单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 13121 - 13140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13121 | 2024-08-07 |
Understanding tumor ecosystems by single-cell sequencing: promises and limitations
2018-12-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1593-z
PMID:30509292
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在理解肿瘤生态系统中的应用及其局限性 | 单细胞测序技术揭示了肿瘤内和肿瘤间的细胞异质性，为癌症进化、转移、耐药性和肿瘤微环境研究带来了新发现 | 单细胞测序技术仍存在局限性，包括技术挑战和潜在应用的限制 | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的最新进展和局限性及其潜在应用 | 肿瘤生态系统和癌症研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、表观基因组、转录组和多组学数据 | NA |
| 13122 | 2024-08-07 |
Missing data and technical variability in single-cell RNA-sequencing experiments
2018-10-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxx053
PMID:29121214
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研究论文 | 本文通过评估实验分析了已发表研究中的单细胞RNA测序数据，揭示了系统误差对细胞间表达变异性的影响 | 本文首次详细探讨了单细胞RNA测序中技术变异导致的零表达问题，并展示了这种技术变异如何与新的生物学结果混淆 | 本文主要关注技术变异对单细胞RNA测序数据的影响，未深入探讨生物学变异的作用 | 研究单细胞RNA测序实验中的数据缺失和技术变异性问题 | 单细胞RNA测序数据中的零表达和技术变异性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个已发表研究的数据 |
| 13123 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals transcript enrichment in oxidative phosphorylation, fluid sheer stress, and inflammatory pathways in obesity-related glomerulopathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101101
PMID:38560497
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了肥胖相关肾小球病变患者的肾脏样本，揭示了特定细胞类型中基因表达的变化 | 首次报道了肥胖相关肾小球病变患者中免疫细胞（如T细胞和B细胞）的减少，以及特定细胞类型中与氧化磷酸化、细胞粘附、产热和炎症途径相关的基因富集 | 研究样本量较小，仅包括四名肥胖相关肾小球病变患者和三名肥胖对照组 | 旨在阐明肥胖相关肾小球病变的分子机制，并探索新的预防或治疗策略 | 肥胖相关肾小球病变患者的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名肥胖相关肾小球病变患者和三名肥胖对照组 |
| 13124 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiling Cellular Heterogeneity and Specific Responses of Fish Gills to Microplastics and Nanoplastics
2024-Apr-02, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c10338
PMID:38512049
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料暴露的细胞异质性和特定反应 | 首次揭示了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性反应，并提供了单细胞分辨率的毒理学机制敏感标记 | NA | 研究鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性和特定反应 | 罗非鱼鳃的单个细胞群体对微塑料和纳米塑料暴露的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种已识别的细胞群体 |
| 13125 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13576
PMID:37994257
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用 | 首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体 | 未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证 | 探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制 | 肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四个单细胞转录组数据集 |
| 13126 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the molecular characterization of the immune microenvironment and oxidative stress signature in melanoma
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28244
PMID:38560689
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研究论文 | 本研究探讨了黑色素瘤免疫微环境和氧化应激特征的异质性。 | 通过整合散装和单细胞RNA测序数据，识别出六种肿瘤亚群，并构建了预测风险模型。 | 研究主要集中在黑色素瘤上，可能无法推广至其他类型肿瘤。 | 旨在分析黑色素瘤的免疫微环境和氧化应激标志物的分子特征。 | 研究对象为黑色素瘤的细胞及其脉络中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞和散装RNA测序数据 | 不明确提供样本数量 |
| 13127 | 2024-08-04 |
SpatialcoGCN: deconvolution and spatial information-aware simulation of spatial transcriptomics data via deep graph co-embedding
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae130
PMID:38557675
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialcoGCN的深度图共嵌入框架，用于提高空间转录组数据的去卷积和模拟性能 | 该研究通过自监督的共图卷积网络模型显著改善了空间转录组数据的低空间分辨率和检测到的RNA转录本数量的问题 | 尚未提及具体的限制因素 | 探讨空间转录组数据中细胞的功能和相互作用 | 使用空间转录组数据和单细胞数据进行细胞组成的去卷积和模拟 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度学习 | 共图卷积网络 | 空间转录组数据 | 模拟的空间转录组数据和来自人类导管癌、发育中人类心脏和小鼠大脑的真实数据集 |
| 13128 | 2024-08-07 |
An immune cell map of human lung adenocarcinoma development reveals an anti-tumoral role of the Tfh-dependent tertiary lymphoid structure
2024-Mar-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101448
PMID:38458196
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术绘制了人肺腺癌发展过程中的免疫细胞图谱，揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在抗肿瘤中的作用 | 首次揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在人肺腺癌发展中的抗肿瘤作用，并通过IL-21-IL-21受体信号通路介导 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 探究人肺腺癌发展过程中的免疫反应及其对患者生存的影响 | 人肺腺癌发展过程中的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13129 | 2024-08-04 |
MMR vaccination induces trained immunity via functional and metabolic reprogramming of γδ T cells
2024-Jan-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170848
PMID:38290093
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研究论文 | 这篇文章系统地研究了MMR疫苗是否可以诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 这项研究首次揭示了MMR疫苗通过功能和代谢重编程γδ T细胞来诱导训练免疫的机制。 | 这项研究的样本量较小，仅涉及39名健康成年人，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究MMR疫苗是否能诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 39名健康成年人，接受MMR疫苗或安慰剂的随机对照试验。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39名健康成年人 |
| 13130 | 2024-08-07 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文通过使用基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统，开发了一种遗传系统，用于在体内无缝记录内皮细胞（EC）的增殖，并结合单细胞RNA测序和基因敲除，揭示了动脉中EC生成在稳态和疾病中的细胞和分子机制。 | 本文创新性地使用遗传增殖追踪技术，结合单细胞RNA测序和基因敲除，精确测量了动脉中内皮细胞的生成动态，并揭示了其与疾病状态的关系。 | 由于大型血管如动脉的增殖频率较低，目前评估动脉中内皮细胞生成动态仍具有挑战性。 | 旨在深入理解血管稳态和疾病的细胞机制，特别是内皮细胞的生成和周转。 | 研究对象为动脉中的内皮细胞（EC）及其在稳态和疾病状态下的生成和周转。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 成年小鼠的主动脉内皮细胞 |
| 13131 | 2024-08-04 |
Cancer-associated fibroblasts: protagonists of the tumor microenvironment in gastric cancer
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1340124
PMID:38562556
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综述 | 本研究回顾了癌相关成纤维细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 探讨了癌相关成纤维细胞的异质性以及其如何促进胃癌的侵袭性和耐药性 | 癌相关成纤维细胞的异质性可能会使针对其的治疗策略开发变得复杂 | 旨在揭示癌相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其潜在治疗策略 | 主要研究癌相关成纤维细胞及其在胃癌中的角色 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 13132 | 2024-08-04 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
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综述 | 本文总结了国际免疫抑制和移植皮肤癌合作组织2022年科学研讨会的主要内容 | 提供了免疫抑制患者和器官移植接受者皮肤癌研究的最新进展 | 主要基于会议报告，缺乏原始数据和实验研究 | 探讨免疫抑制和器官移植患者的皮肤癌相关研究 | 聚焦于器官移植接受者和其他长期免疫抑制患者的皮肤恶性肿瘤 | 数字病理学 | 皮肤癌 | NA | NA | 文献综述 | NA |
| 13133 | 2024-08-04 |
Clinical implications of single cell sequencing for bladder cancer
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.045442
PMID:38560564
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综述 | 本综述总结了单细胞测序在膀胱癌中的临床应用现状 | 该研究首次系统总结了单细胞测序在膀胱癌中的应用，展示其在预后预测和免疫检查点抑制治疗反应评估中的潜力 | 此综述主要基于已发表的研究，可能存在选择偏倚 | 探讨单细胞测序在膀胱癌临床应用的现状和潜在影响 | 膀胱癌及其相关的单细胞研究 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 41篇发表的研究 |
| 13134 | 2024-08-04 |
Lung single-cell RNA profiling reveals response of pulmonary capillary to sepsis-induced acute lung injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1308915
PMID:38348045
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研究论文 | 这篇文章探讨了肺毛细血管在脓毒症诱导的急性肺损伤中的反应 | 揭示了不同类型的肺毛细血管在脓毒症急性肺损伤过程中的免疫互动和功能 | 尚不清楚Cd74+毛细血管的功能倾向是免疫还是耐受，需进一步研究确认 | 研究脓毒症引起的急性肺损伤中内皮细胞的功能和相互作用 | 小鼠的肺毛细血管及其在急性肺损伤中的反应 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠肺组织样本，时间点为0、24和48小时 |
| 13135 | 2024-08-07 |
Cystic Fibrosis Mice Are Highly Susceptible to Repeated Acute Pseudomonas aeruginosa Pneumonia after Intranasal Inoculation
2024, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2024/4769779
PMID:38347907
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研究论文 | 研究囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的易感性 | 首次发现囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌感染后比非囊性纤维化小鼠更易感，并揭示了非囊性纤维化小鼠中性粒细胞招募和效应功能的改善 | 研究仅限于F508del转基因囊性纤维化小鼠模型，可能需要进一步研究其他囊性纤维化小鼠模型 | 探讨囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的免疫反应和易感性 | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 |
| 13136 | 2024-08-07 |
Prognostic Risk Models Using Epithelial Cells Identify β-Sitosterol as a Potential Therapeutic Target Against Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S447023
PMID:38559590
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研究论文 | 本研究利用上皮细胞开发预测食管鳞状细胞癌（ESCC）预后的风险模型，并识别β-谷甾醇作为潜在的治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序和功能富集分析，识别了与ESCC相关的核心基因，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中上皮细胞异质性，并开发基于这些细胞类型的预测风险模型 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的上皮细胞异质性及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 773个食管鳞状细胞癌基因和3407个上皮细胞标记基因 |
| 13137 | 2024-08-07 |
scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17184
PMID:38560451
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scAnnoX的R包，该包整合了多种单细胞注释算法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | scAnnoX提供了一个综合框架，用于整合和比较多种单细胞注释算法，提高了注释效率和准确性 | NA | 开发一个综合工具，用于整合和比较现有的单细胞注释算法 | 单细胞注释算法 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA |
| 13138 | 2024-08-07 |
An androgen receptor-based signature to predict prognosis and identification of ORC1 as a therapeutical target for prostate adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16850
PMID:38562999
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研究论文 | 本研究旨在通过基于雄激素受体（AR）的特征来预测前列腺腺癌（PRAD）的预后，并识别ORC1作为治疗靶点 | 本研究首次识别了基于AR的10个相关基因（ARGs），并发现ORC1作为关键靶点，能够促进PRAD细胞的增殖和干细胞样特性，增强对enzalutamide的敏感性 | NA | 识别新的AR驱动特征以预测前列腺腺癌的预后，并揭示潜在的治疗靶点 | 前列腺腺癌及其对enzalutamide的耐药性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GSE99795的单细胞RNA测序数据 |
| 13139 | 2024-08-04 |
Current annotation strategies for T cell phenotyping of single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1306169
PMID:38187377
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综述 | 本文评估了当前单细胞RNA测序数据中T细胞表型注释的策略 | 提出了对T细胞及其亚群体的自动注释策略，并指出了现有工具中缺失的关键信息 | 缺乏金标准的细胞表型注释方法，导致对T细胞亚型的标记仍然存在问题 | 研究单细胞RNA测序中T细胞的表型注释方法 | 针对T细胞及其亚群体的注释工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13140 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis related to sphingolipid metabolism guides immunotherapy and prognosis of skin cutaneous melanoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304466
PMID:38077400
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研究论文 | 本文探讨了与皮肤黑色素瘤相关的鞘脂代谢基因，以开发患者预后的指标 | 本文通过单细胞测序分析识别了与免疫微环境相关的关键预后基因，提出了一种基于SRG的风险标志 | 鞘脂代谢在黑色素瘤中的具体作用和机制尚不完全明确 | 开发一个与皮肤黑色素瘤患者预后相关的指标 | 研究对象为皮肤黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | scRNA-seq | LASSO和Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |