单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28366 篇文献，本页显示第 13161 - 13180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13161 | 2024-08-05 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-May-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
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研究论文 | 本研究构建了结合铜死亡相关基因和铁死亡相关基因的新标志基因，以探讨骨关节炎的发病机制。 | 创新点在于首次将铜死亡相关基因与铁死亡相关基因结合起来，形成新的标志基因以用于骨关节炎的研究。 | 研究中使用的数据集可能存在选择偏倚，且实验验证样本量较小，可能影响结果的广泛应用。 | 研究骨关节炎的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 本研究主要针对骨关节炎的标志基因进行分析和验证。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE82107数据集进行了验证 |
| 13162 | 2024-08-05 |
Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth
2024-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48550-4
PMID:38740814
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研究论文 | 本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异 | 通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略 | 该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证 | 探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制 | 研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量的具体信息 |
| 13163 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005
PMID:38579725
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤细胞内源性表观遗传失调如何影响与癌症相关的成纤维细胞的异质性，并通过提供脂质支持胰腺癌的代谢。 | 本研究首次揭示SETD2缺失如何通过调节H3K27Ac增强BMP2信号通路，导致成纤维细胞向脂肪丰富表型分化，从而促进肿瘤进展。 | 研究未深入探讨其他可能影响成纤维细胞异质性的因素，仅集中于肿瘤细胞的表观遗传失调。 | 研究旨在探讨胰腺导管腺癌微环境中成纤维细胞异质性的起源和功能。 | 研究对象为SETD2缺失胰腺肿瘤中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | SETD2缺失的胰腺肿瘤样本中识别出的成纤维细胞亚群 |
| 13164 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures
2024-05-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61629-8
PMID:38740918
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性 | 提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力 | 承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大 | 本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性 | 研究对象是肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证 |
| 13165 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals aberrant sphingolipid metabolism in non-small cell lung cancer impacts tumor-associated macrophages and stimulates angiogenesis via macrophage inhibitory factor signaling
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15283
PMID:38587042
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌中异常的鞘脂代谢如何影响肿瘤相关巨噬细胞并通过巨噬细胞抑制因子信号刺激血管生成 | 研究首次探讨了鞘脂在肿瘤微环境中的作用，特别是在巨噬细胞极化和血管生成中的影响 | 未详细讨论鞘脂代谢对其他免疫细胞的影响 | 研究鞘脂代谢在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究巨噬细胞及其与癌细胞之间的相互作用 | 数字病理 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 利用了多个公开的scRNA-seq数据集 |
| 13166 | 2024-08-04 |
Immune cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in esophageal carcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15301
PMID:38587029
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研究论文 | 本文探讨了免疫细胞在食管癌肿瘤免疫微环境中的角色，并建立了预后风险模型 | 利用单细胞测序，识别和表征免疫细胞亚群，构建独立的预后模型 | 未提及 | 研究食管癌患者的肿瘤免疫微环境和预后模型 | 食管癌患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 13167 | 2024-08-05 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
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研究论文 | 本文探讨了在再生心脏中参与巨噬细胞修复的细胞间相互作用 | 识别了ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞与巨噬细胞间的强交互，并阐明了其在心脏再生中的重要性 | 未详细研究其他细胞类型对巨噬细胞反应的影响 | 研究巨噬细胞在心脏修复中的微环境 | 关注再生斑马鱼心脏中的巨噬细胞以及其周围的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了斑马鱼模型进行实验 |
| 13168 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13169 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): A computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012084
PMID:38683883
|
研究论文 | 本文提出了一种名为重构集测试（RESET）的单样本基因集测试方法 | RESET方法通过随机降秩重构算法提供了一种计算上高效的基因集重要性量化方式 | NA | 研究单样本基因集测试的新方法 | 基因集及其在测量基因值重构中的重要性 | 生物信息学 | NA | 随机降秩重构算法 | NA | scRNA-seq数据 | 真实和模拟的scRNA-seq数据 |
| 13170 | 2024-08-04 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本文研究了产后高血压（PPPE）中母体免疫变化及预测生物标志物的潜在性 | 发现胎盘CD163+细胞和初始妊娠期血压可作为非侵入性预测PPPE的生物标志物 | 研究样本的规模和多样性可能限制了结论的普遍性 | 理解PPPE诊断时的免疫贡献及周产期生物标志物的预测潜力 | 通过采集PPPE患者和健康对照组的胎盘和血液样本进行比较分析 | 数字病理学 | 产后高血压 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞内细胞因子染色 | NA | 血液样本、胎盘组织 | 涉及PPPE患者和健康对照组的样本 |
| 13171 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能，并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子，并建立了PANRG评分模型，与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
| 13172 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
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研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型，并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析，Cox回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，样本大小未具体提及 |
| 13173 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome reveals highly complement activated microglia cells in association with pediatric tuberculous meningitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387808
PMID:38745656
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研究论文 | 该研究揭示了与儿童结核性脑膜炎相关的高度补体激活的微胶质细胞。 | 首次在结核性脑膜炎患儿的脑脊液和外周血单核细胞中发现了33种单核细胞亚群和补体激活的微胶质细胞。 | 样本量仅为6个患儿，可能影响结果的普遍性。 | 揭示结核性脑膜炎中的免疫机制及微胶质细胞的作用。 | 研究对象为患有结核性脑膜炎的儿童及其外周血单核细胞和脑脊液细胞。 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6名儿童 |
| 13174 | 2024-08-05 |
Characteristics of T Cells in Single-Cell Datasets of Peripheral Blood and Cerebrospinal Fluid in Alzheimer's Disease Patients
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230784
PMID:38043012
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的特征 | 揭示了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的扩展及其功能特征 | 没有提及具体的样本量和实验限制 | 探索阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的潜在特征 | 阿尔茨海默病患者的外周血和脑脊液中T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集（GSE181279和GSE134578） | NA |
| 13175 | 2024-08-05 |
Copper-binding protein modelling by single-cell transcriptome and Bulk transcriptome to predict overall survival in lung adenocarcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94588
PMID:38577594
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和大规模转录组模型预测肺腺癌患者的总体生存率 | 提出了一种新的铜结合蛋白模型，显示其在肺腺癌预后中的高预测能力 | 未提及可能的样本选择偏倚或数据集的局限性 | 旨在评估铜结合蛋白在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者的铜结合蛋白及其在生存预测中的表现 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox分析，RT-qPCR | CBPRS模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个队列，具体样本数量未说明 |
| 13176 | 2024-08-05 |
Disruption of cholangiocyte-B cell crosstalk by blocking the CXCL12-CXCR4 axis alleviates liver fibrosis
2023-Nov-27, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-05032-y
PMID:38010435
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研究论文 | 本研究探讨了阻断CXCL12-CXCR4轴如何通过破坏胆管细胞与B细胞的相互作用来减轻肝纤维化 | 提出了通过干扰胆管细胞和B细胞之间的通讯来减轻肝纤维化的新机制 | 未评估其他潜在的机制或临床应用环境 | 研究B细胞在肝纤维化中的作用及干预策略 | 以小鼠模型为基础，分析了B细胞和胆管细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA序列 | 使用小鼠模型进行实验 |
| 13177 | 2024-08-05 |
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-Nov-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302126120
PMID:37967215
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研究论文 | 这篇文章探讨了NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调节作用 | 揭示了NMDAR在肝细胞肉瘤和纤维肉瘤微环境中调节肿瘤相关巨噬细胞的全新作用 | 未明确提及研究的具体局限性 | 研究NMDAR在抗肿瘤免疫中对肿瘤相关巨噬细胞的影响 | 肝细胞肉瘤和纤维肉瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 主要涉及肝细胞肉瘤和纤维肉瘤的预临床肿瘤 |
| 13178 | 2024-08-05 |
Mammalian esophageal stratified tissue homeostasis is maintained distinctively by the epithelial pluripotent p63+Sox2+ and p63-Sox2+ cell populations
2023-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04952-z
PMID:37752383
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研究论文 | 研究了哺乳动物食管上皮组织的自我更新及其稳态调控机制 | 揭示了p63和Sox2依赖的细胞谱系在维持食管组织稳态中的独特作用 | 未能在食管鳞状细胞癌细胞系形成的类器官中检测到p63Sox2细胞群 | 探讨哺乳动物食管鳞状上皮组织的稳态以及相关的调控机制 | 通过建立大鼠食管类器官体外系统，研究食管上皮细胞群的特性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了大鼠食管类器官的多个细胞群 |
| 13179 | 2024-08-05 |
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04869-7
PMID:37480481
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研究论文 | 本研究揭示了猪皮肤来源的多能成纤维母细胞前体的转录组特征及其潜在生殖功能 | 本研究发现猪皮肤来源干细胞（SDSCs）主要源于多能成纤维母细胞前体（MDFPs），并展示了其分化为原始生殖细胞样细胞（PGCLCs）的多能性和转录调控机制 | 尚未讨论SDSCs的细胞起源及其在体外分化成PGCLCs过程中的动态转录特征 | 探讨猪皮肤来源干细胞在不育治疗中的潜在应用 | 研究对象为猪皮肤来源干细胞及其分化过程 | 再生医学 | 不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 13180 | 2024-08-04 |
Pancreatic lipase-related protein 2 is selectively expressed by peritubular myoid cells in the murine testis and sustains long-term spermatogenesis
2023-Jul-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04872-y
PMID:37468762
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研究论文 | 研究表明胰脂肪酶相关蛋白2在小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞中特异性表达，支持长期的精子发生 | 首次揭示了Pnliprp2在小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞中特异性表达及其在精子发生中的新角色 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全推广到其他物种 | 探讨Pnliprp2在小鼠睾丸周管平滑肌细胞中的功能及其对精子发生的影响 | 小鼠睾丸中的周管平滑肌细胞和精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和代谢组学 | NA | 生物样本及代谢物数据 | Pnliprp2基因敲除小鼠的多个样本 |