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当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-05-16 |
QCatch: a framework for quality control assessment and analysis of single-cell sequencing data
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag184
PMID:41987571
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研究论文 | 介绍QCatch，一个用于单细胞测序数据质量控制的Python命令行工具，生成综合交互式QC报告 | 专为alevin-fry和simpleaf输出设计，生成标准化、交互式HTML质量控制报告，支持无缝整合下游分析流程 | 仅针对alevin-fry和simpleaf输出格式，可能不兼容其他单细胞分析管道 | 提升单细胞测序数据质量控制的标准化和可重复性 | 单细胞测序数据质量评估流程 | 机器学习， 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1302 | 2026-05-16 |
Sustainable Cultivation of Rare and Endangered Medicinal Plant Multicellular Spheroids Producing Bioactive Therapeutics for Alcohol-Related Liver Disease Therapy
2026-May, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504623
PMID:41668397
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研究论文 | 利用稀有濒危药用植物多细胞球体可持续生产生物活性代谢物，用于酒精性肝病治疗 | 首次开发基于多细胞球体的培养策略，可持续高效生产稀有濒危植物雪莲的次生代谢产物，并结合单细胞转录组学揭示其生物合成细胞簇 | 未提及具体局限性 | 建立可持续的生物制造方法，利用药用植物细胞生产生物活性代谢物，并评估其对酒精性肝病的治疗潜力 | 雪莲（Saussurea involucrata）多细胞球体及其次生代谢产物 | 机器学习 | 酒精性肝病 | 单细胞转录组学，超高效液相色谱-串联质谱 | NA | 转录组数据，代谢组数据 | 小鼠模型（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1303 | 2026-05-16 |
Semaphorin 3C/Plexin D1 Interaction Regulates Collagen Metabolism in Keloid Fibroblasts via the Transforming Growth Factor-β1 Signaling Pathway
2026-05, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.02.007
PMID:41833636
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和实验验证，揭示了SEMA3C/PLXND1相互作用通过TGF-β1信号通路调节瘢痕疙瘩成纤维细胞中胶原代谢的新机制 | 首次发现SEMA3C/PLXND1轴通过激活TGF-β1驱动瘢痕疙瘩纤维化，促进细胞外基质沉积，为瘢痕疙瘩治疗提供了新靶点 | NA | 探究SEMA3C/PLXND1通路在瘢痕疙瘩纤维化过程中的作用及其通过TGF-β1信号转导的机制 | 瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常皮肤样本 | 机器学习 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,转录组测序,实时定量PCR,Western blot,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 8个瘢痕疙瘩和8个正常皮肤样本（来自4个公共数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1304 | 2026-05-16 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Cell-Type-Specific Immune Regulatory Networks in Maize Responding to Southern Corn Rust
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512295
PMID:41837846
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学揭示玉米响应南方锈病的细胞类型特异性免疫调控网络 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组测序技术在单细胞水平揭示玉米叶片对南方锈病菌早期感染的细胞类型特异性转录动态，并通过功能验证鉴定出关键易感因子ZmXET1和抗性组分ZmRBG | 未明确说明，但可能包括样本量有限、时间点较少或仅聚焦早期感染阶段 | 阐明玉米叶片在南方锈病菌侵染早期细胞类型特异的防御机制 | 玉米叶片在南方锈病菌侵染24和48小时后的细胞类型特异性转录动态 | 数字病理学 | 植物病害（玉米南方锈病） | 单核RNA测序，空间转录组测序，VIGS | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 在感染后24小时和48小时采集的玉米叶片样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1305 | 2026-05-16 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514490
PMID:41869863
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研究论文 | 通过综合实验评估基础模型在单细胞数据分析中的性能，并比较其与任务特定方法的优劣 | 首次系统性评估十种单细胞基础模型在八项下游任务中的表现，提出scEval框架用于分析超参数、初始设置和稳定性，并提供预训练与微调指导 | 基础模型并非在所有任务中均优于任务特定方法，挑战了开发单细胞基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞数据分析中的实用性，提供性能基准和开发指南 | 十种单细胞基础模型（如scGPT、Geneformer、CellFM）及八个下游任务 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1306 | 2026-05-16 |
Translating brain anatomy and disease from mouse to human in latent gene expression space
2026-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106259
PMID:42034047
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研究论文 | 通过小鼠和人类基因表达构建潜在空间，实现脑解剖和疾病从小鼠到人类的翻译 | 提出一个定量框架，利用变分自编码器将小鼠和人类基因表达映射到共同潜在空间，实现跨物种脑解剖和疾病的翻译，并预测阿尔茨海默病和帕金森病中人类脑变化模式 | 未明确说明，但可能受限于基因同源性质量、模型泛化能力及训练数据覆盖范围 | 建立跨物种的定量共同空间，以改进从动物模型到人类的神经科学发现翻译 | 小鼠和人类脑基因表达数据 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1307 | 2026-05-16 |
Integrated spatial multi-omics delineates fatty acid degradation fuels malignant evolution at the tumour periphery in cervical squamous cell carcinoma
2026-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106256
PMID:42048995
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研究论文 | 整合空间多组学分析揭示宫颈鳞状细胞癌中脂肪酸降解在肿瘤外周驱动恶性进化 | 首次通过整合空间转录组学与代谢组学，在宫颈鳞状细胞癌中描绘了从肿瘤核心到外周的空间代谢重编程，并确定脂肪酸降解的激活是外周肿瘤灶恶性表型的关键进化驱动力 | 未具体说明，但从样本量（6个CSCC样本）推测可能样本量较小，且功能验证主要依赖细胞系和类器官，尚需更大规模临床队列验证 | 探究宫颈鳞状细胞癌肿瘤灶内空间异质性与恶性进化的分子机制 | 宫颈鳞状细胞癌肿瘤样本及正常宫颈样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学，空间代谢组学，单细胞RNA测序，空间增强分辨率组学测序 | NA | 图像，文本 | 6个CSCC样本、2个正常宫颈样本、20个单细胞RNA测序样本、15个独立空间增强分辨率组学测序样本 | NA | 空间转录组学，空间代谢组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1308 | 2026-05-16 |
Multi-omics integration identifies PFOS-associated immune signatures in Kawasaki disease
2026-May, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2026.110279
PMID:42061194
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研究论文 | 该研究通过多组学整合分析，探索全氟辛烷磺酸（PFOS）暴露与川崎病免疫转录组特征之间的潜在关联 | 首次系统性地将环境暴露与川崎病免疫特征相结合，利用多组学整合、机器学习和单细胞RNA测序等技术，识别出PFOS特异性相关的候选基因和调控网络 | 研究基于计算模拟，缺乏直接的实验验证和流行病学数据支持，且候选基因和调控因子的功能意义需进一步明确 | 探索PFOS暴露与川崎病免疫转录组特征的潜在关联，为后续机制验证和流行病学研究提供候选靶点 | 川崎病患者免疫转录组特征及PFOS毒理学靶标 | 生物信息学，多组学整合，单细胞分析 | 川崎病 | 多组学整合，机器学习，SHAP分析，分子模拟，单细胞RNA测序 | 机器学习模型（用于特征选择与SHAP分析） | 转录组数据，单细胞转录组数据，分子结构数据 | 独立队列（具体数值未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1309 | 2026-05-16 |
Partial domain adaptation enables cross domain cell type annotation between scRNA-seq and snRNA-seq
2026-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014223
PMID:42090457
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研究论文 | ScNucAdapt方法实现了scRNA-seq与snRNA-seq数据集间的跨域细胞类型注释 | 首次应用部分域适应策略解决scRNA-seq与snRNA-seq之间的分布差异和细胞组成差异，实现跨数据集精确注释 | NA | 开发用于scRNA-seq与snRNA-seq数据之间交叉注释的方法 | scRNA-seq和snRNA-seq数据集中的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序 | 部分域适应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 1310 | 2026-05-16 |
TCF1+CD4+ T cells and microglia co-orchestrate tertiary lymphoid structures to enhance prognosis and immunotherapy in non-small cell lung cancer with brain metastases
2026-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106280
PMID:42085932
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研究论文 | 探讨了在非小细胞肺癌脑转移中TCF1+CD4+ T细胞和小胶质细胞协同调控三级淋巴结构以改善预后和免疫治疗反应的作用 | 首次揭示了TCF1+CD4+ T细胞和小胶质细胞通过LTβ/LTβR信号通路共同促进颅内三级淋巴结构形成，并发现CXCL12作为关键趋化因子与免疫治疗获益相关 | 样本量有限且为回顾性研究，TLS功能验证仅在小鼠模型中进行，尚需更大规模前瞻性研究确认 | 阐明非小细胞肺癌脑转移中三级淋巴结构的特征、功能及其对预后和免疫治疗反应的影响机制 | 人非小细胞肺癌脑转移组织样本（120例）和LC-BrM小鼠模型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌脑转移 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、H&E染色 | NA | 组织图像、单细胞转录组数据 | 120例人非小细胞肺癌脑转移手术切除样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞文库构建，Illumina NovaSeq用于测序 |
| 1311 | 2026-05-16 |
Single-cell transcriptomics reveal PRRC1 as a malignant cell enriched driver of DNA repair and therapy resistance in glioblastoma
2026-May, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2026.103934
PMID:41932066
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研究论文 | 通过单细胞转录组等多组学分析发现PRRC1在胶质母细胞瘤恶性细胞中富集并促进DNA修复和治疗抵抗 | 首次揭示PRRC1在胶质母细胞瘤中的功能角色，通过整合单细胞RNA测序、批量转录组和DNA甲基化数据进行无偏多组学分析，阐明了PRRC1在DNA损伤应答和应激适应中的作用 | 研究主要依赖体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；PRRC1的具体分子机制和临床转化潜力需进一步探索 | 识别胶质母细胞瘤中调控DNA损伤应答相关细胞状态的新调控因子 | 胶质母细胞瘤细胞（U87和患者来源细胞）及肿瘤样本 | 计算生物学， 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序， 批量转录组分析， DNA甲基化分析 | NA | 转录组数据， 甲基化数据 | 多组公共数据集（TCGA、GDSC等）及U87和患者来源细胞系 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1312 | 2026-05-16 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Uncover Potential Immunocytes-Related Therapeutic Targets for Obesity
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71185
PMID:42117609
|
研究论文 | 通过单细胞转录组全基因组孟德尔随机化和共定位分析，揭示与免疫细胞相关的肥胖潜在治疗靶点 | 首次整合单细胞转录组数据与孟德尔随机化和共定位分析，从免疫细胞特异性角度鉴定肥胖相关因果基因，并构建药物靶点优先级分级系统 | 依赖公开数据集，可能受样本异质性影响；因果推断需进一步实验验证 | 识别免疫细胞中与肥胖相关的潜在治疗靶基因 | 14种免疫细胞（重点关注CD4 naive/中央记忆T细胞）与肥胖相关表型（肥胖、体重指数、体脂率） | 机器学习 | 肥胖 | 孟德尔随机化分析、共定位分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据、单细胞转录组数据 | 基于eQTL数据和GWAS汇总统计，样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1313 | 2026-05-16 |
Ketone Ester Attenuates Thoracic Aortic Aneurysm and Dissection by Suppressing Ferroptosis
2026-May-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090829
PMID:42121931
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研究论文 | 本文研究了酮酯补充通过抑制铁死亡减轻胸主动脉瘤和夹层的作用机制 | 首次揭示酮酯通过调节GPX4和HO-1表达抑制血管平滑肌细胞铁死亡，为胸主动脉瘤和夹层提供潜在治疗策略 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证，缺乏临床试验数据支持 | 探究酮酯补充是否可通过抑制铁死亡来预防胸主动脉瘤和夹层 | C57BL/6小鼠和人类主动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型（具体数量未提及）及人主动脉平滑肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1314 | 2026-05-16 |
uPAR-Targeting Cytotoxic Antibody-Drug Conjugates Selectively Deplete Proinflammatory Myeloid Cells for Autoimmune Indications
2026-Apr-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090803
PMID:42121904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别类风湿关节炎滑膜中高表达uPAR的促炎性髓系细胞亚群，并开发靶向uPAR的抗体药物偶联物以清除这些细胞，为自身免疫疾病提供新疗法 | 首次利用单细胞RNA测序发现类风湿关节炎滑膜中uPAR高表达的促炎性髓系细胞亚群，并开发靶向uPAR的抗体药物偶联物选择性清除这些细胞 | 小鼠髓系细胞uPAR表达较低且对BCL-2家族抑制剂敏感性较弱，限制了体内概念验证实验的可靠性 | 开发靶向uPAR的抗体药物偶联物以选择性清除促炎性髓系细胞，用于自身免疫性疾病治疗 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的髓系细胞（单核细胞和巨噬细胞） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1315 | 2026-05-16 |
Glioblastoma Stem Cells as Targets for Emerging Precision Immunotherapies and Molecular Treatments
2026-Apr-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090783
PMID:42121884
|
综述 | 探讨胶质母细胞瘤干细胞作为新兴精准免疫疗法和分子治疗靶点的研究进展 | 整合类器官培养、单细胞与空间转录组学、多组学和高分辨率成像等技术，并结合数据科学，构建神经干细胞及恶性干细胞样状态分子图谱，揭示发育程序、细胞可塑性和微环境信号在胶质瘤发生中的作用 | 综述性质，未提及具体实验验证或临床应用数据，可能缺乏对不同技术整合的量化评估 | 阐述胶质母细胞瘤干细胞在精准免疫治疗和分子治疗中的靶向潜力，提供改进肿瘤建模、早期检测和个性化治疗的概念与技术框架 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 1316 | 2026-05-16 |
Unique nasal cell states induced by common pediatric respiratory viruses
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719671
PMID:42079074
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研究论文 | 通过单细胞 RNA 测序构建了 132 名五岁以下儿童的鼻粘膜细胞图谱，揭示了 SARS-CoV-2、鼻病毒和呼吸道合胞病毒（RSV）感染诱导的独特鼻细胞状态和粘膜免疫程序 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三种常见儿童呼吸道病毒对鼻粘膜的重塑作用，发现了 RSV 感染中一种先前未描述的鳞状样上皮亚型，并整合哮喘全基因组关联数据识别出与儿童哮喘风险相关的 hillock 样鳞状上皮亚群 | 未提及 | 解析儿童常见呼吸道病毒如何以细胞分辨率重塑鼻粘膜，并探究这些变化与疾病严重程度及哮喘风险的关联 | 五岁以下儿童鼻粘膜上皮细胞和免疫细胞，涵盖 SARS-CoV-2、鼻病毒、RSV 感染及未感染对照组 | 数字病理学 | 呼吸道病毒感染、儿童哮喘 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 132 名儿童，335174 个鼻粘膜上皮和免疫细胞 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞 3' 测序 |
| 1317 | 2026-05-16 |
Spatial Biology Evolution: Past, Present and Future of Mapping Life in Context
2026-Apr-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090743
PMID:42121845
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综述 | 本文回顾了空间生物学从19世纪组织化学起源到现代空间多组学技术的发展历程，并探讨了其在理解组织微环境、细胞通讯及疾病机制中的关键作用 | 系统整合了空间生物学从经典免疫组化到高通量空间多组学的技术演变，提出‘空间法医学’概念，并强调多重免疫荧光、空间转录组学和蛋白质组学之间的功能共生关系 | 未具体讨论不同空间生物学技术在实际应用中的比较优势或数据整合的具体计算挑战 | 探讨空间生物学技术的演进及其在揭示组织微环境结构和功能中的必要性，以推动疾病机制理解和药物开发 | 空间生物学技术、组织微环境、细胞通讯机制 | 计算病理学 | 癌症、常见病、罕见病 | 空间多组学、多重免疫荧光、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1318 | 2026-05-16 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis on Multi-Subtypes of Idiopathic Inflammatory Myopathy Reveals Pathologic Hallmarks Associated With Stromal Stem and Immune Cells in Damaged Skeletal Muscles
2026-Apr-20, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70185
PMID:42007840
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析揭示特发性炎症性肌病亚型中受损骨骼肌的病理特征与基质干细胞和免疫细胞的关系 | 首次在多个特发性炎症性肌病亚型中进行单细胞转录组分析，识别出MEF2C表达减少与肌纤维生成延迟相关，以及CXCL10+成纤维细胞通过CCL19-CCR7/CCRL2轴招募M1样巨噬细胞等新机制 | 每个亚型样本量较小（n=3-5），结果需在更大队列中验证 | 研究特发性炎症性肌病不同亚型的致病特征 | 健康对照者和四种特发性炎症性肌病亚型患者的受累骨骼肌和外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 特发性炎症性肌病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 健康对照5例，每种特发性炎症性肌病亚型3-5例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1319 | 2026-05-16 |
Single-cell transcriptomics and RNAi screening define a hierarchical program of planarian eye regeneration
2026-Apr-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117245
PMID:41964952
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和RNAi筛选定义了涡虫眼再生的层级程序 | 首次结合单细胞转录组学和大规模RNAi筛选，系统揭示了涡虫眼再生的完整层级序列及每个步骤的调控基因 | 信息不足，无法确定 | 阐明涡虫眼再生的分子机制和层级调控程序 | 涡虫眼再生过程中的细胞类型和基因 | 计算机视觉 | 年龄相关退行性眼病 | 单细胞RNA测序，RNA干扰筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 信息不足，无法确定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1320 | 2026-05-16 |
Heterogeneity and clinical relevance of group 2 innate lymphoid cells subsets in nasal polyps
2026-Apr-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
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研究论文 | 本研究探究鼻息肉中2型固有淋巴样细胞亚群的异质性及其与临床严重程度的相关性 | 首次鉴定出鼻息肉中ILC2的四个功能亚群（迁移性、过渡性、炎症性和耗竭样），并揭示其与CT评分及症状严重度的关联 | 未提及具体限制 | 明确鼻息肉中ILC2亚群的异质性及其与临床特征的关系 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织和外周血样本 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个鼻息肉样本和4个外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |