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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 13081 - 13100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13081 | 2024-11-20 |
Integrated analysis of multi-omics data for the discovery of biomarkers and therapeutic targets for juvenile idiopathic arthritis
2024-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100256
PMID:39554251
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研究论文 | 本研究通过多组学数据的综合分析，发现了青少年特发性关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 首次使用两样本孟德尔随机化分析方法，揭示了血浆蛋白与青少年特发性关节炎之间的因果关系 | 研究仅限于血浆蛋白的分析，未涉及其他可能的生物标志物 | 识别和开发青少年特发性关节炎的新药物靶点和生物标志物，以提高治疗效果 | 青少年特发性关节炎及其相关血浆蛋白 | 生物信息学 | 风湿性疾病 | 两样本孟德尔随机化分析、共定位分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组学、转录组学 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 13082 | 2024-11-20 |
Storm: Incorporating transient stochastic dynamics to infer the RNA velocity with metabolic labeling information
2024-Nov-18, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012606
PMID:39556617
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Storm的新方法，通过解决基因表达动力学的随机微分方程，结合代谢标记信息来推断RNA速度 | Storm方法克服了以往利用确定性动力学和稳态假设的不足，能够处理涉及瞬态过程的数据，并揭示时间依赖和细胞状态特异性的转录调控 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA速度，并揭示基因表达动力学中的瞬态和随机特性 | RNA速度、基因表达动力学、转录调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机微分方程 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13083 | 2024-11-20 |
scCancerExplorer: a comprehensive database for interactively exploring single-cell multi-omics data of human pan-cancer
2024-Nov-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1100
PMID:39558175
|
研究论文 | 开发了一个名为scCancerExplorer的综合数据库，用于交互式探索人类泛癌的单细胞多组学数据 | 填补了缺乏专门用于交互式探索人类泛癌单细胞多组学数据的数据库的空白 | NA | 开发一个用户友好的数据库，促进对单细胞基因组、表观基因组和转录组数据的探索 | 人类泛癌的单细胞基因组、表观基因组和转录组数据 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞多组学 | NA | 基因组、表观基因组和转录组数据 | 50种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 13084 | 2024-11-20 |
Single-cell expression and immune infiltration analysis of polyamine metabolism in breast cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01524-w
PMID:39549127
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统免疫学方法分析了乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和系统免疫学方法，探讨了乳腺癌中多胺代谢与免疫微环境的相互作用 | 研究样本主要来自TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差 | 探讨乳腺癌中多胺代谢与免疫浸润的关系，为个性化治疗提供新思路 | 乳腺癌样本中的多胺代谢与免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 46个乳腺癌增殖相关共表达模块 | NA | NA | NA | NA |
| 13085 | 2024-11-20 |
Single-cell data revealed the regulatory mechanism of TNK cell heterogeneity in liver metastasis from gastric cancer
2024-Nov-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01528-6
PMID:39549183
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析了胃癌肝转移中TNK细胞异质性的调控机制 | 首次揭示了TNK细胞亚群在胃癌肝转移中的关键作用及其调控机制 | NA | 分类与胃癌肝转移相关的细胞亚群，并探讨其与其他免疫细胞亚群的相互作用机制 | 胃癌肝转移中的TNK细胞亚群及其调控机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | GSE163558数据集中的胃癌患者及其转移组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13086 | 2024-11-20 |
Temporal single-cell RNA sequencing dataset of gastroesophagus development from embryonic to post-natal stages
2024-Nov-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04081-7
PMID:39550363
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研究论文 | 本文介绍了从胚胎到出生后阶段的小鼠胃食管发育的单细胞RNA测序数据集的技术质量 | 提供了全面的单细胞RNA测序数据集，捕捉了食管、胃和胃食管鳞柱交界处（GE-SCJ）在胚胎、新生儿和成年阶段的转录动态 | 未提及 | 研究胃食管交界处的发育和稳态失调，以阐明癌症发病机制 | 小鼠的食管、胃和胃食管鳞柱交界处（GE-SCJ） | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个胚胎、新生儿和成年阶段的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13087 | 2024-11-19 |
Chrysalis: decoding tissue compartments in spatial transcriptomics with archetypal analysis
2024-Nov-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07165-7
PMID:39550461
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Chrysalis的计算方法，用于在空间转录组学中通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，无需外部参考数据 | Chrysalis方法无需外部参考数据，通过空间变异基因检测和原型分析快速揭示组织区室，并提供独特的可视化方法 | NA | 开发一种无需外部参考数据的空间转录组学组织区室解析方法 | 空间转录组学中的组织区室 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 原型分析 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13088 | 2024-11-20 |
The advance of single cell transcriptome to study kidney immune cells in diabetic kidney disease
2024-Nov-16, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03853-y
PMID:39550562
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在糖尿病肾病中研究肾脏免疫细胞的应用 | 单细胞测序技术相比传统方法在解析细胞异质性、并行多组学研究和发现新细胞类型方面具有优势 | 由于肾脏结构和功能的复杂性和异质性，研究每种细胞类型在肾脏病理生理学中的功能仍具有挑战性 | 探讨单细胞转录组学在糖尿病肾病领域的应用，并强调通过scRNA-seq分析揭示免疫细胞在糖尿病肾病中的重要作用 | 糖尿病肾病中的肾脏免疫细胞，包括巨噬细胞、T细胞、B细胞等 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肾脏活检和尿液样本的多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 13089 | 2024-11-20 |
Unveiling the role of Pleckstrin-2 in tumor progression and immune modulation: insights from a comprehensive pan-cancer analysis with focus on lung cancer
2024-11-15, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-024-00225-8
PMID:39546161
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研究论文 | 研究探讨了Pleckstrin-2（PLEK2）在肿瘤进展和免疫调节中的作用，特别是在肺癌中的表现 | 系统分析了PLEK2在多种癌症中的表达模式、预后相关性和功能影响，并发现PLEK2抑制剂Navitoclax的潜在应用 | 研究主要基于TCGA、GTEx和Human Protein Atlas的数据，可能存在数据来源的局限性 | 揭示PLEK2在肿瘤进展和免疫调节中的作用，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | PLEK2在多种癌症中的表达、预后影响及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用了来自TCGA、GTEx和Human Protein Atlas的数据，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 13090 | 2024-11-20 |
Analysis of single-cell RNA sequencing in human oocytes with diminished ovarian reserve uncovers mitochondrial dysregulation and translation deficiency
2024-Nov-15, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01321-8
PMID:39548561
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了卵巢储备减少（DOR）患者卵母细胞的转录组变化，揭示了线粒体功能失调和翻译缺陷 | 首次采用单细胞RNA测序技术揭示DOR卵母细胞的转录组变化，并发现PLAG1-IGF2轴的失调可能与DOR卵母细胞质量下降有关 | 研究仅限于GV阶段的DOR卵母细胞，未涵盖其他发育阶段的卵母细胞 | 揭示卵巢储备减少患者卵母细胞的特定致病机制 | 卵巢储备减少患者的卵母细胞 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DOR卵母细胞和对照卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 13091 | 2024-11-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-Nov-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02168-8
PMID:39548577
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，鉴定出COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术，在未分化多形性肉瘤中鉴定出COL6A3作为预后生物标志物，并验证了其在预测总体生存和无转移生存中的有效性 | 研究样本量较小，仅包括5个AFX和PDS活检样本以及1个PDS切除样本 | 鉴定未分化多形性肉瘤中的预后生物标志物 | 未分化多形性肉瘤（UPS）及相关肿瘤 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 5个AFX和PDS活检样本，1个PDS切除样本，以及46个和38个独立的UPS肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13092 | 2024-11-20 |
Lateralized nodose ganglia gene expression implicates cholecystokinin receptors in interoceptive reward signaling
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621506
PMID:39554115
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析左右迷走神经节基因表达差异，探讨胆囊收缩素受体在内脏奖励信号中的作用 | 首次揭示了迷走神经节中胆囊收缩素A受体在右迷走神经中的特异性表达，可能与内脏奖励信号的不对称编码有关 | 研究仅限于大鼠和小鼠，尚未在人类中验证 | 探讨迷走神经节基因表达差异在内脏奖励信号中的作用 | 大鼠和小鼠的左右迷走神经节 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠和小鼠的左右迷走神经节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13093 | 2024-11-20 |
Identifying a CD8T cell signature in the tumor microenvironment to forecast gastric cancer outcomes from sequencing data
2024-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-603
PMID:39554559
|
研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因，预测胃癌患者的预后 | 首次利用CD8T细胞相关基因构建胃癌预后预测模型 | 研究仅基于TCGA数据库的数据，样本量有限 | 探索肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因在胃癌预后预测中的作用 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8T细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞mRNA测序 | Cox回归模型 | 基因数据 | TCGA数据库中的胃癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 13094 | 2024-11-20 |
Landscape of immune cells in systematic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection: assessed by single-cell sequencing
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/kead673
PMID:38078808
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研究论文 | 研究分析了系统性红斑狼疮患者在有无EB病毒感染情况下的免疫细胞和B细胞受体（BCR）谱，并通过单细胞RNA测序识别两者之间的差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，揭示了CD8+增殖T细胞比例和IFN-α/β通路在感染组中的变化 | 样本量较小，仅包括两名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 分析系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，以更好地理解免疫反应机制 | 系统性红斑狼疮患者及其在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共8名参与者，包括2名SLE-EBV+患者，4名SLE-EBV-患者和2名健康对照，共获得83,478个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 13095 | 2024-11-20 |
Biallelic RXFP2 variants lead to congenital bilateral cryptorchidism and male infertility, supporting a role of RXFP2 in spermatogenesis
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae195
PMID:39222519
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研究论文 | 研究探讨了RXFP2基因的双等位变异如何导致先天性双侧隐睾和男性不育，并支持RXFP2在精子发生中的作用 | 首次在人类病例中证实RXFP2在精子发生成熟中的作用，并发现双等位变异导致男性不育 | 目前仅基于一个家庭的研究，需要更多病例验证 | 探讨RXFP2基因变异对男性生育能力的影响 | RXFP2基因及其在精子发生中的作用 | NA | 男性不育 | 长读长测序、单细胞RNA测序、环AMP报告基因检测 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 一个家庭中的两名男性成员 | NA | NA | NA | NA |
| 13096 | 2024-11-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for human testicular ageing
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae199
PMID:39241251
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸衰老的转录组图谱和潜在靶点 | 首次提供了年轻和老年人类睾丸的全面单细胞转录组图谱，并揭示了与睾丸衰老相关的分子机制和潜在治疗靶点 | 由于收集人类睾丸组织的困难，样本量有限，未来需要进一步的功能和机制研究 | 探讨人类睾丸衰老的分子基础和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人类睾丸组织中的单细胞转录组 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6个年轻个体和6个老年个体的睾丸组织样本，以及10个年轻捐赠者和10个老年捐赠者的更大样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 13097 | 2024-11-20 |
The Inflammatory Characteristics of Symptomatic Glioma Associated With Poor Prognosis and Chemoresistance via Tumor Necrosis Factor Signaling Pathway
2024-Oct, Brain tumor research and treatment
DOI:10.14791/btrt.2024.0035
PMID:39542520
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研究论文 | 研究分析了有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异，发现有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 首次揭示了有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 研究为回顾性分析，样本量有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探讨有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异及其对预后和化疗耐药的影响 | 有症状和无症状胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13098 | 2024-11-20 |
Robust self-supervised learning strategy to tackle the inherent sparsity in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae586
PMID:39550222
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRobust的鲁棒自监督学习策略，用于解决单细胞RNA测序数据中的固有稀疏性问题 | scRobust基于Transformer架构，采用对比学习和基因表达预测任务的组合策略，显著提高了细胞类型注释和转录组分析的准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的稀疏性问题，提高细胞类型注释和转录组分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据和scATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), scATAC-seq | Transformer | 基因表达数据 | 九个基准数据集，额外的dropout场景和组合数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 13099 | 2024-11-20 |
Tipping points in epithelial-mesenchymal lineages from single-cell transcriptomics data
2024-09-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.03.021
PMID:38504523
|
研究论文 | 本文提出了一种利用单细胞转录组数据推断细胞谱系稳定性和基因调控网络的计算方法 | 该方法通过单细胞RNA测序数据中的未剪接和剪接计数以及细胞在谱系轨迹上的排序，训练了一个RNA剪接多元模型，并基于模型的雅可比矩阵的光谱分析推断细胞状态的稳定性 | NA | 研究细胞在复杂生物过程中的命运决策机制 | 卵巢癌和肺癌来源的细胞系中的上皮-间质转化过程 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | RNA剪接多元模型 | 转录组数据 | 卵巢癌和肺癌来源的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 13100 | 2024-11-20 |
Disruption of memory B-cell trafficking by belimumab in patients with systemic lupus erythematosus
2024-09-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae286
PMID:38775637
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研究论文 | 研究探讨了贝利木单抗对系统性红斑狼疮患者记忆B细胞迁移的影响 | 首次深入分析了贝利木单抗对记忆B细胞的影响，揭示了其在治疗系统性红斑狼疮中的新机制 | 研究样本量较小，且仅限于特定的患者群体 | 探讨贝利木单抗对系统性红斑狼疮患者记忆B细胞的影响 | 系统性红斑狼疮患者的记忆B细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据，转录组数据 | 1245名系统性红斑狼疮患者 | NA | NA | NA | NA |