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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-10-05 |
Joint single-cell profiling of Cas9 edits and transcriptomes reveals widespread off-target events and effects on gene expression
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.636966
PMID:40909645
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研究论文 | 开发了Superb-seq技术，能够在单细胞水平同时测量Cas9编辑结果及其对基因表达的影响 | 首次实现单细胞分辨率下同时测量Cas9编辑结果和基因表达功能效应，揭示了脱靶编辑的普遍性和对基因表达的广泛影响 | 研究仅针对K562细胞系和四个染色质重塑基因，需要在更多细胞类型和基因中验证 | 评估CRISPR-Cas9基因组编辑的脱靶效应及其功能后果 | K562细胞系中的染色质重塑基因 | 基因组编辑 | NA | 单细胞RNA测序，T7转录 | NA | 单细胞转录组数据，基因编辑数据 | 10,000个K562细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用现成试剂盒和标准设备，无需病毒 |
| 1322 | 2025-10-05 |
PCK1 and ALDH1A1 are identified as biomarkers for inherent drug resistance in hepatocellular carcinoma
2025-Aug-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03481-4
PMID:40856889
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学识别肝细胞癌中与固有耐药性相关的生物标志物PCK1和ALDH1A1 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术揭示肝细胞癌肿瘤异质性，并鉴定出17个共同上调基因中的PCK1和ALDH1A1作为固有耐药性生物标志物 | 研究样本量有限，仅针对接受乐伐替尼治疗的患者，需要更大规模验证 | 探究肝细胞癌肿瘤异质性与固有耐药性机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 伪时间分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 接受乐伐替尼治疗的肝细胞癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1323 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals different cellular states in malignant cells and the tumor microenvironment in primary and metastatic ER-positive breast cancer
2025-Aug-26, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-025-00808-w
PMID:40858590
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示ER阳性乳腺癌原发灶和转移灶中恶性细胞及肿瘤微环境的细胞状态差异 | 首次系统比较ER阳性乳腺癌原发与转移灶的单细胞转录组特征，识别转移灶中关键的免疫抑制细胞亚群和细胞通讯变化 | 样本量相对有限（23例患者）且为未配对样本设计 | 阐明ER阳性乳腺癌从原发到转移的分子机制和肿瘤微环境演变 | 23例女性ER阳性乳腺癌患者（原发和转移灶） | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23例患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1324 | 2025-10-05 |
MYD88 mutations in clonal hematopoiesis promote inflammation and hematopoietic stem cell expansion
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.19.660202
PMID:40667002
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研究论文 | 本研究揭示了MYD88突变通过激活先天免疫通路促进克隆性造血和炎症性疾病 | 首次系统阐明MYD88突变在克隆性造血中的作用机制，包括发现新的突变变体并证实其通过激活NF-κB通路赋予造血干细胞竞争优势 | 主要基于小鼠模型研究，人类样本验证相对有限；对MYD88不同突变变体的功能差异研究不够深入 | 探究MYD88基因突变在克隆性造血中的作用机制及其与炎症性疾病的关系 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)、普通人群和实体癌患者的血细胞 | 血液学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因测序数据、表达数据 | 普通人群和初诊实体癌患者的血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1325 | 2025-10-05 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in a mouse model of ALS
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.21.671404
PMID:40909710
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了ALS小鼠模型中运动神经元退化的分子机制，发现了一种名为DAMNs的新型疾病相关运动神经元状态 | 首次识别出ALS疾病进展中的新型细胞状态DAMNs，并揭示了调控这种状态转变的转录因子网络 | 研究基于SOD1-G93A小鼠模型，可能不完全代表人类ALS的所有亚型 | 揭示肌萎缩侧索硬化中运动神经元退化和选择性易损性的分子决定因素 | SOD1-G93A ALS小鼠模型中的脊髓运动神经元 | 单细胞生物学 | 肌萎缩侧索硬化 | 单核RNA测序, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1326 | 2025-10-05 |
Mendelian randomization and single-cell analysis reveal causal relationships between renal clear cell carcinoma, kidney fibrosis, and inflammatory factors
2025-Aug-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03343-z
PMID:40853443
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞分析探讨肾透明细胞癌与肾脏纤维化及炎症因子的因果关系 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞分析研究肾癌与肾脏纤维化及炎症因子的因果关系 | 观察性研究可能存在混杂因素，样本来源有限 | 评估肾癌与肾脏纤维化及炎症因子的因果关系并分析肿瘤微环境异质性 | 肾透明细胞癌患者、肾脏纤维化患者及炎症因子 | 生物信息学 | 肾癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | MR Egger、逆方差加权、加权模式 | 基因组关联研究数据、单细胞RNA测序数据 | 基于大规模GWAS数据和GEO数据库单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GEO数据库GSM4819725数据集 |
| 1327 | 2025-10-05 |
CD38+ Endothelial Remodeling Defines Spatially Diverse Vasculopathy Programs in Rapidly Advancing Oral Inflammation
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.29.667333
PMID:40766487
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学揭示了快速进展性口腔炎症中CD38+内皮细胞重塑驱动的空间多样性血管病变程序 | 首次发现CD38+内皮细胞在快速进展性口腔炎症中的空间特异性重塑模式，并开发了三重空间分析方法 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 揭示快速进展性口腔炎症的细胞机制和空间结构 | 种植体周围炎和重度牙周炎患者的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 激光捕获显微切割, 微生物分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据, 微生物组数据 | 36个种植体周围炎样本(121395个细胞), 15个空间蛋白质组样本(337260个细胞), 8个重度牙周炎样本(225137个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1328 | 2025-10-05 |
Identification of endothelial INSR as an osteosarcoma-related biomarker and therapeutic target based on weighted gene co-expression network analysis
2025-Aug-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03414-1
PMID:40846806
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析和单细胞分析，识别出内皮细胞中的INSR作为骨肉瘤相关的生物标志物和治疗靶点 | 首次结合WGCNA和单细胞RNA测序分析，发现内皮细胞INSR在骨肉瘤中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 识别骨肉瘤的潜在药物靶点 | 骨肉瘤患者基因表达数据 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归分析, 差异表达基因分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个数据库的骨肉瘤样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1329 | 2025-10-05 |
Healing of lytic lesions and restoration of bone health in multiple myeloma through sclerostin inhibition
2025-Aug-22, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00699-4
PMID:40847323
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研究论文 | 本研究探讨了通过抑制硬化素(Scl-ab)促进多发性骨髓瘤患者溶骨性病变愈合和恢复骨骼健康的潜力 | 首次证明Scl-ab不仅能促进骨骼修复，还能与抗癌药物协同抑制肿瘤，并通过单细胞RNA测序揭示其作用机制 | 研究包含回顾性临床分析，需要更多前瞻性临床试验验证 | 评估硬化素抑制剂在多发性骨髓瘤骨病治疗中的疗效和机制 | 多发性骨髓瘤小鼠模型和患者来源样本 | 骨骼疾病研究 | 多发性骨髓瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床缓解期多发性骨髓瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1330 | 2025-10-05 |
Elucidating the dynamic tumor microenvironment through deep transcriptomic analysis and therapeutic implication of MRE11 expression patterns in hepatocellular carcinoma
2025-Aug-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03931-7
PMID:40841647
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研究论文 | 通过深度转录组分析探索肝细胞癌肿瘤微环境动态变化，并验证MRE11基因的免疫调节和预后意义 | 首次系统揭示MRE11在肝细胞癌肿瘤微环境中的动态调控机制，特别是在免疫治疗条件下的作用 | 样本量相对有限（92例），需要更大规模验证 | 探索肝细胞癌肿瘤微环境动态变化及关键调控基因 | 肝细胞癌患者组织样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | SMR分析，单细胞RNA测序，空间转录组学，qPCR，免疫组化，Western blotting | 101种机器学习算法构建的预后模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 92例肝细胞癌患者样本，加上公共数据库多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1331 | 2025-10-05 |
Revelation of prognosis and tumor microenvironment of colorectal cancer based on genes related to antibody-dependent cellular phagocytosis and single-cell landscape
2025-Aug-21, Clinical proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s12014-025-09553-5
PMID:40841999
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研究论文 | 本研究基于抗体依赖性细胞吞噬作用相关基因构建了结直肠癌预后模型，并通过单细胞数据分析揭示了肿瘤微环境特征 | 首次基于ADCP相关基因构建结直肠癌预后模型，并结合单细胞测序数据深入分析肿瘤微环境 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 开发结直肠癌预后预测工具并探索治疗指导策略 | 结直肠癌患者和肿瘤微环境中的各类细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,分子对接 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA-CRC队列和GEO验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1332 | 2025-10-05 |
APOE-high myeloid cells are uniquely associated with metastatic intrathoracic lymph nodes obtained by EBUS-TBNA in primary lung cancer
2025-Aug-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01091-5
PMID:40835684
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研究论文 | 通过单细胞技术分析EBUS-TBNA获取的胸腔内淋巴结样本，发现转移性淋巴结中APOE高表达髓系细胞的独特特征 | 首次在EBUS-TBNA样本中通过单细胞RNA测序和质谱流式分析揭示转移性淋巴结中APOE高表达髓系细胞的独特表型和细胞间相互作用特征 | 样本量较小（18例转移患者和4例对照），EBUS-TBNA样本量微小可能影响分析结果 | 探索肺癌转移性淋巴结的免疫细胞特征及其诊断价值 | 经病理证实的肺癌患者胸腔内淋巴结样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 22例样本（18例转移性淋巴结，4例非转移对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 1333 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome analysis identifies MIF as a novel tumor-associated neutrophil marker for pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Aug-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01085-3
PMID:40835726
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析鉴定MIF作为胰腺导管腺癌的新型肿瘤相关中性粒细胞标志物 | 首次识别出MIF+中性粒细胞作为胰腺导管腺癌的新型肿瘤相关中性粒细胞亚型，并阐明其促进肿瘤进展的机制 | 未明确说明样本数量和研究队列的详细信息 | 探索胰腺导管腺癌中肿瘤相关中性粒细胞的亚型和功能 | 胰腺导管腺癌患者组织、原位胰腺肿瘤模型和患者来源异种移植模型 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1334 | 2025-10-05 |
Identifying genes associated with Sorafenib resistance in hepatocellular carcinoma to develop risk model
2025-Aug-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03442-x
PMID:40835789
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研究论文 | 本研究通过识别与索拉非尼耐药相关的基因，开发了一个用于预测肝细胞癌患者预后的风险模型 | 识别了305个潜在耐药相关基因并建立了七基因风险模型，该模型在1年、3年和5年生存预测中表现出色 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发预测肝细胞癌患者索拉非尼耐药和预后的风险模型 | 肝细胞癌细胞系和患者数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 差异基因表达分析 | 风险预测模型, 共识聚类, 主成分分析 | 转录组数据, 突变数据, 临床数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 使用Seurat和Harmony R包进行单细胞RNA测序数据处理 |
| 1335 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals hemocyte heterogeneity, differentiation trajectories, and viral tropism in shrimp (Macrobrachium rosenbergii) infected with decapodiridovirus litopenaeus1
2025-Aug-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00790-25
PMID:40679295
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了罗氏沼虾在DIV1病毒感染下的血细胞异质性、分化轨迹和病毒嗜性 | 首次在单细胞分辨率下构建了虾类血细胞在病毒感染下的转录图谱，揭示了血细胞亚群的异质性、分化轨迹和免疫应答特征 | 研究仅针对罗氏沼虾和DIV1病毒，结果在其他虾种或病毒中的普适性有待验证 | 探究虾类血细胞在病毒感染下的转录异质性和免疫应答机制 | 罗氏沼虾血细胞 | 单细胞生物学 | 甲壳类病毒病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1336 | 2025-10-05 |
Inhibition of interferon signaling improves rabbit calicivirus replication in biliary organoid cultures
2025-Aug-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00574-25
PMID:40709942
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研究论文 | 本研究通过使用干扰素信号通路抑制剂Ruxolitinib，首次实现了兔出血症病毒在胆道类器官培养系统中的连续传代 | 首次发现干扰素信号通路抑制剂能显著提高兔出血症病毒在类器官培养系统中的复制效率并实现连续传代 | 研究仅实现了四次连续传代，病毒培养系统的长期稳定性仍需进一步验证 | 开发支持兔出血症病毒有效复制的细胞培养系统 | 兔肝脏来源的胆道类器官培养系统 | 病毒学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR，免疫荧光分析 | 类器官培养模型 | 基因表达数据，图像数据 | 兔肝脏来源的胆道类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1337 | 2025-10-05 |
CAFs exosomal miR-21-5p suppresses ferroptosis and promotes proliferation and migration in osteosarcoma
2025-Aug-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03930-8
PMID:40826086
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-21-5p抑制铁死亡并促进骨肉瘤增殖和迁移的分子机制 | 首次发现CAFs来源的外泌体miR-21-5p通过抑制铁死亡促进骨肉瘤恶性进展 | 需要进一步探索miR-21-5p调控铁死亡的具体下游靶点 | 探究CAFs在骨肉瘤肿瘤微环境中的作用机制 | 骨肉瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,外泌体miRNA测序,qRT-PCR,CCK8,Transwell,透射电镜,NTA分析,siRNA干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据,外泌体miRNA测序数据 | GSE162454数据集 | NA | 单细胞RNA测序,外泌体miRNA测序 | NA | NA |
| 1338 | 2025-10-05 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
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研究论文 | 本研究探讨了衰老相关分泌表型因子CXCL12在年龄相关性内皮功能障碍中的作用及非瑟酮的干预机制 | 首次通过单细胞转录组学揭示衰老内皮细胞中CXCL12表达上调，并证明非瑟酮通过靶向SASP因子改善血管功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类内皮细胞的验证实验有限 | 阐明衰老内皮细胞的分子变化及其在年龄相关性内皮功能障碍中的作用机制 | 年轻和老年小鼠的主动脉组织、分离的小鼠动脉、培养的人内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 蛋白质检测, 细胞培养实验 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 年轻(6月龄)和老年(27月龄)小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1339 | 2025-10-05 |
The expression of PD-1 ligands in the immune microenvironment was altered in TTF-1-negative lung adenocarcinoma
2025-Aug-18, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-025-01275-y
PMID:40824335
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研究论文 | 本研究探讨TTF-1阴性肺腺癌中肿瘤免疫微环境的特征变化 | 首次揭示TTF-1阴性肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的PD-L1/PD-L2表达下调与免疫抑制微环境的关系 | PDCD1LG2表达模式不一致，样本量有限，需进一步验证 | 研究TTF-1表达对肺腺癌免疫微环境的影响 | 226例肺腺癌标本和公共单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 226例肺腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1340 | 2025-10-05 |
A hybrid adversarial autoencoder-graph network model with dynamic fusion for robust scRNA-seq clustering
2025-Aug-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11941-y
PMID:40826008
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研究论文 | 提出一种基于对抗自编码器和图卷积网络的深度聚类方法scCAGN，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 结合对抗自编码器和交叉注意力图卷积网络，采用动态信息融合机制和联合聚类方法，实现无标签的深度细胞特征提取 | NA | 解决单细胞RNA测序数据在细胞聚类中面临的异质性、稀疏性和高维度等技术挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器(AAE), 图卷积网络(GCN) | 单细胞RNA测序数据 | 八个典型单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |