单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
13201 2024-08-07
Single-cell analysis of fate-mapped macrophages reveals heterogeneity, including stem-like properties, during atherosclerosis progression and regression
2019-02-21, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术,首次分析了在小鼠动脉粥样硬化进展和消退过程中,由CX3CR1+前体细胞衍生的斑块细胞的特征 研究揭示了比传统M1和M2极化状态更为复杂的巨噬细胞激活状态,并发现了一个意外的增殖性单核细胞簇,具有类似干细胞的特征 NA 探讨动脉粥样硬化进展和消退过程中巨噬细胞的异质性和特征 小鼠动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
13202 2024-08-07
Lung type 3 innate lymphoid cells respond early following Mycobacterium tuberculosis infection
2024-Apr-10, mBio IF:5.1Q1
研究论文 研究探讨了肺部类型3先天淋巴细胞(ILC3s)在结核分枝杆菌感染早期的反应机制 揭示了ILC3在结核分枝杆菌感染早期的激活和招募机制,特别是IL-1R信号通路和CXCR5信号通路的作用 NA 研究ILC3在结核分枝杆菌感染早期的反应机制及其作为潜在疫苗靶点的可能性 肺部类型3先天淋巴细胞(ILC3s)及其在结核分枝杆菌感染中的作用 免疫学 结核病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠模型中的肺部先天淋巴细胞(ILCs)
13203 2024-08-07
Interferon Regulatory Factor 6 Determines Intestinal Epithelial Cell Development and Immunity
2024-Apr-09, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 研究探讨了干扰素调节因子6(IRF6)在肠道上皮细胞(IEC)发育和免疫中的作用 首次揭示了IRF6在IEC生物学中的作用,包括调节上皮细胞发育和调节先天免疫反应以减少细胞毒性和维持屏障功能 NA 研究IRF6在肠道上皮细胞发育和免疫中的具体作用 肠道上皮细胞(IEC)和IRF6的功能 NA NA CRISPR筛选,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及转化的鼠IEC和IEC类器官
13204 2024-08-04
Deciphering the cellular heterogeneity of the insect brain with single-cell RNA sequencing
2024-Apr, Insect science IF:2.9Q1
综述 本文回顾了昆虫大脑的基本结构及其与行为的关联,重点探讨学习和记忆相关的方面 介绍了单细胞RNA测序在昆虫大脑研究中的应用,揭示了细胞亚群的分类及发育轨迹 缺乏关于昆虫大脑功能调节如何具体作用的更深入解析 探讨昆虫大脑的细胞异质性及其对行为的影响 昆虫大脑的不同细胞类型及其连接和功能 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA
13205 2024-08-04
Tumor-specific activation of folate receptor beta enables reprogramming of immune cells in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该文章展示了肿瘤特异性激活叶酸受体β如何重编程肿瘤微环境中的免疫细胞 阐明了FRβ在肿瘤微环境中的特定作用以及其对免疫细胞重编程的影响 未明确提及研究的局限性 研究FRβ在肿瘤相关巨噬细胞中的功能及其对肿瘤微环境的重编程作用 主要研究肿瘤微环境中的免疫抑制性巨噬细胞及其功能变化 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA NA NA
13206 2024-08-07
Decoding the tumor microenvironment and molecular mechanism: unraveling cervical cancer subpopulations and prognostic signatures through scRNA-Seq and bulk RNA-seq analyses
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,深入分析宫颈癌的肿瘤微环境和分子机制,识别关键的肿瘤上皮细胞亚群及其对宫颈癌进展的影响 首次识别出C3 PLP2+肿瘤上皮祖细胞作为宫颈癌中的一个重要亚群,并建立了独立的预后指标PLP2+肿瘤EPCs评分 NA 深入理解影响宫颈癌进展的决定因素,提高对宫颈癌肿瘤微环境的认识,并为未来的宫颈癌治疗提供有价值的见解 宫颈癌的肿瘤上皮细胞亚群及其对疾病进展的影响 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-seq) NA RNA 四份宫颈癌患者样本
13207 2024-08-07
Innovative prognostic modeling in ESCC: leveraging scRNA-seq and bulk-RNA for dendritic cell heterogeneity analysis
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA分析,深入探讨了食管鳞状细胞癌(ESCC)中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 本研究通过scRNA-seq和批量RNA分析,揭示了树突状细胞在ESCC中的异质性,并开发了基于树突状细胞相关基因签名的预后模型 NA 深入研究食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其对患者预后的影响 食管鳞状细胞癌中的树突状细胞 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA分析 NA RNA GSE53624队列(n = 119)、TCGA-ESCC队列(n = 139)、IMvigor210免疫治疗队列(n = 298)
13208 2024-08-04
Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer's disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development
2023-11-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究创建了一个来自阿尔茨海默病患者的脑类器官模型,探讨了早期事件和病理进程 利用来自具有PSEN1/2突变的阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞创建了特定的脑类器官,并发现了组织模式缺陷和发育改变 研究主要集中在体外模型上,可能不完全反映体内的病理情况 探讨阿尔茨海默病的早期病理事件和进展 利用来自家族性阿尔茨海默病患者的诱导多能干细胞生成的脑类器官 数字病理学 阿尔茨海默病 诱导多能干细胞(iPSC) 脑类器官(CO) 单细胞测序数据 来自三条阿尔茨海默病-iPSC线的样本
13209 2024-08-07
Inverse agonists of retinoic acid receptor/retinoid X receptor signaling as lineage-specific antitumor agents against human adenoid cystic carcinoma
2023-07-06, Journal of the National Cancer Institute
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和异种移植实验,探讨了人腺样囊性癌中两种不同细胞类型的肿瘤起始能力和分化关系,并测试了视黄酸受体/视黄酸X受体信号通路作为特定治疗靶点的潜力。 首次揭示了腺样囊性癌中肌上皮样细胞作为导管样细胞的前体,并发现抑制视黄酸受体/视黄酸X受体信号通路对导管样细胞具有选择性毒性,为治疗提供了新策略。 NA 探索人腺样囊性癌中不同细胞类型的肿瘤起始能力和分化关系,并寻找特定治疗靶点。 人腺样囊性癌中的肌上皮样细胞和导管样细胞。 数字病理学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自人腺样囊性癌的患者源性异种移植模型。
13210 2024-08-07
Repression of the aryl-hydrocarbon receptor prevents oxidative stress and ferroptosis of intestinal intraepithelial lymphocytes
2023-04-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 研究揭示了芳基烃受体抑制剂(AHRR)对维持肠道上皮内淋巴细胞(IELs)的重要性,以及其缺乏导致的氧化应激和铁死亡 首次展示了AHRR在维持IELs中的关键作用,以及其缺乏如何导致氧化应激和铁死亡 研究主要集中在实验室模型和小鼠实验上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探讨AHRR在调节肠道免疫反应和防止氧化应激及铁死亡中的作用 肠道上皮内淋巴细胞(IELs)和芳基烃受体(AHR)及其抑制剂(AHRR) NA 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及小鼠模型和炎症性肠病患者的组织样本
13211 2024-08-07
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Mechanisms of Renal Injury in Essential Hypertension
2023, Kidney & blood pressure research IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,探索了原发性高血压肾损伤的分子机制 首次通过单细胞RNA测序揭示了高血压肾损伤早期细胞特异性基因表达的变化 研究仅限于大鼠模型,结果的临床应用需要进一步验证 识别高血压肾损伤的早期生物标志物和信号通路 高血压肾损伤的大鼠肾脏样本 数字病理学 高血压 单细胞RNA测序 NA 转录组 10,602个单细胞转录组来自2个对照组和2个早期高血压肾损伤样本
13212 2024-08-04
Unraveling the hidden complexity: Exploring dental tissues through single-cell transcriptional profiling
2024-Dec, Regenerative therapy IF:3.4Q2
综述 本研究探讨了使用单细胞转录组技术对牙齿及周围组织的细胞组成进行分析 本文创新地采用单细胞转录组技术,揭示了哺乳动物牙齿和牙周组织的细胞复杂性 本综述主要集中在现有的单细胞转录组研究上,可能未涵盖所有相关研究 揭示牙齿生物学的复杂性以及相关细胞的组成和功能 对小鼠及人类牙齿和牙周组织进行单细胞转录组分析 数字病理学 NA 单细胞转录组 NA 细胞 涉及小鼠和人类的健康及龋齿牙齿的单细胞样本
13213 2024-08-07
The Impact of FBN1-α5β1 Axis in Fibro/Adipogenic Progenitor Cells (FAPCD9-) on Intramuscular Fat Content in Pigs
2024-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序分析了广东小耳花猪(高IMF)和约克夏猪(低IMF)的背最长肌,发现高IMF猪具有更多的纤维/脂肪生成祖细胞(FAPs),而低IMF猪则表现出更高的FBN1-整合素α5β1轴表达,抑制了脂肪生成分化。 本研究首次揭示了FBN1-α5β1轴在纤维/脂肪生成祖细胞中的作用,及其对猪肌肉内脂肪含量的影响。 NA 探讨纤维/脂肪生成祖细胞及其相关分子轴在猪肌肉内脂肪含量中的作用。 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌。 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌样本
13214 2024-08-04
Single-cell multiomics reveals the interplay of clonal evolution and cellular plasticity in hepatoblastoma
2024-Apr-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞多组学策略揭示了肝母细胞瘤中克隆演变与细胞可塑性之间的相互作用 通过单细胞测序,研究了HB细胞状态的连续性及其差异化极性,并揭示了基因调控网络与转录因子激活序列 具体的机制尚不完全明了,且对临床结果的影响仍需进一步研究 解析肝母细胞瘤细胞可塑性的分子决定因素 肝母细胞瘤中的不同基因亚克隆及其细胞状态变化 数字病理学 肝癌 单细胞多组学 NA 基因组数据,空间转录组数据 NA
13215 2024-08-07
Drug repositioning for immunotherapy in breast cancer using single-cell analysis
2024-Apr-08, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
meta-analysis 本研究利用单细胞RNA测序数据和已知治疗性肽,调查了恶性与正常人类乳腺上皮细胞中这些肽的失调情况,并通过ATAC-seq在染色质水平上验证了这些发现,同时评估了不同BC细胞系中的蛋白质水平。此外,采用内部药物再定位方法,识别可能对BC患者无复发生存期产生积极影响的潜在药物。 本研究通过整合药物再定位流程与单细胞分析,提出了一种免疫治疗乳腺癌的新方法,并确定了潜在的药物和药物靶点,以强化免疫系统对抗乳腺癌。 NA 研究旨在通过免疫调节肽的失调作为免疫治疗策略,增强乳腺癌的免疫反应。 研究对象包括恶性与正常人类乳腺上皮细胞,以及不同乳腺癌细胞系中的蛋白质水平。 digital pathology breast cancer single-cell RNA sequencing, ATAC-seq NA RNA sequencing data, chromatin data, protein levels 具体样本数量未在摘要中提及
13216 2024-08-07
Differentiation of type 17 MAIT cells in circulation contributes to the severity of sepsis
2024-Apr-08, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在脓毒症严重程度中的作用 首次发现循环中的MAIT17细胞在脓毒症患者中比例较高,且与疾病严重程度相关 NA 揭示MAIT17细胞在脓毒症中的新作用及其分子机制 MAIT17细胞在脓毒症中的作用及相关的信号通路 免疫学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
13217 2024-08-04
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究报告了抑制ATR可以通过干扰细胞骨架网络和整合素内吞作用来减少胶质母细胞瘤的侵袭 首次提出ATR在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的新角色,并且聚焦于ATR的药物靶向对临床的潜在益处 未明确描述临床应用的具体措施和时间框架 探讨ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的影响 胶质母细胞瘤细胞的运动和侵袭性 数字病理 胶质母细胞瘤 时间延迟显微镜、超分辨率成像和体内成像 正交胶质母细胞瘤模型 图像 具体样本量未提供,使用胶质母细胞瘤肿瘤标本进行研究
13218 2024-08-04
CD200+ fibroblasts form a pro-resolving mesenchymal network in arthritis
2024-Apr, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 这篇文章探讨了在关节炎中成纤维细胞的表型变化及其在炎症解决过程中的作用。 文章首次使用正电子发射断层扫描技术检测成纤维细胞激活蛋白,并展示了成纤维细胞在炎症解决过程中的动态分子调控。 这项研究主要集中在实验性关节炎模型中,可能不完全适用于人类的所有疾病状态。 研究成纤维细胞在炎症解决过程中的表型变化及其功能。 研究对象为在实验性关节炎中活化的成纤维细胞。 数字病理学 关节炎 正电子发射断层扫描(PET),单细胞RNA测序 NA 生物样本(活检) 实验性关节炎的小鼠模型和人类关节活检样本
13219 2024-08-04
Tracking the immune response profiles elicited by the BNT162b2 vaccine in COVID-19 unexperienced and experienced individuals
2024-04, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本文对BNT162b2疫苗在COVID-19经历和未经历感染个体中的免疫反应进行了纵向分析 研究揭示了疫苗接种后免疫反应的动态变化,在经历自然感染与否的个体中有不同的克隆扩展模式。 研究可能未考虑其他因素如个体遗传背景和免疫系统的差异对免疫反应的影响 旨在分析BNT162b2疫苗在不同感染经历个体中的免疫反应 针对曾经历和未经历SARS-CoV-2感染的个体进行了免疫学分析 数字病理学 NA CITE-seq, LIBRA-seq, VDJ-seq NA 单细胞转录组数据 NA
13220 2024-08-07
Cannabidiol protects against acute aortic dissection by inhibiting macrophage infiltration and PMAIP1-induced vascular smooth muscle cell apoptosis
2024-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 研究探讨了大麻二酚(CBD)对急性主动脉夹层(AAD)的保护作用及其机制 首次揭示了CBD通过抑制巨噬细胞浸润和PMAIP1诱导的血管平滑肌细胞凋亡来减轻AAD的进展 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 探索CBD作为AAD治疗药物的潜在效果及其作用机制 急性主动脉夹层、巨噬细胞、血管平滑肌细胞 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA RNA 包括人类和鼠类的AAD样本
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