在处理极低质量或高度降解组织样本时的性能,也未讨论其计算资源需求或在不同物种间的普适性限制 | 开发一个通用的计算解决方案,以经济高效且可扩展的方式重建三维空间转录组学景观,从而更真实地研究组织结构和疾病生物学 | 小鼠胚胎数据集和三维人类癌症组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 生成式AI框架(整合核点卷积、交叉注意力层、光流插值、图自编码器、隐式神经表示) | 三维空间转录组学数据(点云、连续切片) | 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠胚胎数据集和两种三维人类癌症组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1337 | 2026-04-02 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
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研究论文 | 本文提出了一种结合单细胞拉曼光谱和机器学习的方法,用于快速分析黑色素瘤细胞并预测其对靶向和免疫疗法的反应 | 开发了一种非破坏性、单细胞水平的拉曼光谱结合机器学习方法,用于预测黑色素瘤的靶向和免疫治疗反应,该方法成本较低且能反映影响肿瘤行为的生化改变 | 研究样本量有限(9例患者来源样本),且方法在更广泛临床环境中的验证仍需进一步研究 | 预测黑色素瘤对靶向和免疫治疗的反应,以改善精准医疗中的治疗选择评估 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系,以及9例已知对靶向和免疫治疗抑制剂(如bemcentinib、cabozantinib、dabrafenib、nivolumab等)具有耐药性特征的黑色素瘤患者来源样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 光谱数据 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系,以及9例患者来源样本 | NA | 单细胞拉曼光谱 | NA | NA |
| 1338 | 2026-04-02 |
In Vivo CRISPR Screening Identifies the Glutamate Receptor GRIA2 as Promoting Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer via Calcium-Dependent β-Catenin Activation
2026-Mar-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521746
PMID:41806318
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现谷氨酸受体GRIA2通过钙依赖性β-连环蛋白激活促进胃癌腹膜转移 | 首次通过体内全基因组CRISPR/Cas9筛选鉴定出GRIA2作为胃癌腹膜转移的关键驱动因子,并揭示了癌症相关成纤维细胞通过谷氨酸旁分泌轴促进转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,尚未在人体中进行直接干预验证 | 探索胃癌腹膜转移的新治疗靶点 | 胃癌细胞、腹膜转移灶、癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床病理数据 | 细胞系来源和患者来源的类器官异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1339 | 2026-04-02 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-Mar-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了胃癌中的“危险区”,揭示了其通过CCDC80+成纤维细胞诱导CD8+ T细胞功能障碍来驱动癌症进展的机制 | 首次定义了胃癌中的空间“危险区”,并发现CCDC80+成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号招募并诱导CD8+ T细胞功能障碍,为预后预测和免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的观察,机制验证虽包括共培养实验,但临床转化和体内功能验证仍需进一步探索 | 探究胃癌肿瘤微环境的空间异质性及其对癌症进展和免疫抑制的影响 | 小鼠侵袭性肿瘤和人类胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞分析,非负矩阵分解,XGBoost分类器,LightGBM模型 | XGBoost, LightGBM | 空间转录组数据,单细胞数据,H&E切片图像 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠肿瘤和人类胃癌队列 | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 1340 | 2026-04-02 |
CRISPR-based functional genomics for dissecting therapeutic dependency in primary acute myeloid leukemia samples
2026-Mar-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.003
PMID:41759529
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的基于CRISPR的功能基因组学平台,用于直接研究原发性急性髓系白血病样本中的癌症依赖性和细胞异质性 | 将CRISPR功能基因组学平台直接应用于异质性原发性肿瘤(特别是患者来源的异种移植和原发性AML样本),而非仅限于小鼠模型或已建立的癌细胞系,并结合Perturb-seq在单细胞水平解析扰动效应 | 研究主要聚焦于急性髓系白血病,平台在其他癌症类型中的普适性有待进一步验证 | 开发并应用CRISPR功能基因组学平台,以直接剖析原发性癌症样本中的治疗依赖性和耐药机制 | 患者来源的异种移植模型和原发性急性髓系白血病样本 | 功能基因组学 | 急性髓系白血病 | CRISPR-Cas9基因敲除、CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |