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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2026-06-02 |
Multi-omics integration and machine learning reveal gut-immune signatures in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from bulk RNA-seq, single-cell profiles, spatial transcriptomics, and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1730289
PMID:41939867
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研究论文 | 通过多组学整合和机器学习揭示特发性肺纤维化中的肠道-免疫特征，并实验验证关键基因表达 | 首次整合批量RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组及外周血多组学数据，结合孟德尔随机化分析证实肠道-免疫-肺轴在IPF中的因果作用，并利用药物特征反转预测潜在治疗药物 | 基于公共数据集分析，样本量有限；实验验证仅在部分模型中进行，缺乏大规模临床队列验证 | 阐明特发性肺纤维化中肠道-免疫-肺轴的分子机制，识别诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者及动物模型（TGF-β1刺激的成纤维细胞、博来霉素诱导小鼠）、患者血浆 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qPCR, ELISA, 孟德尔随机化 | CNN | 基因表达数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个公共数据集及实验样本（TGF-β1刺激成纤维细胞、博来霉素小鼠肺组织、患者血浆） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1282 | 2026-06-02 |
UVB-induced genotoxic stress activates the DNA damage response and innate immune pathways in sea urchin coelomocytes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1787989
PMID:41939874
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研究论文 | 利用紫海胆体腔细胞研究UVB诱导的基因毒性应激如何激活DNA损伤反应和先天免疫通路 | 首次在无脊椎后口动物（紫海胆）中揭示DNA损伤反应与先天免疫通路的同时诱导，为理解损伤识别系统进化提供分子框架 | 仅分析了UVB暴露后6小时的单细胞转录组，未涵盖更长时间点的动态变化 | 探究后口动物谱系中DNA损伤反应与先天免疫系统交互作用的祖先起源和多样性 | 紫海胆（Strongylocentrotus purpuratus）的免疫细胞（体腔细胞） | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | UVB暴露后6小时的紫海胆体腔细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1283 | 2026-06-02 |
Osteopontin from monocyte-derived dendritic cells mediates ozone-induced pulmonary responses in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1748667
PMID:41939905
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等方法发现，臭氧暴露诱导单核细胞来源树突状细胞产生骨桥蛋白，通过树突状细胞-中性粒细胞相互作用促进中性粒细胞性气道炎症 | 首次揭示单核细胞来源树突状细胞是臭氧暴露后骨桥蛋白的主要来源，并阐明其通过树突状细胞-中性粒细胞相互作用促进中性粒细胞性气道炎症的机制 | 骨桥蛋白中和对抗气道高反应性改善效果有限，且研究仅在雄性BALB/c小鼠中进行 | 探究骨桥蛋白在臭氧诱导的肺部反应中的作用及其机制 | 雄性BALB/c小鼠的肺部组织、支气管肺泡灌洗液和骨髓来源中性粒细胞 | 机器学习 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、RNA测序、CellChat分析 | NA | 基因表达数据 | 每组6-8只小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台 |
| 1284 | 2026-06-02 |
A copula-infused graph neural network for cell type classification in single-cell RNA sequencing data
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2026.01.010
PMID:41940310
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研究论文 | 提出了一种融合Copula理论的图神经网络（scCopulaGNN），用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 将Copula理论与图神经网络相结合，同时捕捉基因间的复杂依赖关系和细胞间的结构关系，以处理高维、稀疏和噪声的单细胞RNA测序数据 | 未在论文标题和摘要中明确说明研究局限性 | 开发一种有效的细胞类型分类方法，以更好地理解细胞异质性和生物学机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 包含真实数据集和模拟数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1285 | 2026-06-02 |
Aerobic Exercise-Induced TGF-β Receptor Reprogramming Disrupts Neutrophil-Microglia Crosstalk to Attenuate Early Brain Injury after Subarachnoid Hemorrhage
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1301
PMID:42221302
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研究论文 | 有氧运动通过TGF-β受体重编程破坏中性粒细胞-小胶质细胞相互作用，减轻蛛网膜下腔出血后早期脑损伤 | 首次发现Lrg1作为关键免疫介质，揭示有氧运动通过受体水平重编程调节中性粒细胞-小胶质细胞相互作用，进而减轻蛛网膜下腔出血后神经炎症的机制 | NA | 探究有氧运动减轻蛛网膜下腔出血后早期脑损伤的分子机制 | 小鼠蛛网膜下腔出血模型及原代中性粒细胞-小胶质细胞共培养系统 | machine learning | 蛛网膜下腔出血 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1286 | 2026-06-02 |
Meiotic gene variants contribute to recurrent blastulation failure
2026, Human reproduction open
IF:8.3Q1
DOI:10.1093/hropen/hoag039
PMID:42221552
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研究论文 | 本研究揭示了减数分裂基因变异导致复发囊胚形成障碍的遗传病因 | 首次发现双亲减数分裂基因变异是良好质量卵裂期胚胎复发囊胚形成障碍（R-GQBF）的未被充分认识的病因，并证实其导致配子来源的复杂非整倍体和胚胎基因组激活缺陷 | 无法直接评估卵母细胞染色体完整性，更大规模队列可能发现更多基因，需要动物模型功能研究验证基因型-表型关系 | 探究复发囊胚形成障碍，尤其是形态良好的卵裂期胚胎中该障碍的遗传病因 | 经历复发囊胚形成障碍的夫妇及其胚胎、精子样本 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | 全外显子测序（WES）、拷贝数变异（CNV）分析、单精子染色体分析、单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 97对夫妇（共109人，93名女性和16名男性）及103个发育阻滞胚胎、15个阻滞胚胎的单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1287 | 2026-06-02 |
Integrated Transcriptomics and Experimental Validation Reveal Müller Cell-Driven PANoptosis in Diabetic Retinopathy via PSAP-GPR37 Signaling
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S585908
PMID:42221844
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研究论文 | 综合转录组学与实验验证揭示Müller细胞通过PSAP-GPR37信号通路驱动糖尿病视网膜病变中的PANoptosis | 首次整合单细胞与批量转录组学，明确Müller细胞亚群通过PSAP-GPR37信号轴驱动糖尿病视网膜病变中PANoptosis的新型机制，并筛选出潜在的治疗靶点 | 结果主要基于动物模型和体外细胞实验，缺乏人体临床样本的直接验证，且未深入探讨其他细胞类型在PANoptosis中的交互作用 | 阐明Müller细胞在糖尿病视网膜病变中通过膜蛋白介导的PANoptosis及其亚群特异性机制 | 糖尿病视网膜病变模型大鼠、高糖处理视网膜Müller细胞（RMC-1） | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因集富集分析、细胞通讯分析、蛋白质相互作用网络构建 | NA | 基因表达数据 | 大鼠视网膜组织样本及体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1288 | 2026-06-02 |
Uromodulin as a genetically anchored biomarker stratifies time to valve intervention in aortic regurgitation
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1839906
PMID:42222106
|
研究论文 | 该研究通过英国生物银行数据发现，尿调素可作为主动脉瓣反流患者术前进展和手术时机的遗传锚定生物标志物，与传统肾脏标志物相比具有独立预测价值 | 首次将尿调素确定为遗传锚定的肾脏特异性生物标志物，将肾-主动脉瓣反流 paradigm 从术后风险修正转向基于肾小管驱动疾病进展的机制模型，为早期风险分层提供新依据 | 研究仅基于英国生物银行数据，可能限制通用性；未涉及更早期疾病阶段或更长的随访时间；单细胞数据源自公共数据库，缺乏患者特异性验证 | 探究肾脏生物标志物在主动脉瓣反流患者术前疾病进展中的关联，并评估尿调素作为生物标志物的潜力 | 英国生物银行中2,493名主动脉瓣反流患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | Cox比例风险模型、逻辑回归 | 临床影像数据、基因组学数据、单细胞RNA测序数据 | 2,493名主动脉瓣反流患者（来自英国生物银行） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 利用Kidney Cell Atlas公共数据库的单细胞RNA测序数据 |
| 1289 | 2026-06-02 |
Ferroptosis-pyroptosis crosstalk signature as prognostic biomarkers and therapeutic targets in sepsis-induced ARDS
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1810674
PMID:42222337
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研究论文 | 探讨铁死亡与焦亡交叉作用在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统分析铁死亡与焦亡通路在脓毒症相关ARDS中的交叉作用，并鉴定出10个交叉关键基因 | 未提及具体局限性 | 阐明铁死亡与焦亡交叉作用在脓毒症相关ARDS中的分子机制并验证其作为生物标志物的潜力 | 脓毒症和ARDS患者的基因表达数据及免疫细胞群体 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 定量PCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1290 | 2026-06-02 |
Genetic Loci Associated With Periodontitis: The FinnGen Study Based on National Health Registers
2025-09, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14193
PMID:40682483
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研究论文 | 利用FinnGen队列和全国健康登记数据，对牙周炎进行全基因组关联研究，识别出11个遗传位点 | 基于芬兰全国健康登记中的诊断和手术编码以及CPI指数设计三种牙周炎表型，并发现6个新的遗传位点 | 未在论文摘要中明确说明局限性 | 探索牙周炎的遗传因素及其与其他复杂性状的遗传相似性 | 近25万名芬兰公共医疗牙科就诊者 | 机器学习 | 牙周炎 | GWAS，单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据，单细胞RNA表达数据 | 约250,000名芬兰个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1291 | 2026-06-02 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
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综述 | 综述了基于图像的轮廓分析在计算领域的发展现状，包括当前程序、局限性及未来发展方向 | 系统梳理了深度学习对基于图像的轮廓分析的变革性影响，包括特征提取、可扩展性和多模态数据整合的改进 | 该领域仍面临显著挑战，需要创新解决方案 | 为研究人员提供基于图像的轮廓分析技术演进的路线图 | 基于图像的轮廓分析方法及其计算工具 | 计算机视觉 | NA | NA | 深度学习 | 显微图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1292 | 2026-06-02 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-03-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 通过X射线荧光显微镜和空间转录组学相结合的多模态方法，研究小鼠海马体中金属组基因表达与金属离子含量的相关性 | 首次将元素图谱与空间转录组学结合，揭示海马体关键亚区金属异质性的分子基础 | 文中未提及具体局限 | 揭示海马体神经金属组图谱的分子基础及其区域异质性机制 | 小鼠海马体及其亚区 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1293 | 2026-06-02 |
Dynamic Reprogramming of Stromal Pdgfra-expressing cells during WNT-Mediated Transformation of the Intestinal Epithelium
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634326
PMID:39896606
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研究论文 | 研究WNT介导的肠道上皮转化过程中基质Pdgfra表达细胞的动态重编程 | 首次揭示Pdgfra成纤维细胞在WNT驱动肿瘤发生早期分泌配体促进肠黏膜再生样状态 | 未明确说明 | 探究WNT介导的肠道肿瘤发生过程中基质成纤维细胞的动态变化及与上皮细胞的相互作用 | 小鼠肠道间充质细胞和上皮细胞 | 机器学习 | 肠道肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1294 | 2026-06-02 |
Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586
PMID:40196108
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研究论文 | 本研究探究糖皮质激素受体激活通过下调Pparg和Gata3抑制血吸虫病中Th2免疫反应的机制 | 首次整合RNA测序和单细胞测序揭示GR激活通过下调关键转录因子Gata3和Pparg抑制血吸虫病Th2免疫反应的分子机制 | 需要进一步研究评估靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性 | 探究GR激活对血吸虫病肝脏Th2免疫反应的影响及其分子机制 | 日本血吸虫感染小鼠模型和Th2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 血吸虫病 | RNA测序，单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 感染日本血吸虫的小鼠及体外培养的Th2细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1295 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用，特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应，提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章，说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展，并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1296 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型，用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇，引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应，同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1297 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型，通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析，以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱，避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法，以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 1298 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积，识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据，系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集（GSE119409、GSE35452、GSE45404） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1299 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达，并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1300 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应，首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路，为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；仅分析了顺铂损伤后72小时时间点，未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞（顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型）及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本（顺铂损伤组和对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |