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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-10-05 |
RESCUE: recovery of idiosyncratic expression patterns in spatial transcriptomics
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.11.669542
PMID:40832184
|
研究论文 | 开发了一种名为RESCUE的计算方法，用于恢复空间转录组学中被现有分析方法遗漏的特殊表达模式 | 能够捕获脆弱或代表性不足的细胞类型、神经突等亚细胞结构以及细胞外表达等重要表达模式 | NA | 解决现有空间转录组学分析方法在捕获特殊表达模式方面的不足 | 空间转录组学数据，特别是蜜蜂大脑MERFISH数据和多个ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，MERFISH | RESCUE计算方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 1322 | 2025-10-05 |
Quantum Annealing for Enhanced Feature Selection in Single-Cell RNA Sequencing Data Analysis
2025-Aug-15, ArXiv
PMID:40832053
|
研究论文 | 本研究利用量子退火增强的QUBO方法进行单细胞RNA测序数据的特征选择 | 首次将量子退火赋能的二次无约束二进制优化(QUBO)应用于单细胞RNA测序数据的特征选择 | NA | 改进单细胞RNA测序数据分析中的特征选择方法 | 人类细胞分化系统和抗癌药物耐药性研究数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | QUBO(二次无约束二进制优化) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1323 | 2025-10-05 |
Neoadjuvant immunotherapy promotes the formation of mature tertiary lymphoid structures in a remodeled pancreatic tumor microenvironment
2025-Aug-15, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了新辅助免疫治疗促进胰腺癌中成熟三级淋巴结构形成及其与肿瘤微环境重塑的关系 | 首次构建了接受新辅助免疫治疗的胰腺癌患者肿瘤和淋巴结的空间多组学图谱，发现了TLS特异性空间基因表达特征与患者生存改善的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究胰腺癌中三级淋巴结构在免疫治疗中的作用及其空间特征 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织和肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学 | 机器学习分类模型,无监督学习 | 图像,基因表达数据 | 接受联合新辅助免疫治疗的胰腺癌患者样本 | NA | 空间转录组学,成像质谱流式 | NA | NA |
| 1324 | 2025-10-05 |
Transcriptomic HEPN1 signatures predict treatment response in low grade glioma
2025-Aug-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03395-1
PMID:40815398
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现HEPN1等铁死亡相关基因可作为低级别胶质瘤治疗反应的预测生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下系统分析铁死亡相关基因在胶质瘤微环境中的表达模式及细胞异质性 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于GL261和BV2细胞系 | 建立HEPN1作为胶质瘤铁死亡靶向治疗的关键生物标志物 | 胶质瘤患者基因表达数据及GL261、BV2细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 差异表达分析 | 基因共表达网络 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胶质瘤数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1325 | 2025-10-05 |
Preventive role of CD163-positive macrophages in postoperative peritoneal adhesions
2025-Aug-15, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00392-3
PMID:40817081
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定CD163阳性巨噬细胞在预防术后腹膜粘连中的关键作用 | 首次发现CD163阳性巨噬细胞通过调节纤溶系统和减少PAI-1分泌来抑制术后腹膜粘连形成 | 研究主要基于动物模型和细胞系实验，人类样本验证相对有限 | 探索巨噬细胞亚型在术后腹膜粘连形成中的具体作用和机制 | 巨噬细胞亚型、间皮细胞、术后腹膜粘连模型 | 单细胞测序分析 | 术后并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 阑尾炎病例来源的人类术后腹膜粘连模型、小鼠盲肠结扎穿孔模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1326 | 2025-10-05 |
Illuminating photoreceptors: TGFβ signaling modulates the severeness of retinal degeneration
2025-Aug-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02685-5
PMID:40817252
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和伪时间分析揭示了TGFβ信号通路在光诱导视网膜变性中的关键调控作用 | 首次结合光诱导视网膜变性小鼠模型与单细胞RNA测序技术，识别出疾病相关视杆细胞亚群并发现TGFβ信号通路和RISC复合物的关键调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，人类视网膜变性的机制可能有所不同 | 探索视网膜变性过程中光感受器细胞死亡的分子机制 | 小鼠视网膜光感受器细胞 | 单细胞组学 | 视网膜变性 | 单细胞RNA测序, 伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 光诱导视网膜变性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1327 | 2025-10-05 |
Immature monocytic cells within tumors differentiate into immunosuppressive cells in resistant tumors to immunotherapy
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113141
PMID:40822347
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现未成熟单核细胞在免疫治疗耐药肿瘤中分化为免疫抑制细胞 | 首次鉴定出单核树突状祖细胞和普通单核祖细胞在免疫治疗敏感与耐药肿瘤中的差异分布及其向免疫抑制细胞分化的机制 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要进一步临床验证 | 探索骨髓细胞在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的作用及其与免疫检查点抑制剂耐药性的关系 | 4T1乳腺癌克隆模型、乳腺癌、肺癌和结直肠癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌、肺癌、结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1328 | 2025-10-05 |
Identification and mechanistic insights of ubiquitin-proteasome system and pyroptosis-related biomarkers in type 2 diabetes mellitus
2025-Aug-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v16.i8.104879
PMID:40837339
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定2型糖尿病中泛素-蛋白酶体系统和细胞焦亡相关生物标志物 | 首次整合泛素-蛋白酶体系统和细胞焦亡相关基因，发现四个新型生物标志物(ABCC8、RBP4、RASGRF1、SLC34A2)在2型糖尿病中的作用机制 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 探究2型糖尿病中泛素-蛋白酶体系统和细胞焦亡相关基因的作用机制 | 2型糖尿病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 生物信息学分析, 单细胞测序, qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集(GSE76894、GSE41762、GSE86469) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1329 | 2025-10-05 |
Autoimmune origin for immune checkpoint inhibitor-diabetes revealed by deep immune phenotyping of the pancreas
2025-Aug-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011818
PMID:40813111
|
研究论文 | 通过胰腺深度免疫表型分析揭示免疫检查点抑制剂相关糖尿病的自身免疫起源 | 首次在免疫检查点抑制剂相关糖尿病患者中通过手术切除胰腺组织进行单细胞RNA测序和免疫表型分析 | 仅基于单一病例研究，样本量有限 | 阐明免疫检查点抑制剂相关糖尿病的发病机制 | 一名接受免疫检查点抑制剂治疗的转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫表型分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫表型数据 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1330 | 2025-10-05 |
Decoding the Effects of Bexarotene treatment on brain of AD-like model mice: Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility Analysis
2025-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7201032/v1
PMID:40831503
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究Bexarotene治疗对阿尔茨海默病模型小鼠大脑的转录调控机制 | 首次整合单核ATAC-seq、单细胞RNA-seq和RXR ChIP-seq技术，系统揭示RXR激活在多层面转录调控级联反应中的作用机制 | 研究仅限于APP/PS1ΔE9小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究RXR激活对染色质结构和基因表达的影响，为神经退行性疾病提供治疗策略 | Bexarotene处理的APP/PS1ΔE9阿尔茨海默病模型小鼠 | 单细胞多组学 | 阿尔茨海默病 | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 转录因子足迹分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 蛋白质-DNA相互作用数据 | APP/PS1ΔE9转基因小鼠模型 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 1331 | 2025-10-05 |
Colorectal cancer heterogeneity co-evolves with tumor architecture to determine disease outcome
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.11.669722
PMID:40832253
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于深度学习的图像分析范式，通过量化结直肠癌组织结构和核形态来预测患者预后 | 揭示了肿瘤组织结构与细胞状态之间的动态共进化关系，发现组织结构通过促进不同癌症干细胞状态来驱动肿瘤异质性 | NA | 探索结直肠癌异质性与肿瘤结构的关系及其对疾病结局的影响 | 结直肠癌患者组织样本和患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 深度学习, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | 深度学习 | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1332 | 2025-10-05 |
Multi-Ancestry Transcriptome-wide Association Studies Uncover New Insights into Breast Cancer Genetics and Biology
2025-Aug-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.12.25333509
PMID:40832405
|
研究论文 | 通过多祖先转录组范围关联研究揭示乳腺癌遗传学和生物学新见解 | 开发了祖先特异性遗传模型，首次在TWAS中报告103个新基因，其中46个基因远离已知风险变异位点 | 研究样本主要来自非洲、亚洲和欧洲血统，可能不适用于其他人群 | 发现乳腺癌易感基因并解析其生物学机制 | 652名女性的正常乳腺组织样本和178,534例乳腺癌患者及248,300名对照 | 遗传学 | 乳腺癌 | 转录组范围关联研究(TWAS), 单细胞RNA测序 | 遗传预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 652个正常乳腺组织样本 + 426,834个GWAS样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1333 | 2025-10-05 |
LLM-based cell type annotation harmonization across single-cell studies using GCTHarmony
2025-Aug-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7151095/v1
PMID:40831495
|
研究论文 | 开发了一种基于大语言模型的单细胞研究细胞类型注释协调方法GCTHarmony | 首次利用OpenAI文本嵌入模型将任意细胞类型注释映射到标准化细胞本体术语，协调不同研究间的注释层次差异 | NA | 解决单细胞RNA-seq研究中细胞类型注释不一致的问题 | 单细胞研究中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | LLM | 文本 | NA | OpenAI | 文本嵌入 | NA | OpenAI文本嵌入模型 |
| 1334 | 2025-10-05 |
CART-GPT: A T Cell-Informed AI Linguistic Framework for Interpreting Neurotoxicity and Therapeutic Outcomes in CAR-T Therapy
2025-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.08.669387
PMID:40832178
|
研究论文 | 开发了一个基于Transformer的AI模型CART-GPT，用于预测CAR-T细胞疗法的治疗效果和神经毒性风险 | 首个针对CAR-T疗法同时预测治疗反应和ICANS神经毒性风险的AI模型，采用新颖的细胞聚合策略将单细胞预测与患者水平指标关联 | NA | 解决CAR-T细胞疗法中患者特异性治疗效果和神经毒性预测的临床挑战 | CAR-T细胞疗法患者 | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 112万个CAR-T单细胞RNA-seq图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1335 | 2025-10-05 |
Translating the Transcriptome: A Connectomics Approach for Gene-Network Mapping and Clinical Application
2025-Aug-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.08.25333301
PMID:40832435
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研究论文 | 提出一种结合空间转录组学和规范功能连接性的基因网络映射框架，用于研究基因表达与脑网络的关系 | 首次将空间转录组学与规范功能连接性相结合，开发了基因网络映射框架，能够识别与基因表达相关的脑网络 | NA | 研究基因表达如何塑造大脑功能连接组，并开发网络信息化的精准医疗诊断和治疗方法 | 大脑功能连接组、基因表达网络、脑部疾病相关基因 | 计算生物学 | 脑部疾病 | 空间转录组学, 功能连接性分析, 深部脑刺激 | 网络映射框架 | 基因表达数据, 功能连接数据, 临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1336 | 2025-10-05 |
Tissue-Resident Macrophage and Dendritic Cell Cooperation Drives Type I IFN Immunity to Enteroviruses in the Liver
2025-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669977
PMID:40832243
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏中组织驻留巨噬细胞和树突状细胞通过I型干扰素免疫应答协作抵抗肠道病毒感染的机制 | 首次阐明库普弗细胞和树突状细胞亚群在驱动早期I型干扰素应答中的关键作用，并证明肝细胞依赖于免疫细胞产生的保护性干扰素信号 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 解析I型和III型干扰素在保护肝脏免受肠道病毒感染中的相对贡献 | 肠道病毒感染的肝脏免疫应答机制 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1337 | 2025-10-05 |
Coxiella burnetii strains elicit distinct inflammatory responses in human macrophages
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.10.669536
PMID:40832301
|
研究论文 | 本研究通过分析不同毒力贝氏柯克斯体菌株感染人类肺泡巨噬细胞后的转录反应，揭示了菌株特异性免疫应答差异 | 首次系统比较不同毒力贝氏柯克斯体菌株在人类巨噬细胞中引发的特异性炎症反应，并结合单细胞RNA测序揭示巨噬细胞应答异质性 | 研究仅关注人类肺泡巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或动物模型 | 阐明贝氏柯克斯体不同菌株与宿主巨噬细胞的相互作用机制 | 人类肺泡巨噬细胞(hAMs)和三种贝氏柯克斯体菌株(强毒NMI/G、减毒NMII、无毒Dugway) | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞因子检测 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1338 | 2025-10-05 |
STARComm Scalably Detects Emergent Modules of Spatial Cell-Cell Communication in Inflammation and Cancer
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669133
PMID:40832247
|
研究论文 | 开发了一种可扩展解释的计算方法STARComm，用于从空间转录组数据中检测细胞间通信模块 | 首次提出可扩展的多细胞通信交互模块检测方法，能够从2D和3D高plex空间转录组数据中发现空间共定位的受体-配体活性 | NA | 开发空间细胞间通信检测方法，用于炎症和癌症研究 | 人类组织中的细胞间通信网络 | 空间生物学 | 癌症, 慢性移植物抗宿主病 | 空间转录组学 | 计算方法 | 空间转录组数据 | 超过1400万个细胞，涵盖8种癌症类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1339 | 2025-10-05 |
Longitudinal transcriptomic analysis of SIV-infected rhesus macaques reveals peripheral immune dynamics throughout untreated SIV infection and long-term antiretroviral therapy
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.08.669172
PMID:40832257
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序纵向分析SIV感染恒河猴的外周血单核细胞，揭示未经治疗的SIV感染和长期抗逆转录病毒治疗期间的免疫动态变化 | 首次在非人灵长类动物模型中应用纵向单细胞转录组学系统描绘从急性感染到长期抗病毒治疗的完整免疫动态图谱 | 研究基于非人灵长类动物模型，结果向人类HIV感染的转化需要进一步验证 | 全面了解长期感染和治疗过程中的免疫动态变化，为HIV治愈策略提供见解 | SIV感染的恒河猴外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，完整前病毒DNA检测(IPDA) | NA | 单细胞转录组数据 | SIV感染恒河猴的纵向样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1340 | 2025-10-05 |
BioLLM: A standardized framework for integrating and benchmarking single-cell foundation models
2025-Aug-08, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101326
PMID:40843339
|
研究论文 | 介绍BioLLM框架，用于整合和评估单细胞基础模型 | 提出首个统一框架解决单细胞基础模型架构和编码标准异质性问题 | 未提及具体数据规模或实验设置的局限性 | 开发标准化框架以整合和评估单细胞基础模型 | 单细胞基础模型（scGPT、Geneformer、scFoundation、scBERT） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序分析 | 大型语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |