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当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-04-20 |
Advances in single-cell and spatial omics for studying symbiotic nitrogen fixation: comparative cellular and evolutionary perspectives
2026-Mar-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04024-y
PMID:41814406
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间组学技术在研究共生固氮中的应用进展，从细胞和进化角度进行比较分析 | 整合单细胞转录组、表观基因组及空间转录组数据，揭示共生固氮的保守与物种特异性调控网络，为工程化非豆科作物提供新视角 | NA | 探讨单细胞和空间组学技术如何推动共生固氮机制的研究，并比较不同物种间的细胞异质性和调控动态 | 豆科植物和非豆科植物的根瘤组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1302 | 2026-04-20 |
Vps35 p. D620N causes Lrrk2 kinase hyperactivity, chronic microglial activation and inflammation
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710482
PMID:41846978
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研究论文 | 本文研究了Vps35 p.D620N突变如何导致LRRK2激酶活性增强，引发慢性小胶质细胞激活和炎症，从而影响帕金森病的发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Vps35 p.D620N突变在小胶质细胞中引起的转录组变化，并阐明了其如何通过增强LRRK2激酶活性促进慢性炎症和突触重塑 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类帕金森病的复杂病理过程，且样本量有限 | 探究Vps35 p.D620N突变如何通过影响LRRK2激酶活性和小胶质细胞功能，促进帕金森病的神经退行性变 | 携带Vps35 p.D620N突变的敲入小鼠（VKI）的小胶质细胞 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量PCR | NA | RNA测序数据，图像数据，基因表达数据 | 6个月大的VKI小鼠脑部小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1303 | 2026-04-20 |
AKAP7 is a prognostic biomarker involved in immune infiltration of bladder urothelial carcinoma and correlated with ferroptosis
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04786-8
PMID:41806078
|
研究论文 | 本研究探讨了AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达水平、预后意义及其与免疫浸润和铁死亡的相关性 | 首次系统性地将AKAP7与膀胱尿路上皮癌的预后、免疫微环境特征及铁死亡过程联系起来，并验证了其作为生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床研究和实验验证来确认其机制 | 探索AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达模式、预后价值、免疫特征及其与铁死亡的关系 | 膀胱尿路上皮癌组织、细胞系及相关的公共数据库数据 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 基于TCGA、GEO等多个公共数据库的样本，并包含临床样本和细胞系验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1304 | 2026-04-18 |
Integrated multi-target pharmacology of ginseng in acute myeloid leukemia through single-cell sequencing, molecular docking, network pharmacology, and in vitro experiments
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04747-1
PMID:41806205
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1305 | 2026-04-20 |
Integrated multi-omics analysis identifies and validates endoplasmic reticulum stress and mitophagy-related biomarkers in MASLD
2026-Mar-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43311-3
PMID:41796234
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别并验证了内质网应激和线粒体自噬相关生物标志物在MASLD中的作用 | 首次整合GEO数据挖掘、机器学习、scRNA-seq分析和虚拟筛选，系统性地揭示了NR4A1作为内质网应激和线粒体自噬介导MASLD进展的关键靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，缺乏深入的体内功能机制研究和临床样本验证 | 阐明内质网应激和线粒体自噬在MASLD进展中的潜在机制，并识别针对这些通路的候选治疗药物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | GEO数据挖掘、scRNA-seq、分子对接、虚拟筛选 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及FFA处理的肝细胞、MASLD小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1306 | 2026-03-09 |
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43023-8
PMID:41794881
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1307 | 2026-04-20 |
ENS lineage potential is not intrinsically regionalized but is modulated by PTPRZ1 signaling
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709942
PMID:41846962
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能扰动，揭示了肠道神经系统（ENS）在发育过程中缺乏内在的区域化，而是通过微环境信号如PTPRZ1信号进行精细调控 | 发现ENS发育不依赖内在的前后轴区域化，而是由局部微环境信号（如PTN/MDK-PTPRZ1信号）调控，挑战了传统区域化模型 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎发育阶段（E13.5至E18.5），人类ENS发育的验证仅基于干细胞培养模型，可能未完全反映体内复杂性 | 探究肠道神经系统（ENS）在发育过程中是否经历区域化转录多样化，以及微环境信号如何调控其成熟 | 小鼠胚胎肠道组织（包括ENS、上皮和间充质）以及人多能干细胞衍生的ENS培养物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1308 | 2026-04-20 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag160
PMID:41996577
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scGPD的深度学习框架，用于利用单细胞RNA-seq数据为靶向空间转录组学设计紧凑、非冗余的基因组合 | 引入了基于深度学习的框架scGPD，通过基因-基因相关性感知的门控机制从数据中提取信息特征，鼓励所选基因的多样性并消除冗余，克服了现有方法忽视基因间相关性的局限 | 未在摘要中明确提及 | 为靶向空间转录组学技术设计信息丰富的基因组合，以捕获组织内细胞和空间异质性的复杂性 | 基因组合设计 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1309 | 2026-04-20 |
Airway injury induces alveolar epithelial responses mediated by macrophages
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116881
PMID:41579370
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨了气道损伤如何通过巨噬细胞介导远端肺泡上皮细胞的响应 | 揭示了气道特异性损伤可诱导远端肺泡II型细胞的短暂增殖，并明确了肺泡巨噬细胞在这一过程中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且未详细探讨长期影响 | 探究气道损伤对远端肺泡和免疫反应的调控机制 | 小鼠模型中的气道特异性上皮损伤 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1310 | 2026-04-20 |
Multiomics and multi-region spatial transcriptome analysis reveal cellular networks and pathways associated with HCC recurrence
2026-Feb-18, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101790
PMID:41950768
|
研究论文 | 本研究通过多组学和多区域空间转录组分析，揭示了与肝细胞癌复发相关的细胞网络和通路 | 识别出INTS6+内皮细胞在复发患者中富集并与肿瘤细胞空间共定位，发现ANGPTL4-SDC1配体-受体相互作用 | 样本量相对较小（空间转录组仅4名患者），需进一步验证 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境的复杂性及细胞间相互作用在疾病复发中的作用 | 肝细胞癌患者的手术切除肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、bulk RNA测序、免疫荧光、多重免疫组化 | NA | 空间转录组数据、bulk RNA测序数据、图像数据 | 空间转录组：4名患者的17个组织样本；bulk RNA测序：90名患者的329个区域 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1311 | 2026-04-20 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
|
研究论文 | 本研究构建了一个整合了转录组和染色质可及性数据的人类视网膜单细胞参考图谱 | 首次创建了整合多模态（转录组和染色质可及性）、多供体（125名不同祖先背景的供体）和多实验室数据的人类视网膜细胞综合图谱，识别了超过130种细胞类型，并分析了年龄、祖先和区域差异 | 未明确提及具体技术限制，但依赖于现有已发表和未发表数据的整合，可能存在批次效应或技术偏差 | 构建全面的人类视网膜细胞参考图谱，以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜组织 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 约390万个细胞，来自125名不同祖先背景的供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1312 | 2026-04-20 |
upsML: A high-accuracy machine learning classifier for predicting Plasmodium falciparum var gene upstream groups
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344557
PMID:41990100
|
研究论文 | 本文开发了一个名为upsML的高精度机器学习分类器，用于预测恶性疟原虫var基因的上游分组 | upsML基于2,530个经过筛选的var基因训练，能基于不同部分基因区域的序列特征准确分配上游分组，在DBLα标签序列上达到83%的准确率，在全长PfEMP1序列上达到92%的准确率，显著优于现有工具 | NA | 开发一个高精度的机器学习分类器，以改进恶性疟原虫var基因上游分组的预测，从而更好地理解寄生虫生物学和临床结果 | 恶性疟原虫的var基因家族，特别是其上游分组（upsA、upsB、upsC、upsE） | 机器学习 | 疟疾 | RNA-seq | 支持向量机、随机森林、XGBoost、HMMER | 序列数据 | 2,530个经过筛选的var基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1313 | 2026-04-20 |
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09420-x
PMID:41449269
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了肺毛细血管内皮细胞的五个新亚群及其在生理和病理中的功能意义 | 首次识别出五个具有不同分子特征和功能的肺毛细血管内皮细胞新亚群，包括表达Scn7a和Clic4离子转运蛋白的亚群、有丝分裂活跃的'根'细胞以及表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮细胞 | 研究主要基于单细胞转录组学数据，可能未完全捕捉细胞的空间分布和动态相互作用，且缺氧模型可能无法完全模拟所有肺疾病的病理条件 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能作用 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1314 | 2026-04-20 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中年龄相关的免疫动态变化 | 首次结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，纵向追踪96名成年人两年的季节性流感疫苗接种，揭示了T细胞亚群中非线性的转录重编程和功能偏向 | 研究样本主要来自健康成年人，可能未涵盖特定疾病群体或更广泛的人口多样性 | 探究年龄如何影响免疫系统的动态变化和功能 | 超过300名25至90岁的健康成年人，重点关注外周血单核细胞和免疫细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，其中96名进行纵向追踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1315 | 2026-04-20 |
RUNX1T1-HDAC Reprogramming of the HOX Code Signaling Drives a Targetable Pan-Cancer Lineage Plasticity
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681000
PMID:41280130
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研究论文 | 本研究通过分析多组学数据，发现RUNX1T1-HDAC复合物通过重编程HOX代码信号驱动泛癌谱系可塑性，并揭示了其作为可药物靶点的潜力 | 首次将RUNX1T1鉴定为泛癌谱系可塑性的新型生物标志物，揭示了RUNX1T1-HDAC复合物调控HOX代码的机制，并证明HDAC抑制可选择性靶向可塑性细胞 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，需要更多体内实验和临床试验进一步证实其治疗潜力 | 探索癌症谱系可塑性的分子机制并寻找可靶向的生物标志物 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病（AML）的癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌, 肺癌, 急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析, AI建模 | AI-based modeling | 转录组数据 | 超过80,000个RNA-seq样本，涵盖114种癌症类型，包括大量临床前和临床队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1316 | 2026-04-20 |
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
PMID:40950474
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法，阐明了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式及在新生儿大脑发育过程中的细胞谱系特异性表达 | 首次系统描绘了MAEL基因在人类大脑发育过程中的时空表达谱，并直接验证了其在人类脑积水组织中的表达下调，为理解该基因在疾病中的作用机制提供了进化与发育背景 | 研究主要基于观察性数据，MAEL表达下调与脑积水之间的直接因果关系仍需进一步的体外和体内功能实验验证 | 阐明MAEL基因的进化起源及其在人类大脑发育和脑积水中的表达模式 | MAEL基因、人类大脑组织（包括正常发育大脑和脑积水手术获取的皮质组织） | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、系统进化分析、基因表达定量 | NA | 基因序列数据、单细胞转录组数据 | 来自艾伦研究所发育中人类大脑图谱的49个脑区scRNA-seq数据，以及手术获取的原代脑积水皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1317 | 2026-04-20 |
Consensus nonnegative matrix factorization reveals metastatic gene expression program and identifies E74-like ETS transcription factor 3 confers to the lymph nodes metastasis in papillary thyroid cancer
2025-06, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-025-04205-y
PMID:40048012
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，通过共识非负矩阵分解揭示甲状腺乳头状癌中的基因表达程序，并识别ELF3在淋巴结转移中的关键作用 | 采用共识非负矩阵分解方法识别与淋巴结转移相关的EMT基因表达程序，并首次将ELF3确立为BRAF突变型PTC中驱动肿瘤侵袭和血管生成的核心基因 | 研究主要基于转录组数据，缺乏体内动物模型验证，且样本量可能有限，未涵盖所有PTC亚型 | 探究甲状腺乳头状癌的转录异质性，识别驱动淋巴结转移的基因表达程序和关键分子标记 | 甲状腺乳头状癌患者的恶性细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 共识非负矩阵分解, 机器学习框架 | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1318 | 2026-04-20 |
Immune checkpoint TIM-3 regulates microglia and Alzheimer's disease
2025-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08852-z
PMID:40205047
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点分子TIM-3在小胶质细胞中的功能及其在阿尔茨海默病中的作用 | 首次揭示了TIM-3通过增强TGFβ信号通路维持小胶质细胞稳态，并证明靶向小胶质细胞TIM-3可改善阿尔茨海默病模型小鼠的认知障碍和淀粉样蛋白病理 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明TIM-3在小胶质细胞中的具体功能及其在阿尔茨海默病病理过程中的作用 | 小鼠模型中的小胶质细胞，特别是5×FAD转基因阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单核RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1319 | 2026-04-20 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
|
研究论文 | 本研究通过整合433,369个人类下丘脑细胞的单核测序与空间转录组学数据，构建了首个全面的人类下丘脑空间-细胞转录图谱（HYPOMAP） | 首次创建了人类下丘脑的高分辨率空间-细胞转录图谱，揭示了人类与小鼠在特定神经元类型（如POMC神经元）和GPCR表达水平上的关键差异，并发现了与BMI相关的新基因（CORO1A） | 研究主要基于转录组数据，功能验证和神经环路层面的分析仍需进一步探索 | 构建人类下丘脑的细胞组成与空间分布图谱，为代谢、生殖和昼夜节律等疾病的治疗靶点发现提供资源 | 人类下丘脑组织 | 空间转录组学 | 代谢性疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | 433,369个下丘脑细胞 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1320 | 2026-04-20 |
Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease
2025-Mar, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeaf011
PMID:40201592
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏冲击波疗法通过激活TLR3受体，促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化，从而改善缺血性心肌病的心肌灌注和功能 | 首次揭示了冲击波疗法通过机械刺激激活TLR3信号通路，诱导染色质重塑和表观遗传可塑性，从而促进成纤维细胞向内皮细胞转分化的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和转基因小鼠模型，尚未在大型动物或临床患者中进行验证 | 探究冲击波疗法改善缺血性心肌病心脏功能的细胞和分子机制 | 人类心脏成纤维细胞、Fsp1-Cre/LacZ转基因小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |