单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12981 - 13000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12981 | 2024-08-04 |
Revolutionizing cancer immunotherapy in solid tumor: CAR engineering and single-cell sequencing insights
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310285
PMID:38090577
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mini-review | 这篇文章探讨了嵌合抗原受体（CAR）细胞疗法在实体肿瘤治疗中的进展及单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用 | 结合scRNA-seq与CAR疗法，提供了对CAR细胞生物特性及肿瘤免疫逃逸的新见解，推动癌症免疫治疗的创新 | 主要面临识别可靠的肿瘤相关抗原和肿瘤微环境复杂性的问题 | 研究CAR细胞疗法在实体肿瘤中的应用以及scRNA-seq的潜力 | CAR-T细胞和实体肿瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | NA |
| 12982 | 2024-08-04 |
An integrated analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals that EMP1+/COL3A1+ fibroblasts contribute to the bone metastasis process in breast, prostate, and renal cancers
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1313536
PMID:38187400
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研究论文 | 本研究通过综合分析大规模测序和单细胞RNA转录组数据，揭示了EMP1+/COL3A1+成纤维细胞在乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移过程中的作用 | 首次调查了成纤维细胞与多种肿瘤微环境中的骨转移过程之间的关系 | 尚未明确骨转移机制的所有细节 | 探索不同肿瘤的骨转移相关特征 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌样本中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌、前列腺癌、肾癌 | 大规模测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA转录组数据 | 乳腺癌、前列腺癌和肾癌的骨转移样本 |
| 12983 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity in esophageal squamous epithelial cells and constructs models for predicting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1322147
PMID:38098487
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研究论文 | 该文章探讨了食管鳞状上皮细胞异质性，并建立了预测患者预后和免疫治疗模型 | 通过单细胞转录组学揭示了恶性上皮细胞亚群的异质性，并建立了与生存相关的预后模型 | 样本量和所用数据集的选择可能限制了结果的普遍适用性 | 全面探索食管鳞状细胞癌微环境中恶性鳞状上皮细胞亚群的异质性 | 主要研究食管鳞状细胞癌患者中的恶性鳞状上皮细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | TCGA和GSE53624队列的样本 |
| 12984 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immune cells during the progression from HBV infection to HBV cirrhosis and HBV-associated hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1320414
PMID:38116005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同疾病阶段的人类肝脏免疫微环境，揭示了HBV感染至HBV相关肝硬化和肝细胞癌过程中免疫细胞的变化 | 首次详细描述了从HBV感染到肝硬化和肝细胞癌进展过程中肝脏免疫微环境的单细胞景观，并识别了两个相关的免疫细胞亚群Macrophage-CD9/IL18和macrophage-CD9/IFI6 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探究HBV相关肝脏疾病进展过程中肝脏免疫环境的变化 | HBV感染、HBV肝硬化和HBV相关肝细胞癌患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 118,455个免疫细胞，来自6名健康个体、4名HBV感染患者、5名HBV肝硬化患者和3名HBV相关肝细胞癌患者 |
| 12985 | 2024-08-07 |
Unraveling the enigma of B cells in diffuse large B-cell lymphoma: unveiling cancer stem cell-like B cell subpopulation at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310292
PMID:38149239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和多种生物信息学工具，全面分析了弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群，特别是揭示了一种具有癌症干细胞特性的B细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤中存在具有癌症干细胞特性的B细胞亚群，并探讨了其与不良预后的关联 | 研究样本量较小，且仅限于DLBCL和正常淋巴组织，未来需扩大样本量和涵盖更多类型的淋巴瘤 | 揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中癌症干细胞样B细胞亚群的特性和其在疾病进展中的作用 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群及其与癌症干细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 230个DLBCL组织样本和3个DLBCL样本及1个正常淋巴组织样本 |
| 12986 | 2024-08-07 |
Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315602
PMID:38268924
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研究论文 | 本研究旨在通过分析COVID-19患者外周血中的干扰素（IFN）反应基因表达，深入了解COVID-19感染期间的系统性干扰素反应 | 首次在未接种疫苗的COVID-19患者中研究了干扰素反应基因的表达，并利用单细胞RNA测序数据分析了特定细胞类型在干扰素反应中的作用 | 样本仅限于疾病发作后10天内的血液样本，且未考虑接种疫苗后的情况 | 研究COVID-19患者在自然感染期间的先天免疫反应，特别是干扰素反应 | COVID-19患者和健康对照组的外周血样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 105名COVID-19患者和30名健康对照 |
| 12987 | 2024-08-07 |
Effect of sodium stibogluconate in recruiting and awakening immune cells in the pleural fluid of pancreatic cancer: preparation for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315468
PMID:38313432
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研究论文 | 研究钠锑葡萄糖酸盐（SSG）在胰腺癌患者的胸腔积液中招募和唤醒免疫细胞的效果，为免疫治疗做准备 | 首次使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究SSG在胰腺癌胸腔积液中的免疫激活作用 | 研究仅限于胰腺癌患者的胸腔积液，未涉及其他类型的癌症或疾病 | 探讨SSG在胰腺癌胸腔积液中激活免疫细胞的机制，为免疫治疗提供新策略 | 胰腺癌患者的胸腔积液中的免疫细胞 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 12988 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies mechanisms of inflammatory heterogeneity in chronic rhinosinusitis
2022-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01312-0
PMID:36138182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞，识别了与慢性鼻窦炎亚型发病机制相关的特定细胞亚群和分子 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了慢性鼻窦炎亚型的异质性免疫微环境和发病机制，并发现了潜在的治疗靶点 | 研究主要集中在小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 深入理解慢性鼻窦炎的异质性免疫微环境和发病机制，并探索潜在的治疗方法 | 健康个体和慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜细胞 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞 |
| 12989 | 2024-08-07 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
|
研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过矿物皮质激素受体依赖性增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量，加剧成年雌性小鼠肥胖的现象。 | 本研究首次揭示了早期生活压力通过矿物皮质激素受体影响脂肪细胞功能，加剧肥胖的具体机制。 | 研究主要集中在雌性小鼠上，未来研究可以扩展到雄性小鼠或其他动物模型，以验证结果的普遍性。 | 旨在理解母体分离和早期断奶对脂肪组织基本稳态功能的具体影响，并探究这种影响是否通过矿物皮质激素受体介导。 | 研究对象包括雌性小鼠的卵巢白色脂肪组织，以及分离的前脂肪细胞和成熟脂肪细胞。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据，脂质组学数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 12990 | 2024-08-07 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠造血干细胞和LSK前体细胞中，外部信号干扰素、粒细胞集落刺激因子和前列腺素对细胞状态的影响 | 首次全面分析了造血干细胞对外部刺激的反应异质性和特异性，并揭示了细胞内在的染色质状态与对外部信号反应的关系 | NA | 探究外部信号如何调控造血干细胞的连续转录状态 | 造血干细胞及其前体细胞对外部刺激的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-Seq） | NA | 基因表达数据 | 功能验证的小鼠造血干细胞和LSK前体细胞样本 |
| 12991 | 2024-08-07 |
Single Cell Sequencing of Induced Pluripotent Stem Cell Derived Retinal Ganglion Cells (iPSC-RGC) Reveals Distinct Molecular Signatures and RGC Subtypes
2021-12-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12122015
PMID:34946963
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了由诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞（RGC），以识别不同的分子特征和RGC亚型 | 首次通过单细胞测序技术揭示了iPSC衍生的RGC中的分子特征和亚型多样性 | 仅限于使用特定技术（Chromium Single Cell 3' V3协议和Illumina Novaseq）进行测序，可能限制了数据的多功能性 | 旨在识别由iPSC衍生的RGC中的差异表达基因（DEG）和RGC亚型 | 人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 4705个细胞 |
| 12992 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a strong connection between Gadd45g upregulation and oncolytic HSV infection in tumor tissue
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.006
PMID:34786476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肿瘤组织在接受基于单纯疱疹病毒2的溶瘤病毒治疗后的基因表达谱 | 揭示了溶瘤病毒感染肿瘤细胞后Gadd45g基因显著上调的现象，并探讨了其对病毒复制的影响 | NA | 研究溶瘤病毒在肿瘤组织中的感染效率及其对肿瘤细胞基因表达的影响 | 肿瘤组织在接受溶瘤病毒治疗后的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 12993 | 2024-08-07 |
Dissociation of intact adult mouse cortical projection neurons for single-cell RNA-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100941
PMID:34877546
|
research paper | 本文提供了一种改进的流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元，适用于液滴和板式单细胞RNA测序、qPCR、免疫细胞化学和长期细胞培养等应用 | 该协议使用现成的试剂，无需昂贵的分离试剂盒，通过独特的孵育步骤和FACS门控策略，实现了对成年大脑皮质神经元前所未有的富集 | NA | 开发一种稳健且可重复的分离流程，用于从成年小鼠皮质中分离完整的投射神经元 | 成年小鼠皮质中的投射神经元 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | RNA | NA |
| 12994 | 2024-08-07 |
Beyondcell: targeting cancer therapeutic heterogeneity in single-cell RNA-seq data
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01001-x
PMID:34911571
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研究论文 | 本文介绍了Beyondcell方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别具有不同药物反应的肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | Beyondcell方法通过计算药物签名富集分数，界定治疗簇（TCs）在细胞群体中的分布，并确定细胞群体间的治疗差异，生成基于敏感性的优先级排名以指导药物选择 | NA | 开发一种计算方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别肿瘤细胞亚群并提出癌症特异性治疗方案 | 单细胞RNA测序数据中的肿瘤细胞亚群及其药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 五个单细胞数据集 |
| 12995 | 2024-08-07 |
Predicting heterogeneity in clone-specific therapeutic vulnerabilities using single-cell transcriptomic signatures
2021-12-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-01000-y
PMID:34915921
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研究论文 | 本文通过大规模癌症组学数据分析，利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，研究了肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的重要性，并展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性 | 本文首次利用单细胞RNA测序和推荐系统CaDRReS-Sc，展示了异质基因表达特征在预测药物反应中的高准确性，并验证了其在单药治疗和组合治疗中的有效性 | NA | 研究肿瘤内转录组异质性对预测临床结果的影响，并开发一种新的方法来加速药物再利用研究 | 肿瘤内转录组异质性和药物反应预测 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 推荐系统 | 转录组数据 | 大规模癌症组学数据集和患者近端细胞系 |
| 12996 | 2024-08-07 |
Deciphering regulatory protein activity in human pancreatic islets via reverse engineering of single-cell sequencing data
2021-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154482
PMID:34907912
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研究论文 | 本文通过逆向工程从单细胞RNA测序数据中解析了人类胰岛中调控蛋白的活性，并探讨了这些活性在2型糖尿病（T2D）中的独特模式 | 首次应用逆向工程方法从单细胞RNA测序数据中获取调控蛋白活性，并识别出与T2D相关的独特调控蛋白活性模式 | NA | 揭示2型糖尿病中胰岛功能障碍的分子机制 | 人类胰岛中的调控蛋白活性 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 非糖尿病和T2D患者的胰岛样本 |
| 12997 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of monolayer cultured human dental pulp stem cells with enhanced differentiation capacity
2021-12-15, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-021-00140-6
PMID:34911932
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术研究了新鲜分离和单层培养的人牙髓干细胞的转录差异 | 首次揭示了单层培养的人牙髓干细胞与新鲜分离的细胞在细胞组成上的变化，并发现了一种具有增强分化潜能的亚群 | NA | 研究单层培养的人牙髓干细胞的转录差异及其在再生医学中的潜在价值 | 人牙髓干细胞及其在单层培养后的转录特征 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12998 | 2024-08-07 |
Benchmarking UMI-based single-cell RNA-seq preprocessing workflows
2021-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02552-3
PMID:34906205
|
研究论文 | 本文系统地比较了10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程的性能 | 首次全面比较了多种单细胞RNA测序预处理工作流程，并评估了它们对下游分析的影响 | 未详细讨论每种工作流程的具体技术细节和潜在的改进空间 | 比较不同单细胞RNA测序预处理工作流程的性能，并评估它们对下游分析的影响 | 10种基于UMI的单细胞RNA测序预处理工作流程 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用不同生物复杂性水平的数据集 |
| 12999 | 2024-08-07 |
CIDER: an interpretable meta-clustering framework for single-cell RNA-seq data integration and evaluation
2021-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02561-2
PMID:34903266
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CIDER的可解释元聚类框架，用于单细胞RNA测序数据的综合和评估 | CIDER在模拟和真实数据集上均优于其他单细胞RNA测序聚类方法和整合方法，并且可以评估真实数据集中整合的生物学正确性，而不需要先验的细胞注释 | NA | 开发一种新的方法来解决单细胞RNA测序数据聚类中的批次效应和生物学变异问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 元聚类框架 | RNA测序数据 | NA |
| 13000 | 2024-08-07 |
geneBasis: an iterative approach for unsupervised selection of targeted gene panels from scRNA-seq
2021-12-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02548-z
PMID:34872616
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研究论文 | 本文介绍了一种名为geneBasis的无监督迭代方法，用于从scRNA-seq数据集中选择最优基因面板 | geneBasis方法通过迭代选择能够最大化真实流形与当前选定基因面板构建流形之间距离的基因，从而优于现有策略 | NA | 旨在从scRNA-seq数据中选择适用于空间转录组学等技术的最优基因子集 | scRNA-seq数据集中的基因面板选择 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |