单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 13241 - 13260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13241 | 2024-08-07 |
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
2021-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00787-0
PMID:33558695
|
研究论文 | 本研究利用10x Genomics Visium平台，在人类背外侧前额叶皮质的六个层次中定义了基因表达的空间地形图 | 研究首次在转录组规模上定义了人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达地形图，并开发了一个数据驱动的框架来定义空间转录组数据中的无监督聚类 | NA | 旨在探索人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达模式及其与神经精神疾病的关联 | 人类背外侧前额叶皮质的基因表达 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13242 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics: Current Methods and Challenges in Data Acquisition and Analysis
2021, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2021.591122
PMID:33967674
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学的方法、文库制备和数据生成，并强调了计算挑战 | 单细胞转录组学能够揭示人类生命的新基础，并提供科学界新的见解 | 由于起始材料少，SC-RNA-seq数据面临多种计算挑战，如归一化、差异基因表达分析和降维等 | 探讨单细胞转录组学在数据获取和分析中的当前方法和挑战 | 单细胞转录组学数据及其分析方法 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序（SC-RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数百万细胞 |
| 13243 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Angiotensin-Converting Enzyme 2 and Transmembrane Serine Protease 2 Expression in TROP2+ Liver Progenitor Cells: Implications in Coronavirus Disease 2019-Associated Liver Dysfunction
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.603374
PMID:33968947
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，调查了人类肝脏中与冠状病毒疾病2019（COVID-19）相关的肝功能障碍的潜在肝细胞类型 | 首次发现TROP2肝祖细胞中血管紧张素转换酶2和跨膜丝氨酸蛋白酶2的共表达，并揭示了这些细胞在COVID-19相关肝功能障碍中的作用 | NA | 探索COVID-19患者中肝功能障碍的特定靶细胞类型，并研究其与病毒入侵的关系 | 人类肝脏中的单细胞 | 数字病理学 | 冠状病毒疾病2019 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约300,000个单细胞，来自五种不同类型的人类肝脏组织（胎儿、健康、肝硬化、肿瘤及邻近正常组织） |
| 13244 | 2024-08-07 |
A robust method of nuclei isolation for single-cell RNA sequencing of solid tissues from the plant genus Populus
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0251149
PMID:33974645
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研究论文 | 本文介绍了一种从植物杨属中提取高质量原生质体的简单方法，通过从单个细胞核中提取mRNA进行单细胞RNA测序 | 提出了一种新的方法，通过从单个细胞核中提取mRNA，而不是整个细胞，来生成高质量的原生质体，适用于具有不同细胞复杂性和细胞壁结构的植物材料 | 该方法主要在杨属植物的顶端和更木质化的茎部进行了测试，可能需要进一步验证其在其他植物种类中的适用性 | 开发一种适用于植物组织单细胞RNA测序的新方法，以克服现有技术的局限性 | 杨属植物的顶端和木质化茎部组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 使用了两种不同复杂性和细胞壁结构的杨属植物材料 |
| 13245 | 2024-08-07 |
Unraveling Root Development Through Single-Cell Omics and Reconstruction of Gene Regulatory Networks
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.661361
PMID:34017350
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在植物和动物中应用的不同策略，并探讨了如何利用这些技术揭示新的调控机制和重建基因调控网络（GRN） | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在侧根发育中的应用，以及如何整合scRNA-seq结果与之前的RNA测序数据和基因调控网络 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在侧根发育研究中的应用，以及如何通过这些技术揭示细胞命运指定和模式化的基本生物学机制 | 侧根发育过程中的细胞命运指定和基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 13246 | 2024-08-07 |
Epigenetic Regulation in Hydra: Conserved and Divergent Roles
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.663208
PMID:34041242
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综述 | 本文综述了水螅中表观遗传调控的现代知识，包括与其他刺胞动物的研究以及调控机制之间的相互作用 | 探讨了表观遗传机制在转录调控中的祖先和分化作用，并利用单细胞转录组数据预测了潜在基因调控成分的生理相关性 | NA | 深入理解刺胞动物和两侧对称动物分化前基因调控过程的进化基础 | 水螅及其他前两侧对称生物的表观遗传调控机制 | 表观遗传学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13247 | 2024-08-07 |
Dysfunction of Decidual Macrophages Is a Potential Risk Factor in the Occurrence of Preeclampsia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.655655
PMID:34054819
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研究论文 | 本研究探讨了蜕膜巨噬细胞功能障碍作为子痫前期发生的风险因素 | 通过基因表达谱分析和单细胞测序，揭示了蜕膜巨噬细胞与其他蜕膜免疫细胞间的相互作用对子痫前期的影响 | 研究主要集中在基因和细胞层面，对临床干预的具体机制尚不明确 | 探究蜕膜巨噬细胞在子痫前期发病机制中的作用 | 蜕膜巨噬细胞及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13248 | 2024-08-07 |
Understanding the Adult Mammalian Heart at Single-Cell RNA-Seq Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.645276
PMID:34055776
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在理解成年哺乳动物心脏细胞多样性方面的应用和进展 | 单细胞RNA测序技术使得心血管研究领域能够重新定义心脏细胞亚群，并通过细胞特异性转录组特征无偏倚地识别相关甚至新的细胞类型 | 讨论了单细胞RNA测序技术的应用和局限性 | 增加对正常和病理性心脏的理解 | 成年哺乳动物心脏的细胞多样性 | NA | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13249 | 2024-08-07 |
The role of single-cell sequencing in studying tumour evolution
2021, Faculty reviews
DOI:10.12703/r/10-49
PMID:34131659
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究肿瘤进化中的作用 | 单细胞测序技术提供了对肿瘤进化动态过程的最终分辨率的洞察 | NA | 探讨单细胞测序技术如何为理解肿瘤进化提供变革性的见解 | 肿瘤细胞的体细胞（表观）基因组变化及其引起的表型后果 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 13250 | 2024-08-07 |
Meta-Analysis of Smooth Muscle Lineage Transcriptomes in Atherosclerosis and Their Relationships to In Vitro Models
2021, Immunometabolism
DOI:10.20900/immunometab20210022
PMID:34178388
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meta-analysis | 本研究对来自小鼠动脉粥样硬化的五个实验中的平滑肌细胞系追踪细胞的单细胞RNA测序数据进行了元分析，并将体内表达谱与体外胆固醇加载的平滑肌细胞和极化巨噬细胞的数据集进行了比较 | 研究揭示了体外胆固醇加载模型不足以模拟体内平滑肌细胞状态的转变，强调了开发更好细胞模型的必要性 | 体外数据与体内观察到的细胞状态转变不一致，表明现有体外模型存在局限性 | 旨在理解动脉粥样硬化中平滑肌细胞命运的转变，并评估现有体外模型的有效性 | 研究对象包括动脉粥样硬化中的平滑肌细胞和巨噬细胞，以及它们在体内外的表达谱 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及五个小鼠动脉粥样硬化实验的单细胞数据，以及三个体外胆固醇加载的平滑肌细胞实验和三个极化巨噬细胞实验的数据 |
| 13251 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Cellular Heterogeneity of Cardiovascular Diseases
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.643519
PMID:34179129
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示心血管疾病的细胞异质性 | 利用单细胞转录组学技术全面捕捉单个细胞内的基因表达图谱，识别稀有或未知的细胞亚群，分析单细胞轨迹和干细胞或前体细胞系转换 | 讨论了单细胞转录组学在心血管疾病研究中的当前局限性和有前景的临床潜力 | 总结正常血管和动脉粥样硬化、主动脉瘤、肺动脉高压中的细胞集群和基因表达模式，揭示血管异质性和心血管疾病的新调控因子 | 心血管疾病的细胞亚群及其基因表达特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 |
| 13252 | 2024-08-07 |
Genetic mapping of developmental trajectories for complex traits and diseases
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.05.055
PMID:34194671
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的生物信息学方法，通过整合全基因组关联研究（GWAS）信号与单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，增强对复杂人类特征和疾病的功能解释 | 该方法通过识别细胞分化轨迹与特征之间的联系，阐明生物过程和分子通路，并优先考虑目标基因，从而提高对复杂疾病病因的理解 | NA | 旨在通过识别轨迹-疾病联系和分子通路，优先考虑候选风险基因，提高对复杂疾病病因的理解 | 复杂人类特征和疾病 | 生物信息学 | NA | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 11种不同病理特征，12种不同发育过程的scRNA-seq数据集 |
| 13253 | 2024-08-07 |
How Do Uterine Natural Killer and Innate Lymphoid Cells Contribute to Successful Pregnancy?
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.607669
PMID:34234770
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review | 本文综述了子宫自然杀伤细胞和先天淋巴细胞在成功妊娠中的作用 | 利用单细胞RNA测序和高维流式及质谱流式技术详细分析了子宫内先天淋巴细胞的异质性 | 由于月经周期和妊娠期间组织快速变化的特性，确定每个亚群的具体作用具有内在挑战性 | 探讨子宫内先天淋巴细胞在非妊娠期子宫内膜和妊娠早期蜕膜中的表型和功能多样性，以及它们如何促进胎盘发育 | 子宫内的先天淋巴细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的子宫组织 |
| 13254 | 2024-08-07 |
Reference Transcriptomes of Porcine Peripheral Immune Cells Created Through Bulk and Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.689406
PMID:34249103
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序技术，定义了猪外周血免疫细胞的转录组 | 首次提供了猪外周血单核细胞的单细胞转录组数据，并将其与人类数据进行比较验证 | NA | 为猪的免疫遗传特征基因提供注释，并为进一步研究猪的免疫学和开发新试剂提供资源 | 猪的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8种细胞类型的批量细胞和7个样本的单细胞转录组数据 |
| 13255 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Chicken Anterior Pituitary: A Bird's-Eye View on Vertebrate Pituitary
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.562817
PMID:34267669
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了成年鸡前垂体的转录组，揭示了前垂体细胞群的基因表达特征 | 首次在鸡前垂体中识别出四种已知的内分泌细胞群和四种非内分泌/分泌细胞类型，并发现了新的标记基因和性二态表达基因 | 未分析somatotrophs细胞群 | 深入了解脊椎动物前垂体的细胞组成、异质性、细胞间通讯和基因表达谱 | 成年鸡前垂体的细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鸡前垂体的多个细胞群 |
| 13256 | 2024-08-07 |
Statistical and machine learning methods for spatially resolved transcriptomics with histology
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.06.052
PMID:34285782
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综述 | 本文综述了空间分辨转录组学（SRT）数据分析中的统计和机器学习方法，并探讨了如何整合空间位置和组织学信息与基因表达数据 | 强调了SRT数据与单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的差异性，并提出了针对SRT数据特性的新方法需求 | 指出了该领域存在的未解决问题和未来研究方向 | 旨在推动对转录复杂性的理解 | 空间分辨转录组学数据及其伴随的高分辨率组织学信息 | 机器学习 | NA | 空间分辨转录组学（SRT） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13257 | 2024-08-07 |
Toward uncharted territory of cellular heterogeneity: advances and applications of single-cell RNA-seq
2021, Journal of translational genetics and genomics
DOI:10.20517/jtgg.2020.51
PMID:34322662
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在细胞异质性研究中的应用 | scRNA-seq技术在cDNA合成与扩增、下一代测序读取的处理与比对、差异表达基因识别、细胞聚类、亚群识别及发育轨迹预测等方面取得了快速的技术进步 | NA | 探索scRNA-seq技术快速发展的技术景观，并深入了解其在各个显著进展领域的特点和优势 | scRNA-seq技术及其在人类和动物模型中细胞类型全局转录谱研究的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 13258 | 2024-08-07 |
DNF: A differential network flow method to identify rewiring drivers for gene regulatory networks
2020-Oct-14, Neurocomputing
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.neucom.2020.05.028
PMID:34025035
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研究论文 | 本文提出了一种差异网络流（DNF）方法，用于识别基因调控网络中的关键调节因子 | DNF方法通过量化网络流分布的差异，能够从局部到全局捕捉全面的拓扑差异，从而更准确地识别驱动基因 | NA | 旨在开发一种新方法，能够从随机变化和下游效应中分离出真正的调控元件的影响 | 基因调控网络中的关键调节因子 | 基因组学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 基因组数据 | 四个人类数据集来自癌症基因组图谱和三个小鼠神经和造血分化单细胞RNA测序数据集 |
| 13259 | 2024-08-07 |
STAT3-BDNF-TrkB signalling promotes alveolar epithelial regeneration after lung injury
2020-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0569-x
PMID:32989251
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研究论文 | 本文通过全基因组染色质可及性和基因表达分析，研究了急性肺损伤后肺泡上皮再生的机制，特别是STAT3-BDNF-TrkB信号轴的作用。 | 首次揭示了STAT3-BDNF-TrkB信号轴在肺泡上皮再生中的生物学和治疗重要性。 | NA | 阐明肺损伤后肺泡上皮再生的机制。 | 肺泡上皮细胞（AT2和AT1细胞）及其再生过程。 | 数字病理学 | 肺疾病 | 全基因组染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13260 | 2024-08-07 |
SciBet as a portable and fast single cell type identifier
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15523-2
PMID:32286268
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SciBet的监督式细胞类型识别工具，该工具能够快速准确地预测新测序细胞的身份，具有速度优势 | SciBet提供了一种快速、鲁棒且技术独立的计算方法，用于单细胞RNA测序数据的监督式细胞类型注释 | NA | 开发一种快速且用户友好的工具，用于单细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督式学习模型 | RNA测序数据 | NA |