单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1321	2025-04-13	Age-Dependent Bi-Phasic Dynamics of Ly49+CD8+ Regulatory T Cell Population 2025-Apr, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14461 PMID:39696807	research paper	该研究首次揭示了Ly49+CD8+调节性T细胞群体在衰老过程中的双相动态变化	首次在衰老背景下研究了非冗余的Foxp3-CD8调节性T细胞，并建立了CD8 Tregs与虚拟记忆T细胞的表型区分	研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自PBMC的单细胞RNA-seq分析	探究CD8调节性T细胞在衰老过程中的动态变化及其免疫调节作用	小鼠和人类外周血单个核细胞(PBMC)中的CD8调节性T细胞	免疫学	衰老相关免疫疾病	流式细胞术、转录组分析、scRNA-seq	NA	基因表达数据、流式细胞数据	小鼠生命周期样本和人类PBMC scRNA-seq数据集
1322	2025-04-13	Nuclear respiratory factor-1 (NRF1) induction as a powerful strategy to deter mitochondrial dysfunction and senescence in mesenchymal stem cells 2025-Apr, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14446 PMID:39720856	研究论文	本研究探讨了核呼吸因子-1（NRF1）过表达对间充质干细胞（MSCs）线粒体功能障碍和衰老的抑制作用	首次提出NRF1过表达可通过增强线粒体功能来延缓MSCs衰老，为基于MSCs的再生疗法提供了新策略	研究主要基于体外实验，尚未在动物模型或临床环境中验证其效果	探索NRF1过表达对MSCs衰老的抑制作用及其潜在机制	间充质干细胞（MSCs）	细胞生物学	衰老相关疾病	scRNA-Seq	NA	基因表达数据	未明确说明具体样本数量
1323	2025-04-13	Therapeutic Black Phosphorus Nanosheets Elicit Neutrophil Response for Enhanced Tumor Suppression 2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414779 PMID:39840467	research paper	研究探讨了聚乙二醇功能化的黑磷纳米片（BP-PEG）在乳腺癌模型中的免疫调节作用及其抗肿瘤效果	发现BP-PEG通过重塑肿瘤免疫微环境，特别是通过招募和激活中性粒细胞来抑制肿瘤生长和转移，这一机制此前未被充分探索	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索黑磷纳米片在癌症治疗中的免疫调节作用及其潜在应用	乳腺癌模型（4T1原位BALB/c小鼠和MMTV-PyMT转基因小鼠）	癌症免疫治疗	乳腺癌	质谱流式细胞分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序	小鼠模型	生物分子数据、细胞数据	免疫活性小鼠模型（具体数量未明确说明）
1324	2025-04-13	Human Pituitary Organoids: Transcriptional Landscape Deciphered by scRNA-Seq and Stereo-Seq, with Insights into SOX3's Role in Pituitary Development 2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414230 PMID:39951008	研究论文	本研究通过优化培养条件和应用scRNA-seq和Stereo-seq技术，揭示了人类垂体类器官的细胞组成、细胞间相互作用和空间分布，并探讨了SOX3基因在垂体发育中的作用	首次在垂体类器官中应用scRNA-seq和Stereo-seq技术，揭示了其转录组景观和空间信息，并发现SOX3基因干扰会影响iPSCs向垂体类器官的分化	该技术仍处于起步阶段，对于垂体类器官的细胞组成和相互作用的理解仍有不确定性	研究人类垂体类器官的细胞组成、细胞间相互作用和空间分布，并探索SOX3基因在垂体发育中的作用	人类垂体类器官	数字病理学	垂体疾病	scRNA-seq, Stereo-seq	3D类器官模型	转录组数据	NA
1325	2025-04-13	Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs 2025-Mar-19, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08727-3 PMID:40108456	研究论文	该研究通过量化小鼠和人类肺部纤维化过程中的基质变化，结合多组学数据，揭示了促纤维化和抗纤维化特征的功能价值	首次绘制了纤维化与消退过程中基质变化的时空轨迹，并鉴定了促消退成纤维细胞的功能及其在人类肺纤维化中的潜在应用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证仍需进一步扩大	揭示肺纤维化过程中促纤维化与抗纤维化因子的作用机制	小鼠和人类肺部组织	数字病理学	肺纤维化	单细胞测序、空间转录组分析	NA	组织图像、转录组数据	NA
1326	2025-04-13	Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints 2025-Mar-19, World neurosurgery IF:1.9Q2 DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908 PMID:40118372	研究论文	本研究通过整合单细胞测序和转录组分析，探讨铁死亡在缺血性脑卒中中的作用及免疫检查点的分子机制	首次结合单细胞测序和机器学习算法识别与缺血性脑卒中相关的关键铁死亡基因，并验证其诊断价值	研究样本量有限，仅基于公开数据集GSE247474进行分析	探索铁死亡在缺血性脑卒中中的分子机制，寻找早期诊断的生物标志物	缺血性脑卒中患者的星形胶质细胞和T细胞亚群	生物信息学	缺血性脑卒中	单细胞转录组测序，机器学习算法（Lasso回归和支持向量机）	Lasso回归，支持向量机	转录组数据	公开数据集GSE247474
1327	2025-04-13	Single-cell RNA sequencing of bone marrow reveals the immune response mechanisms of lymphocytes under avian leukosis virus subgroup J infection 2025-Mar-08, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2025.104995 PMID:40121758	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析禽白血病病毒J亚型感染下鸡骨髓淋巴细胞的免疫反应机制	首次使用单细胞RNA测序技术鉴定ALV-J感染下骨髓淋巴细胞的18个不同细胞簇，并揭示关键免疫反应基因和信号通路	未明确ALV-J病毒基因仅在部分细胞中表达的具体机制	探究ALV-J感染下骨髓淋巴细胞的免疫反应机制	鸡骨髓淋巴细胞	生物信息学	禽白血病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), Ingenuity Pathway Analysis(IPA)	NA	RNA测序数据	未明确样本数量(鸡骨髓淋巴细胞)
1328	2025-04-13	Local genetic covariance analysis with lipid traits identifies novel loci for early-onset Alzheimer's Disease 2025-Mar, PLoS genetics IF:4.0Q1 DOI:10.1371/journal.pgen.1011631 PMID:40096060	研究论文	本研究通过基因组多性状遗传协方差分析，探讨早发性阿尔茨海默病（EOAD）与脂质通路的共享遗传性	首次使用SUPERGNOVA方法进行局部遗传协方差分析，识别出EOAD与脂质性状之间的共享遗传架构和机制通路	样本量虽大但EOAD病例相对较少，可能影响统计功效	揭示EOAD与脂质代谢的遗传关联	早发性阿尔茨海默病患者（n=19,668）和血脂性状人群（n=1,320,016）	遗传学	阿尔茨海默病	GWAS meta分析、SUPERGNOVA协方差分析、eQTL共定位分析、单细胞RNA测序	SUPERGNOVA	基因组数据	EOAD样本19,668例，血脂样本1,320,016例
1329	2025-04-13	Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection 2025-Feb-25, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01507-24 PMID:39727412	研究论文	研究发现MUC2和MHC II分子的缺失导致小鼠对轮状病毒感染的罕见抗性	揭示了分泌细胞产物与MHC II表达之间先前未被认识的关联	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究分泌细胞在轮状病毒感染中的作用	Atoh1敲除小鼠和野生型小鼠	病理学	肠道感染	单细胞RNA测序	Atoh1敲除小鼠模型	基因表达数据	Atoh1敲除小鼠和野生型小鼠
1330	2025-04-13	Identification of therapeutic targets for Alzheimer's Disease Treatment using bioinformatics and machine learning 2025-01-31, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88134-w PMID:39890844	研究论文	本研究通过生物信息学和机器学习方法识别阿尔茨海默病的潜在治疗靶点	整合多种生物信息学方法和机器学习算法，识别出与阿尔茨海默病相关的五个核心基因，并筛选出潜在治疗药物	未提及实验验证结果或临床前研究数据	发现阿尔茨海默病的治疗靶点并构建诊断模型	阿尔茨海默病相关基因和潜在治疗药物	生物信息学	阿尔茨海默病	差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、Mfuzz聚类、单细胞RNA测序	LASSO回归、SVM-RFE、随机森林	基因表达数据	未明确说明样本数量
1331	2025-04-13	GPX4 expression changes in proximal tubule cells highlight the role of ferroptosis in IgAN 2025-01-31, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87228-9 PMID:39890853	研究论文	本研究探讨了氧化应激在IgA肾病中的作用，特别是通过单细胞RNA测序和微阵列数据分析，揭示了近端小管细胞中铁死亡的调控机制及其与GPX4表达的关系	首次通过单细胞RNA测序和微阵列数据综合分析，揭示了IgA肾病中近端小管细胞铁死亡的调控机制及GPX4的关键作用	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探究氧化应激在IgA肾病中的作用及其机制	IgA肾病患者的近端小管细胞和肾组织	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 微阵列分析, 免疫组化	NA	RNA测序数据, 微阵列数据, 图像数据	未明确提及具体样本数量，但包括IgA肾病患者的scRNA-seq数据和微阵列数据
1332	2025-04-13	TRα1 mutant suppresses KLF9 to cause endometrial metaplasia with ectopic IL-33 expression leading to uterine fibrosis and infertility 2025-01-31, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86848-5 PMID:39890871	研究论文	研究甲状腺激素受体突变如何通过抑制KLF9导致子宫内膜化生和纤维化，进而引发不孕	揭示了KLF9在子宫内膜正常分化中的关键作用，以及突变TRα1通过抑制KLF9导致子宫内膜化生和纤维化的新机制	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证	探究甲状腺激素受体突变导致不孕的分子机制	携带突变TRα1的小鼠子宫内膜	生殖医学	不孕症	RNA-seq分析、激光捕获显微切割、空间转录组学	小鼠模型	基因表达数据、组织学数据	突变TRα1小鼠的子宫内膜组织
1333	2025-04-13	Characterisation of macrophages in healthy and diseased livers in mice: identification of necrotic lesion-associated macrophages 2025-Jan, eGastroenterology DOI:10.1136/egastro-2025-100189 PMID:40212045	研究论文	本研究通过多重免疫荧光染色、高级图像分析和单细胞RNA测序技术，对健康和小鼠病肝中的巨噬细胞进行了表征	识别了坏死病变相关巨噬细胞，并揭示了它们在坏死病变清除中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类肝脏中验证	研究肝脏巨噬细胞的异质性、空间分布及其与其他细胞的相互作用	健康和小鼠病肝中的巨噬细胞	免疫学	肝病	多重免疫荧光染色、高级图像分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	图像、基因表达数据	健康和小鼠病肝样本
1334	2025-04-13	Dynamic regulation of Rgs16 and its correlation with Neuregulin1 expression in acute and chronic nerve injury 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1540453 PMID:40213396	研究论文	研究Rgs16在急性和慢性神经损伤中的动态调控及其与Neuregulin1表达的相关性	揭示了Rgs16在神经损伤后的动态表达模式及其与Neuregulin1的潜在反馈机制	需要进一步研究以明确Rgs16的具体功能	探究Rgs16在周围神经系统（PNS）损伤中的作用	小鼠和大鼠的坐骨神经和正中神经	神经科学	周围神经病变	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	野生型和CMT1A转基因大鼠的坐骨神经
1335	2025-04-13	Pan-cancer analysis reveals MTTP as a prognostic and immunotherapeutic biomarker in human tumors 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1549965 PMID:40213543	research paper	该研究通过泛癌分析揭示了MTTP作为人类肿瘤预后和免疫治疗生物标志物的潜力	首次全面评估MTTP在多种癌症中的表达及其与免疫微环境和铁死亡的关系	研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胃癌细胞	探索MTTP在肿瘤中的预后价值和免疫治疗潜力	人类多种肿瘤类型和胃癌细胞系	肿瘤免疫学	泛癌研究（重点胃癌）	生物信息学分析（TIMER 2.0、GEPIA等）、单细胞测序、体外和体内实验	NA	RNA-seq数据、单细胞测序数据	TCGA数据库中的泛癌数据及胃癌细胞实验
1336	2025-04-13	An anti-FAP-scFv-functionalized exosome-carrying hydrogel delivers SKI mRNA to fibrotic nucleus pulposus cells to alleviate intervertebral disc degeneration by regulating FOXO3 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.107776 PMID:40213661	研究论文	本研究探讨了TGF-β信号抑制因子在髓核纤维化中的作用及机制，并开发了一种靶向递送SKI mRNA的Gel@EX系统以缓解椎间盘退变	开发了一种pH响应的外泌体/水凝胶系统Gel@EX，用于靶向递送SKI mRNA至表达FAP的纤维化髓核细胞，并通过调控FOXO3抑制TGF-β信号通路	研究主要基于大鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索TGF-β信号抑制因子在髓核纤维化中的作用机制，并开发新的治疗策略	纤维化髓核细胞（NPC）和椎间盘退变（IVDD）	生物医学工程	椎间盘退变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、共免疫沉淀	大鼠模型	RNA测序数据、分子相互作用数据	未明确说明具体样本数量，但涉及大鼠模型和HEK-293T细胞
1337	2025-04-13	Hepatic stellate cell-derived microfibrillar-associated protein 2 prevents liver fibrosis by regulating extracellular matrix and inflammation 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.109771 PMID:40213670	研究论文	研究探讨了微纤维相关蛋白2（MFAP-2）在肝纤维化中的作用及其机制	揭示了HSC来源的MFAP-2在肝纤维化中的保护作用及其通过调节ECM和炎症的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究MFAP-2在肝纤维化进程和消退中的作用	肝星状细胞（HSCs）和肝纤维化小鼠模型	肝病研究	肝纤维化	组织芯片、小鼠模型、RNA测序（bulk和scRNA-seq）、蛋白质组学	小鼠肝纤维化模型（CCl4注射和胆管结扎）	基因表达数据、蛋白质数据	人类组织芯片和小鼠模型
1338	2025-04-13	A distinct subgroup with Schwann-like differentiation presents immune resistance and poor prognosis in plantar melanoma 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.99526 PMID:40213656	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了足底黑色素瘤中一个具有雪旺细胞样分化的亚群，该亚群与免疫抵抗和不良预后相关	首次揭示了足底黑色素瘤向雪旺细胞样分化的独特进化轨迹，并发现该过程受特定转录因子调控，导致免疫耐受和淋巴结转移倾向增加	样本量相对有限（20例足底黑色素瘤和6例正常样本），且机制研究有待进一步深入	探究足底黑色素瘤的肿瘤异质性、细胞亚群进化及其对免疫环境和预后的影响	足底黑色素瘤患者肿瘤组织	digital pathology	melanoma	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics, multiplex immunohistochemistry (mIHC), single-cell multiomics analysis	NA	single-cell RNA sequencing data, spatial transcriptomics data, bulk RNA sequencing data	20例足底黑色素瘤样本和6例正常样本（单细胞分析），68例黑色素瘤患者（批量RNA测序分析）
1339	2025-04-13	O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice 2024-Nov, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00263-6 PMID:39375536	research paper	该研究揭示了高血糖通过增加海马神经元中Bmal1的O-GlcNAcylation修饰，进而导致认知功能障碍的分子机制	首次发现高血糖通过O-GlcNAcylation修饰Bmal1影响生物钟基因表达，进而导致线粒体钙超载和神经元损伤	研究仅在糖尿病小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究糖尿病相关认知功能障碍的分子机制	糖尿病小鼠模型中的海马神经元	分子生物学	糖尿病	单细胞RNA测序	动物模型	基因表达数据	糖尿病小鼠模型
1340	2025-04-13	Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye 2024-Oct, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003 PMID:39306240	research paper	研究干燥性干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响，特别关注单核吞噬细胞	使用单细胞RNA测序和scATAC-seq技术分析干燥应激下结膜免疫细胞的基因表达和染色质可及性变化，发现单核吞噬细胞在干燥应激下的显著变化及其调控机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	评估干眼症对结膜免疫细胞的影响	C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞	免疫学	干眼症	单细胞RNA测序(scRNA-seq), scATAC-seq	NA	基因表达数据, 染色质可及性数据	非应激和干燥应激的C57BL/6小鼠