单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 13341 - 13360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13341 | 2024-08-04 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-Feb-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 该研究探讨了系统性红斑狼疮患者皮肤纤维母细胞的炎症反应与瘢痕生成之间的关系 | 揭示了系统性红斑狼疮纤维母细胞在炎症反应中的不同表现，为治疗皮肤损伤提供了新靶点 | 研究仅限于小样本量且主要集中在皮肤样本上 | 旨在理解红斑狼疮皮肤纤维母细胞的炎症机制及其在瘢痕疾病中的作用 | 对22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照的皮肤纤维母细胞进行分析 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照 |
| 13342 | 2024-08-04 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
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研究论文 | 本研究调查了在脓疱性汗腺炎（HS）皮损中B细胞的动态和微环境互动 | 首次在HS皮损中识别了三级淋巴结构，并描述了T细胞、B细胞、抗原呈递细胞和皮肤基质之间的有组织互动 | 本研究主要集中在皮损区域，未能广泛评估HS的全身反应 | 探讨B细胞在脓疱性汗腺炎发病机制中的作用及其微环境 | 研究了脓疱性汗腺炎患者皮损中B细胞的活动 | 数字病理学 | 脓疱性汗腺炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 涉及多个脓疱性汗腺炎皮损样本 |
| 13343 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上，可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 |
| 13344 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
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研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒（HCV）感染肝干细胞并干扰其正常功能，导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞，并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 |
| 13345 | 2024-08-04 |
Robust enhancer-gene regulation identified by single-cell transcriptomes and epigenomes
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100342
PMID:37492103
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组数据识别增强子与基因之间的调控关系 | 提出了一种基于非参数置换的程序，以控制增强子-基因关联研究中的假阳性风险 | 未提及具体的样本大小和多样性限制 | 研究如何通过单细胞测序数据实现增强子与基因的稳健链接 | 包括小鼠和人脑的多种组织的大规模转录组和表观基因组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13346 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后，并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 |
| 13347 | 2024-08-04 |
MediMer: a versatile do-it-yourself peptide-receptive MHC class I multimer platform for tumor neoantigen-specific T cell detection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294565
PMID:38239352
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MediMer的平台，用于肿瘤新抗原特异性T细胞的检测 | MediMer是一个多功能自制的pMHC-I多聚体平台，能够以较少的操作时间定制并生产用于个体化肿瘤患者的新抗原检测 | 未提及具体的局限性 | 提高针对个体肿瘤患者新抗原的T细胞受体的发现能力 | 主要研究人类抗原特异性T细胞，特别是针对黑色素瘤患者的新抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 重组MHC分子 | NA | 细胞 | 黑色素瘤患者血液样本中发现稀有T细胞亚群 |
| 13348 | 2024-08-07 |
A tumor microenvironment-specific gene expression signature predicts chemotherapy resistance in colorectal cancer patients
2021-Feb-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00142-x
PMID:33580207
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研究论文 | 本研究利用肿瘤微环境（TME）特异性基因表达特征来预测结直肠癌（CRC）患者的化疗耐药性 | 构建了一个名为SFM的特征，能够区分TME和药物敏感性，并通过K-means聚类在三个独立队列中验证 | NA | 研究TME特异性基因表达特征在预测结直肠癌化疗耐药性中的作用 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和化疗耐药性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | K-means聚类 | RNA测序数据 | 总共2269个'bulk' RNA测序数据集和四个单细胞RNA测序数据集 |
| 13349 | 2024-08-07 |
Mutated clones driving leukemic transformation are already detectable at the single-cell level in CD34-positive cells in the chronic phase of primary myelofibrosis
2021-Feb-04, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00144-9
PMID:33542466
|
研究论文 | 研究通过单细胞基因组学和转录组学分析，揭示了原发性骨髓纤维化（PMF）向急性髓系白血病（AML）转化过程中的克隆演化和基因突变模式 | 首次在单细胞水平上检测到驱动白血病转化的突变克隆，并揭示了Ruxolitinib对干扰素信号的抑制作用及其免疫抑制效应 | 研究仅基于单一患者样本，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 探讨骨髓增生性肿瘤疾病进展的基因组复杂性，并评估单细胞分析在预测疾病演变和个性化治疗中的应用 | 原发性骨髓纤维化患者的CD34阳性细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞基因组学和转录组学 | NA | 基因组和转录组数据 | 单一患者样本 |
| 13350 | 2024-08-07 |
Clonal evolution in liver cancer at single-cell and single-variant resolution
2021-02-02, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01036-y
PMID:33531041
|
研究论文 | 本文基于单细胞突变谱重构了人类肝癌的单变异分辨率克隆进化 | 首次重构了人类肝癌的单细胞和单变异克隆进化，并解析了遗传和表型异质性的关系 | NA | 研究肝癌的克隆进化及其与遗传和表型异质性的关系 | 人类肝癌的克隆进化及其遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞突变谱 | NA |
| 13351 | 2024-08-07 |
Tumour heterogeneity and intercellular networks of nasopharyngeal carcinoma at single cell resolution
2021-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21043-4
PMID:33531485
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序技术，分析了10对鼻咽癌肿瘤-血液样本中的176,447个细胞，揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，特别是发现了LAMP3树突状细胞、调节性T细胞和耗竭的CD8 T细胞之间的密集相互作用 | NA | 揭示鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，为鼻咽癌的精准治疗提供新的见解 | 鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 176,447个细胞来自10对鼻咽癌肿瘤-血液样本 |
| 13352 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
2021-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-00955-z
PMID:33526011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年小鼠造血干细胞的转录组，揭示了老化过程中造血干细胞分化和细胞周期的延迟现象 | 本研究首次在单细胞尺度上重新审视了小鼠造血干细胞在老化过程中的转录可塑性，并揭示了老化导致造血干细胞分化延迟的潜在机制 | NA | 探讨老化过程中造血干细胞的分化及细胞周期变化 | 小鼠的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15,000个年轻和老年小鼠的转录组 |
| 13353 | 2024-08-07 |
Melanoma Single-Cell Biology in Experimental and Clinical Settings
2021-Feb-01, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10030506
PMID:33535416
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术深入研究了恶性黑色素瘤的细胞异质性及其对治疗反应和耐药性的影响 | 揭示了免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的预后亚型，以及检查点抑制剂治疗耐药性的免疫细胞特征和新的可靶向的细胞内信号通路 | NA | 深入了解黑色素瘤的生物学特性，特别是肿瘤异质性和转录可塑性的作用 | 恶性黑色素瘤的单细胞生物学特性，包括免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13354 | 2024-08-07 |
Patient-tailored design for selective co-inhibition of leukemic cell subpopulations
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe4038
PMID:33608276
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研究论文 | 本文提出了一种基于机器学习的方法，通过结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为急性髓系白血病（AML）患者定制药物组合，以实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | 本文的创新点在于利用机器学习方法，结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为患者定制药物组合，实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | NA | 本文的研究目的是设计个性化组合治疗方案，以利用患者特定的治疗脆弱性，选择性地靶向驱动疾病的细胞亚群。 | 本文的研究对象是急性髓系白血病（AML）患者及其白血病细胞亚群。 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个诊断期和两个难治性急性髓系白血病（AML）患者病例 |
| 13355 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics following ischemic injury identifies a role for B2M in cardiac repair
2021-01-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01636-3
PMID:33514846
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，分析了心肌缺血损伤后不同时间点心脏主要细胞类型的基因表达数据，揭示了细胞和转录异质性及心脏重塑过程中的细胞功能变化 | 研究首次证实心肌细胞在缺血损伤后表达和分泌高水平的β2微球蛋白，通过旁分泌方式激活成纤维细胞，为心脏修复提供了新的治疗靶点 | NA | 深入理解心肌缺血损伤后修复过程中的细胞间信号传导机制，以促进治疗应用 | 心肌缺血损伤后的心脏修复过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同时间点的心脏主要细胞类型 |
| 13356 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals SARS-CoV-2 infection dynamics in lungs of African green monkeys
2021-01-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe8146
PMID:33431511
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了非洲绿猴肺部SARS-CoV-2感染的动态过程 | 开发了新的分析方法，用于无偏倚地靶向宿主对SARS-CoV-2感染反应中的重要细胞 | NA | 揭示SARS-CoV-2感染的病毒和宿主因素，以及其在COVID-19发病机制中的作用 | 非洲绿猴肺部细胞及肺引流纵隔淋巴结细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非洲绿猴 |
| 13357 | 2024-08-07 |
Tailoring the resolution of single-cell RNA sequencing for primary cytotoxic T cells
2021-01-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20751-7
PMID:33495472
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研究论文 | 本文针对主要细胞毒性T细胞的单细胞RNA测序分辨率进行优化，提出了一种基于液滴的高通量分析方法（tDrop-seq）和一种基于平板的高性能深度分析方法（tSCRB-seq），以克服RNA量少导致的捕获效率低的问题。 | 提出的tSCRB-seq方法相比基于液滴的技术，平均每基因捕获的转录本数量提高了15倍，提高了基因检测的动态范围，适用于高分辨率敏感的下游应用。 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序技术在细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）分析中的效率和分辨率，以优化基于T细胞的癌症免疫疗法。 | 主要细胞毒性T细胞（CTLs）的分子程序和功能异质性。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 13358 | 2024-08-07 |
Single-cell resolution landscape of equine peripheral blood mononuclear cells reveals diverse cell types including T-bet+ B cells
2021-01-22, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00947-5
PMID:33482825
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术全面定义了健康马匹外周血单个核细胞的细胞多样性 | 首次在马匹外周血中发现并描述了T-bet+ B细胞这一免疫细胞亚群 | 研究受限于物种特异性免疫细胞类型、频率和表型的不完全理解 | 探索非传统模型生物的免疫细胞特性 | 马匹外周血单个核细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自不同品种、年龄和性别的健康马匹的外周血单个核细胞 |
| 13359 | 2024-08-07 |
Prior activation state shapes the microglia response to antihuman TREM2 in a mouse model of Alzheimer's disease
2021-01-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2017742118
PMID:33446504
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研究论文 | 研究探讨了TREM2在阿尔茨海默病小鼠模型中对小胶质细胞反应的影响 | 首次展示了TREM2通过mAb hT2AB作为替代配体激活小胶质细胞，并影响不同性别小鼠中特定类型小胶质细胞的分布 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究TREM2在阿尔茨海默病中的作用及其对小胶质细胞反应的影响 | 5XFAD转基因小鼠，这些小鼠积累Aβ并表达常见的TREM2变体 | NA | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | RNA | 包括不同性别的小鼠，具体数量未详细说明 |
| 13360 | 2024-08-07 |
OCT4 induces embryonic pluripotency via STAT3 signaling and metabolic mechanisms
2021-01-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008890118
PMID:33452132
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研究论文 | 研究探讨了OCT4通过STAT3信号传导和代谢机制诱导胚胎多能性的机制 | 发现OCT4在早期小鼠胚胎中独立于其他多能性相关转录因子激活JAK/STAT信号传导机制，并调控关键的糖酵解酶以维持糖酵解 | 研究主要集中在OCT4对胚胎多能性的影响，未涉及其在其他生物过程中的作用 | 确定OCT4如何在胚胎中建立和保护多能性谱系 | 控制组和OCT4缺失的囊胚内细胞团在两个发育阶段的单细胞转录组学和定量免疫荧光 | NA | NA | 单细胞转录组学，定量免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 控制组和OCT4缺失的囊胚内细胞团 |