单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 13341 - 13360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13341 | 2024-08-04 |
Cell Heterogeneity and Variability in Peripheral Nerve after Injury
2024-Mar-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063511
PMID:38542483
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综述 | 本文总结了外周神经损伤后的细胞异质性和变异性。 | 本研究通过总结当前的测序数据，揭示了外周神经中特别是坐骨神经的细胞异质性。 | 没有提到具体的实验数据，主要依赖于现有文献的汇总。 | 研究外周神经的细胞组成和其在损伤后的变化。 | 探讨施旺细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞的细胞变异。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 测序数据 | NA |
| 13342 | 2024-08-07 |
Subepithelial Stromal Cells: Their Roles and Interactions with Intestinal Epithelial Cells during Gut Mucosal Homeostasis and Regeneration
2024-Mar-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030668
PMID:38540281
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综述 | 本文综述了肠道黏膜稳态和再生过程中上皮下基质细胞与肠上皮细胞的相互作用及其功能 | 利用单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、共聚焦显微镜和计算重构等新技术，识别和表征了特定的肠道间质干细胞亚群 | 由于缺乏大多数功能同质亚群的特异性标记，探索这些异质性肠道间质干细胞的功能仍然具有挑战性 | 旨在理解调控这些细胞激活的细胞途径及其在肠上皮再生过程中的相互作用 | 肠道间质干细胞及其在肠道形态发生、稳态和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 共聚焦显微镜 | NA | NA | NA |
| 13343 | 2024-08-04 |
Unique Spatial Transcriptomic Profiling of the Murine Femoral Fracture Callus: A Preliminary Report
2024-Mar-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060522
PMID:38534368
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研究论文 | 本文探讨了小鼠股骨骨折愈合过程中独特的空间转录组特征 | 使用Visium CytAssist空间转录组平台提供了首次空间完整的基因表达变化特征 | 未提及研究的具体限制 | 研究骨折愈合过程中基因表达的动态变化及其空间分布 | 采用BALB/c小鼠模型及其在转移性乳腺癌影响下的骨折愈合情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | NA | 组织切片 | BALB/c小鼠的样本，具体数量未提及 |
| 13344 | 2024-08-04 |
A Retrospective View of the Triple-Negative Breast Cancer Microenvironment: Novel Markers, Interactions, and Mechanisms of Tumor-Associated Components Using Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
2024-Mar-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16061173
PMID:38539508
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研究论文 | 该文章回顾了三阴性乳腺癌的肿瘤微环境，探讨了新的标记物、相互作用及相关机制 | 通过公共单细胞RNA测序数据集发现了特定的TNBC标记和细胞类型间的相互作用 | 该研究使用了公共数据集，可能限制了对特定临床背景的分析 | 寻找新的治疗靶点，以更好地理解三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | 分析三阴性乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 利用公共单细胞RNA测序数据集分析多种细胞类型 |
| 13345 | 2024-08-07 |
Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Elucidate the Etiology of Severe COVID-19
2024-Mar-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063280
PMID:38542251
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，探讨了严重COVID-19的潜在病因及其与系统性自身免疫疾病的相似性 | 本研究首次综合分析了批量和单细胞RNA测序数据，揭示了严重COVID-19与炎症相关基因的上调关系 | NA | 阐明严重COVID-19的病因 | 严重COVID-19的基因表达模式及其与炎症综合征的关联 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27项研究和8项meta分析的数据 |
| 13346 | 2024-08-04 |
Unveiling Shared Immune Responses in Porcine Alveolar Macrophages during ASFV and PRRSV Infection Using Single-Cell RNA-seq
2024-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030563
PMID:38543614
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研究论文 | 本研究揭示了非洲猪瘟病毒（ASFV）和猪繁殖与呼吸综合症病毒（PRRSV）感染期间猪肺泡巨噬细胞的共同免疫反应 | 首次比较了ASFV和PRRSV感染后猪肺泡巨噬细胞共享的免疫反应 | 本研究可能仅适用于特定的细胞类型和病毒模型，结果的普遍性尚待验证 | 研究ASFV和PRRSV感染对猪肺泡巨噬细胞免疫反应的影响 | 猪肺泡巨噬细胞（PAMs）在ASFV和PRRSV感染后的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用两个单细胞转录组数据集 |
| 13347 | 2024-08-04 |
Exploring Transcriptional Regulation of Beta Cell SASP by Brd4-Associated Proteins and Cell Cycle Control Protein p21
2024-Mar-06, Epigenomes
IF:2.5Q3
DOI:10.3390/epigenomes8010010
PMID:38534794
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研究论文 | 这篇文章探讨了Brd4相关蛋白和细胞周期控制蛋白p21对β细胞SASP的转录调控。 | 揭示了Brd4与多种蛋白绑定，并探讨了p21在β细胞SASP机制中的作用。 | 在NIT-1细胞中，p21的RNAi干扰对细胞活力或SASP没有显著影响，这可能限制了对p21功能的全面理解。 | 探讨在1型糖尿病模型中β细胞SASP的转录调控机制。 | 使用NOD小鼠模型的β细胞系NIT-1作为研究对象。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | RNA干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NOD小鼠模型中的小鼠β细胞和来自对照、自身抗体阳性及1型糖尿病供体的人类β细胞 |
| 13348 | 2024-08-04 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-Mar, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
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研究论文 | 该文章介绍了一种名为SCORPION的工具，通过高通量单细胞转录组数据重建可比较的基因调控网络 | SCORPION使用信息传递算法重建基因调控网络，并在合成数据上优于12种现有技术，显示其准确识别不同细胞间调控网络差异的能力 | 文章未讨论SCORPION在不同生物背景下的适应性 | 研究旨在实现单细胞RNA测序数据在群体水平的基因调控网络比较 | 文章研究了来自结直肠癌及其相邻健康组织的200,436个单细胞的基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 单细胞 RNA 测序数据 | 200,436个单细胞 |
| 13349 | 2024-08-07 |
Schnurri-3 controls osteogenic fate of Adipoq-lineage progenitors in bone marrow
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.008
PMID:38549808
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，探讨了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响 | 首次揭示了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的功能，及其对骨形成和骨折愈合的促进作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证其临床应用潜力 | 探讨Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响 | Adipoq谱系前体细胞和Schnurri-3基因 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA序列数据 | 小鼠和人类样本 |
| 13350 | 2024-08-07 |
Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2024-Feb-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030529
PMID:38540141
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研究论文 | 本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能 | 本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色 | 评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13351 | 2024-08-04 |
A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Feb-26, Biology
DOI:10.3390/biology13030145
PMID:38534415
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研究论文 | 这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况 | 本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别 | 这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性 | 旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制 | 研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13352 | 2024-08-07 |
Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment
2024-Feb-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12030506
PMID:38540119
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研究论文 | 本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应 | NA | 提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针 | 脑肿瘤微环境的转录组结构 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 六种脑肿瘤类型的细胞群体 |
| 13353 | 2024-08-04 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
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研究论文 | 本研究揭示了SPINK1在肝细胞癌治疗抵抗中的作用 | 首次阐明了SPINK1在肝细胞癌化疗抵抗中的关键角色，并确定其作为潜在治疗靶点 | 对SPINK1影响的机制理解仍然有限，尚需进一步的研究 | 探究SPINK1对肝细胞癌化疗抵抗的影响 | 肝细胞癌患者的细胞和组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 来自两个肝细胞癌队列的单细胞样本 |
| 13354 | 2024-08-04 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-Feb-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 该研究探讨了系统性红斑狼疮患者皮肤纤维母细胞的炎症反应与瘢痕生成之间的关系 | 揭示了系统性红斑狼疮纤维母细胞在炎症反应中的不同表现，为治疗皮肤损伤提供了新靶点 | 研究仅限于小样本量且主要集中在皮肤样本上 | 旨在理解红斑狼疮皮肤纤维母细胞的炎症机制及其在瘢痕疾病中的作用 | 对22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照的皮肤纤维母细胞进行分析 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照 |
| 13355 | 2024-08-04 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
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研究论文 | 本研究调查了在脓疱性汗腺炎（HS）皮损中B细胞的动态和微环境互动 | 首次在HS皮损中识别了三级淋巴结构，并描述了T细胞、B细胞、抗原呈递细胞和皮肤基质之间的有组织互动 | 本研究主要集中在皮损区域，未能广泛评估HS的全身反应 | 探讨B细胞在脓疱性汗腺炎发病机制中的作用及其微环境 | 研究了脓疱性汗腺炎患者皮损中B细胞的活动 | 数字病理学 | 脓疱性汗腺炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 涉及多个脓疱性汗腺炎皮损样本 |
| 13356 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上，可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 |
| 13357 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
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研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒（HCV）感染肝干细胞并干扰其正常功能，导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞，并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 |
| 13358 | 2024-08-04 |
Robust enhancer-gene regulation identified by single-cell transcriptomes and epigenomes
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100342
PMID:37492103
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组数据识别增强子与基因之间的调控关系 | 提出了一种基于非参数置换的程序，以控制增强子-基因关联研究中的假阳性风险 | 未提及具体的样本大小和多样性限制 | 研究如何通过单细胞测序数据实现增强子与基因的稳健链接 | 包括小鼠和人脑的多种组织的大规模转录组和表观基因组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13359 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后，并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 |
| 13360 | 2024-08-04 |
MediMer: a versatile do-it-yourself peptide-receptive MHC class I multimer platform for tumor neoantigen-specific T cell detection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294565
PMID:38239352
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MediMer的平台，用于肿瘤新抗原特异性T细胞的检测 | MediMer是一个多功能自制的pMHC-I多聚体平台，能够以较少的操作时间定制并生产用于个体化肿瘤患者的新抗原检测 | 未提及具体的局限性 | 提高针对个体肿瘤患者新抗原的T细胞受体的发现能力 | 主要研究人类抗原特异性T细胞，特别是针对黑色素瘤患者的新抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 重组MHC分子 | NA | 细胞 | 黑色素瘤患者血液样本中发现稀有T细胞亚群 |