单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 13161 - 13180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13161 | 2024-08-07 |
The role of positional information in determining dermal fibroblast diversity
2024-Apr, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2024.02.009
PMID:38423396
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综述 | 本文综述了位置信息在决定皮肤成纤维细胞多样性中的作用及其对皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症的影响 | 探讨了成纤维细胞多样性对皮肤功能和疾病发展的影响，为抗纤维化治疗和个性化医疗提供新思路 | NA | 理解成纤维细胞多样性如何影响皮肤稳态、伤口愈合、纤维化和癌症 | 皮肤成纤维细胞及其在皮肤功能和疾病中的作用 | NA | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 13162 | 2024-08-04 |
scNovel: a scalable deep learning-based network for novel rare cell discovery in single-cell transcriptomics
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae112
PMID:38555470
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为scNovel的深度学习网络，专注于单细胞转录组中稀有新细胞的发现 | scNovel通过深度学习方法，在发现稀有的新细胞类型方面显著优于现有模型，且在多个数据集上表现出色 | 目前工具主要集中于一般细胞类型注释，对于发现新稀有细胞类型的挑战尚未得到充分解决 | 研究旨在推动稀有新细胞类型的发现，以促进生物医学领域的研究 | 研究对象为单细胞转录组数据中的稀有新细胞类型 | 数字病理学 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | 深度学习神经网络 | 数据集 | 包含百万规模的数据集 |
| 13163 | 2024-08-04 |
PANoptosis, an indicator of COVID-19 severity and outcomes
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae124
PMID:38555477
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis在COVID-19严重性和预后的指示作用 | 揭示了PANoptosis在COVID-19中的潜在作用及其调节免疫反应的机制 | 需要进一步的研究来澄清PANoptosis如何调节COVID-19中的免疫反应和预后 | 探讨PANoptosis作为COVID-19严重性的指标 | 针对COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单核细胞的生物信息学分析 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)和整体RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了在线数据集的多个样本进行分析 |
| 13164 | 2024-08-04 |
Dysregulation of cell state dynamics during early stages of serous endometrial carcinogenesis
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585274
PMID:38562813
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研究论文 | 本文提供了关于小鼠模型中正常、前发病和发病子宫内膜细胞类型及其状态的综合调查。 | 鉴定出44个基因作为早期诊断和预后标志物，并强调了腔上皮在SEC发病机制中的重要角色。 | 主要基于小鼠模型，可能与人类SEC的病理生理有所不同。 | 研究SEC早期阶段细胞状态动态和分子机制。 | 正常、前发病和发病子宫内膜的细胞类型及其状态。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 44个基因 panel，涉及正常和病变子宫内膜样本 |
| 13165 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis
2024-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13912
PMID:38088448
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研究论文 | 本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境 | 该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用 | 该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制 | 解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异 | 周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者，以及健康供体的高通量样本 |
| 13166 | 2024-08-07 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.04.574196
PMID:38260616
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研究论文 | 本文描述了通过多种测序技术识别出一种由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群，该亚群在重新刺激后表现出加剧的促炎反应 | 首次揭示了星形胶质细胞记忆由代谢酶ATP柠檬酸裂解酶（ACLY）和组蛋白乙酰转移酶p300共同调控，这一发现为神经系统疾病的治疗提供了新的靶点 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统病理中的作用及其调控机制 | 星形胶质细胞及其在多发性硬化症（MS）和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、核酸检测和测序的细胞特异性聚焦（FIND-seq）、CRISPR/Cas9基因扰动研究 | NA | 细胞 | 急性和慢性EAE模型中的星形胶质细胞，慢性MS病变中的人类星形胶质细胞 |
| 13167 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing provides insight into multiple chemotherapy resistance in a patient with refractory DLBCL: a case report
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1303310
PMID:38533514
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病例报告 | 本研究利用单细胞转录组测序和常规批量下一代测序（NGS）分析了一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的肿瘤全景 | 结合NGS和单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤微环境中的异质性和免疫抑制特性，为治疗难治性DLBCL提供了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 阐明DLBCL进展的机制并开发新的治疗方法 | 一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者 | 数字病理学 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, NGS | NA | 转录组 | 单一患者样本 |
| 13168 | 2024-08-04 |
Friend or foe? The elusive role of hepatic stellate cells in liver cancer
2023-10, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-023-00821-z
PMID:37550577
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综述 | 本文讨论了肝星形细胞在肝癌中的双重角色 | 揭示了肝星形细胞亚群在肝纤维化和肝癌发展中的不同作用 | NA | 探讨肝星形细胞在肝纤维化及肝癌进展中的作用 | 肝星形细胞及其在肝癌中的不同亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 13169 | 2024-08-07 |
Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2023-10, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01424-2
PMID:37697111
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研究论文 | 本研究利用单细胞/单核RNA测序技术分析了超过298,000个细胞和细胞核，以优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 通过计算方法识别了参与胶质细胞命运指定的候选基因，并利用转录组数据优化了小鼠星形胶质细胞分化协议，缩短了协议长度和复杂性 | NA | 优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞中的星形胶质细胞和少突胶质细胞的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序（scRNA-seq/snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过298,000个细胞和细胞核 |
| 13170 | 2024-08-04 |
CD168+ macrophages promote hepatocellular carcinoma tumor stemness and progression through TOP2A/β-catenin/YAP1 axis
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106862
PMID:37275516
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研究论文 | 本研究探讨了肝癌干样细胞的起源及TOP2A/β-catenin/YAP1轴在肝细胞癌干性和进展中的作用 | 首次揭示了M2样巨噬细胞对肝癌干样细胞的调控及TOP2A/β-catenin/YAP1轴在肝细胞癌干性中的关键作用 | 研究未全面评估其他免疫细胞在肝细胞癌干样细胞中的作用 | 探究肝癌干样细胞的起源及其在肝细胞癌进展中的机制 | 肝细胞癌干样细胞及其微环境中的M2样巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 13171 | 2024-08-04 |
Allograft tissue under the microscope: only the beginning
2023-04-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000001052
PMID:36787238
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review | 回顾了肾移植活检的新方法，以补充当前的Banff分类方案 | 引入了人工智能、机器学习和数字病理学等新方法来改进移植组织的检查 | 活检的内在抽样误差和没有自动形态测量分析限制了其在移植健康预后中的表现 | 探索可以改进肾移植组织活检分析的新方法 | 肾移植活检样本和相关组织研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | AI和ML算法 | 组织样本 | NA |
| 13172 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic heterogeneity between conduit and resistance mesenteric arteries in rats
2023-04-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 该文章探讨了大鼠导管和阻力肠系膜动脉中内皮细胞的单细胞转录组异质性 | 通过单细胞RNA测序，揭示了不同动脉节段的内皮和血管平滑肌细胞在表型上的差异 | 仅基于9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠进行研究，可能限制了结果的外推性 | 研究内皮细胞和血管平滑肌细胞在不同动脉之间的表型异质性 | 成年雄性斯普拉格-道利大鼠的不同径向动脉 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠，分为6个样本 |
| 13173 | 2024-08-04 |
MicroRNA-155 Plays Selective Cell-Intrinsic Roles in Brain-Infiltrating Immune Cell Populations during Neuroinflammation
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200478
PMID:36883849
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研究论文 | 本研究探讨了miR-155在神经炎症中浸润的免疫细胞群体中的细胞内作用 | 本研究首次确认了miR-155在不同免疫细胞中的特异性作用，展示了通过条件性KO方法对其功能的重要见解 | 研究未能确定miR-155在浸润的巨噬细胞中的作用 | 研究miR-155在多发性硬化症模型中不同免疫细胞群体的重要性 | 主要研究对象为小鼠模型中的T细胞、巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除（KO）模型 | RNA序列数据 | 多个小鼠样本，包括全球miR-155 KO小鼠和野生型对照小鼠 |
| 13174 | 2024-08-04 |
NOX1 is essential for TNFα-induced intestinal epithelial ROS secretion and inhibits M cell signatures
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326305
PMID:36191961
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研究论文 | 本文探讨了NOX1缺失如何影响肠道上皮ROS分泌及M细胞特征 | 揭示了NOX1缺失对M细胞诱导的影响及其在UC炎症中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不能完全反映人类疾病的复杂性 | 探讨NOX1在炎症性肠病（IBD）中的角色和机制 | 以NOX1基因型和TNFα刺激分层的肠道类器官为研究对象 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组分析，免疫组化 | 小鼠 | 基因表达数据 | 使用了多个人来源的肠道类器官和小鼠模型 |
| 13175 | 2024-08-04 |
Osteoimmunology in Periodontitis and Orthodontic Tooth Movement
2023-04, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00774-x
PMID:36862360
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review | 综述免疫细胞在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用及其与其他细胞的相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序揭示不同细胞类型在对抗细菌挑战中的作用 | 未能详细探讨系统性疾病对免疫反应的影响 | 研究免疫细胞与牙周组织中细胞的相互作用在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用 | 牙周炎和正畸牙齿移动中细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 13176 | 2024-08-07 |
Chronic jetlag accelerates pancreatic neoplasia in conditional Kras-mutant mice
2023-04, Chronobiology international
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/07420528.2023.2186122
PMID:36912021
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研究论文 | 研究探讨了慢性时差对携带胰腺特异性激活突变的小鼠胰腺癌发生的影响 | 首次揭示了非细胞自主性时钟功能障碍在加速胰腺癌前病变发展中的作用，并通过单细胞RNA测序识别了与时钟依赖性变化最相关的细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究时钟错位与胰腺癌之间的关联及其机制 | 携带胰腺特异性激活突变的小鼠 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13177 | 2024-08-07 |
Preneoplastic stromal cells promote BRCA1-mediated breast tumorigenesis
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01298-x
PMID:36914836
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研究论文 | 本文研究了BRCA1突变携带者中，癌前基质细胞如何促进乳腺肿瘤的发生 | 首次揭示了癌前基质微环境在BRCA1驱动的肿瘤发生中的作用，特别是通过促进上皮细胞增殖和改变腔前体细胞的分化 | NA | 探讨BRCA1突变携带者中癌前基质细胞对乳腺肿瘤发生的影响 | BRCA1突变携带者的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌前BRCA1和非携带者的乳腺组织 |
| 13178 | 2024-08-04 |
Identifying the programmed cell death index of hepatocellular carcinoma for prognosis and therapy response improvement by machine learning: a bioinformatics analysis and experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298290
PMID:38170006
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关联，并构建了用于预后和治疗反应预测的程序性死亡指数。 | 提出了一种基于机器学习的整合框架来构建程序性死亡指数（PCDI），超越了以往的预后模型。 | 研究可能存在数据来源的局限性，未提供样本具体数量的信息。 | 阐明程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关系，以改善临床管理及个体化治疗。 | 肝细胞癌患者，关注程序性死亡相关基因及其临床特征。 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞测序，蛋白质组学 | 机器学习 | 基因数据，蛋白质组学数据 | NA |
| 13179 | 2024-08-07 |
Immune and oxidative stress disorder in ovulation-dysfunction women revealed by single-cell transcriptome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297484
PMID:38116006
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了排卵功能障碍女性中免疫和氧化应激紊乱的情况 | 首次系统性地分析了排卵功能障碍女性中免疫图谱的变化，并揭示了cDC介导的信号通路对炎症反应的重要贡献 | NA | 深入了解排卵功能障碍的机制，为更好的诊断和治疗提供依据 | 排卵功能障碍女性中的免疫细胞和氧化应激 | NA | 排卵功能障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 80,689个PBMCs样本 |
| 13180 | 2024-08-07 |
Lineage tracing of T cell differentiation from T-iPSC by 2D feeder-free culture and 3D organoid culture
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1303713
PMID:38162650
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研究论文 | 本研究通过2D无饲养层培养和3D类器官培养追踪T细胞分化，分析了T-iPS-T细胞在不同培养阶段的单细胞水平数据，并识别了关键基因用于CD4+ T-iPS-T细胞的诱导。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，比较了2D无饲养层培养和3D类器官培养中T-iPS-T细胞的关键基因，为CD4+ T细胞的生成提供了新的见解。 | 研究主要集中在T-iPS-T细胞的基因表达分析，未涉及这些细胞在免疫治疗中的实际应用效果。 | 旨在通过追踪T细胞分化过程，优化T-iPS-T细胞的培养条件，以促进其在免疫治疗中的应用。 | 研究对象为从抗原特异性T细胞衍生的诱导多能干细胞（T-iPS-T细胞）。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个T-iPS-T细胞样本和人类胸腺细胞数据集 |