单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 13001 - 13020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13001 | 2024-08-07 |
Dexamethasone modulates immature neutrophils and interferon programming in severe COVID-19
2022-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01576-3
PMID:34782790
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组学技术，探讨了地塞米松在严重COVID-19中对未成熟中性粒细胞和干扰素编程的调节作用 | 发现COVID-19相关ARDS中存在由干扰素和前列腺素信号调节的特定中性粒细胞状态，地塞米松能改变这些中性粒细胞状态并重塑细胞间相互作用 | 研究主要集中在男性患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示地塞米松在严重COVID-19中的作用机制，为开发针对性的免疫疗法提供依据 | 严重COVID-19患者中的中性粒细胞及其对地塞米松的反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，血浆蛋白质组学 | NA | RNA序列，蛋白质 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 13002 | 2024-08-07 |
An immunodominant NP105-113-B*07:02 cytotoxic T cell response controls viral replication and is associated with less severe COVID-19 disease
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01084-z
PMID:34853448
|
研究论文 | 研究了NP105-113-B*07:02特异性CD8 T细胞反应在SARS-CoV-2感染者中的主导作用及其与轻度COVID-19疾病的关系 | 展示了NP-B*07:02特异性T细胞在COVID-19疾病进展中的有益关联，并指出其在感染后6个月仍保持抗病毒效力 | NA | 探讨NP-B*07:02特异性T细胞反应与COVID-19疾病严重程度的关系，并为未来疫苗设计提供依据 | NP-B*07:02特异性T细胞反应及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | T细胞受体使用、转录组特征和疾病严重程度数据 | 急性期77例，恢复期52例 |
| 13003 | 2024-08-07 |
Long non-coding RNAs (lncRNAs) NEAT1 and MALAT1 are differentially expressed in severe COVID-19 patients: An integrated single-cell analysis
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261242
PMID:35007307
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了长非编码RNA NEAT1和MALAT1在重症COVID-19患者中的差异表达情况 | 首次综合分析了来自重症和轻症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，揭示了NEAT1和MALAT1在不同病情中的差异表达 | 研究仅限于特定的细胞类型和基因，可能需要更广泛的细胞和基因分析以全面理解其在COVID-19中的作用 | 揭示重症与轻症COVID-19患者之间的关键炎症差异因子 | 长非编码RNA NEAT1和MALAT1在COVID-19患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自重症和轻症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗细胞和外周血单个核细胞 |
| 13004 | 2024-08-07 |
Optimization of Long-Term Human iPSC-Derived Spinal Motor Neuron Culture Using a Dendritic Polyglycerol Amine-Based Substrate
2022 Jan-Dec, ASN neuro
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/17590914211073381
PMID:35023784
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于树枝状聚甘油胺（dPGA）基质的方法，用于延长人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的脊髓运动神经元（MNs）的长期培养 | 使用dPGA涂层培养皿，使得MNs更适合长期研究细胞活力、分子身份和自发网络电生理活动 | 目前hiPSC衍生的MN应用常受限于我们监测MN形态、存活和其他功能特性的能力 | 改善hiPSC衍生的MN的长期培养条件，以促进人类MN生物学和疾病的研究 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的脊髓运动神经元（MNs） | NA | 脊髓性肌萎缩症，肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA |
| 13005 | 2024-08-07 |
An atlas of dynamic peripheral blood mononuclear cell landscapes in human perioperative anaesthesia/surgery
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.663
PMID:35061932
|
研究论文 | 本研究探讨了围手术期麻醉对患者免疫细胞动态变化的影响，通过单细胞测序技术分析了外周血单个核细胞（PBMCs）的响应。 | 首次报道了围手术期麻醉/手术对循环免疫细胞时间表型的影响，并提供了单细胞层面的解决方案。 | NA | 研究围手术期麻醉对患者免疫系统的具体影响，特别是免疫细胞的动态变化。 | 外周血单个核细胞（PBMCs）及其在围手术期对麻醉的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | PBMCs样本在麻醉和手术前1天、麻醉后0小时、24小时和48小时采集。 |
| 13006 | 2024-08-07 |
Extracellular vesicles produced by the human commensal gut bacterium Bacteroides thetaiotaomicron affect host immune pathways in a cell-type specific manner that are altered in inflammatory bowel disease
2022-01, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12189
PMID:35064769
|
研究论文 | 研究由人类共生肠道细菌Bacteroides thetaiotaomicron产生的胞外囊泡如何影响宿主免疫途径，特别是在炎症性肠病中的细胞类型特异性影响 | 首次详细分析了特定细菌胞外囊泡在不同免疫细胞类型中的作用，并探讨了健康与疾病状态下这些作用的差异 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和计算机模拟，需要进一步的实验验证 | 探讨肠道细菌胞外囊泡与宿主免疫细胞的相互作用，以促进炎症性肠病的治疗 | Bacteroides thetaiotaomicron产生的胞外囊泡及其对宿主免疫细胞的影响 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 13007 | 2024-08-07 |
Evaluation of deep convolutional neural networks for in situ hybridization gene expression image representation
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0262717
PMID:35073334
|
研究论文 | 本文评估了深度卷积神经网络在原位杂交基因表达图像表示中的应用 | 提出了一种对比学习任务——基因重识别，以计算原位杂交图像的表示，并在模型中实现了显著的改进 | NA | 更好地捕捉人类大脑皮层中基因表达的复杂模式 | 原位杂交图像中的基因表达强度和模式 | 计算机视觉 | 精神分裂症 | 深度卷积神经网络 | CNN | 图像 | 约1000个基因的数据集，来自42个个体；第二个数据集包含78个基因，来自53个个体 |
| 13008 | 2024-08-07 |
Cell-by-cell dissection of phloem development links a maturation gradient to cell specialization
2021-Dec-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5531
PMID:34941412
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术，重建了原生韧皮部从细胞前体到根部分化末期的发育轨迹，揭示了韧皮部发育中成熟梯度与细胞特化之间的关系。 | 首次通过单细胞转录组学方法，详细解析了韧皮部发育过程中的细胞成熟梯度和细胞特化机制。 | NA | 研究植物韧皮部发育过程中细胞成熟梯度与细胞特化之间的联系。 | 植物韧皮部的发育过程及其调控机制。 | 植物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 13009 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of T and B cell repertoires following SARS-CoV-2 mRNA vaccine
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153201
PMID:34935643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和功能性检测，比较了接种两剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗后与无症状康复者之间的体液和细胞免疫反应 | 本研究发现接种疫苗后富集了针对刺突蛋白的B细胞、激活的CD4+ T细胞以及强大的抗原特异性多功能CD4+ T细胞反应 | 尽管观察到克隆扩增的CD8+ T细胞，但其反应相对较弱且变化较大 | 探究接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的转录和免疫谱变化 | T细胞和B细胞的免疫谱 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 13010 | 2024-08-07 |
Volumetric compression develops noise-driven single-cell heterogeneity
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2110550118
PMID:34916290
|
研究论文 | 本文研究了物理压缩对非小细胞肺癌细胞异质性的影响，并通过单细胞转录组测序和单分子荧光原位杂交技术进行了验证 | 首次揭示了物理微环境对单细胞异质性的贡献，并展示了机械刺激通过改变转录动力学影响细胞命运决定的机制 | NA | 探讨物理微环境对单细胞异质性的影响及其机制 | 非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 13011 | 2024-08-07 |
CARMN Is an Evolutionarily Conserved Smooth Muscle Cell-Specific LncRNA That Maintains Contractile Phenotype by Binding Myocardin
2021-12-07, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了一种名为CARMN的进化保守的平滑肌细胞特异性长非编码RNA，通过结合肌动蛋白来维持收缩表型 | CARMN是首个被发现与肌动蛋白相互作用的非编码RNA，其在维持血管平滑肌细胞收缩表型中起着先前未被重视的作用 | NA | 研究CARMN在维持血管平滑肌细胞分化表型中的作用及其分子机制 | CARMN在血管平滑肌细胞中的表达及其对收缩表型的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的血管疾病模型，以及CARMN敲入和敲除的小鼠模型 |
| 13012 | 2024-08-07 |
Impact of chemotherapy and immunotherapy on the composition and function of immune cells in COVID-19 convalescent with gynecological tumors
2021-12-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203739
PMID:34862879
|
研究论文 | 研究了化疗和免疫治疗对COVID-19康复者中妇科肿瘤患者免疫细胞组成和功能的影响 | 发现COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞分子特征与无肿瘤的COVID-19患者相似，且抗PD-L1治疗能显著增强NK细胞和T细胞的细胞毒性评分及T细胞的克隆扩增 | 样本量较小，仅包括3名健康捐赠者、4名COVID-19患者和4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | 探讨COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫记忆及其对化疗和免疫治疗的响应 | COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞 | NA | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名健康捐赠者，4名COVID-19患者，4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 |
| 13013 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了新生期暴露于高氧环境的小鼠在成年期的肺细胞景观变化 | 首次揭示了新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观的持久影响，并发现了类型II细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究仅在动物模型中进行，结果需要进一步在人类中验证 | 探究新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观和功能的长远影响 | 新生期暴露于高氧环境的小鼠的肺细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个细胞，分为45个集群和32个细胞状态 |
| 13014 | 2024-08-07 |
Clinical and therapeutic relevance of cancer-associated fibroblasts
2021-12, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00546-5
PMID:34489603
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤发展和治疗中的临床相关性和治疗意义 | 通过单细胞RNA测序和新型小鼠模型，增加了对CAF多样性的理解 | 不同CAF群体的上下文依赖角色及其可互换的可塑性仍大多未知 | 探讨CAFs在癌症进展中的作用及其作为预后因子和治疗靶点的价值 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的复杂相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 13015 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-related molecular biomarkers for Alzheimer's disease
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00714-8
PMID:34880454
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自4名阿尔茨海默病（AD）患者和2名正常对照的外周血单个核细胞（PBMCs），探索了AD患者PBMCs中的差异细胞亚群，并发现了B细胞的显著减少。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了与AD进展相关的B细胞分子标志物，并通过功能实验验证了B细胞在AD早期阶段的作用。 | 研究样本量较小，且仅限于AD患者和正常对照，未来研究需要扩大样本量并考虑更多疾病阶段和人群。 | 探索阿尔茨海默病中与B细胞相关的分子标志物，以促进AD进展的临床识别。 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和B细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名AD患者（早期2名，晚期2名）和2名正常对照，以及43名AD患者和41名正常受试者 |
| 13016 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.650
PMID:34965030
|
研究论文 | 本研究利用大规模并行多重单细胞RNA测序技术，构建了超过13万个单个间充质干细胞的转录组图谱，以评估其异质性 | 首次构建了人类间充质干细胞的综合单细胞图谱，并发现了七个组织特异性和五个保守的MSC亚群，这些亚群具有不同的基因表达特征 | NA | 探索间充质干细胞的细胞异质性，以促进基于MSC的治疗效果的潜在改进 | 人类间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过13万个单个间充质干细胞转录组，来自多个组织和供体，包括正常骨髓（3个）、脂肪组织（3个）、脐带（2个）和真皮（3个） |
| 13017 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Seq reveals cellular landscape-specific characteristics and potential etiologies for adolescent idiopathic scoliosis
2021-Dec, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1184
PMID:35005449
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，比较了青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观，揭示了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断，并通过细胞通信分析提供了骨细胞和软骨细胞分化功能障碍的可能发病机制。 | 首次通过单细胞分析揭示了AIS患者与健康受试者在细胞状态上的差异，并发现了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断。 | NA | 探讨青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者在脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观差异及其潜在的病因。 | 青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者的脊椎松质骨组织。 | 数字病理学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 基因组范围的转录组数据 | AIS患者与健康受试者的脊椎松质骨组织样本 |
| 13018 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics at subspot resolution with BayesSpace
2021-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00935-2
PMID:34083791
|
research paper | 本文介绍了BayesSpace，一种完全贝叶斯统计方法，用于增强空间转录组数据的分辨率和聚类分析 | BayesSpace利用空间邻域信息提高空间转录组数据的分辨率，并改进对组织内转录组特征的识别 | NA | 提高空间转录组数据的分辨率和聚类分析的准确性 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本的转录组特征 | digital pathology | NA | 空间转录组技术 | 贝叶斯统计方法 | 转录组数据 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本 |
| 13019 | 2024-08-07 |
Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells
2021-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00927-2
PMID:34083792
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ASAP-seq的新工具，能够在单细胞水平上同时分析染色质可及性和蛋白质水平 | ASAP-seq结合了scATAC-seq数据和多种细胞表面及细胞内蛋白质标记物的检测，以及可选的线粒体DNA捕获，实现了单细胞中三种不同模态的同步分析 | NA | 展示系统性多组学分析在揭示基因调控中心法则中染色质、RNA和表面蛋白质协调及不同变化方面的应用 | 染色质可及性、基因表达和蛋白质水平在单细胞中的变化 | 基因组学 | NA | scATAC-seq, ASAP-seq | NA | 染色质可及性数据、蛋白质标记物数据、线粒体DNA | NA |
| 13020 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了AML初始细胞在疾病进展中的RNA变化 | 首次在AML初始细胞中识别出RNA克隆进化现象 | NA | 深入理解AML复发机制，开发新的预后生物标志物和治疗策略 | AML初始细胞（LICs）在诊断和复发样本中的RNA变化 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 匹配的AML患者诊断和复发样本 |