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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1301 2025-12-15
Bioinformatics frameworks for single-cell long-read sequencing: unlocking isoform-level resolution
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文综述了单细胞长读长测序技术及其生物信息学框架在解锁异构体水平分辨率方面的应用 探讨了单细胞长读长测序技术如何结合单细胞分辨率与第三代测序技术,以解决传统短读长测序在重构全长转录本异构体方面的限制 NA 探索单细胞长读长测序技术在理解异构体调控和异常剪接在人类疾病中的作用,并揭示其诊断和治疗潜力 单细胞长读长测序数据及其生物信息学分析工具 生物信息学 癌症 单细胞长读长RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 长读长RNA-seq NA NA
1302 2025-12-15
A Multi-omics Exploration Revealing SLIT2 as a Prime Therapeutic Target for Peripheral Facial Paralysis: Integrating Single-Cell Transcriptomics and Plasma Proteome Data
2025-Oct-16, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化分析和单细胞转录组测序,探索了外周性面瘫的潜在治疗靶点,并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,系统地从宏观遗传关联到微观细胞功能研究外周性面瘫,并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 研究主要基于动物模型,且动物与人类在面运动核方面存在显著差异 识别外周性面瘫的治疗靶点并理解其分子和细胞机制 外周性面瘫患者(通过公开血浆蛋白数据)及SD大鼠面神经损伤模型 单细胞组学 神经系统疾病(外周性面瘫) 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析 NA 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 1925个公开可用的血浆蛋白顺式遗传力工具;SD大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1303 2025-12-15
Single-cell multiomics identifies Tcf1 and Lef1 as key initiators of early thymic progenitor fate
2025-Sep-12, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学技术揭示了Tcf1和Lef1作为早期胸腺祖细胞命运的关键启动因子 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序解析小鼠早期胸腺祖细胞的异质性,并发现Tcf1和Lef1在Notch通路上游调控ETP形成 研究主要基于小鼠模型,人类ETP形成机制可能有所不同 探究调控早期胸腺祖细胞形成的分子机制 小鼠早期胸腺祖细胞 单细胞多组学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1304 2025-12-15
Regulatory KIR+CD8+ T cells are elevated during human pregnancy
2025-Aug-06, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了表达抑制性杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)的CD8+ T细胞在人类妊娠期间的作用及其与母胎耐受性的关系 首次发现KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间频率升高,特别是在怀有男性胎儿的孕妇中,并揭示了该细胞亚群通过抑制针对胎儿特异性抗原的母体T细胞反应来促进母胎耐受的新机制 研究主要基于外周血和早期妊娠蜕膜组织样本,缺乏对妊娠全过程及更多妊娠并发症的系统性分析 探究KIR+CD8+ T细胞在人类妊娠免疫调节中的作用及其与妊娠结局的关联 孕妇外周血、脐带血细胞及早期妊娠蜕膜组织中的CD8+ T细胞 免疫学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序、体外细胞共培养实验、纵向分析 NA 基因表达数据、细胞频率数据 妊娠期女性外周血样本、早期妊娠蜕膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1305 2025-12-15
Antlers on does: An unexpected role of macrophages in deer biology
2025-Jun-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调控巨噬细胞来调节鹿角生长的分子机制 首次发现巨噬细胞在鹿角生成中的关键作用,并证明雄激素通过上调AP细胞中的CCL2表达来招募巨噬细胞 雄激素调控巨噬细胞的具体信号通路尚未完全阐明 探索雄激素调控鹿角再生的分子机制 梅花鹿(雄性及雌性)及裸鼠移植模型 发育生物学 NA bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据, 组织学图像 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1306 2025-12-15
Integrated Metabolomics and Spatial Transcriptomics of Cystic Pancreatic Cancer Precursors Reveals Dysregulated Polyamine Metabolism as a Biomarker of Progression
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过整合代谢组学和空间转录组学分析囊性胰腺癌前病变,揭示了多胺代谢失调作为疾病进展的生物标志物 首次在胰腺癌前病变中结合囊液代谢组学与组织空间转录组学,识别出多胺代谢通路作为恶性风险的关键生物标志物 样本量相对有限(125例),且为回顾性研究,需要前瞻性验证 识别胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)恶性风险相关的代谢标志物 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)患者囊液及组织样本 数字病理学 胰腺癌 非靶向代谢组学,空间转录组学,单细胞转录组学 NA 代谢组数据,转录组数据 125例患者囊液样本 NA 空间转录组学,单细胞转录组学 NA NA
1307 2025-12-15
Azacitidine, Venetoclax, and Magrolimab in Newly Diagnosed and Relapsed Refractory Acute Myeloid Leukemia: Phase Ib/II Study and Correlative Analysis
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究评估了阿扎胞苷、维奈托克和magrolimab三联疗法在新诊断和复发难治性急性髓系白血病患者中的安全性和疗效 首次在临床研究中评估针对CD47的macrophage检查点抑制剂magrolimab与阿扎胞苷-维奈托克联合使用的三联疗法,并进行了单细胞RNA测序的相关分析 研究为Ib/II期试验,样本量相对较小,且未与标准疗法进行直接比较,生存结果未显示出显著优势 评估三联疗法在急性髓系白血病患者中的安全性和疗效,并探索生物标志物 成人急性髓系白血病患者,包括一线治疗(不适合强化化疗)和复发/难治性患者 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA NA 一线队列54名患者,复发/难治队列52名患者,单细胞RNA测序分析11名TP53突变患者的27个纵向样本 NA NA NA NA
1308 2025-12-15
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本文探讨了O-GlcNAcylation稳定的WTAP通过N6-甲基腺苷依赖方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化增强稳定性,调控LOXL2的m6A修饰,进而影响胶质母细胞瘤干细胞间充质转化和免疫微环境形成的新机制 NA 研究m6A在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 间充质胶质母细胞瘤干细胞和髓源性巨噬细胞 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱分析、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq NA NA
1309 2025-12-15
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性 scRegulate通过变分推理整合基因调控网络先验知识,提供了一种可扩展且生物学可解释的解决方案,能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用 NA 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性的计算方法 转录因子活性和基因调控网络 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 生成式深度学习框架,变分推理 单细胞RNA测序数据 多个公共实验和合成数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1310 2025-12-15
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了乳腺浸润性小叶癌(ILC)中MDC1蛋白作为ER共调节因子的新功能及其与DNA修复功能障碍和PARP抑制剂敏感性的关联 发现MDC1在ILC细胞中作为ER共调节因子驱动独特ER活性,同时导致同源重组修复功能障碍,这种功能障碍不同于经典的“BRCAness”状态,但表现出对PARP抑制剂的敏感性 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限,且MDC1介导的DNA修复功能障碍的具体分子机制尚未完全阐明 探究ILC中MDC1的双重功能(ER共调节和DNA修复)及其对PARP抑制剂治疗的意义 乳腺浸润性小叶癌(ILC)细胞系、ILC异种移植模型 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 多个ILC细胞系和异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1311 2025-12-15
Exploratory spatial transcriptomic profiling of peritumoral Th2 immune polarization in HPV-positive oropharyngeal cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过空间转录组学分析,探索了HPV阳性口咽癌中肿瘤周围Th2免疫极化与淋巴转移的关系 首次在HPV阳性口咽癌中应用空间转录组学技术,揭示了肿瘤周围淋巴滤泡区域中Th2偏向性免疫与抑制淋巴转移的潜在关联 样本量较小(6例患者),属于探索性研究,需要更大规模的验证 阐明HPV阳性口咽癌早期淋巴转移高发但预后良好的矛盾现象背后的免疫机制 来自6名腭扁桃体来源口咽鳞状细胞癌患者的福尔马林固定石蜡包埋组织样本 空间转录组学 口咽癌 空间转录组学分析 NA 空间转录组数据 6例患者 NA 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler NA
1312 2025-12-15
Epigenetic control of antigen presentation failure in osteosarcoma: from single-cell chromatin maps to therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了骨肉瘤中抗原呈递失败的染色质调控机制,并探讨了基于单细胞染色质图谱的治疗策略 整合单细胞ATAC-seq与单细胞及空间转录组学,揭示HLA/NLRC5/干扰素轴的可逆性表观遗传抑制机制 临床疗效仍需验证,需考虑克隆选择、干扰素信号保留及联合治疗方案的优化 阐明骨肉瘤抗原呈递失败的表观遗传机制并开发治疗策略 骨肉瘤肿瘤-免疫生态系统中的恶性克隆、分化状态及免疫细胞微环境 数字病理学 骨肉瘤 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 染色质可及性数据, 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
1313 2025-12-15
Inflammation-driven mechanisms in endometrial cancer: pathways from inflammatory microenvironment remodeling to immune escape
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了炎症微环境在子宫内膜癌进展中的作用,重点阐述了其促进免疫逃逸和治疗抵抗的机制,并探讨了潜在的干预策略 系统性地阐述了子宫内膜癌中炎症微环境重塑到免疫逃逸的完整通路,并强调了单细胞分析和空间转录组学等新技术在揭示可操作分子模式和开发个体化策略方面的潜力 文中提到的肿瘤内异质性、动态变化的免疫环境以及缺乏可靠的生物标志物等仍是重大挑战 阐明炎症微环境在子宫内膜癌免疫逃逸和治疗抵抗中的作用机制,并探索新的治疗干预靶点 子宫内膜癌 数字病理学 子宫内膜癌 单细胞分析,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1314 2025-12-15
Single-cell transcriptomics identifies FOSL1-regulated IGFBP3+ melanoma subtype as a neuro-immunoregulatory signaling hub facilitating tumor progression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,识别出FOSL1调控的IGFBP3+黑色素瘤亚型,该亚型作为神经免疫调节信号枢纽促进肿瘤进展 首次将IGFBP3+黑色素瘤亚型与FOSL1转录因子关联,并揭示其作为神经免疫相互作用枢纽在肿瘤微环境中的关键作用 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据,实验验证仅限于体外细胞系模型,缺乏体内动物模型验证 揭示黑色素瘤的细胞异质性,识别分子靶点和促肿瘤亚型 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境中的其他细胞类型 单细胞转录组学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 Seurat, Harmony, PySCENIC, CellChat 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的黑色素瘤单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1315 2025-12-15
Macrophage migration inhibitory factor-CD74 axis drives vascular smooth muscle cell-induced M1 macrophage polarization to exacerbate intracranial aneurysm inflammation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了颅内动脉瘤中分泌型血管平滑肌细胞通过MIF-CD74轴驱动巨噬细胞M1极化,加剧炎症的新机制 首次提供了颅内动脉瘤的单细胞图谱,并发现sVSMC来源的MIF-CD74轴是驱动巨噬细胞M1极化和动脉瘤炎症的新机制 研究主要基于转录组和体外实验,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 阐明巨噬细胞迁移抑制因子在颅内动脉瘤炎症中的作用机制 颅内动脉瘤组织、正常动脉组织、分泌型血管平滑肌细胞、巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、甲基化测序、转录组分析、体外功能实验 NA RNA测序数据、甲基化数据、单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,涉及IA和正常动脉组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1316 2025-12-15
Succinylation heterogeneity in lung adenocarcinoma: from prognostic model to KLK6-driven tumor microenvironment remodeling
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究描绘了肺腺癌中琥珀酰化的全景图,构建了一个基于琥珀酰化的新型预后模型,并发现KLK6是肿瘤进展和免疫抑制的潜在驱动因子 首次在肺腺癌中系统描绘了蛋白质琥珀酰化的全景图及其临床意义,构建了基于7个基因的琥珀酰化预后特征,并利用单细胞和空间转录组学揭示了KLK6通过重塑肿瘤微环境促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,部分机制结论(如KLK6驱动成纤维细胞分化)仍需更多体内实验验证,临床转化潜力有待前瞻性研究评估 探索肺腺癌中蛋白质琥珀酰化的全景图、临床预后价值及其对肿瘤微环境的影响,并寻找潜在治疗靶点 肺腺癌患者(来自TCGA和GEO数据库的多个队列)、肺腺癌细胞系 生物信息学与计算生物学 肺癌 多组学整合分析、差异表达分析、Cox回归、PCA、LASSO、单细胞RNA测序、空间转录组学、hdWGCNA、体外细胞实验 预后风险模型(基于LASSO和Cox回归) 基因组、转录组、临床数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 TCGA队列及7个独立的GEO验证队列(具体样本数未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1317 2025-12-15
RNA interference shapes stress responses in Arabidopsis thaliana
2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 本文综述了RNA干扰在拟南芥应激响应中的调控机制,整合了系统性信号传递、应激响应RNAi机制及AGO蛋白多样性的最新进展 将系统性sRNA信号传递、应激响应RNAi机制和AGO蛋白多样性整合为一个连贯框架,用于理解RNAi驱动的应激适应 NA 理解RNA干扰在植物应激响应中的调控作用与机制 拟南芥中的小RNA(包括miRNA和siRNA)及ARGONAUTE蛋白 自然语言处理 NA 高分辨率sRNA测序、单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
1318 2025-12-15
Single-cell transcriptome analysis reveals elongation and ossification characteristics of antlers
2025, Frontiers in veterinary science IF:2.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织,揭示了鹿角快速伸长和骨化的细胞分化轨迹 首次在单细胞分辨率下解析了鹿角尖端间充质和软骨组织的分化轨迹,并鉴定出一种具有多种细胞特征的新型过渡细胞 研究仅基于一只5岁健康雄性梅花鹿的样本,样本量较小,且未涉及不同发育阶段或不同个体的比较 阐明鹿角快速伸长和骨化过程中的细胞分化机制 梅花鹿鹿角尖端的间充质和软骨组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 一只5岁健康雄性梅花鹿的鹿角尖端组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1319 2025-12-14
Fibroblast diversity within human gut-associated lymphoid tissues
2026-Mar-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,绘制了人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性图谱 首次识别CD24作为区分GALT成纤维细胞的标记物,并揭示了不同GALT亚型中成纤维细胞的功能差异 研究主要基于观察性数据,功能验证实验相对有限 探索人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性和功能 人类肠道相关淋巴组织(包括Peyer斑块、黏膜孤立淋巴滤泡和黏膜下孤立淋巴滤泡)中的成纤维细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞RNA测序,流式细胞术,共聚焦激光显微镜 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,显微镜图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1320 2025-12-14
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-Feb, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和单核RNA测序技术,识别了小鼠视网膜发育过程中独特的髓系细胞群体,并验证了它们在神经纤维层和血管生成前沿的解剖位置 首次在视网膜中识别并验证了发育特异性髓系细胞群体,包括Spp1和Hmox1标记的两种小胶质细胞亚群,揭示了NRF2转录因子在调控这些状态转换中的作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证,且功能机制探究有限 探究小胶质细胞在视网膜发育过程中的具体作用和分子特征 发育中的小鼠视网膜髓系细胞群体,特别是小胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA RNA序列数据 多个发育时间点的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
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