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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1321 2025-12-14
PD-1+/CXCR6+CD8+T lymphocytes promote MASLD malignant progression through inflammatory and immune dysregulation
2026-Jan-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了PD-1+/CXCR6+ CD8+ T淋巴细胞通过炎症和免疫失调促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病恶性进展的机制 揭示了在MASLD向HCC进展过程中,CD8 T细胞亚群(特别是PD-1+和CXCR6+亚群)的动态变化及其通过促进炎症和免疫失调驱动恶性转化的新机制 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,具体的分子机制和因果关系的深入验证有待进一步研究 阐明CD8 T细胞在MASLD向HCC恶性进展中的作用机制 MASLD模型小鼠、MASLD/HCC患者的临床样本 免疫学 肝细胞癌 流式细胞术、单细胞测序 NA 流式细胞数据、单细胞测序数据、临床生化数据 动物模型(HFD和HFD/HCC组小鼠)及MASLD/HCC患者临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1322 2025-12-14
Breakthroughs of ultrasound-targeted microbubble destruction in treating myocardial ischemia-reperfusion injury: from angiogenesis regulation to precise inflammation suppression
2025-Dec-31, Drug delivery IF:6.5Q1
综述 本文综述了超声靶向微泡破坏技术在治疗心肌缺血再灌注损伤中的最新进展,涵盖从血管生成调控到精准炎症抑制等多个方面 系统总结了UTMD技术通过调控HIF-1α/VEGF通路促进血管生成、抑制NLRP3炎症小体激活以减轻炎症反应的双重作用机制,并强调了结合放射组学、人工智能及多组学技术(如单细胞RNA测序)实现精准诊断与治疗的新策略 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,主要基于现有文献进行总结与展望 探讨超声靶向微泡破坏技术治疗心肌缺血再灌注损伤的机制、应用及未来研究方向 心肌缺血再灌注损伤及其相关的分子通路、细胞过程与治疗策略 心血管疾病 心血管疾病 超声靶向微泡破坏、单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、放射组学、人工智能图像分析 NA 多组学数据、医学影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1323 2025-12-14
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances IF:7.4Q1
综述 本文探讨了预测CAR T细胞疗法疗效的生物标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫的相互作用 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学和细胞因子多功能性分析等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物和优化治疗策略 NA 识别和验证CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 CAR T细胞疗法在淋巴恶性肿瘤患者中的疗效和安全性 机器学习 淋巴恶性肿瘤 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞因子多功能性分析 机器学习 转录组数据、蛋白质组数据、细胞因子数据 NA NA NA NA NA
1324 2025-12-14
Ovarian somatic tissue rejuvenates circulating apolipoproteins and promotes cognitive health in postreproductive female mice
2025-Dec-13, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过移植年轻卵巢体细胞组织或细胞,探索了其在改善老年雌性小鼠认知功能和脂质信号方面的作用 首次利用单细胞转录组学和拉曼光谱技术,识别出两种卵巢体细胞类型,这些细胞通过脂质信号通路恢复老年雌性小鼠的健康状态 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证,且具体分子机制需进一步阐明 探究年轻卵巢体细胞组织或细胞移植对老年雌性小鼠健康,特别是认知功能和脂质信号的影响 老年、生殖后雌性小鼠及其血清、组织样本 生物医学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,拉曼光谱 NA 转录组数据,光谱数据,生理数据 老年雌性小鼠样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1325 2025-12-14
Integrative bulk and single-cell transcriptomic profiling identifies core gene networks and potential therapeutic targets in glioma
2025-Dec-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多队列批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,系统识别了胶质瘤的核心基因网络和潜在治疗靶点 采用多算法整合策略(包括CytoHubba、LASSO、SVM-RFE和随机森林)筛选特征基因,并结合单细胞转录组数据验证了核心基因在肿瘤细胞亚群中的特异性表达模式 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,临床样本验证规模有限(69例),且功能机制尚未通过实验完全验证 识别胶质瘤的新型诊断生物标志物和潜在治疗靶点 胶质瘤组织样本及相关转录组数据 生物信息学 胶质瘤 批量RNA测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR WGCNA,LASSO回归,SVM-RFE,随机森林 基因表达数据,单细胞转录组数据 504个批量转录组样本(来自5个GEO数据集)和69个临床验证样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1326 2025-12-14
Spatial transcriptomics reveals expression gradients in developing wheat inflorescences at cellular resolution
2025-Dec-13, The Plant cell
研究论文 本研究利用MERFISH空间转录组技术,在细胞分辨率下揭示了小麦花序发育过程中沿顶端-基部轴的基因表达梯度 首次在小麦花序组织中优化并应用MERFISH技术,实现了200个基因在细胞水平的空间定位,揭示了花序发育的时空组织模式 仅分析了200个基因的表达模式,可能未覆盖所有相关基因;研究聚焦于小麦特定发育阶段,其他物种或阶段需进一步验证 解析小麦花序发育过程中基因表达的空间模式,以理解花序架构多样性的分子基础 小麦(Triticum aestivum)花序组织,包括四个发育阶段 空间转录组学 NA MERFISH(多重错误鲁棒荧光原位杂交) NA 空间转录组数据 约50,000个细胞,覆盖四个发育阶段 NA 空间转录组学 NA NA
1327 2025-12-14
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2025-Dec-13, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者感染COVID-19后,其循环髓系细胞因表观遗传印记而表现出过度炎症反应的分子机制 首次在单细胞水平揭示了ASCVD患者感染SARS-CoV-2后髓系免疫反应的失调特征,并证实了表观遗传印记通过I型干扰素信号通路导致过度炎症反应的机制 研究主要基于中度COVID-19患者,未涵盖重症病例;体外感染实验可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明心血管疾病患者感染COVID-19后出现更严重炎症反应的分子机制 动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者与COVID-19患者的免疫细胞 单细胞组学与免疫学 心血管疾病与COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、多重细胞因子检测、酶联免疫吸附试验(ELISA)、批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、细胞因子数据、临床数据 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA测序 NA NA
1328 2025-12-14
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,探索苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的分子机制 首次整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,系统揭示环境神经毒物苯并[a]芘通过靶向EGFR和HSP90AB1促进阿尔茨海默病发展的分子机制,并发现EGFR作为潜在生物标志物的诊断价值 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;单细胞数据仅来源于一个数据集(GSE157827),样本代表性可能有限 探索环境神经毒物苯并[a]芘在阿尔茨海默病发病机制中的作用 苯并[a]芘与阿尔茨海默病的共同靶点基因及其分子机制 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq,分子对接 LASSO,SVM 基因表达数据,单细胞转录组数据 使用了GEO数据库的AD差异表达数据和单细胞RNA-seq数据集(GSE157827),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1329 2025-12-14
MOH: a novel multilayer multi-omics heterogeneous graph for single-cell clustering
2025-Dec-12, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为MOH的新型多层多组学异构图算法,用于单细胞聚类分析 MOH通过构建多层异构图整合三种单细胞组学数据(scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学),并引入层内和层间边来捕捉关联和相似性关系,克服了传统方法仅整合两种组学数据且忽视细胞间相互作用的局限 未明确提及具体局限性,但暗示了模型在引入新组学数据时可能需要调整图结构,这可能影响其可扩展性 开发一种能够整合多种单细胞组学数据的聚类算法,以更准确地识别细胞群体 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学 机器学习 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 多层异构图算法 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
1330 2025-12-14
Heterogeneity of the intestinal mononuclear phagocyte compartment in health and inflammatory bowel disease
2025-Dec-12, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探索了人类肠道单核吞噬细胞在健康和克罗恩病中的异质性 发现了具有DC3转录特征的CD1c cDC亚群,并揭示了肠道cDC2s/DC3s在克罗恩病中增加且来源于特定前体细胞 研究主要关注回肠和结肠,未全面覆盖其他肠道区域或更广泛的炎症性肠病类型 探究人类肠道单核吞噬细胞多样性及其在炎症状态下的变化 人类回肠和结肠固有层中的单核吞噬细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞RNA测序, 细胞转录组和表位索引测序, 流式细胞术, 成像技术 NA 单细胞转录组数据, 表位数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1331 2025-12-14
Hepatic CD4 T Cells Predict Hepatocellular Carcinoma Risk on Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis Patients
2025-Dec-12, United European gastroenterology journal IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过分析MASH患者的肝活检样本,发现肝内CD4+ T细胞浸润增加与HCC风险相关,并结合临床参数构建了预测模型 首次在MASH患者中系统性地结合组织病理学、多重免疫组化和单细胞RNA-seq数据,识别出CD4+ T细胞密度作为HCC风险的预测标志物,并开发出高精度的预测模型 样本量较小(预HCC组10例,对照组13例),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 识别MASH患者发展为HCC的预测性免疫特征 MASH患者的肝活检样本(FFPE组织) 数字病理学 肝细胞癌 多重免疫组化,单细胞RNA-seq 预测模型(基于逻辑回归或类似方法) 图像,基因表达数据 23例MASH患者肝活检样本(预HCC组10例,对照组13例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1332 2025-12-14
Artificial Intelligence Revolution in Transcriptomics: From Single Cells to Spatial Atlases
2025-Dec-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了人工智能在单细胞RNA测序和空间转录组学数据分析中的应用、发展趋势及挑战 系统性地追踪了AI模型在转录组分析工作流程中的发展轨迹和演变趋势,并提供了模型选择的实用指南 作为综述文章,未涉及原始实验数据或新模型开发,主要基于现有文献进行总结 探讨人工智能如何变革转录组学数据分析,特别是在单细胞和空间转录组学领域 单细胞RNA测序和空间转录组学数据及其分析工作流程 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1333 2025-12-14
Colorectal Cancer Cell's Weapon: RNF32 Engages SPP1+ Macrophages to Foster Liver Metastasis, Targeted by Indole-3-Acetic Acid
2025-Dec-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了RNF32基因通过调控Wnt信号通路和招募SPP1+巨噬细胞,驱动结直肠癌肝转移的分子机制,并发现吲哚-3-乙酸可作为RNF32抑制剂抑制转移 首次发现RNF32通过催化GSK3β的K48连接泛素化稳定β-catenin激活Wnt通路,并鉴定其通过CCL2招募SPP1+巨噬细胞重塑转移前微环境,同时通过虚拟筛选发现吲哚-3-乙酸作为新型RNF32抑制剂 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化效果需进一步验证;虚拟筛选发现的抑制剂IAA在人体内的安全性和有效性尚未评估 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 结直肠癌细胞、巨噬细胞、小鼠肝转移模型 肿瘤生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、虚拟筛选、Cox回归、WGCNA NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 基于TCGA数据库的结直肠癌样本及单细胞测序数据,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1334 2025-12-14
Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility
2025-Dec-12, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1
研究论文 本研究采用蛋白质组范围的孟德尔随机化方法,揭示了铁死亡和坏死性凋亡通路在多发硬化症易感性中的因果作用,并识别出关键效应蛋白如IFNA4和TNFAIP3 首次通过蛋白质组范围的孟德尔随机化验证了铁死亡和坏死性凋亡通路在多发硬化症易感性中的因果关联,并识别出新的治疗靶点 研究依赖于遗传工具变量,可能存在多效性偏倚,且转录组验证主要基于现有数据,缺乏实验功能验证 探究铁死亡和坏死性凋亡通路及其上游调节因子与多发硬化症风险之间的因果联系 与铁死亡和坏死性凋亡通路相关的蛋白质、上游免疫调节因子以及多发硬化症患者样本 生物信息学 多发硬化症 孟德尔随机化、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq 孟德尔随机化模型 蛋白质组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1335 2025-12-14
HIDF: Integrating Tree-Structured scRNA-seq Heterogeneity for Hierarchical Deconvolution of Spatial Transcriptomics
2025-Dec-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为HIDF的分层迭代去卷积框架,用于整合树状结构的单细胞RNA测序异质性,以从空间转录组数据中恢复单细胞空间分布 HIDF通过分层迭代优化机制,结合簇树引导,逐步从粗到细解析细胞异质性,并引入空间邻域和跨层正则化约束以增强稳定性,从而揭示传统方法无法检测的细胞亚型空间异质模式 NA 解决主流空间转录组技术因空间分辨率有限而掩盖单细胞信息的问题,通过整合单细胞RNA测序参考数据推断细胞组成 空间转录组数据中的细胞异质性和空间组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 分层迭代优化框架 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1336 2025-12-14
Interferon-stimulated gene GALNT2 restricts respiratory virus infections
2025-Dec-12, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序,揭示了干扰素刺激基因GALNT2作为抗病毒因子,通过O-糖基化机制限制多种冠状病毒和甲型流感病毒的复制,影响病毒清除和疾病严重程度 首次将GALNT2鉴定为抗病毒干扰素刺激基因,并阐明其通过O-糖基化调控病毒糖蛋白加工和病毒-细胞融合的机制,同时发现病毒刺突蛋白的丝氨酸残基是GALNT2敏感性的关键遗传决定因素 研究主要基于体外和体内实验,人类遗传数据分析可能受样本量限制,且GALNT2在其他呼吸道病毒中的作用尚未全面探索 探究干扰素刺激基因在抗呼吸道病毒感染中的功能和机制 野生型和IFNAR缺陷小鼠的肺组织、COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞,以及多种冠状病毒和甲型流感病毒 自然语言处理 NA 转录组分析、单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 野生型和IFNAR小鼠的肺组织样本、COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1337 2025-12-14
S1PR3 Inhibition in alveolar epithelial cells alleviates pulmonary fibrosis by enhancing alveolar barrier function
2025-Dec-12, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究探讨了S1PR3在肺泡上皮细胞中的表达及其在肺纤维化中对肺泡-毛细血管屏障功能的影响 首次在肺纤维化模型中系统研究了肺泡上皮细胞特异性S1PR3的功能,并验证了其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行临床验证 探究S1PR3在肺纤维化发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的可行性 肺泡上皮细胞、肺纤维化小鼠模型、特发性肺纤维化患者样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、siRNA敲低、选择性拮抗剂抑制 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学图像 公共单细胞RNA测序数据集中的特发性肺纤维化患者样本及博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1338 2025-12-14
Multiomics insights into rumen microbiome and function in grazing lambs: implications for nutrient absorption and grassland sustainability
2025-Dec-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了放牧羔羊瘤胃微生物组与功能在营养吸收和草地可持续性中的作用 首次结合宏基因组、宏转录组、单细胞RNA测序和血清代谢组学,系统解析了瘤胃微生物与上皮细胞亚型在草料消化和短链脂肪酸代谢中的相互作用 研究仅针对羔羊,结果可能不适用于其他反刍动物;实验设计为双因素(放牧强度和精料补充),但未考虑长期效应 探究瘤胃微生物组如何调控草料摄入和宿主代谢,以优化反刍动物管理策略并促进草地可持续性 72只放牧羔羊的瘤胃微生物组、瘤胃壁上皮细胞和血清代谢物 微生物组学 NA 宏基因组分析、宏转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、血清代谢组学 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、代谢组数据 72只羔羊 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1339 2025-12-14
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Dec-12, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究利用App敲入小鼠模型,探索生活方式干预如何影响阿尔茨海默病临床前阶段的社会行为、小胶质细胞功能及免疫反应 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,通过连续追踪至7月龄,结合单细胞RNA测序技术,揭示了临床前阶段社会行为缺陷与小胶质细胞免疫监视功能受损的早期关联,并发现环境富集可调节干扰素反应性小胶质细胞 研究基于还原论的小鼠模型,可能无法完全模拟人类阿尔茨海默病的复杂性;样本量未明确说明;结果主要聚焦于临床前阶段,未延伸至疾病晚期表现 探究生活方式因素(通过环境富集模拟)对阿尔茨海默病临床前阶段行为、神经可塑性和免疫系统的影响 App敲入小鼠(阿尔茨海默病模型小鼠) 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、血浆分析、行为追踪 NA 基因表达数据、行为数据、血浆生物标志物数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1340 2025-12-14
Single-Cell and Multiomic Analysis Reveals Neutrophil Heterogeneity and Prognostic Value in Cervical Lesions
2025-Dec-12, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了宫颈病变中中性粒细胞的异质性及其在疾病进展和预后中的关键作用 首次在宫颈癌中鉴定出五个中性粒细胞亚群(N0-N4),并发现N4亚群在疾病进展中显著增加,通过空间转录组学和组织微阵列分析证实了N4在肿瘤区域的富集及其与增殖、转移和免疫逃逸相关基因的关联 研究样本量相对较小(20例宫颈活检样本),且主要基于单中心数据,需要更大规模的多中心验证 探究中性粒细胞在宫颈癌肿瘤微环境中的异质性及其在疾病进展和预后中的作用 宫颈活检样本,涵盖不同疾病阶段的宫颈病变 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织微阵列分析,多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据,组织微阵列数据 20例宫颈活检样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
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