单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 13261 - 13280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13261 | 2024-08-07 |
A HIERARCHICAL BAYESIAN MODEL FOR SINGLE-CELL CLUSTERING USING RNA-SEQUENCING DATA
2019-Sep, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/19-aoas1250
PMID:34079613
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研究论文 | 本文提出了一种名为BasClu的贝叶斯分层模型，用于使用RNA测序数据的单细胞聚类 | BasClu模型能够更好地表征scRNA-seq数据的重要特征，从而更准确地进行细胞聚类 | NA | 理解细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 贝叶斯分层模型 | RNA表达数据 | 涉及三个真实的scRNA-seq数据集 |
| 13262 | 2024-08-07 |
Bloody Zebrafish: Novel Methods in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00124
PMID:30374440
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研究论文 | 本文讨论了斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的应用，以及新技术如何改变该领域的理解 | 介绍了斑马鱼模型在造血研究中的新应用，以及单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学和大数据处理等新技术的使用 | NA | 探讨斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的益处以及新技术的影响 | 斑马鱼模型及其在造血研究中的应用 | 数字病理学 | 恶性血液病 | 单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 大数据集 | NA |
| 13263 | 2024-08-07 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
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研究论文 | 研究探讨了Nfe2l3基因在中枢神经系统（CNS）损伤后的神经保护和轴突再生中的作用 | 首次揭示了Nfe2l3在神经保护和轴突再生中的作用，并展示了其作为治疗CNS损伤和疾病的潜在疗法 | NA | 研究Nfe2l3在CNS损伤后的神经保护和轴突再生中的功能 | Nfe2l3基因在皮质和视网膜神经节细胞（RGC）中的表达及其在CNS损伤后的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 皮质和视网膜神经节细胞（RGC） |
| 13264 | 2024-08-07 |
Development and validation of a prognostic model for cervical cancer by combination of machine learning and high-throughput sequencing
2024-Apr, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2024.108241
PMID:38452717
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种结合机器学习和高通量测序的宫颈癌预后模型 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和高通量测序数据，利用多种机器学习算法构建宫颈癌预后模型 | 本研究仅使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据进行模型构建和验证，可能存在样本选择偏倚 | 开发一种评估宫颈癌预后的综合模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据，具体样本数量未详细说明 |
| 13265 | 2024-08-04 |
Identification of spatially-resolved markers of malignant transformation in Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46994-2
PMID:38553466
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研究论文 | 该论文研究了乳头状粘液性肿瘤中的恶性转化的空间分辨标记 | 本研究确认了乳头状粘液性肿瘤的亚型特异性标记，为风险分层提供了新的分子依据 | 研究依赖于两个独立患者队列，但可能存在样本多样性和外部验证的不足 | 研究乳头状粘液性肿瘤中恶性转化的分子标记 | 调查乳头状粘液性肿瘤患者的亚型特异性分子标记 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 两个独立的患者队列 |
| 13266 | 2024-08-07 |
Aberrant activated Notch1 promotes prostate enlargement driven by androgen signaling via disrupting mitochondrial function in mouse
2024-Mar-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05143-0
PMID:38538986
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研究论文 | 本研究证明过度激活的Notch1信号在小鼠前列腺上皮细胞中通过增强增殖和抑制凋亡导致前列腺增大 | 揭示了过度激活的Notch1信号通过增加雄激素受体敏感性、破坏细胞线粒体代谢、增加活性氧和增加前体细胞数量诱导前列腺增大的机制，并发现N-乙酰-L-半胱氨酸治疗可以缓解这种过度激活引起的增生 | NA | 探讨Notch信号在前列腺增大和增生中的潜在调控机制 | 小鼠前列腺上皮细胞和人类良性前列腺增生患者 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类良性前列腺增生患者的样本 |
| 13267 | 2024-08-07 |
Analysis of the effect of CCR7 on the microenvironment of mouse oral squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing technology
2024-Mar-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03013-y
PMID:38539232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析CCR7对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析CCR7基因敲除对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境中细胞类型和基因表达的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类口腔鳞状细胞癌中验证CCR7的作用 | 探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌微环境中的作用 | CCR7基因敲除小鼠和野生型小鼠的口腔鳞状细胞癌模型 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三只CCR7基因敲除小鼠和三只野生型小鼠 |
| 13268 | 2024-08-07 |
Adipose stem cells control obesity-induced T cell infiltration into adipose tissue
2024-Mar-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113963
PMID:38492218
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪干细胞（ASCs）在肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的作用 | 首次揭示了脂肪干细胞通过上调C-C基序趋化因子配体5（CCL5）在肥胖早期阶段调控T细胞积累的关键作用 | NA | 阐明肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的机制 | 脂肪干细胞和T细胞 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用肥胖小鼠的脂肪干细胞和骨髓进行移植实验 |
| 13269 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq: First Atlas and Cellular Landscape of Lacrimal Sac: Implications in Primary Acquired Nasolacrimal Duct Obstruction Pathogenesis
2024-Mar-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.3.38
PMID:38551583
|
研究论文 | 本研究旨在描述原发性获得性鼻泪管阻塞（PANDO）患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并尝试构建首个泪囊细胞图谱，以阐明可能驱动疾病发病机制的潜在机制。 | 本研究首次构建了泪囊细胞图谱，并揭示了T细胞、B细胞和上皮细胞在炎症反应中的作用以及细胞间信号网络的构建。 | NA | 描述PANDO患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并构建泪囊细胞图谱以阐明疾病发病机制。 | 泪囊样本中的个体细胞群体，包括上皮细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 5名患者的泪囊样本，共25,791个细胞 |
| 13270 | 2024-08-04 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-Mar, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
|
研究论文 | 本文概述了肿瘤浸润B细胞的克隆特征和功能程序的分析工具 | 提出了整合单细胞和空间转录组学、基因组学及蛋白组学的多种技术方法，推进了对B细胞功能的理解 | 目前对不同癌症、亚群体和个体患者中B细胞作用的理解仍然有限 | 旨在解析肿瘤微环境中B细胞的功能角色和行为 | 研究肿瘤微环境中浸润的B细胞及其克隆群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、基因组学、蛋白组学 | NA | NA | NA |
| 13271 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-Jan-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13272 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了在小鼠皮肤伤口早期炎症期间，细胞凋亡途径和吞噬凋亡细胞受体在纤维母细胞和免疫细胞中的上调情况，并分析了其在伤口修复中的作用。 | 本研究首次揭示了Axl信号在小鼠伤口修复中的必要性，以及Timd4受体在吞噬凋亡细胞和伤口修复中的作用，为慢性伤口的治疗提供了潜在的靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的应用和效果需要进一步验证。 | 探讨细胞凋亡识别受体在皮肤组织修复中的调控机制。 | 小鼠皮肤伤口的早期炎症过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 13273 | 2024-08-04 |
Cellular and transcriptome signatures unveiled by single-cell RNA-Seq following ex vivo infection of murine splenocytes with Borrelia burgdorferi
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1296580
PMID:38149246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠脾细胞在Borrelia burgdorferi感染后的特征 | 首次利用GFP标记的Borrelia burgdorferi对小鼠脾细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫响应的分子和细胞特征 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化至人类 | 揭示Borrelia burgdorferi感染后宿主的免疫反应和相关生物标志物 | 感染Borrelia burgdorferi的小鼠脾细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠中分离的GFP+和GFP-脾细胞 |
| 13274 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses unravel DNA damage repair-related clusters in breast cancer with experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297180
PMID:38022619
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乳腺癌中与DNA损伤修复（DDR）相关的特征，并通过实验验证了其分类 | 本研究首次构建了DDR分类，并通过多层队列分析验证了DDR评分，揭示了恶性细胞在单细胞水平上对DDR评分的贡献 | NA | 研究乳腺癌中DNA损伤修复的异质性，并探索其个性化分子和临床病理机制 | 乳腺癌中的DNA损伤修复相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析 | NA | 转录组学、基因组学、单细胞转录组数据 | 276个DDR相关基因，多个公共数据集包括SCAN-B数据集、METABRIC数据库和TCGA-BRCA数据库 |
| 13275 | 2024-08-07 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
|
研究论文 | 本文开发了一种结合蛋白质和转录组单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法，用于分析人外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 该研究首次实现了在PBMCs中同时进行蛋白质和转录组的单细胞RNA测序，这种方法比传统的流式细胞术、质谱细胞术或仅转录组的scRNA-seq具有更高的分辨率。 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高临床研究中PBMCs分析的分辨率和应用范围。 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat UMAPs 和 Louvain 聚类 | 细胞 | 31名参与者，共测序41,611个细胞 |
| 13276 | 2024-08-07 |
RNA helicase DDX5 acts as a critical regulator for survival of neonatal mouse gonocytes
2021-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13000
PMID:33666296
|
研究论文 | 研究探讨了RNA解旋酶DDX5在新生小鼠生殖细胞中的作用及其对生殖细胞分化的影响 | 揭示了DDX5在生殖细胞命运决定中的关键作用，为男性不育的病理机制提供了新的见解 | NA | 探索DDX5在调节生殖细胞分化中的功能 | 新生小鼠的生殖细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 野生型和Ddx5敲除小鼠的睾丸样本 |
| 13277 | 2024-08-07 |
Identifying the functions of two biomarkers in human oligodendrocyte progenitor cell development
2021-05-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-02857-8
PMID:33933125
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研究论文 | 研究了NG2和A2B5两种生物标志物在人少突胶质细胞前体细胞发育中的功能差异 | 首次深入研究了NG2和A2B5细胞群在人少突胶质细胞前体细胞发育中的功能差异 | 研究仅限于体外细胞增殖和迁移实验以及小鼠移植实验，未涉及临床应用 | 探讨NG2和A2B5细胞在人少突胶质细胞前体细胞发育中的差异 | 人少突胶质细胞前体细胞（hOPCs）及其生物标志物NG2和A2B5 | NA | 脱髓鞘疾病 | 细胞分选技术，单细胞测序，mRNA测序 | NA | 细胞 | 涉及NG2+/-, A2B5+/-细胞群及PDGFR-α+细胞 |
| 13278 | 2024-08-07 |
PseudotimeDE: inference of differential gene expression along cell pseudotime with well-calibrated p-values from single-cell RNA sequencing data
2021-04-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02341-y
PMID:33926517
|
研究论文 | 提出了一种名为PseudotimeDE的方法，用于从单细胞RNA测序数据中沿着细胞伪时间推断差异表达基因，并输出校准良好的p值 | PseudotimeDE方法适应多种伪时间推断方法，考虑了伪时间推断的不确定性，并输出校准良好的p值 | NA | 研究细胞状态变化背后的分子机制 | 差异表达基因 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 13279 | 2024-08-07 |
Stabilized epithelial phenotype of cancer cells in primary tumors leads to increased colonization of liver metastasis in pancreatic cancer
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108990
PMID:33852841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型，探讨了部分上皮间质转化（EMT）和上皮稳定化在胰腺导管腺癌（PDAC）生长和转移中的功能作用 | 首次揭示了上皮稳定化导致癌细胞集体迁移增强和免疫微环境调节，从而促进肝脏转移 | NA | 探讨胰腺癌转移的多样性机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的生长和转移 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约50个癌细胞集群 |
| 13280 | 2024-08-07 |
Activated Regulatory T-Cells, Dysfunctional and Senescent T-Cells Hinder the Immunity in Pancreatic Cancer
2021-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081776
PMID:33917832
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研究论文 | 本研究分析了32名胰腺癌患者的T细胞，通过多参数质谱细胞术和单细胞RNA测序，揭示了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的免疫抑制状态 | 发现了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的新免疫抑制状态，并确定了多个新的治疗靶点 | NA | 旨在更好地理解胰腺癌中的白细胞特征，以识别更好的治疗策略 | 胰腺癌患者的T细胞 | NA | 胰腺癌 | 多参数质谱细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学成像和空间分析 | NA | 细胞，组织 | 32名胰腺癌患者 |