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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1281 | 2025-10-05 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2025-Sep-14, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
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研究论文 | 通过多组学和网络药理学方法研究肠道微生物代谢物与基质金属蛋白酶-3在乳腺癌中的相互作用 | 首次发现并验证了肠道微生物代谢物与MMP3之间的相互作用轴,揭示了8种无毒微生物代谢物与MMP3的强结合亲和力 | 研究结果需要后续体外和体内实验验证 | 系统研究微生物代谢物与其靶标在乳腺癌中的关键相互作用 | 肠道微生物代谢物与基质金属蛋白酶-3(MMP3) | 机器学习 | 乳腺癌 | 网络药理学、机器学习、SHAP分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接 | 机器学习模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1282 | 2025-10-05 |
Tuberculosis susceptibility in genetically diverse mice reveals functional diversity of neutrophils
2025-Sep-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102441
PMID:40937719
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研究论文 | 本研究利用19种地理来源多样的野生近交系小鼠,探索结核病易感性的功能多样性,特别是中性粒细胞的作用 | 发现野生来源小鼠对结核分枝杆菌感染的异质性免疫反应,识别出与感染控制失败相关的新型中性粒细胞特征 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类转化的适用性有待验证 | 探究结核病易感性的遗传和免疫机制 | 19种野生来源近交系小鼠 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19种小鼠品系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1283 | 2025-10-05 |
The citrullinating enzyme PADI4 governs progenitor cell proliferation and translation in developing hair follicles
2025-Sep-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx4511
PMID:40938992
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研究论文 | 本研究揭示了瓜氨酸化酶PADI4通过调控翻译抑制因子4E-BP1影响毛囊发育过程中祖细胞增殖和翻译的分子机制 | 首次阐明PADI4通过瓜氨酸化翻译抑制因子4E-BP1并与其磷酸化形成交叉对话,调控毛囊祖细胞状态转换的新机制 | 研究主要聚焦于毛囊发育模型,在其他组织或病理状态下的普适性仍需验证 | 探究翻译后修饰在组织形成过程中调控祖细胞状态转换的分子机制 | 小鼠毛囊发育过程中的祖细胞和分化细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1284 | 2025-10-05 |
CLL to Richter syndrome: Integrating network strategies with experiments elucidating disease drivers and personalized therapies
2025-Sep-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu7705
PMID:40938978
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研究论文 | 本研究通过整合数学逻辑建模与实验数据,建立了首个慢性淋巴细胞白血病向Richter综合征转化的动态计算模型 | 开发了首个疾病转化的计算机动态模型,整合数学建模与多组学实验数据识别疾病驱动因素 | 动物模型和细胞系资源有限,可能影响转化机制的全面理解 | 研究慢性淋巴细胞白血病向Richter综合征转化的机制并探索个性化治疗靶点 | 慢性淋巴细胞白血病患者、Richter综合征患者、FFPE组织样本 | 计算生物学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、数学逻辑建模 | 动态计算模型 | 单细胞RNA测序数据、FFPE组织数据 | CLL/RS患者FFPE组织队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1285 | 2025-10-05 |
Potential modulation of microglial ferroptosis by Linggui Zhugan decoction in Alzheimer's disease through IL-17 and TNF pathways
2025-Sep-12, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115489
PMID:40945030
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研究论文 | 探讨苓桂术甘汤通过IL-17和TNF通路调节阿尔茨海默病中小胶质细胞铁死亡的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学研究传统中药复方对阿尔茨海默病铁死亡的调节作用 | 研究结果仅显示相关性,需要进一步机制验证以确定因果关系 | 探究苓桂术甘汤对阿尔茨海默病中小胶质细胞铁死亡的调节作用 | AD模型小鼠和Aβ1-42处理的小胶质细胞 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 体外实验 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | AD模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1286 | 2025-10-05 |
Targeting CD161 inhibitory receptors enhances NK cell-mediated changes in synovial fibroblast function in rheumatoid arthritis
2025-Sep-12, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115528
PMID:40945032
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研究论文 | 本研究探讨CD161抑制性受体在类风湿关节炎中的作用机制及其治疗潜力 | 首次系统揭示CD161在RA滑膜NK细胞中的特异性过表达及其通过IFN-γ和PI3K-AKT通路调控FLS功能的机制 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验,需要更多临床验证 | 探究CD161在类风湿关节炎发病机制中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 类风湿关节炎患者样本、胶原诱导关节炎模型、NK细胞系、成纤维样滑膜细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | RNA测序,单细胞RNA测序,全基因组测序,细胞共培养 | NA | 基因表达数据,临床数据,细胞功能数据 | 未明确具体样本数量,包含RA患者样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
1287 | 2025-10-05 |
A comprehensive single-cell atlas of three centenarian cohorts unveils unique natural killer cell signatures and enhanced mutual interactions among peripheral immune cells
2025-Sep-12, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105922
PMID:40945050
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研究论文 | 通过单细胞技术分析三个百岁老人队列的外周免疫细胞特征,揭示自然杀伤细胞的独特年轻化特征和增强的细胞间相互作用 | 首次整合多个百岁老人队列的单细胞数据,系统揭示NK细胞年轻化特征及其与T细胞增强的互作机制 | 样本量相对有限,且来自特定地理区域(中国临高县) | 研究百岁老人群体的免疫特征与健康衰老的关系 | 百岁老人(CENs)、其子女(COs)及对照人群(CTs)的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱流式细胞术、流式细胞术分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 总共74个样本(31名百岁老人、17名子女、26名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1288 | 2025-10-05 |
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Sep-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.009
PMID:40945518
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析慢性鼻窦炎患者鼻上皮组织,揭示鼻息肉形成过程中的免疫-上皮相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示鼻息肉形成过程中巨噬细胞-嗜酸性粒细胞募集、T细胞失调和肥大细胞富集等关键免疫-上皮相互作用机制 | 研究样本量有限,主要关注转录组层面,缺乏蛋白质水平验证 | 解析慢性鼻窦炎鼻息肉形成的分子机制和细胞相互作用 | 慢性鼻窦炎患者(伴或不伴鼻息肉)及对照组的鼻上皮组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过100名慢性鼻窦炎患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1289 | 2025-10-05 |
Lead binds HIF-1α contributing to depression-like behaviour through modulating mitochondria-associated astrocyte ferroptosis
2025-Sep-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08824-z
PMID:40935814
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研究论文 | 本研究揭示了铅通过结合HIF-1α诱导星形胶质细胞铁死亡,导致抑郁样行为的分子机制 | 首次发现铅离子直接结合HIF-1α蛋白的脯氨酸羟基化位点,稳定其结构并促进核转位,进而通过VDAC1调控线粒体功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究铅暴露导致抑郁样行为的分子机制 | 小鼠脑组织星形胶质细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,计算模型,实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1290 | 2025-10-05 |
Identification of CD159A as a prognostic and immune biomarker in kidney renal clear cell carcinoma
2025-Sep-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18515-8
PMID:40935873
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定CD159A作为肾透明细胞癌的预后和免疫生物标志物 | 首次系统揭示CD159A在KIRC中的免疫检查点功能及其与NK/CD8 T细胞浸润的关联 | 研究样本主要基于TCGA数据库和单一验证队列,需要更多独立队列验证 | 探讨CD159A在肾透明细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析,qRT-PCR,免疫组化,单细胞RNA测序,流式细胞术 | 机器学习分析 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库样本和湘雅KIRC验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1291 | 2025-10-05 |
Targeting CIRP and IL-6R-mediated microglial inflammation to improve outcomes in intracerebral hemorrhage
2025-Sep-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.012
PMID:40934970
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研究论文 | 本研究探讨神经元来源的CIRP通过IL-6R激活小胶质细胞炎症的机制,并开发靶向肽抑制剂改善脑出血预后 | 首次揭示CIRP通过IL-6R/STAT3通路驱动小胶质细胞炎症的机制,并开发了双靶点肽抑制剂TCC | 动物模型与人类疾病存在差异,临床转化需要进一步验证 | 阐明CIRP在脑出血后神经炎症中的作用机制并开发治疗策略 | 大鼠脑出血模型、小鼠基因敲除模型、人类脑出血患者、体外氧糖剥夺模型 | 神经科学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序,基因敲除,肽抑制剂设计 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,行为学数据,影像学数据 | 未明确具体样本数量(包含动物模型和人类患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1292 | 2025-10-05 |
METTL3 promotes ovarian cancer progression through YTHDF2-dependent degradation of GATA4
2025-Sep-09, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156224
PMID:40945198
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研究论文 | 本研究揭示了METTL3通过YTHDF2介导的GATA4降解促进卵巢癌进展的分子机制 | 首次发现METTL3-YTHDF2调控轴通过m6A修饰促进肿瘤抑制因子GATA4 mRNA降解的新机制 | 未明确METTL3在其他类型细胞中的具体作用机制 | 阐明m6A修饰在卵巢癌进展中的分子调控机制 | 卵巢癌细胞及肿瘤微环境中的颗粒细胞、成纤维细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 药理学抑制 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1293 | 2025-10-05 |
OmnibusX: A unified platform for accessible multi-omics analysis
2025-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013480
PMID:40920823
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研究论文 | 介绍OmnibusX——一个集成化、注重隐私的统一平台,用于简化多组学数据分析 | 将碎片化的分析工具整合为统一平台,提供代码免费的多组学数据分析,具有高精度细胞类型预测引擎和交互式绘图编辑器 | NA | 降低多组学数据分析的技术门槛,提高研究可重复性 | 多组学数据分析平台 | 生物信息学 | NA | 多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, spatial transcriptomics | OmnibusX | 集成Scanpy、DESeq2、SciPy、scikit-learn等开源工具的桌面应用和企业版服务器部署 |
1294 | 2025-10-05 |
Cytotoxic CX3CR1+ Vδ1 T cells clonally expand in an interplay of CMV, microbiota, and HIV-1 persistence in people on antiretroviral therapy
2025-Sep, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013489
PMID:40920867
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研究论文 | 本研究揭示了HIV-1感染者中Vδ1 γδ T细胞的克隆扩增机制及其与CMV、微生物组和HIV-1病毒库控制的关联 | 首次在单细胞水平系统解析HIV-1感染者Vδ1 T细胞的表型、功能、转录组和受体库特征,并阐明其与CMV、微生物组的相互作用 | 样本量有限(15名HIV-1感染者和15名对照),仅关注十二指肠和血液样本 | 探究HIV-1感染者Vδ1 T细胞的扩增机制及其在控制HIV-1病毒库中的作用 | HIV-1感染者和HIV血清阴性对照者的血液和十二指肠上皮内淋巴细胞 | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序,表型分析,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 | 30人(15名HIV-1感染者,15名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1295 | 2025-10-05 |
Repopulating Microglia Suppress Peripheral Immune Cell Infiltration to Promote Poststroke Recovery
2025-Sep, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70565
PMID:40931631
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研究论文 | 本研究探讨通过PLX5622短暂清除后再增殖的小胶质细胞如何通过抑制外周免疫细胞浸润促进脑卒中后神经功能恢复 | 首次采用小胶质细胞清除-再增殖范式,证明再增殖小胶质细胞通过重塑免疫微环境促进卒中后恢复 | 研究仅关注急性期干预效果,长期效果和临床转化潜力需进一步验证 | 开发同时抑制有害炎症级联反应和促进神经修复过程的创新治疗策略 | 缺血性脑卒中后的小胶质细胞和免疫微环境 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组学, 行为学测试, 细胞因子阵列, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 行为学数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1296 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironments in HPV-associated penile squamous cell carcinoma
2025-Sep, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf013
PMID:40936798
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HPV相关阴茎鳞状细胞癌中独特的肿瘤微环境特征 | 首次在单细胞水平系统描绘阴茎鳞状细胞癌的肿瘤微环境,并揭示HPV阳性与阴性肿瘤在免疫细胞组成和功能状态上的显著差异 | 样本量相对较小(11例患者),且仅分析了初治患者 | 阐明HPV状态对阴茎鳞状细胞癌肿瘤微环境的影响机制 | 11例初治阴茎鳞状细胞癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 11例患者,共52,980个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1297 | 2025-10-05 |
Analysis of immune cell infiltration landscape and identification of diagnostic biomarkers in ankylosing spondylitis
2025-Sep, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0252297
PMID:40936943
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证鉴定强直性脊柱炎中免疫细胞相关诊断生物标志物 | 首次结合多种生物信息学方法和实验验证鉴定出CX3CR1等三个免疫细胞相关生物标志物在强直性脊柱炎中的诊断价值 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要更大规模临床样本验证 | 筛选和验证强直性脊柱炎中免疫细胞相关的诊断生物标志物 | 强直性脊柱炎患者和对照样本的基因表达数据 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 差异表达分析,免疫细胞浸润分析,WGCNA,ROC分析,RT-qPCR,免疫荧光染色,单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE25101,GSE41038,GSE73754,GSE194315) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
1298 | 2025-10-05 |
Plasma proteomic signature for preoperative prediction of microvascular invasion in HCC
2025-Sep, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101481
PMID:40823177
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析开发了用于术前预测肝细胞癌微血管侵犯风险的血液检测工具 | 首次发现TALDO1、PDIA3和PGK1三个血浆蛋白生物标志物,并建立了基于机器学习的PRIM预测模型 | 样本量相对有限(160例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发术前非侵入性预测肝细胞癌微血管侵犯的方法 | 肝细胞癌患者 | 生物医学 | 肝细胞癌 | 数据非依赖性采集质谱,单细胞RNA测序,ELISA | 机器学习模型 | 蛋白质组数据,RNA测序数据 | 160例HCC患者(80例MVI阳性,80例MVI阴性),来自四个医疗中心 | NA | 质谱分析,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1299 | 2025-10-05 |
Deciphering tryptophan metabolism in colorectal cancer through multi-omics analysis
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102157
PMID:40836965
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研究论文 | 通过多组学分析揭示色氨酸代谢在结直肠癌中的关键作用及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 整合非靶向代谢组学、靶向代谢组学和单细胞RNA测序数据,首次系统阐明色氨酸代谢在结直肠癌中的调控机制及其与M2巨噬细胞极化的直接因果关系 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要进一步的前瞻性研究验证临床适用性 | 探究色氨酸代谢在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌组织及配对癌旁组织 | 多组学分析 | 结直肠癌 | 非靶向代谢组学, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 多种机器学习算法 | 代谢组数据, 转录组数据 | 多个独立队列的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
1300 | 2025-10-05 |
Ginsenoside Rb1 attenuates coronary microvascular inflammatory injury via NDUFS4-SIRT5-DUSP1-mediated mitochondrial quality control in a murine ischemia-reperfusion model
2025-Sep, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2025.04.006
PMID:40843019
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研究论文 | 本研究探讨人参皂苷Rb1通过NDUFS4-SIRT5-DUSP1轴调控线粒体质量控制网络,减轻小鼠缺血再灌注模型中冠状动脉微血管炎性损伤的分子机制 | 首次揭示人参皂苷Rb1通过NDUFS4-SIRT5-DUSP1信号轴调控线粒体质量控制网络在冠状动脉疾病中的保护作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究人参皂苷Rb1在缺血再灌注损伤中对内皮细胞的保护作用机制 | 小鼠模型(SIRT5CKO/TG和NDUFS4CKO/TG)、细胞模型(Si-DUSP-1/ad-DUSP-1和si-SIRT5/ad-SIRT5) | 分子生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞转录组测序、基因修饰技术、荧光检测、线粒体膜电位测定、RT-PCR、Western blotting | 基因敲除/过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |