单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 13261 - 13280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13261 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses unravel DNA damage repair-related clusters in breast cancer with experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297180
PMID:38022619
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乳腺癌中与DNA损伤修复（DDR）相关的特征，并通过实验验证了其分类 | 本研究首次构建了DDR分类，并通过多层队列分析验证了DDR评分，揭示了恶性细胞在单细胞水平上对DDR评分的贡献 | NA | 研究乳腺癌中DNA损伤修复的异质性，并探索其个性化分子和临床病理机制 | 乳腺癌中的DNA损伤修复相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析 | NA | 转录组学、基因组学、单细胞转录组数据 | 276个DDR相关基因，多个公共数据集包括SCAN-B数据集、METABRIC数据库和TCGA-BRCA数据库 |
| 13262 | 2024-08-07 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
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研究论文 | 本文开发了一种结合蛋白质和转录组单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法，用于分析人外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 该研究首次实现了在PBMCs中同时进行蛋白质和转录组的单细胞RNA测序，这种方法比传统的流式细胞术、质谱细胞术或仅转录组的scRNA-seq具有更高的分辨率。 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高临床研究中PBMCs分析的分辨率和应用范围。 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat UMAPs 和 Louvain 聚类 | 细胞 | 31名参与者，共测序41,611个细胞 |
| 13263 | 2024-08-07 |
RNA helicase DDX5 acts as a critical regulator for survival of neonatal mouse gonocytes
2021-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13000
PMID:33666296
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研究论文 | 研究探讨了RNA解旋酶DDX5在新生小鼠生殖细胞中的作用及其对生殖细胞分化的影响 | 揭示了DDX5在生殖细胞命运决定中的关键作用，为男性不育的病理机制提供了新的见解 | NA | 探索DDX5在调节生殖细胞分化中的功能 | 新生小鼠的生殖细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 野生型和Ddx5敲除小鼠的睾丸样本 |
| 13264 | 2024-08-07 |
Identifying the functions of two biomarkers in human oligodendrocyte progenitor cell development
2021-05-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-02857-8
PMID:33933125
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研究论文 | 研究了NG2和A2B5两种生物标志物在人少突胶质细胞前体细胞发育中的功能差异 | 首次深入研究了NG2和A2B5细胞群在人少突胶质细胞前体细胞发育中的功能差异 | 研究仅限于体外细胞增殖和迁移实验以及小鼠移植实验，未涉及临床应用 | 探讨NG2和A2B5细胞在人少突胶质细胞前体细胞发育中的差异 | 人少突胶质细胞前体细胞（hOPCs）及其生物标志物NG2和A2B5 | NA | 脱髓鞘疾病 | 细胞分选技术，单细胞测序，mRNA测序 | NA | 细胞 | 涉及NG2+/-, A2B5+/-细胞群及PDGFR-α+细胞 |
| 13265 | 2024-08-07 |
PseudotimeDE: inference of differential gene expression along cell pseudotime with well-calibrated p-values from single-cell RNA sequencing data
2021-04-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02341-y
PMID:33926517
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研究论文 | 提出了一种名为PseudotimeDE的方法，用于从单细胞RNA测序数据中沿着细胞伪时间推断差异表达基因，并输出校准良好的p值 | PseudotimeDE方法适应多种伪时间推断方法，考虑了伪时间推断的不确定性，并输出校准良好的p值 | NA | 研究细胞状态变化背后的分子机制 | 差异表达基因 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 13266 | 2024-08-07 |
Stabilized epithelial phenotype of cancer cells in primary tumors leads to increased colonization of liver metastasis in pancreatic cancer
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108990
PMID:33852841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型，探讨了部分上皮间质转化（EMT）和上皮稳定化在胰腺导管腺癌（PDAC）生长和转移中的功能作用 | 首次揭示了上皮稳定化导致癌细胞集体迁移增强和免疫微环境调节，从而促进肝脏转移 | NA | 探讨胰腺癌转移的多样性机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的生长和转移 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约50个癌细胞集群 |
| 13267 | 2024-08-07 |
Activated Regulatory T-Cells, Dysfunctional and Senescent T-Cells Hinder the Immunity in Pancreatic Cancer
2021-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081776
PMID:33917832
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研究论文 | 本研究分析了32名胰腺癌患者的T细胞，通过多参数质谱细胞术和单细胞RNA测序，揭示了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的免疫抑制状态 | 发现了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的新免疫抑制状态，并确定了多个新的治疗靶点 | NA | 旨在更好地理解胰腺癌中的白细胞特征，以识别更好的治疗策略 | 胰腺癌患者的T细胞 | NA | 胰腺癌 | 多参数质谱细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学成像和空间分析 | NA | 细胞，组织 | 32名胰腺癌患者 |
| 13268 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Parkinson's Disease
2021-Apr-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9040368
PMID:33916045
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在帕金森病分子发病机制研究中的应用 | 介绍了通过动物和体外人类模型以及测序技术，对帕金森病细胞组成和表型的无偏见全局视图的研究进展 | 主要限制包括死后脑组织稀缺和技术挑战，如RNA降解导致的质量问题 | 旨在深入理解帕金森病的分子发病机制 | 帕金森病的细胞类型及其特定疾病关联 | 数字病理学 | 帕金森病 | sc/snRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 13269 | 2024-08-07 |
Dive into Single, Seek Out Multiple: Probing Cancer Metastases via Single-Cell Sequencing and Imaging Techniques
2021-Mar-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13051067
PMID:33802312
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和成像技术探究癌症转移机制 | 利用单细胞测序技术直接比较转移样本在不同阶段的基因组和转录组变化，以及通过单细胞成像技术实时观察肿瘤微环境中恶性与非恶性细胞的异质行为 | NA | 精确识别、理解和针对推动癌症转移的事件 | 癌症转移机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像 | NA |
| 13270 | 2024-08-07 |
Enhancement and Imputation of Peak Signal Enables Accurate Cell-Type Classification in scATAC-seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.658352
PMID:33889181
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研究论文 | 本文介绍了一种基于支持向量机（SVM）的方法svmATAC，用于增强和填补scATAC-seq数据中的峰值信号，从而实现准确的细胞类型分类 | svmATAC通过增强峰值信号强度和通过共可及性模式填补信号，无需依赖文献标记，且在不同库和平台的数据集中表现稳健 | NA | 开发一种新的方法来提高scATAC-seq数据中细胞类型分类的准确性 | scATAC-seq数据中的细胞类型分类 | 基因组学 | NA | scATAC-seq | SVM | scATAC-seq数据 | 涉及人类免疫细胞、造血系统细胞和外周血单个核细胞的多个scATAC-seq数据集 |
| 13271 | 2024-08-07 |
DRscDB: A single-cell RNA-seq resource for data mining and data comparison across species
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.04.021
PMID:33995899
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research paper | 本文构建了一个新的搜索数据库DRscDB，用于跨物种的单细胞RNA测序数据挖掘和比较 | DRscDB是一个综合性的数据库，提供了跨物种的单细胞RNA测序数据，并允许用户进行细胞簇富集分析 | NA | 构建一个数据库，用于跨物种的单细胞RNA测序数据挖掘和比较 | 单细胞RNA测序数据，包括多种组织类型及其在脊椎动物中的相应类似组织 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 多种组织类型及其在脊椎动物中的相应类似组织，包括斑马鱼、小鼠和人类 |
| 13272 | 2024-08-07 |
Human Cell Atlas and cell-type authentication for regenerative medicine
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0421-1
PMID:32929224
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综述 | 本文综述了细胞类型鉴定的当前进展，从人类细胞图谱项目到基于细胞数据指南的再生医学的分子标记数据库和其他来源 | 近年来单细胞RNA测序技术的进步为基于RNA特征的细胞个体和时空水平表征开辟了新途径，极大地改变了我们对细胞类型的理解 | NA | 探讨细胞类型鉴定的最新进展及其在再生医学中的应用 | 细胞类型的鉴定及其在组织器官发育研究和细胞疗法及疾病模型中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 13273 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the small intestine throughout the human lifespan demonstrates unique features of fetal immune cells
2024-Mar-28, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.011
PMID:38555026
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，创建了人类小肠在整个生命周期中的转录组图谱，特别关注免疫细胞，并揭示了胎儿期小肠免疫细胞的独特特征 | 首次展示了胎儿小肠免疫细胞的复杂免疫景观，并识别了其在整个生命周期中的变化 | NA | 探讨人类小肠黏膜免疫系统的发育过程及其在不同生命阶段的特点 | 人类小肠的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涵盖从第一孕期到成年的多个样本 |
| 13274 | 2024-08-07 |
CellMixS: quantifying and visualizing batch effects in single-cell RNA-seq data
2021-06, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202001004
PMID:33758076
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research paper | 本文开发了一种细胞特异性混合得分（cms）来量化和可视化单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 提出了一种新的细胞特异性混合得分（cms），能够检测局部批次偏差并区分不平衡批次和同类型细胞间的系统性差异 | 文章未明确提及 | 系统探索单细胞RNA测序数据中的批次效应，并开发新的方法来量化和可视化这些效应 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 使用了真实和合成数据集进行比较 |
| 13275 | 2024-08-07 |
Gregarine single-cell transcriptomics reveals differential mitochondrial remodeling and adaptation in apicomplexans
2021-04-16, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01007-2
PMID:33863338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了五种从蟑螂中分离的格拉雷菌的转录组，结合其他顶复门生物的数据，进行了详细的系统基因组学分析，并描述了它们的线粒体代谢 | 首次广泛地探索了格拉雷菌的基因组规模，提供了该群体中差异性叶绿体保留的证据，并揭示了顶复门中线粒体代谢功能的可变重组 | 对于格拉雷菌线粒体的保留和代谢能力了解仍然有限 | 探讨顶复门生物中线粒体重塑和适应性的差异 | 从蟑螂中分离的五种格拉雷菌 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 五种格拉雷菌 |
| 13276 | 2024-08-07 |
Single-Cell Study of Two Rat Models of Pulmonary Arterial Hypertension Reveals Connections to Human Pathobiology and Drug Repositioning
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202006-2169OC
PMID:33021809
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了两种肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征，并探讨了其与人类PAH病理生物学的关联及药物再定位的可能性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了两种常用PAH模型中基因和通路的独特及共享失调情况，并展示了其与人类PAH的相关性和药物再定位的实用性 | NA | 确定并优先考虑PAH大鼠模型肺部失调的基因、通路和细胞类型，评估其与人类PAH的相关性并识别药物再定位候选物 | 肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括单冠毒素（MCT）、Sugen-低氧（SuHx）和对照组大鼠的肺部样本 |
| 13277 | 2024-08-07 |
Transcriptomic studies of systemic lupus erythematosus
2021-Apr-09, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00161-y
PMID:33836832
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综述 | 本文综述了系统性红斑狼疮（SLE）的转录组学研究，探讨了相关生物标志物和治疗策略的发现及其局限性 | 介绍了单细胞RNA测序在SLE血液和组织中的应用，揭示了分子异质性和关键亚群 | 某些研究发现仍存在争议，需要进一步研究以确定新的治疗靶点和精确的患者分层 | 探讨SLE的转录组学研究成果及其局限性 | 系统性红斑狼疮（SLE）的生物标志物和治疗策略 | NA | 系统性红斑狼疮 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13278 | 2024-08-07 |
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
2021-04-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02302-5
PMID:33827654
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research paper | 本文介绍了一种名为ACME的细胞固定-解离方法，用于单细胞转录组学研究 | ACME方法能够在固定细胞的同时进行解离，保持RNA完整性，支持多次冷冻保存，并且细胞可分类和可渗透 | NA | 开发一种适用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法 | 单细胞转录组学中的细胞解离问题 | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同物种的单细胞转录组数据 |
| 13279 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas and chromatin accessibility landscape reveal differentiation trajectories in the rice root
2021-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22352-4
PMID:33824350
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性调查，分析了水稻根尖细胞的转录组和染色质可及性，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络 | 首次综合利用单细胞RNA测序和染色质可及性分析，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络，并比较了单子叶和双子叶植物根发育路径的异同 | NA | 解析水稻根尖分生组织在细胞分化中的作用及其转录调控网络 | 水稻根尖细胞的分化轨迹和调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个水稻根尖细胞 |
| 13280 | 2024-08-07 |
Inhibition of Hedgehog Signaling Alters Fibroblast Composition in Pancreatic Cancer
2021-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3715
PMID:33495315
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研究论文 | 本文研究了 Hedgehog 信号通路抑制对胰腺癌微环境中成纤维细胞组成的影响 | 发现 Hedgehog 信号通路在成纤维细胞中特异性激活，并且在肌成纤维细胞性 CAF（myCAF）中差异性升高 | NA | 探讨 Hedgehog 信号通路抑制如何重编程胰腺癌微环境 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的成纤维细胞组成和免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 时间飞行流式细胞术，单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA |