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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2026-05-01 |
The landscape of B and plasma cells in breast cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00917-0
PMID:41820356
|
研究论文 | 通过整合公开单细胞RNA测序数据和新生成的79份样本单细胞测序数据,构建了乳腺癌中B细胞和浆细胞的高分辨率图谱,揭示了其异质性和功能多样性 | 首次在乳腺癌中识别出两种肿瘤富集的B细胞亚群——CD200初始B细胞和ISG15非典型记忆B细胞,并验证了CD200 B细胞在抗肿瘤免疫和免疫检查点阻断治疗中的关键作用 | 未提及 | 解析乳腺癌中B细胞和浆细胞的异质性及其功能角色,探索其作为免疫治疗生物标志物和靶点的潜力 | 35名乳腺癌患者的79份样本(B细胞和浆细胞) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、BCR序列数据、空间转录组学数据 | 35名患者共79份样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 1282 | 2026-05-01 |
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00915-2
PMID:41820369
|
研究论文 | 提出一个结合多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新框架,用于生成高质量、无标记、与苏木精-伊红染色等效的乳腺癌病理图像 | 通过引入显著性和全局特征一致性损失增强CycleGAN,实现无需像素级配准的非配对数据虚拟染色,且为非破坏性方法,同一组织切片可后续用于单细胞RNA测序或空间转录组学 | 未提及具体局限性 | 开发快速、非破坏性的诊断级乳腺癌病理图像生成方法,用于临床诊断和机制研究 | 临床样本、小鼠模型和类器官共培养样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 多光谱自发荧光成像 | CycleGAN | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1283 | 2026-05-01 |
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06937-6
PMID:41820393
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研究论文 | 介绍了一个整合空间转录组学与H&E组织学图像的多组织数据集STHELAR,用于细胞类型注释 | 首次构建了包含16种组织类型、超过1100万个细胞的大规模多组织空间转录组数据集,并关联了H&E全切片图像,为直接从组织学图像预测细胞类型提供了参考资源 | 未提及具体限制,但可能存在数据来源于特定平台(Xenium FFPE)和细胞类别为十种泛癌类别的泛化局限性 | 通过整合空间转录组学与组织学图像,开发用于细胞类型注释的大规模数据集,以促进肿瘤微环境研究 | 来自22名癌症患者和9名非癌症患者的31个人类Xenium FFPE组织切片,涵盖16种组织类型 | 数字病理学, 空间转录组学 | 肿瘤(泛癌) | 空间转录组学, H&E染色 | 人工智能模型(用于从组织学图像预测细胞类型注释) | 图像, 基因表达数据 | 31个组织切片,来自31名患者(22例癌症,9例非癌症),包含超过1100万个细胞和50万个组织图像块 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium FFPE组织切片 |
| 1284 | 2026-05-01 |
Low-dose chemotherapy remodels hepatic immune landscape and potentiates antitumor response to immune checkpoint blockade in cholangiocarcinoma
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001735
PMID:41779955
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研究论文 | 该研究探索低剂量吉西他滨/顺铂联合抗PD-L1治疗肝内胆管癌的疗效和机制 | 首次揭示低剂量化疗通过重塑肝内免疫景观并解除SPP1-VLA-4信号轴对CD8+T细胞的抑制,增强抗PD-L1免疫治疗的抗肿瘤应答 | 尚未明确低剂量化疗在不同肝内胆管癌亚型中的效果差异及长期疗效数据 | 优化肝内胆管癌治疗策略,降低化疗毒性并提高免疫治疗疗效 | 多种肝内胆管癌小鼠模型及患者来源的肿瘤组织和临床样本 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体内/体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多种小鼠模型及部分肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1285 | 2026-05-01 |
A tumor-promoting inflammatory SPP1+ macrophage-IL-6-CRP axis drives immune dysfunction in bladder cancer
2026-Feb-27, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1774
PMID:41747249
|
研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中SPP1+巨噬细胞通过IL-6-CRP轴驱动免疫功能障碍的促炎机制 | 首次将全身性炎症标志物(IL-6/CRP)与肿瘤微环境中的SPP1+巨噬细胞免疫抑制功能直接关联,并定义了驱动免疫检查点阻断治疗耐药的巨噬细胞轴 | 未明确说明样本量大小及队列种族多样性,且因果验证主要依赖相关性分析和功能实验,缺乏更直接的体内干预证据 | 探究膀胱癌中全身性炎症与肿瘤微环境免疫功能障碍的关联机制 | 接受免疫检查点阻断治疗的膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序平台,Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 1286 | 2026-05-01 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-02-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
|
综述 | 综述空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展,揭示其在理解疾病机制和开发治疗策略中的潜力 | 系统整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学在肺纤维化研究中的最新成果,强调其保留组织空间上下文的高通量分析能力 | 未提及具体样本量和跨平台验证等方面的局限性 | 探讨空间组学技术如何推动肺纤维化精准诊断、治疗靶点发现和药物开发 | 肺纤维化疾病,特别是特发性肺纤维化的组织微环境 | 数字病理学 | 肺纤维化、特发性肺纤维化 | 空间代谢组学、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 图像、分子数据 | NA | NA | 空间代谢组学、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1287 | 2026-05-01 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
|
研究论文 | 结合功能性ADCC检测和单细胞转录组学,分析COVID-19患者外周NK细胞中干扰素刺激和NKG2D表达对抗体依赖性细胞毒作用的增强机制 | 首次通过单细胞转录组学揭示高ADCC反应与低ADCC反应NK细胞的不同转录程序,发现干扰素刺激基因和NKG2D的高表达与ADCC增强相关,同时发现干扰素介导的NK细胞激活与抗体ADCC能力降低之间存在矛盾调节机制 | 未提供具体的限制信息 | 探究NK细胞内在因素和抗体在介导抗病毒ADCC反应中的相对贡献,揭示其分子决定因素 | COVID-19患者的外周NK细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19参与者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1288 | 2026-05-01 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态变化中的作用 | 首次揭示Hspa8通过调节中性粒细胞浸润和活性氧产生来缓解缺血性脑损伤的免疫机制 | 未提及具体局限性 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤后免疫炎症反应中的调节作用 | 缺血性脑损伤模型中的T细胞、中性粒细胞和单核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1289 | 2026-05-01 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
|
研究论文 | 研究核酸代谢相关基因在三阴性乳腺癌中的表达模式及其对预后和免疫浸润的影响 | 首次发现PDE8B作为癌基因通过促进上皮-间充质转化诱导三阴性乳腺癌转移,并通过单细胞RNA测序揭示核酸代谢和同源重组修复缺陷对耗竭CD8 T细胞的独特作用 | 未提及 | 探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用及其对预后和免疫微环境的影响 | 三阴性乳腺癌肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据 | 297个三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1290 | 2026-05-01 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
|
研究论文 | 该研究探讨了巨噬细胞中逆转录转座子表达与狼疮之间的关系,发现MTD逆转录转座子在ROS缺陷的狼疮易感小鼠中表达增加,并可通过调节T细胞活化和减轻巨噬细胞浸润来影响疾病进程 | 首次揭示MTD逆转录转座子在ROS缺陷条件下促进巨噬细胞扩增和激活,进而驱动狼疮早期发病的机制,并发现霉酚酸酯治疗可降低其表达 | 研究仅限于小鼠模型,未在人体样本中进行验证 | 阐明NCF1基因变异导致ROS缺陷与狼疮免疫失调之间的潜在机制 | ROS缺陷的狼疮易感lpr小鼠模型中的组织驻留巨噬细胞 | 机器学习 | 狼疮 | 批量RNA测序、流式细胞术、空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据、图像数据 | ROS缺陷的lpr小鼠(具体数量未提及) | NA | 批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1291 | 2026-05-01 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
|
研究论文 | 本研究利用时空转录组学揭示铁死亡及TFRC相关的免疫相互作用在缺血再灌注急性肾损伤中的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析铁死亡相关基因在AKI中的空间分布及其与免疫细胞的相互作用,并识别TFRC作为潜在治疗靶点 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中验证;未详细探讨其他铁死亡相关基因的独立作用 | 探究急性肾损伤中铁死亡相关基因的表达、空间分布及免疫相互作用,寻找潜在治疗靶点 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾组织及细胞 | 机器学习,空间转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习,免疫荧光,共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1292 | 2026-05-01 |
Recruitment of CCR5+ inflammatory monocytes in pulmonary tissue contributes to acute lung injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00371-1
PMID:41444399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCR5+炎性单核细胞在肺组织中的募集促进急性肺损伤,并揭示CCR5阻断通过调节自噬缓解损伤 | 首次在深低温停循环诱导的大鼠急性肺损伤模型中,通过单细胞RNA测序鉴定出CCR5高表达的促炎性CD43单核细胞亚群选择性扩增,并证实CCR5药物阻断可同时降低CCR5表达、减轻肺损伤和抑制自噬,揭示CCR5和自噬之间的新型调控关系 | 主要基于大鼠模型,结果向临床转化需进一步验证;未深入探讨CCR5调控自噬的具体分子机制 | 探究深低温停循环后急性肺损伤中单核细胞的亚群变化及CCR5的作用机制 | 健康大鼠与深低温停循环处理后大鼠的肺组织细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织细胞,具体样本量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1293 | 2026-05-01 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68257-4
PMID:41519914
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定转录因子HHEX在肾上腺皮质束状带中的高表达,揭示其通过调控雄激素信号和胆固醇酯维持糖皮质激素水平,并保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭 | 首次发现HHEX作为雄激素受体靶基因,通过抑制雌性转录程序来塑造肾上腺性二态性,同时保护脂滴免于雄激素诱导的脂自噬,并揭示HHEX对最内层肾上腺皮质细胞亚群身份维持的多功能调控作用 | 未提及人类样本验证及长期代谢表型分析 | 解析肾上腺皮质束状带细胞异质性和适应性重塑的分子机制,阐明HHEX维持糖皮质激素稳态的调控通路 | Sf1-Cre; Rosa报告基因小鼠的肾上腺皮质细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | Sf1-Cre; Rosa报告小鼠的肾上腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1294 | 2026-05-01 |
Single-cell multimodal analysis reveals the dynamic immunopathogenesis of HBV-ACLF progression
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333308
PMID:40841166
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研究论文 | 单细胞多模态分析揭示HBV-ACLF进展的动态免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学纵向多组学分析,绘制HBV-ACLF病程中免疫应答的动态轨迹,并识别出具有疾病预后和治疗指导价值的免疫细胞模块 | 未提及具体限制 | 全面描绘HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)疾病过程中免疫应答的动态演变 | 45份住院患者(进展/稳定/恢复期HBV-ACLF各6/5/6例)和15例对照(肝硬化、慢性乙肝、健康对照各5例)的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病, HBV-ACLF | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞蛋白质组数据 | 45份样本(17例患者)和15例对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组学 |
| 1295 | 2026-05-01 |
The 2026 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1427
PMID:41431842
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评论 | 介绍2026年《核酸研究》数据库专刊内容及在线分子生物学数据库合集更新 | 专刊包含首个突破性论文JoGo,覆盖层级命名和背景化的人类单倍型,以及So3D提供真正三维空间转录组学数据 | 未提及具体研究局限性 | 总结和推广分子生物学数据库领域的新资源和更新 | 核酸、蛋白质结构、结构域和家族、酶、蛋白质组、人类单倍型、空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 三维空间转录组学 | NA | 数据库 | NA | NA | 三维空间转录组学 | NA | NA |
| 1296 | 2026-05-01 |
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697241
PMID:41509433
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示睾酮治疗与人类乳腺激素信号减少之间的关联 | 首次利用单细胞RNA测序比较接受睾酮替代疗法的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织,发现睾酮治疗显著降低雌激素信号通路基因表达,提出睾酮可能通过抑制雌激素信号发挥保护作用 | 研究样本量有限,未深入探讨睾酮治疗对乳腺长期安全性及癌症风险的具体机制 | 探究睾酮替代疗法对人类乳腺生物学的影响及其对激素信号通路的调控 | 接受睾酮替代疗法的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人口统计学匹配队列的顺性别女性和接受TRT的跨性别男性乳腺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1297 | 2026-05-01 |
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101656
PMID:41047099
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研究论文 | 该研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与上皮代谢特征改变的关系 | 首次揭示GLP-1+细胞减少是肠道炎症的普遍特征,并发现其与上皮细胞代谢重编程相关,而非仅因功能受损 | 尚未明确GLP-1+细胞减少的具体分子机制及因果关系;人类数据仅来自Crohn病患者,未涵盖其他IBD亚型 | 探究肠内分泌细胞特别是GLP-1+细胞在肠道炎症中的作用机制 | 肠内分泌细胞(EECs)中的L细胞及GLP-1+细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织切片 | 4种小鼠炎症模型、IL-10缺乏小鼠、ClpPΔIEC小鼠、人类Crohn病患者黏膜活检、人类及小鼠肠道类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台(具体产品未在摘要中明确) |
| 1298 | 2026-05-01 |
Integrative single-cell and bulk RNA sequencing unravels the role of ACTN1 in promoting lung cancer with brain metastasis and epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor resistance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1738641
PMID:42058147
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序揭示ACTN1在促进肺癌脑转移及EGFR-TKI耐药中的作用 | 首次通过整合scRNA-seq和批量RNA测序构建肺癌脑转移微环境图谱,并识别出ACTN1+上皮细胞亚群与EGFR-TKI耐药和脑转移的关联 | 基于公开数据集,可能未完全涵盖所有患者异质性;体外实验需进一步在体内模型中验证 | 探讨ACTN1在肺癌脑转移和EGFR-TKI耐药中的功能及机制 | 肺癌脑转移病灶中的肿瘤微环境细胞及EGFR-TKI耐药的肺癌细胞系 | 数字病理学,机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 整合公开的scRNA-seq数据集及细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1299 | 2026-05-01 |
LGMN+ macrophage promotes the formation of a tumor-supportive microenvironment in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1810794
PMID:42058204
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研究论文 | 发现LGMN+巨噬细胞通过促进血管生成和建立免疫抑制微环境驱动胃癌进展 | 通过单细胞RNA测序揭示LGMN+巨噬细胞在胃癌中的富集及其与不良预后的关联,并利用巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠证实其促癌机制 | NA | 评估LGMN+巨噬细胞对胃癌进展的影响并阐明其潜在机制 | 胃癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 公共数据库中的胃癌样本及巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 1300 | 2026-05-01 |
The AhR-TLR4 axis in non-IgE-mediated Cow's milk allergy: a systematic review with integrated multi-omics corroboration
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1789143
PMID:42058623
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系统综述 | 系统综述结合多组学验证,探究非IgE介导的牛奶蛋白过敏中AhR-TLR4轴的作用及相关生物标志物和治疗策略 | 首次通过系统综述与单细胞RNA测序数据的整合分析,阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中由肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并验证B/E比值作为早期风险分层标志物的潜力 | 纳入研究的异质性可能影响结论的普适性,单细胞RNA测序数据来源为公开数据集且样本量有限 | 阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并评估相关预测性生物标志物和潜在治疗方法 | 0-3岁经医生确诊的非IgE介导的牛奶蛋白过敏婴儿 | 机器学习和生物信息学 | 牛奶蛋白过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 39项研究汇总,单细胞RNA测序整合分析基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |