单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40490 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-06-05 |
Neuroprotection following FLASH-RT may be mediated by sustained glutamate receptor AMPAR activation in CA3 neurons
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.725423
PMID:42239092
|
研究论文 | 通过空间转录组学揭示FLASH-RT对CA3神经元中AMPAR的持续激活介导的神经保护机制 | 首次发现FLASH辐照通过持续上调谷氨酸受体AMPAR表达，提供长期神经保护，并揭示早期钙离子内流与后续AMPAR持续表达的可能机制 | 未提及具体局限性 | 阐明FLASH-RT在正常大脑中长期神经保护作用的早期机制 | C57BL/6J小鼠海马CA3和DG区域神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | C57BL/6J小鼠经全脑照射，使用1或3个分次10 Gy，FLASH剂量率5.6×10^6 Gy/s或常规剂量率0.1 Gy/s | Nanostring | 空间转录组学 | Nanostring平台 | NA |
| 1302 | 2026-06-05 |
Integrated spatial transcriptomic and metabolic profiling identifies molecular networks associated with cognitive performance in the porcine prefrontal cortex
2026-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 整合空间转录组学与代谢组学分析猪前额叶皮层，揭示认知能力相关的分子网络 | 首次在大型脑回类动物中构建空间分辨多组学框架，将转录活动、代谢状态与神经化学信号联系起来，识别出与认知表现相关的新基因 | 研究主要聚焦于皮层III-V层，未涵盖其他皮层区域，且结果基于猪模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 阐明认知功能的分子结构基础，探索神经退行性疾病的通路 | 猪前额叶皮层（特别是III-V层）及分层小鼠模型 | 空间转录组学、代谢组学、数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学、代谢组学、免疫组织化学分析、Y迷宫行为测试 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据、组织图像 | 猪组织样本（具体数量未说明）及分层小鼠模型（用于Y迷宫行为测试） | NA | 空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 1303 | 2026-06-05 |
Workload-induced changes to cell state contribute to β-cell failure in diabetes
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.725004
PMID:42239070
|
研究论文 | 揭示工作量诱导的β细胞状态变化在2型糖尿病中导致β细胞衰竭的机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义工作量诱导的β细胞转录状态变化，识别出与失代偿β细胞应激状态不同的新型补偿状态，并发现Lsd1在约束β细胞状态转变中的关键作用 | 研究主要在动物模型中进行，结果在人类中尚需进一步验证 | 探讨β细胞在2型糖尿病自然病程中从功能正常到失代偿的进展机制 | β细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 糖尿病小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1304 | 2026-06-05 |
AKT3-Driven Epithelial-Mesenchymal Plasticity Governs Ovarian Metastasis in Colorectal Cancer via Tumor Microenvironment Remodeling
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1718
PMID:41662163
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组分析，揭示AKT3驱动的上皮-间充质可塑性通过肿瘤微环境重塑调控结直肠癌卵巢转移的机制 | 首次鉴定AKT3+上皮间充质转化样细胞作为结直肠癌卵巢转移起始细胞，并揭示其与癌相关成纤维细胞的互作形成前馈环路驱动转移 | 未提及 | 阐明结直肠癌卵巢转移的生物学机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌卵巢转移患者的肿瘤样本、异种移植模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 结直肠癌，卵巢转移 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，多重免疫荧光染色，异种移植模型，患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据，多重免疫荧光图像 | 35名患者的155,163个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 1305 | 2026-06-05 |
The modified Zuojin formula (SQQT) associates ILC2-linked JAK-2/STAT5/c-Myc cascade and gastric metaplasia regression
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121345
PMID:41663001
|
研究论文 | 改良左金方通过ILC2介导的JAK-2/STAT5/c-Myc通路促进胃化生消退的机制研究 | 首次揭示了改良左金方通过调控ILC2激活及JAK-2/STAT5/c-Myc通路这一新机制来治疗胃化生 | 未明确说明研究局限性，可能包括样本量有限或动物模型与临床转化的差异 | 研究改良左金方在免疫微环境中对胃化生治疗的机制 | 胃化生患者及他莫昔芬诱导的胃化生小鼠模型 | 数字病理学 | 胃化生 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胃化生患者样本和小鼠模型，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1306 | 2026-06-05 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104201
PMID:42196184
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性和与线粒体自噬相关的生物标志物 | 首次整合单细胞和批量转录组分析，揭示RACGAP1和KIF11在IPF巨噬细胞-线粒体自噬轴中的关键作用，为理解IPF发病机制中的巨噬细胞-线粒体自噬轴提供新框架 | NA | 阐明特发性肺纤维化、巨噬细胞和线粒体自噬之间的关联，以推进早期诊断和临床管理 | IPF患者的巨噬细胞亚群和相关生物标志物 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1307 | 2026-06-05 |
Accurate classification of ependymomas and medulloblastomas using Raman spectroscopy and pilot transcriptomic profiling
2026-May-05, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy
DOI:10.1016/j.saa.2026.127532
PMID:41653757
|
研究论文 | 利用拉曼光谱和后颅窝室管膜瘤与髓母细胞瘤的转录组谱分析实现准确分类 | 首次将拉曼光谱与空间转录组学结合，用于区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤，并在冷冻和FFPE标本中验证了分类模型的准确性 | 样本量较小（34份标本），患者级别的性能需在更大队列中验证，且为回顾性研究 | 评估拉曼光谱在区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤中的准确性，并探索相关生化差异的生物学背景 | 后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤的冷冻及FFPE组织标本 | 数字病理学 | 脑肿瘤（室管膜瘤和髓母细胞瘤） | 拉曼光谱，空间转录组学 | 主成分分析-支持向量机分类器 | 光谱数据，转录组数据 | 34份标本（21份冷冻，13份FFPE） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium In Situ v2 FFPE workflow | 10x Genomics Xenium In Situ v2 FFPE工作流程 |
| 1308 | 2026-06-05 |
Deciphering the glioblastoma microenvironmental landscape with multi-modal radiogenomics to guide prognosis and personalized therapy
2026-May-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08226-7
PMID:42087207
|
研究论文 | 通过多模态影像基因组学解析胶质母细胞瘤微环境特征，以指导预后和个性化治疗 | 首次结合MRI影像组学特征与单细胞转录组数据建立非侵入性框架，揭示胶质母细胞瘤的异质性和微环境结构，并利用计算药物筛选识别与特定影像组学特征相关的高风险表达模式的可逆靶向药物 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、影像组学特征的临床验证不足以及单细胞数据的整合方法依赖性 | 建立非侵入性框架以表征胶质母细胞瘤的异质性，桥接影像组学特征与肿瘤微环境结构，并识别个性化治疗的新型可药物靶点 | 胶质母细胞瘤患者的MRI影像数据、单细胞转录组数据以及药物敏感性数据 | 医学影像与计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | MRI影像组学、单细胞RNA测序 | 排名计算方法用于评估单细胞水平的基因集活性 | 图像（MRI）和基因表达数据（scRNA-seq） | 未明确数量，但包括了来自公共数据集的影像组学数据和单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1309 | 2026-06-05 |
spatiAlytica: Viewer-Grounded Multimodal Agentic System for Interactive Spatial Omics Analysis
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721735
PMID:42146494
|
研究论文 | 提出一个嵌入Napari查看器的多模态交互式智能系统spatiAlytica，使无编程背景的生物学家可通过自然语言进行迭代、假设驱动的空间组学分析 | 首个将查看器状态序列化、智能体记忆、生物概念至数据字段映射、代码生成与调试、空间视觉问答及有依据解释相结合的查看器中心化多模态交互系统 | 未提及具体局限性 | 为无编程背景的生物学家提供可通过自然语言进行空间组学分析的交互式工具 | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 卡波西肉瘤, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 多模态智能体系统 | 空间组学数据, 图像 | 222个单轮空间分析编码问题, 178个多轮序列工作流问题, 7350个图像基础推理问题 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1310 | 2026-06-05 |
PVAED: prior-guided variational autoencoders with diffusion denoising for interpretable single-cell representation learning
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag259
PMID:42202286
|
研究论文 | 提出了一种结合生物先验知识和扩散去噪的可解释单细胞表示学习框架PVAED | 将生物先验知识整合到变分自编码器中，并利用扩散去噪模块优化潜在嵌入，同时引入邻域保持损失项确保细胞局部相似性，提高了可解释性和聚类性能 | 未明确说明局限性，但可能依赖于先验知识的完整性和准确性 | 开发一种能够整合生物先验知识的可解释降维方法，用于单细胞RNA测序数据的表示学习 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体及其调控因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器（VAE）与扩散模型 | 基因表达数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1311 | 2026-06-05 |
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520744
PMID:41655216
|
综述 | 系统回顾空间蛋白质基因组学在肿瘤研究中的发展，从单模态分析到多模态整合，以及从传统机器学习到人工智能驱动分析框架的演进 | 系统性梳理了空间蛋白质基因组学从单模态到多模态整合的演进脉络，涵盖RNA-蛋白共定位、空间蛋白质组+代谢组联合分析、深度视觉蛋白质组学及多模态基础AI模型等前沿技术 | 面临分辨率、标准化和数据复杂性等挑战，同时需要量子计算、活体成像和类器官整合等前沿技术的进一步突破 | 总结空间蛋白质基因组学在肿瘤研究中的应用进展和未来方向 | 肿瘤微环境中的蛋白质、RNA、代谢物等多模态分子信息 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间蛋白质基因组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, MALDI成像, 质谱成像 | KRONOS, HEIST，多模态基础AI模型 | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 单细胞多组学 | 不适用 | 空间CITE-seq、NanoPOTS、PiMS等技术平台的具体配置信息未提供 |
| 1312 | 2026-06-05 |
PFKFB3 nuclear translocation improves diabetic retinopathy by attenuating endothelial cell senescence through inhibition of USP7-p53 axis
2026-May, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156553
PMID:41655956
|
研究论文 | 本文发现PFKFB3核转位通过抑制USP7-p53轴减少内皮细胞衰老，从而改善糖尿病视网膜病变 | 首次揭示PFKFB3核定位在抑制糖尿病内皮细胞衰老中的关键作用，并阐明其通过调控USP7-p53轴的分子机制 | 研究未涉及体内长期治疗效果评估及潜在副作用分析 | 探究PFKFB3核转位在糖尿病视网膜病变中调控内皮细胞衰老的分子机制 | 糖尿病视网膜病变小鼠模型及体外培养的人视网膜内皮细胞 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，免疫共沉淀，质谱分析，Western blotting，衰老相关β-半乳糖苷酶染色，免疫荧光，细胞周期流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本（未具体说明数量）及体外培养的内皮细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |
| 1313 | 2026-06-05 |
Sustainable Cultivation of Rare and Endangered Medicinal Plant Multicellular Spheroids Producing Bioactive Therapeutics for Alcohol-Related Liver Disease Therapy
2026-May, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504623
PMID:41668397
|
研究论文 | 利用稀有濒危药用植物多细胞球体可持续生产生物活性代谢物，用于酒精性肝病治疗 | 开发了基于多细胞球体的药用植物细胞培养策略，可持续高效生产生物活性代谢物，并结合单细胞转录组学、代谢组学和网络药理学揭示其治疗酒精性肝病的机制 | 未提及具体的局限性 | 建立稀有濒危药用植物生物活性代谢物的可持续生产方式，并评估其对酒精性肝病的治疗潜力 | 雪莲（Saussurea involucrata）多细胞球体及其衍生的次级代谢产物 | 机器学习 | 酒精性肝病 | 单细胞转录组学、超高效液相色谱-串联质谱、网络药理学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 体外细胞实验和小鼠模型实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1314 | 2026-06-05 |
Developmental neurotoxicity of thyroid hormone system-disrupting chemicals: a systems-level exploration using multi-omics approach
2026-May, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04303-4
PMID:41654649
|
研究论文 | 基于多组学方法系统探索甲状腺激素系统干扰化学物质对大脑发育的神经毒性机制 | 首次结合蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学多组学整合分析，揭示不同作用模式的甲状腺激素干扰物在大脑中引起趋同的分子扰动，并展示多组学在预测性风险评估中的高灵敏度和潜力 | 主要关注大鼠模型，未在人体中验证；PCN暴露组的毒性效应不明显，可能限制对实际健康风险的推断 | 阐明甲状腺激素系统干扰化学物质如何通过干扰特定分子靶标影响母体甲状腺激素稳态和后代大脑发育 | 妊娠大鼠及其子代，涉及甲状腺、肝脏和脑等靶器官 | 机器学习和多组学整合分析 | 神经发育毒性 | 蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学 | NA | 蛋白质组、代谢组、空间转录组数据 | 暴露于PTU和PCN的妊娠大鼠及其子代，具体样本数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1315 | 2026-06-05 |
Multi-omic characterization of nasopharyngeal carcinoma delineates the subtype-specific landscape of response to induction chemotherapy
2026-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-026-01149-8
PMID:41986499
|
研究论文 | 通过多组学分析，描绘鼻咽癌对诱导化疗反应亚型特异性景观 | 首次整合蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、基因组学和转录组学，在240名患者中鉴定出三个对诱导化疗具有不同治疗反应的蛋白质组亚型，并验证了IgA浆细胞浸润作为GP-IC耐药和抗PD-1治疗获益的预测标志 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究鼻咽癌对吉西他滨和顺铂诱导化疗的预测标志物及亚型特异性反应景观 | 240名接受GP-IC或CCRT治疗的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 磷酸化蛋白质组数据, 基因组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间数据 | 240名患者（三个阶段临床试验和空间分析验证） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1316 | 2026-06-05 |
Tetrameric STAT5 regulates the formation of immune niche cells to protect stem cell regenerative repair against mucosal inflammation
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01716-0
PMID:42062572
|
research paper | 研究四聚体STAT5如何通过调控免疫微环境细胞保护肠道干细胞在黏膜炎症中的再生修复 | 首次揭示了四聚体STAT5抑制隐窝T细胞生态位形成的作用机制，并发现干扰STAT5四聚体可促进TCRγδ细胞扩增，从而增强肠道干细胞再生修复 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，尚需在人体中进一步验证；STAT5四聚体对T细胞迁移的具体分子机制仍需深入探索 | 探究四聚体STAT5在肠道炎症中调控干细胞再生修复的机制 | 肠道干细胞、隐窝T细胞、TCRγδ细胞 | machine learning | inflammatory bowel disease | scRNA-seq, ChIP-seq | NA | single-cell RNA-seq data | 人类IBD样本、STAT5超活性和四聚体缺陷小鼠、类器官 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 1317 | 2026-06-05 |
Interpretable MRI-based Multiparametric Radiomics for Preoperative Prediction of CMS4 Colorectal Cancer
2026-May, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.251719
PMID:42153825
|
研究论文 | 基于MRI的放射组学机器学习模型用于术前预测结直肠癌CMS4亚型，并探索其生物学可解释性 | 首次将放射组学特征与转录组分析结合，开发了可解释的MRI多参数放射组学模型（MRC4s）用于预测结直肠癌CMS4亚型，性能优于深度学习方法，并揭示了与TGF-β和上皮-间质转化通路的关联 | 样本量有限（253例），为回顾性研究，模型在不同数据集上的泛化性需进一步验证 | 评估基于放射组学的机器学习方法能否预测结直肠癌CMS4状态，并探索放射组学特征的生物学相关性和可解释性 | 结直肠癌患者，共253例（中位年龄63岁，163名男性） | 机器学习 | 结直肠癌 | MRI成像 | 机器学习放射组学模型（MRC4s）及深度学习模型（ResNet50、VGG16、DenseNet201） | 图像数据（MRI）和转录组数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 253例结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1318 | 2026-06-05 |
Spatial and multi-omics transcriptomic dissects platinum resistance in lung adenocarcinoma: a five-gene predictive model with tumor microenvironment dynamics
2026-Apr-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111952
PMID:41662930
|
研究论文 | 通过空间和多组学转录组分析揭示肺腺癌铂类耐药机制，构建五基因预测模型并探索肿瘤微环境动态 | 首次结合空间转录组学与多组学分析，识别出Cluster1亚型和恶性上皮PH细胞为铂类耐药的关键决定因素，并构建了临床级诊断精度的五基因预测模型 | 未提及明显局限性 | 识别肺腺癌铂类耐药相关的分子亚型并构建稳健的预测模型 | 肺腺癌患者公共数据集、A549/DDP细胞系和裸鼠模型 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 肺腺癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 共识聚类 | 监督主成分分析, 机器学习, 卷积神经网络, 长短期记忆网络, 生成对抗网络 | 图像, 文本 | 未明确提及样本数量 | Illumina | 空间转录组学, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 未提供具体平台配置详情 |
| 1319 | 2026-06-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics in Phragmites australis reveal the association of B chromosomes with plant invasiveness
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04079-x
PMID:42021342
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和比较基因组学，构建了芦苇的单细胞图谱，揭示了B染色体与植物入侵性的关联 | 首次在非模式入侵植物中构建细胞类型解析的分子图谱，并发现B染色体上差异表达基因与入侵性的关联 | 研究仅分析了来自欧洲和北美洲的种群，样本范围有限；B染色体功能验证仍需进一步实验 | 阐明入侵植物芦苇的分子和基因组机制，特别是B染色体在入侵过程中的作用 | 芦苇（Phragmites australis）的欧洲原生种群和北美入侵种群 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，比较基因组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，基因组数据 | 多个欧洲原生和北美入侵种群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 1320 | 2026-06-05 |
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04083-1
PMID:42021407
|
研究论文 | 测试九种机器学习方法用于预测单细胞蛋白表达，发现基于机器学习的预测优于单独使用mRNA的推断 | 全面比较多种机器学习方法在单细胞蛋白表达预测上的效果，发现全转录组预测可成功预测mRNA缺失的蛋白 | 模型泛化性有限，需要高度相似的训练数据，限制了当前应用范围 | 评估机器学习方法从单细胞RNA-seq数据推断蛋白表达的准确性及适用性 | 单细胞蛋白表达预测的机器学习模型及其在不同数据集上的表现 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | 机器学习 | 单细胞基因表达数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |