单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 13021 - 13040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13021 | 2024-08-07 |
Loss of Adam10 Disrupts Ion Transport in Immortalized Kidney Collecting Duct Cells
2021, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab024
PMID:34131651
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研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9技术敲除mCCD细胞中的Adam10基因，观察其对钠转运能力和醛固酮反应的影响 | 首次揭示了Adam10基因敲除对肾皮质集合管细胞中钠转运和细胞标记物分布的影响 | 仅限于mCCD细胞系和特定基因敲除，可能不完全代表体内情况 | 探讨Adam10基因在肾皮质集合管细胞中的功能及其对离子转运的影响 | 自永生化的肾皮质集合管细胞系mCCD | NA | NA | CRISPR-Cas9技术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫染色图像 | 多个独立的mCCD细胞克隆 |
| 13022 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Hepatocellular Carcinoma Reveals Cell Interactions and Cell Heterogeneity in the Microenvironment
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S338090
PMID:34992435
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本，揭示了微环境中的细胞相互作用和细胞异质性 | 本研究通过单细胞测序数据识别了新的HCC预后标志物，包括ALDOB, APOC3, APOH等10个关键基因 | NA | 旨在基于单细胞测序数据识别肝细胞癌的新预后标志物 | 肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 21个HCC样本和256个正常肝组织样本 |
| 13023 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Anterior Kidney Leukocytes From Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783196
PMID:35027916
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，对尼罗罗非鱼前肾中的白细胞进行了转录模式分析 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究尼罗罗非鱼前肾白细胞的异质性，并识别出多种免疫细胞亚群 | 未能根据已知的特定标记物更详细地识别髓系细胞亚群 | 揭示尼罗罗非鱼前肾白细胞的亚群及其潜在标记物 | 尼罗罗非鱼前肾中的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11,388个前肾白细胞 |
| 13024 | 2024-08-07 |
Natural Barcodes for Longitudinal Single Cell Tracking of Leukemic and Immune Cell Dynamics
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788891
PMID:35046946
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review | 本文综述了利用染色体拷贝数变化、体细胞核和线粒体DNA突变、单核苷酸多态性以及T和B细胞受体序列作为个人自然条形码，在单细胞分析工作流程中的技术实现及其应用 | 介绍了多模态单细胞测序技术的新平台，以及如何利用分子事件作为条形码追踪恶性细胞和免疫细胞群体随时间的变化 | NA | 探讨血液恶性肿瘤治疗瓶颈后疾病演变的纵向追踪以及抗肿瘤免疫变化监测的新方法 | 血液恶性肿瘤中的恶性细胞和免疫细胞动态 | digital pathology | 血液恶性肿瘤 | multi-modal single-cell sequencing | NA | DNA 和 RNA 序列 | NA |
| 13025 | 2024-08-07 |
Deciphering the Immune-Tumor Interplay During Early-Stage Lung Cancer Development via Single-Cell Technology
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.716042
PMID:35047383
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术解码早期肺癌发展过程中的免疫-肿瘤相互作用 | 利用单细胞测序技术探索早期肺癌中肿瘤免疫微环境的详细机制 | 目前主要集中在肿瘤临床可检测的“逃逸”阶段，早期阶段的机制尚不明确 | 深入理解早期肺癌发展过程中免疫反应及其动态变化 | 早期肺癌的免疫-肿瘤相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 未具体说明 |
| 13026 | 2024-08-07 |
Principles of Spatial Transcriptomics Analysis: A Practical Walk-Through in Kidney Tissue
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.809346
PMID:35069263
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review | 本文综述了空间转录组技术及其在肾脏组织中的应用，特别是Slide-seqV2技术的使用 | 介绍了Slide-seqV2技术在近单细胞分辨率下收集空间转录组数据的能力 | NA | 探讨空间转录组技术在肾脏组织中的应用，并展示如何通过这些技术进行细胞类型映射和空间细胞类型及转录组特征分析 | 肾脏组织及其空间结构中的细胞和基因表达特征 | digital pathology | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13027 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 13028 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Apr-04, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤内异质性 | 利用单细胞转录组测序技术，深入研究了ESCC肿瘤微环境的分子机制，并构建了预测ESCC患者预后的风险模型 | NA | 探究食管鳞状细胞癌的发病机制，并识别潜在的关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境和细胞类型分布 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 |
| 13029 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 13030 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
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综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现，包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA |
| 13031 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 13032 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 13033 | 2024-08-07 |
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6245
PMID:38229567
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研究论文 | 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 | 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未在临床试验中验证 | 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 | SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38个髓母细胞瘤组织样本 |
| 13034 | 2024-08-07 |
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912
PMID:38458566
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研究论文 | 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用，特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 | 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白，参与调节骨骼肌细胞外基质的组成，这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 | 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用，以及其作为治疗干预的潜力。 | 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 | 使用后肢卸载和重载的小鼠模型，研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 | NA | NA | qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 细胞外液蛋白组 | 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 |
| 13035 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2024-04-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57714-7
PMID:38561388
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于NK细胞标记基因的新型特征，用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证，未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证 | 旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征，为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 共分析了1560个样本 |
| 13036 | 2024-08-07 |
Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening
2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03027-6
PMID:38561797
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研究论文 | 本研究通过大规模CRISPRi筛选，识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子 | 发现了一系列遗传修饰因子，如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1，这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果，并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用 | NA | 提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效 | 胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CRISPRi筛选 | NA | RNA测序数据 | 大规模细胞系 |
| 13037 | 2024-08-07 |
Monocytes Release Pro-Cathepsin D to Drive Blood-to-Brain Transcytosis in Diabetes
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323622
PMID:38420756
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞释放的前胱天蛋白酶D在糖尿病中驱动血液到大脑的转胞吞作用中的作用 | 发现了循环中的前胱天蛋白酶D在糖尿病脑微血管病变发病机制中的新作用 | NA | 确定2型糖尿病进展中微血管并发症的潜在机制 | 人类单核细胞样本和表达人胱天蛋白酶D的转基因小鼠 | NA | 糖尿病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA | 控制组和糖尿病患者的单核细胞样本 |
| 13038 | 2024-08-07 |
Versican Promotes Cardiomyocyte Proliferation and Cardiac Repair
2024-03-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 首次揭示了versican作为心脏成纤维细胞来源的促进增殖的蛋白聚糖，并阐明了其在促进成年心脏修复中的作用 | NA | 探究versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 新生和成年小鼠的心脏 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、液相色谱-质谱分析、Western blot、免疫染色、定量逆转录聚合酶链反应、Masson三色染色、超声心动图 | NA | NA | 新生和成年小鼠 |
| 13039 | 2024-08-07 |
DESP demixes cell-state profiles from dynamic bulk molecular measurements
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100729
PMID:38490205
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research paper | 本文介绍了一种名为DESP的算法，该算法利用单细胞RNA测序等独立估计的细胞状态比例，解析细胞状态对批量分子测量（特别是定量蛋白质组学）的相对贡献 | DESP算法能够从批量分子测量中准确重建细胞状态特征，为研究细胞状态水平的蛋白质组和其他分子谱提供了一个可推广的计算框架 | NA | 开发一种算法，用于解析细胞状态对批量分子测量的贡献，并提供对细胞状态水平分子谱的研究方法 | 细胞状态对批量分子测量的贡献，特别是蛋白质组和转录组的测量 | machine learning | NA | single-cell RNA sequencing, quantitative proteomics | DESP algorithm | proteome, transcriptome | NA |
| 13040 | 2024-08-07 |
Anchored-fusion enables targeted fusion search in bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100733
PMID:38503288
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Anchored-fusion的高灵敏度融合基因检测工具，该工具能够锚定感兴趣的基因并恢复传统算法通常过滤掉的短读序列匹配 | Anchored-fusion包含基于深度学习层次结构的模块，采用自蒸馏学习（HVLD）有效过滤假阳性融合片段，同时保持真实融合基因 | NA | 开发一种高灵敏度的融合基因检测工具，适用于低测序深度的应用 | 融合基因的检测 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA |