单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 13241 - 13260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13241 | 2024-08-07 |
Reference Transcriptomes of Porcine Peripheral Immune Cells Created Through Bulk and Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.689406
PMID:34249103
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序技术，定义了猪外周血免疫细胞的转录组 | 首次提供了猪外周血单核细胞的单细胞转录组数据，并将其与人类数据进行比较验证 | NA | 为猪的免疫遗传特征基因提供注释，并为进一步研究猪的免疫学和开发新试剂提供资源 | 猪的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8种细胞类型的批量细胞和7个样本的单细胞转录组数据 |
| 13242 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Chicken Anterior Pituitary: A Bird's-Eye View on Vertebrate Pituitary
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.562817
PMID:34267669
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了成年鸡前垂体的转录组，揭示了前垂体细胞群的基因表达特征 | 首次在鸡前垂体中识别出四种已知的内分泌细胞群和四种非内分泌/分泌细胞类型，并发现了新的标记基因和性二态表达基因 | 未分析somatotrophs细胞群 | 深入了解脊椎动物前垂体的细胞组成、异质性、细胞间通讯和基因表达谱 | 成年鸡前垂体的细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鸡前垂体的多个细胞群 |
| 13243 | 2024-08-07 |
Statistical and machine learning methods for spatially resolved transcriptomics with histology
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.06.052
PMID:34285782
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综述 | 本文综述了空间分辨转录组学（SRT）数据分析中的统计和机器学习方法，并探讨了如何整合空间位置和组织学信息与基因表达数据 | 强调了SRT数据与单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的差异性，并提出了针对SRT数据特性的新方法需求 | 指出了该领域存在的未解决问题和未来研究方向 | 旨在推动对转录复杂性的理解 | 空间分辨转录组学数据及其伴随的高分辨率组织学信息 | 机器学习 | NA | 空间分辨转录组学（SRT） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13244 | 2024-08-07 |
Toward uncharted territory of cellular heterogeneity: advances and applications of single-cell RNA-seq
2021, Journal of translational genetics and genomics
DOI:10.20517/jtgg.2020.51
PMID:34322662
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在细胞异质性研究中的应用 | scRNA-seq技术在cDNA合成与扩增、下一代测序读取的处理与比对、差异表达基因识别、细胞聚类、亚群识别及发育轨迹预测等方面取得了快速的技术进步 | NA | 探索scRNA-seq技术快速发展的技术景观，并深入了解其在各个显著进展领域的特点和优势 | scRNA-seq技术及其在人类和动物模型中细胞类型全局转录谱研究的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 13245 | 2024-08-07 |
DNF: A differential network flow method to identify rewiring drivers for gene regulatory networks
2020-Oct-14, Neurocomputing
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.neucom.2020.05.028
PMID:34025035
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研究论文 | 本文提出了一种差异网络流（DNF）方法，用于识别基因调控网络中的关键调节因子 | DNF方法通过量化网络流分布的差异，能够从局部到全局捕捉全面的拓扑差异，从而更准确地识别驱动基因 | NA | 旨在开发一种新方法，能够从随机变化和下游效应中分离出真正的调控元件的影响 | 基因调控网络中的关键调节因子 | 基因组学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 基因组数据 | 四个人类数据集来自癌症基因组图谱和三个小鼠神经和造血分化单细胞RNA测序数据集 |
| 13246 | 2024-08-07 |
STAT3-BDNF-TrkB signalling promotes alveolar epithelial regeneration after lung injury
2020-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0569-x
PMID:32989251
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研究论文 | 本文通过全基因组染色质可及性和基因表达分析，研究了急性肺损伤后肺泡上皮再生的机制，特别是STAT3-BDNF-TrkB信号轴的作用。 | 首次揭示了STAT3-BDNF-TrkB信号轴在肺泡上皮再生中的生物学和治疗重要性。 | NA | 阐明肺损伤后肺泡上皮再生的机制。 | 肺泡上皮细胞（AT2和AT1细胞）及其再生过程。 | 数字病理学 | 肺疾病 | 全基因组染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13247 | 2024-08-07 |
SciBet as a portable and fast single cell type identifier
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15523-2
PMID:32286268
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SciBet的监督式细胞类型识别工具，该工具能够快速准确地预测新测序细胞的身份，具有速度优势 | SciBet提供了一种快速、鲁棒且技术独立的计算方法，用于单细胞RNA测序数据的监督式细胞类型注释 | NA | 开发一种快速且用户友好的工具，用于单细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督式学习模型 | RNA测序数据 | NA |
| 13248 | 2024-08-07 |
A HIERARCHICAL BAYESIAN MODEL FOR SINGLE-CELL CLUSTERING USING RNA-SEQUENCING DATA
2019-Sep, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/19-aoas1250
PMID:34079613
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研究论文 | 本文提出了一种名为BasClu的贝叶斯分层模型，用于使用RNA测序数据的单细胞聚类 | BasClu模型能够更好地表征scRNA-seq数据的重要特征，从而更准确地进行细胞聚类 | NA | 理解细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 贝叶斯分层模型 | RNA表达数据 | 涉及三个真实的scRNA-seq数据集 |
| 13249 | 2024-08-07 |
Bloody Zebrafish: Novel Methods in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00124
PMID:30374440
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研究论文 | 本文讨论了斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的应用，以及新技术如何改变该领域的理解 | 介绍了斑马鱼模型在造血研究中的新应用，以及单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学和大数据处理等新技术的使用 | NA | 探讨斑马鱼模型在生理和病理造血研究中的益处以及新技术的影响 | 斑马鱼模型及其在造血研究中的应用 | 数字病理学 | 恶性血液病 | 单细胞转录组分析、表观遗传调控、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 大数据集 | NA |
| 13250 | 2024-08-07 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
|
研究论文 | 研究探讨了Nfe2l3基因在中枢神经系统（CNS）损伤后的神经保护和轴突再生中的作用 | 首次揭示了Nfe2l3在神经保护和轴突再生中的作用，并展示了其作为治疗CNS损伤和疾病的潜在疗法 | NA | 研究Nfe2l3在CNS损伤后的神经保护和轴突再生中的功能 | Nfe2l3基因在皮质和视网膜神经节细胞（RGC）中的表达及其在CNS损伤后的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 皮质和视网膜神经节细胞（RGC） |
| 13251 | 2024-08-07 |
Development and validation of a prognostic model for cervical cancer by combination of machine learning and high-throughput sequencing
2024-Apr, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2024.108241
PMID:38452717
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种结合机器学习和高通量测序的宫颈癌预后模型 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和高通量测序数据，利用多种机器学习算法构建宫颈癌预后模型 | 本研究仅使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据进行模型构建和验证，可能存在样本选择偏倚 | 开发一种评估宫颈癌预后的综合模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据，具体样本数量未详细说明 |
| 13252 | 2024-08-04 |
Identification of spatially-resolved markers of malignant transformation in Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46994-2
PMID:38553466
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研究论文 | 该论文研究了乳头状粘液性肿瘤中的恶性转化的空间分辨标记 | 本研究确认了乳头状粘液性肿瘤的亚型特异性标记，为风险分层提供了新的分子依据 | 研究依赖于两个独立患者队列，但可能存在样本多样性和外部验证的不足 | 研究乳头状粘液性肿瘤中恶性转化的分子标记 | 调查乳头状粘液性肿瘤患者的亚型特异性分子标记 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 两个独立的患者队列 |
| 13253 | 2024-08-07 |
Aberrant activated Notch1 promotes prostate enlargement driven by androgen signaling via disrupting mitochondrial function in mouse
2024-Mar-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05143-0
PMID:38538986
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研究论文 | 本研究证明过度激活的Notch1信号在小鼠前列腺上皮细胞中通过增强增殖和抑制凋亡导致前列腺增大 | 揭示了过度激活的Notch1信号通过增加雄激素受体敏感性、破坏细胞线粒体代谢、增加活性氧和增加前体细胞数量诱导前列腺增大的机制，并发现N-乙酰-L-半胱氨酸治疗可以缓解这种过度激活引起的增生 | NA | 探讨Notch信号在前列腺增大和增生中的潜在调控机制 | 小鼠前列腺上皮细胞和人类良性前列腺增生患者 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类良性前列腺增生患者的样本 |
| 13254 | 2024-08-07 |
Analysis of the effect of CCR7 on the microenvironment of mouse oral squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing technology
2024-Mar-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03013-y
PMID:38539232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析CCR7对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析CCR7基因敲除对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境中细胞类型和基因表达的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类口腔鳞状细胞癌中验证CCR7的作用 | 探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌微环境中的作用 | CCR7基因敲除小鼠和野生型小鼠的口腔鳞状细胞癌模型 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三只CCR7基因敲除小鼠和三只野生型小鼠 |
| 13255 | 2024-08-07 |
Adipose stem cells control obesity-induced T cell infiltration into adipose tissue
2024-Mar-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113963
PMID:38492218
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪干细胞（ASCs）在肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的作用 | 首次揭示了脂肪干细胞通过上调C-C基序趋化因子配体5（CCL5）在肥胖早期阶段调控T细胞积累的关键作用 | NA | 阐明肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的机制 | 脂肪干细胞和T细胞 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用肥胖小鼠的脂肪干细胞和骨髓进行移植实验 |
| 13256 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq: First Atlas and Cellular Landscape of Lacrimal Sac: Implications in Primary Acquired Nasolacrimal Duct Obstruction Pathogenesis
2024-Mar-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.3.38
PMID:38551583
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研究论文 | 本研究旨在描述原发性获得性鼻泪管阻塞（PANDO）患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并尝试构建首个泪囊细胞图谱，以阐明可能驱动疾病发病机制的潜在机制。 | 本研究首次构建了泪囊细胞图谱，并揭示了T细胞、B细胞和上皮细胞在炎症反应中的作用以及细胞间信号网络的构建。 | NA | 描述PANDO患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并构建泪囊细胞图谱以阐明疾病发病机制。 | 泪囊样本中的个体细胞群体，包括上皮细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 5名患者的泪囊样本，共25,791个细胞 |
| 13257 | 2024-08-04 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-Mar, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
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研究论文 | 本文概述了肿瘤浸润B细胞的克隆特征和功能程序的分析工具 | 提出了整合单细胞和空间转录组学、基因组学及蛋白组学的多种技术方法，推进了对B细胞功能的理解 | 目前对不同癌症、亚群体和个体患者中B细胞作用的理解仍然有限 | 旨在解析肿瘤微环境中B细胞的功能角色和行为 | 研究肿瘤微环境中浸润的B细胞及其克隆群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、基因组学、蛋白组学 | NA | NA | NA |
| 13258 | 2024-08-07 |
Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis
2024-Jan-16, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01296-0
PMID:38225514
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13259 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了在小鼠皮肤伤口早期炎症期间，细胞凋亡途径和吞噬凋亡细胞受体在纤维母细胞和免疫细胞中的上调情况，并分析了其在伤口修复中的作用。 | 本研究首次揭示了Axl信号在小鼠伤口修复中的必要性，以及Timd4受体在吞噬凋亡细胞和伤口修复中的作用，为慢性伤口的治疗提供了潜在的靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的应用和效果需要进一步验证。 | 探讨细胞凋亡识别受体在皮肤组织修复中的调控机制。 | 小鼠皮肤伤口的早期炎症过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 13260 | 2024-08-04 |
Cellular and transcriptome signatures unveiled by single-cell RNA-Seq following ex vivo infection of murine splenocytes with Borrelia burgdorferi
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1296580
PMID:38149246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠脾细胞在Borrelia burgdorferi感染后的特征 | 首次利用GFP标记的Borrelia burgdorferi对小鼠脾细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫响应的分子和细胞特征 | 研究结果主要基于小鼠模型，可能无法完全转化至人类 | 揭示Borrelia burgdorferi感染后宿主的免疫反应和相关生物标志物 | 感染Borrelia burgdorferi的小鼠脾细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠中分离的GFP+和GFP-脾细胞 |