单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-05-22 |
Alcohol consumption and esophageal cancer risk: unveiling DLEU2 as a key immune modulator through Mendelian randomization and transcriptomic analysis
2025-May-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02660-7
PMID:40383861
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了酒精消费与食管癌风险之间的遗传和分子机制，并发现DLEU2作为关键的免疫调节因子 | 首次通过孟德尔随机化分析确认酒精消费与食管癌之间的因果关系，并发现DLEU2作为长链非编码RNA在肿瘤免疫微环境和癌症进展中的关键作用 | 研究样本量未明确说明，且机制研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索酒精消费导致食管癌的遗传和分子机制 | 食管癌患者样本和相关的基因表达数据 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 孟德尔随机化分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者来源的样本（具体数量未说明） |
| 1322 | 2025-05-22 |
Metabolism-associated marker gene-based predictive model for prognosis, targeted therapy, and immune landscape in ovarian cancer: an integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing with spatial transcriptomics
2025-May-17, BMC women's health
DOI:10.1186/s12905-025-03750-y
PMID:40382612
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和空间转录组学数据，构建了一个基于代谢相关标记基因的预后模型，用于卵巢癌的预后预测、靶向治疗和免疫景观分析 | 首次结合四种代谢途径（糖酵解代谢、脂质代谢、胆碱代谢和鞘脂代谢）构建卵巢癌预后模型，并预测了潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，部分实验验证仍需进一步扩大样本量 | 开发有效的卵巢癌预后生物标志物并探索新的治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和癌细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, bulk RNAseq, 空间转录组学, RT-qPCR, CCK-8, Transwell实验 | 代谢相关基因预后模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 实验数据 | TCGA-OV样本及实验验证样本（数量未明确说明） |
| 1323 | 2025-05-22 |
Evaluation of tumour pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumours to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-May-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
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研究论文 | 本研究通过基于计算机断层扫描的放射组学评估胰腺神经内分泌肿瘤的假包膜状态，以预测预后并指导手术策略 | 结合放射组学和机器学习术前识别假包膜状态，为小肿瘤患者提供更精准的手术策略 | 研究样本仅来自单一医疗机构，可能存在选择偏倚 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对手术策略选择和预后预测的价值 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, 放射组学分析 | 机器学习模型 | 影像数据, 临床数据 | 578例接受首次胰腺切除术的患者（最终纳入475例） |
| 1324 | 2025-05-22 |
Regulation of RNA polymerase II transcription through re-initiation and bursting
2025-May-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.011
PMID:40378829
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review | 本文总结了真核细胞中RNA聚合酶II（RNAPII）爆发性转录的调控策略，重点关注RNAPII的重新启动机制 | 提出了RNAPII重新启动和爆发性转录作为基因调控的常见现象，并探讨了其分子机制和争议 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于已有研究的总结 | 探讨RNAPII转录调控的分子机制及其在健康和疾病中的意义 | RNA聚合酶II（RNAPII）及其转录调控机制 | 分子生物学 | NA | 活细胞成像、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 1325 | 2025-05-22 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-May-15, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌（CRC）中表型异质性和可塑性在肿瘤进展、转移和治疗抵抗中的关键作用 | 揭示了具有再生和炎症表型的癌细胞状态，这些状态与小鼠模型中的转移起始细胞极为相似，并识别了一个具有混合再生和干细胞表型的中间群体 | 调控因素和驱动表型异质性的外在信号仍不明确 | 揭示结直肠癌转移中的表型异质性和可塑性的调控机制 | 结直肠癌（CRC）患者 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞多组学和空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组数据 | 原发性和转移性CRC患者样本 |
| 1326 | 2025-05-22 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了特发性正常压力脑积水（iNPH）患者外周血和脑室脑脊液的细胞图谱，揭示了与认知功能下降相关的免疫失调现象 | 首次构建了iNPH患者的单细胞转录组图谱，发现外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能下降相关，并识别了可能代表脑室周围神经胶质细胞脱落的脑脊液细胞群 | 样本量相对有限（140,207个单细胞转录组），且仅针对iNPH患者进行研究 | 探究特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的免疫特征及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水（iNPH）患者的外周血和脑室脑脊液样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 |
| 1327 | 2025-05-22 |
Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502256122
PMID:40333757
|
research paper | 该研究揭示了组蛋白去乙酰化酶1（Hdac1）在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因子的作用 | 首次发现Hdac1对T-int细胞亚群分化的特异性调控作用，并阐明其通过表观遗传机制同时促进T-int细胞命运和抑制耗竭程序过度激活的双重功能 | 研究主要基于小鼠慢性病毒感染模型，在人类疾病中的普适性需要进一步验证 | 探究慢性病毒感染中CD8+ T细胞不同耗竭亚群分化的表观遗传调控机制 | 抗原特异性CD8+ T细胞亚群（Tcf1干细胞样细胞、T-int中间耗竭细胞和终末耗竭细胞） | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组测序、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA（未明确说明具体样本数量） |
| 1328 | 2025-05-22 |
Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2422236122
PMID:40333758
|
研究论文 | 研究黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的干扰素诱导激活与早期抗体反应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞亚群的激活状态及其与早期IgM抗体反应的相关性 | 研究仅关注了疫苗接种后的早期免疫反应，未评估长期免疫保护机制 | 阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件与快速产生保护性免疫的关系 | 人类血液中的树突状细胞和单核细胞亚群 | 免疫学 | 黄热病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 大量疫苗接种者的血液样本 |
| 1329 | 2025-05-22 |
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2025-May-13, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.032
PMID:40373963
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研究论文 | 本研究通过识别一种新型的单核细胞衍生巨噬细胞亚型MES-MDM，揭示了其在促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性中的作用机制，并提出了针对MES-MDM的治疗策略 | 首次识别了MES-MDM这一新型MDM亚型，并阐明了其通过TNF-CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对TMZ耐药性的机制 | 研究结果需要在更大规模的临床试验中进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性的机制并开发新的治疗策略 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其微环境中的单核细胞衍生巨噬细胞(MDM) | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、患者来源的GBM类器官模型、颅内原位GBM模型 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA |
| 1330 | 2025-05-22 |
Spatial multi-omics reveals the potential involvement of SPP1+ fibroblasts in determining metabolic heterogeneity and promoting metastatic growth of colorectal cancer liver metastasis
2025-May-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.004
PMID:40340245
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌肝转移（CRLM）中关键微观区域的作用，重点关注癌症相关成纤维细胞（CAFs）在促进肿瘤进展中的关键作用，并利用多组学技术为其诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解 | 发现了SPP1+成纤维细胞在CRLM中的代谢异质性和促进转移性生长中的潜在作用，并通过空间多组学技术揭示了其与肿瘤细胞的相互作用 | 样本量较小（仅2名未治疗CRLM患者的12个新鲜手术样本），可能限制结果的普遍性 | 研究CRLM中关键微观区域的作用，特别是CAFs在肿瘤进展中的作用，为诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解 | 结直肠癌肝转移（CRLM）患者的手术样本和冷冻组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学（ST）、空间代谢组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、RT-qPCR、非靶向代谢组学 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据 | 12个新鲜手术样本（来自2名患者），92个冷冻组织样本（来自40名患者） |
| 1331 | 2025-05-22 |
Spatial proteomic landscape of primary and relapsed hepatocellular carcinoma reveals immune escape characteristics in early relapse
2025-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000979
PMID:38900411
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research paper | 该研究通过空间蛋白质组学技术揭示了原发性与复发性肝细胞癌的免疫逃逸特征 | 发现了与早期术后复发相关的树突状细胞新亚群(PDL1 + CD103 + DCs)，并揭示了其通过多种配体-受体途径增强免疫抑制和免疫逃逸的机制 | 样本量相对有限(46例患者)，且研究结果需要更大规模的队列验证 | 探究肝细胞癌术后复发的空间分子结构变化 | 46例接受手术切除治疗的原发性和复发性肝细胞癌患者的92个手术标本 | digital pathology | liver cancer | imaging mass cytometry, single-cell RNA sequencing | NA | spatial proteomic data, single-cell RNA sequencing data | 46例患者的92个手术标本中的358,729个单细胞 |
| 1332 | 2025-05-22 |
Revealing VCAN as a Potential Common Diagnostic Biomarker of Renal Tubules and Glomerulus in Diabetic Kidney Disease Based on Machine Learning, Single-Cell Transcriptome Analysis and Mendelian Randomization
2025-May, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0233
PMID:39849979
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research paper | 该研究通过机器学习、单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法，揭示了VCAN作为糖尿病肾病肾小管和肾小球共同诊断生物标志物的潜力 | 首次将VCAN鉴定为糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断标志物，并验证其与免疫基因上调和免疫细胞浸润的关联 | 未明确说明样本量大小及具体机器学习模型类型 | 寻找糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者的肾小球壁上皮细胞和近曲小管细胞 | machine learning | diabetic kidney disease | single-cell transcriptome analysis, Mendelian randomization | NA | gene expression data | NA |
| 1333 | 2025-05-22 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-Mar-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 本研究通过多模态模板结合X射线荧光显微镜和空间转录组学，揭示了小鼠海马区金属离子含量与金属组基因表达的相关性 | 首次将元素映射与空间转录组学结合，揭示了海马区金属离子富集与特定转录本区域富集的分子基础 | 研究仅局限于小鼠海马区，未涉及其他脑区或物种 | 探究大脑金属稳态的分子机制及其对神经功能的影响 | 小鼠海马区及其亚区域的金属离子含量和基因表达 | 神经科学 | NA | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 元素映射数据, 基因表达数据 | 小鼠海马区样本 |
| 1334 | 2025-05-22 |
CellPie: a scalable spatial transcriptomics factor discovery method via joint non-negative matrix factorization
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf251
PMID:40167331
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研究论文 | 介绍了一种名为CellPie的快速、无监督因子发现方法，用于联合非负矩阵分解空间RNA转录本和组织学图像特征 | 采用加速分层最小二乘法显著减少计算时间，适用于高维空间转录组数据集 | NA | 开发一种可扩展的空间转录组学因子发现方法 | 人类癌症组织的空间转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间RNA转录本和组织学图像 | 三种不同空间分辨率的人类癌症类型数据集，包括一个高分辨率的Visium HD数据集 |
| 1335 | 2025-05-22 |
An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671
PMID:39615601
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研究论文 | 通过单细胞数据分析揭示了AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果 | 首次使用单细胞测序技术分析AMG487对免疫细胞的影响，揭示了其在调节免疫细胞比例和功能方面的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探究AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其作用机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和Vogt-Koyanagi-Harada患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜炎 | 单细胞转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)和RNA测序(RNA-seq) | NA | 单细胞测序数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和Vogt-Koyanagi-Harada患者的样本 |
| 1336 | 2025-05-22 |
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08334-8
PMID:39695234
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了大脑衰老的空间时钟模型，揭示了T细胞和神经干细胞对邻近细胞的促衰老和促再生效应 | 首次开发了空间衰老时钟模型，系统研究了衰老组织中细胞间相互作用的分子机制 | 研究仅基于小鼠模型，人类组织的验证仍需进一步研究 | 探究衰老过程中细胞间相互作用对组织功能衰退的影响机制 | 成年小鼠大脑中的420万个细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组测序 | 机器学习模型（空间衰老时钟）、深度学习 | 单细胞转录组数据 | 20个不同年龄段的420万个细胞 |
| 1337 | 2025-05-22 |
CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727
PMID:39716644
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研究论文 | 该研究通过结合肾脏单细胞RNA-seq数据库和CMAP数据库预测并验证了Forskolin作为一种保护足细胞和抗蛋白尿的药物在肾毒性血清治疗小鼠中的效果 | 首次结合单细胞RNA-seq和CMAP数据库预测针对特定足细胞损伤的药物，并验证了Forskolin的保护作用 | 研究仅在小鼠模型和体外培养的足细胞中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探索针对特定足细胞损伤的精准药物治疗策略 | 肾毒性血清(NTS)处理的小鼠和体外培养的足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq, CMAP分析, GO和KEGG富集分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | NTS处理的小鼠和对照组小鼠的肾小球单细胞RNA-seq数据 |
| 1338 | 2025-05-22 |
Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics
2025-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2024.100029
PMID:39919554
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研究论文 | 利用单细胞转录组学技术解析小鼠肝脏中药物代谢酶、转运体和转录因子的细胞类型特异性及区域分布 | 首次系统性地描述了肝脏不同细胞类型和区域中药物处理基因的基线mRNA富集情况 | 研究仅基于已发表的单细胞和核转录组数据集，未进行实验验证 | 解析肝脏中药物处理基因的分布特征 | 小鼠肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 已发表的单细胞和核转录组数据集 |
| 1339 | 2025-05-22 |
Mapping Human Uterine Disorders Through Single-Cell Transcriptomics
2025-01-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030156
PMID:39936948
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学技术探索人类子宫疾病的细胞异质性和分子机制 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了子宫疾病中的关键细胞类型、信号通路和阶段特异性动态 | 面临可扩展性和可重复性等挑战 | 研究子宫疾病的细胞和分子基础，以发现生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症、腺肌症、子宫内膜癌和子宫肌瘤等子宫疾病 | digital pathology | gynecological disease | single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | NA | RNA-seq data | NA |
| 1340 | 2025-05-22 |
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08247-6
PMID:39567700
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研究论文 | 本研究通过RNA测序数据集挖掘和多种实验方法，发现肝脏X受体（LXR）通路激活作为组织对损伤的适应性反应，能够相互调节肠道再生和肿瘤发生 | 首次揭示了LXR通路在肠道损伤修复和肿瘤发生中的双重调节作用，并发现CYP27A1酶在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索肠道再生与肿瘤发生之间的分子调控机制 | 肠道上皮细胞和结直肠癌 | 分子生物学 | 结直肠癌 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序、肠道类器官培养、功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据 | 两种肠道损伤模型和人类结直肠癌标本 |