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当前共找到 38549 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-04-03 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DSAVE的新方法，用于评估单细胞转录组簇的纯度并识别错误分类的细胞 | 开发了基于下采样的变异估计方法，通过消除采样噪声差异并使用基于对数似然的度量来识别错误分类的细胞，这是现有类似工具无法检测的 | 未在摘要中明确说明 | 评估单细胞RNA测序数据中细胞亚群的纯度并检测错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇和细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1302 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets
IF:2.5Q2
DOI:10.1080/09537104.2026.2651849
PMID:41918402
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研究论文 | 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学，系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 | 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析，系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因，并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 | 研究主要基于计算生物学和体外数据验证，缺乏体内实验的直接功能验证；样本量可能有限，且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 | 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制，并探索其治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物（罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕）的靶点 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 | hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据（具体样本数未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1303 | 2026-04-02 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本的单细胞转录组数据，构建了一个基于癌症干细胞样细胞特征的12基因签名，用于预测患者生存和治疗反应 | 首次在患者样本中识别出具有癌症干细胞样特征的罕见细胞群，并基于此构建了CARS评分系统，揭示了其与索拉非尼耐药性和免疫检查点抑制剂敏感性的关联 | 研究基于单细胞转录组数据，样本量有限，需要更大规模的临床验证来确认CARS的预测价值 | 开发一个基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因签名，以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌患者样本中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 基因签名评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1304 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法，整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究，系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据，结合孟德尔随机化框架，识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断，需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1305 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术，识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇，并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学，免疫组织化学，免疫荧光，苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析，细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据，图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学，总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1306 | 2026-04-02 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Apr, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和顺序免疫荧光技术，揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域，揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏中的情况可能有所不同；技术方法可能无法完全捕捉细胞间相互作用的复杂性 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 顺序免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1307 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-Apr, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了二维单层和三维球体两种人源肝脏微组织模型对乙酰氨基酚暴露的细胞反应差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了2D与3D肝脏微组织对药物暴露的转录组反应，揭示了氧气可用性与药物代谢之间的动态相互作用 | 仅使用单一药物（乙酰氨基酚）进行验证，暴露时间固定为24小时，未涵盖其他肝毒性药物或更长时间点的反应 | 评估和比较不同体外肝脏模型（2D单层与3D球体）在预测药物性肝损伤方面的生理相关性和机制差异 | 由原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的二维单层和三维球体肝脏微组织 | 单细胞转录组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1308 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异，特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异，并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小（4名男性和5名女性患者），且仅关注了前交叉韧带，未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织切片图像 | 9名患者（4名男性，5名女性）的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1309 | 2026-04-02 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
|
研究论文 | 本研究探讨了代谢减重手术对肥胖青少年2型糖尿病患者早期肾损伤的缓解作用及其分子机制 | 首次在青少年2型糖尿病肥胖患者中，通过配对肾活检样本，结合单细胞RNA测序、代谢组学和蛋白质组学，系统揭示了垂直袖状胃切除术后肾脏的结构和分子适应性变化，并发现了mTORC1/JAK/STAT信号通路的下调 | 样本量较小（n=5），且为观察性研究，无法完全排除混杂因素的影响 | 探究代谢减重手术如何缓解肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 患有2型糖尿病和严重肥胖的青少年 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，代谢组学，蛋白质组学，组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，组织学图像，临床数据 | 5名青少年（IMPROVE-T2D队列）的配对肾活检样本；64名青少年（Teen-LABS队列）的循环蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1310 | 2026-04-02 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
|
研究论文 | 本研究探讨了在闭合性头部损伤模型中，炎症小体适配蛋白ASC如何促进持续的神经炎症和轻度认知障碍 | 首次在单细胞水平揭示ASC在闭合性头部损伤后微胶质细胞中的选择性表达，并证明其在维持神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠模型中的皮质组织，特别是微胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1311 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1312 | 2026-04-02 |
In vivo CRISPR screens identify CBX4 as an epigenetic regulator for cancer immunotherapy
2026-Mar-31, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200564
PMID:41915438
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现CBX4是癌症免疫治疗的关键表观遗传调控因子 | 首次通过体内CRISPR筛选鉴定出CBX4作为表观遗传免疫检查点，揭示了其通过沉默逆转录转座子调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肝癌患者数据，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探索表观遗传调控因子在肿瘤免疫治疗耐药中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型、接受新辅助抗PD-1治疗的肝癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 体内CRISPR-Cas9筛选、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CRISPR筛选模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1313 | 2026-04-02 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析，揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 | 首次在CTEPH中整合多组学数据（单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化）进行互补分析，并识别出具有遗传支持的新型候选基因（如ETS1和FGR）及其诊断潜力 | 样本量相对有限，且为观察性研究，需进一步功能验证和更大队列验证 | 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 | 未明确具体样本数，涉及CTEPH患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |
| 1314 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
|
研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架，用于空间转录组学数据插补，并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略，利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域；2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示；3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN)，在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战，实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据，自然图像 | 多种组织类型（包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1315 | 2026-04-02 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间转录组数据的生成式AI模型，用于预测大脑血管系统的空间组织结构 | 利用空间mRNA引导的生成模型Tera-MIND，通过Cldn5和Acta2基因的共表达模式及其学习到的注意力图，在细胞级别分辨率上预测大脑血管空间组织 | NA | 探索大脑血管系统的结构变异性和区域特异性功能，以解释疾病模型中的神经学改变 | 小鼠大脑血管系统 | 数字病理学 | 神经疾病 | 空间转录组学 | 生成式AI模型，基于patch和边界感知的扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1316 | 2026-04-02 |
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01394-1
PMID:41917254
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，系统性地揭示了VDAC2在泛癌中的致癌作用及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路影响肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 首次在泛癌层面系统性地整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据来研究VDAC2，并识别了VDAC2-BAK1-IFNγ这一在消化系统癌症中重要的新通路 | 体外实验验证主要集中于胃癌细胞，需要在更多癌症类型和体内模型中进行进一步验证 | 系统性地挖掘VDAC2在泛癌中的作用，探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 泛癌数据集、胃癌细胞系 | 机器学习 | 泛癌（重点关注消化系统癌症） | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-PCR, 细胞共培养, CCK-8检测, Transwell侵袭实验, ELISA | NA | 转录组数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1317 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of urothelial carcinoma with basal/squamous differentiation identifies Galectin-7 as a specific marker of squamous lineage commitment
2026-Mar-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04927-z
PMID:41917522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1318 | 2026-04-02 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
|
研究论文 | 提出了一种名为scMIB的掩码信息瓶颈框架，用于从单细胞RNA测序数据中学习紧凑且信息丰富的表示，以提升细胞聚类的准确性和鲁棒性 | 结合了基于掩码的去噪策略与信息瓶颈目标，通过扰动基因表达模式并训练模型恢复信息结构，同时压缩冗余信号并保留对聚类最相关的信息，还引入了掩码一致性学习机制以捕获稳定的基因水平模式 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中高稀疏性、噪声和冗余性对细胞聚类准确性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码信息瓶颈框架 | 基因表达数据 | 多个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1319 | 2026-04-02 |
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120083
PMID:41916120
|
研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法，探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 | 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合，系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 | 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用，需进一步实验验证；单细胞数据未明确说明样本来源和数量 | 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 | 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 | NA | 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 | 基于NHANES数据库的流行病学队列（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1320 | 2026-04-02 |
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101191
PMID:41916275
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研究论文 | 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 | 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程，并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态，特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 | 研究主要基于体外实验模型，尚未在临床样本中得到充分验证 | 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | DNA条形码技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |