单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2025-04-20 |
Integrative transcriptome profiling elucidates molecular and immunovascular characteristics of macrotrabecular HCC
2025-Feb-26, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001284
PMID:40009602
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research paper | 该研究通过整合大规模bulk和单细胞RNA测序数据，阐明了肝癌（HCC）中一种侵袭性亚型（macrotrabecular HCC）的分子和免疫血管特征 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肝癌细胞的不同亚群及其特征，发现了p53和MYC在侵袭性肝癌中的关键作用，并提出了针对肿瘤血管和免疫检查点的联合治疗策略 | 研究样本量相对有限，且主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 阐明肝癌侵袭性亚型的分子机制和肿瘤微环境特征，探索潜在治疗策略 | 肝癌细胞及其微环境 | digital pathology | liver cancer | scRNA-seq, bulk RNA-seq | syngeneic mouse model | RNA sequencing data | 228,564个活细胞（来自6个scRNA-seq数据集）和691个肿瘤样本（bulk RNA-seq分析） |
| 1282 | 2025-04-19 |
Editorial: Spatial transcriptome and single-cell sequencing for exploring molecular mechanisms of neuroimmunity and discovering novel markers of neurological diseases
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1582019
PMID:40248015
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1283 | 2025-04-20 |
Cancer-associated fibroblasts: multidimensional players in liver cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1454546
PMID:40248197
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review | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肝癌中的多维作用，特别是通过单细胞RNA测序技术揭示的不同CAF亚群在肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）发展中的具体功能和调控机制 | 利用先进的单细胞RNA测序技术（scRNAseq）结合多种基因工程小鼠模型，鉴定了肝癌前微环境（PME）和肿瘤微环境（TME）中多样的CAF亚群，深化了对各CAF亚群在癌症发展中具体作用的理解 | 不同研究针对靶向CAFs以干扰肿瘤进展的结果存在极大争议，表明CAFs的作用机制仍需进一步探索 | 阐明CAF亚群在不同病理生理条件下的作用和调控机制，以促进发现调节CAF活性的新治疗方法 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）中的亚群 | 肿瘤微环境研究 | 肝癌 | 单细胞RNA测序技术（scRNAseq） | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1284 | 2025-04-20 |
Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14804
PMID:38385817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了健康与炎症牙髓组织在伤口愈合过程中的转录组学变化 | 首次在牙髓伤口管理中应用单细胞RNA测序技术，揭示了炎症条件下细胞组成和基因表达的显著变化 | 样本量相对较小（50例患者），且仅关注了牙髓组织，未考虑其他口腔组织的影响 | 研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动态的复杂相互作用 | 健康与炎症状态的人类牙髓组织 | 数字病理 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 50例患者的牙髓组织样本 |
| 1285 | 2025-04-20 |
Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14768
PMID:38446012
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研究论文 | 本研究探讨了伤口愈合基因与粪便常规和血清肿瘤标志物在结直肠癌诊断和预后中的联合应用价值 | 结合粪便常规和血清肿瘤标志物提高了结直肠癌的诊断准确性，并探索了伤口愈合基因在疾病进展中的潜在作用 | 样本量较小（56例结直肠癌患者和56例健康对照） | 评估伤口愈合基因与粪便常规和血清肿瘤标志物在结直肠癌诊断和预后中的联合应用价值 | 结直肠癌患者和健康对照 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 临床信息、粪便样本、血清样本、RNA测序数据 | 56例结直肠癌患者和56例健康对照 |
| 1286 | 2025-04-20 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveals intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569494
PMID:38076932
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研究论文 | 介绍了一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法Perturb-FISH，用于研究单细胞水平的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与并行光学检测扩增的引导RNA相结合，揭示了细胞内、细胞间及功能转录回路 | NA | 开发一种新方法来研究空间和功能生物学的遗传和分子关联 | 培养的单核细胞和诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 分子生物学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、Perturb-FISH | NA | 转录组数据、光学成像数据 | NA |
| 1287 | 2025-04-20 |
Heterogeneity of human prostate carcinoma-associated fibroblasts implicates a role for subpopulations in myeloid cell recruitment
2020-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.23929
PMID:31763714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定了人类前列腺癌相关成纤维细胞（CAF）的异质性亚群，并探讨了这些亚群在肿瘤微环境中对髓系细胞招募的作用 | 首次在前列腺癌中通过单细胞RNA测序技术揭示了CAF的异质性亚群，并发现特定亚群通过分泌趋化因子CCL2和CXCL12促进髓系细胞招募 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步在人体组织中验证这些发现 | 探索前列腺癌相关成纤维细胞亚群的特征及其在肿瘤微环境中的功能 | 人类前列腺癌相关成纤维细胞（CAF）及其亚群 | 肿瘤微环境研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），贝叶斯分析，体外迁移实验 | 无特定模型（主要使用聚类分析） | 基因表达数据 | 3321个CAF细胞 |
| 1288 | 2025-04-19 |
OmniClust: A versatile clustering toolkit for single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.007
PMID:40057293
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research paper | 介绍了一个名为OmniClust的工具包，用于单细胞和空间转录组学数据的聚类分析 | 开发了一个整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的算法工具包，采用深度学习和机器学习算法进行特征学习和聚类 | 未提及具体局限性 | 开发一个适用于单细胞和空间转录组学数据的聚类工具 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, 空间转录组学 | 深度学习, 机器学习 | RNA测序数据 | 12个空间转录组学基准数据集和4个scRNA-seq基准数据集 |
| 1289 | 2025-04-19 |
Spatial proteomic landscape of primary and relapsed hepatocellular carcinoma reveals immune escape characteristics in early relapse
2025-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000979
PMID:38900411
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研究论文 | 通过空间蛋白质组学分析，揭示了原发性与复发性肝细胞癌的免疫逃逸特征 | 首次描绘了原发性与复发性HCC单细胞动态空间景观及多细胞结构，发现了一种与术后早期复发相关的新型树突状细胞亚群（PDL1+CD103+DCs） | 样本量相对有限（46例患者），外部验证队列规模未明确说明 | 探究肝细胞癌术后复发的空间分子结构变化机制 | 46例HCC患者的92份手术标本（原发与复发肿瘤） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 成像质谱流式细胞技术（IMC）、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 358,729个单细胞（来自46例患者的92份标本） |
| 1290 | 2025-04-19 |
Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia
2025-May, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了早发型子痫前期中胎盘合体滋养层细胞的衰老相关分泌表型及其在母血中的早期预测价值 | 首次发现早发型子痫前期胎盘合体滋养层细胞存在衰老相关分泌表型，并鉴定出PAI-1和activin A等可在妊娠早期预测疾病的生物标志物 | 研究样本量有限，且需要进一步验证这些标志物在更大规模人群中的预测效能 | 探索早发型子痫前期的发病机制并寻找早期预测标志物 | 人类母胎界面单位（胎儿绒毛和母体蜕膜） | 生殖医学 | 子痫前期 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 早发型子痫前期患者和健康对照的胎盘组织样本（具体数量未明确说明），来自多中心临床队列 |
| 1291 | 2025-02-23 |
Decoding cell-cell communication using spatial transcriptomics
2025-May, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00824-3
PMID:39984677
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1292 | 2025-04-19 |
Identification of the crucial roles of BAXhigh NK cells in human derived mesenchymal stem cell therapy for chronic heart failure patients
2025-May, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155924
PMID:40174277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，探讨了间充质干细胞治疗慢性心力衰竭患者中BAX高表达NK细胞的关键作用 | 首次发现BAX高表达NK细胞在心力衰竭发病机制中的作用，并揭示间充质干细胞通过抑制BAX表达改善NK细胞功能的机制 | 研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步实验验证 | 探究间充质干细胞治疗心力衰竭的分子机制 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 1293 | 2025-04-19 |
Identification of a cancer stem cell-like subpopulation that promotes HCC metastasis
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101302
PMID:40242316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，鉴定并表征了肝细胞癌（HCC）中促进转移的癌症干细胞样亚群 | 首次在HCC中发现并表征了一个促进转移的癌症干细胞样亚群，揭示了其通过ICAM1信号通路抑制抗肿瘤免疫的新机制 | 样本量相对较小（19例单细胞RNA测序和12例空间转录组学样本），需要更大规模研究验证 | 探索癌症干细胞在HCC转移中的作用机制 | 肝细胞癌（HCC）中的癌症干细胞样细胞 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学测序、生物信息学分析 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据 | 19例HCC患者的单细胞RNA测序数据和12例HCC患者的空间转录组数据 |
| 1294 | 2025-04-19 |
CRISPR/Cas9-mediated SHP-1-knockout T cells combined with simvastatin enhances anti-tumor activity in humanized-PDX HCC model
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112266
PMID:40241752
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术敲除SHP-1基因的CD8 T细胞，并结合辛伐他汀增强抗肿瘤活性，在人源化PDX肝癌模型中验证其效果 | 首次提出结合SHP-1靶向细胞疗法和代谢调节的双重策略来克服肝癌免疫治疗的耐药性 | 研究仅在人源化PDX模型中进行验证，尚未进行临床试验 | 增强肝癌免疫治疗的抗肿瘤活性 | 肝癌（HCC）和CD8 T细胞 | 癌症免疫治疗 | 肝癌 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | 人源化PDX模型 | 基因表达数据、细胞功能数据 | 肝癌患者的T细胞样本和人源化PDX模型 |
| 1295 | 2025-04-19 |
CXCR4+ PD-L1+ neutrophils are increased in non-survived septic mice
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112083
PMID:40241761
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析存活与未存活CLP脓毒症小鼠的免疫细胞，揭示未存活小鼠血液中未成熟CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞频率增加及其在肺部的积累 | 发现未存活脓毒症小鼠中CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞的增加及其与炎症和器官损伤的关联，并指出IFN-gamma在其中的作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床样本中验证 | 探讨中性粒细胞在脓毒症高炎症表型中的免疫学机制 | CLP脓毒症小鼠的免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 存活与未存活的CLP脓毒症小鼠 |
| 1296 | 2025-04-19 |
Identifying causal brain structures, genes and proteins for osteoarthritis: A large-scale genetic correlation study based on brain imaging-derived phenotypes, transcriptomes, and proteomes
2025-Apr-18, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf083
PMID:40247738
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research paper | 该研究通过整合脑成像衍生表型、转录组和蛋白质组数据，验证了脑结构与骨关节炎（OA）风险之间的相关性，并识别了关键因果基因 | 首次大规模整合脑结构、转录组和蛋白质组数据，揭示脑-关节轴在OA遗传学中的作用，并识别出与OA相关的特定脑区、基因和蛋白质 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制结果在其他人群中的普适性 | 验证脑结构与OA风险的遗传相关性，并识别关键因果基因和蛋白质 | 826,690名参与者的OA汇总统计数据，5,138个脑转录组和152个人脑蛋白质组 | 遗传学 | 骨关节炎 | LDSC、孟德尔随机化(MR)、TWAS、PWAS、单细胞RNA-Seq eQTL分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 826,690名参与者 |
| 1297 | 2025-04-19 |
CeiTEA: Adaptive Hierarchy of Single Cells with Topological Entropy
2025-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503539
PMID:40245302
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研究论文 | 介绍了一种基于拓扑熵的自适应层次聚类算法CeiTEA，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 结合了自底向上和自顶向下的策略，通过最小化拓扑熵构建多叉分割树，优化细胞类型间关系和多样性的表示 | 未提及算法在大规模数据集上的计算效率或可扩展性 | 解决现有聚类方法难以捕捉细胞类型和亚型复杂层次结构的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 生物信息学 | 肿瘤异质性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 自适应层次聚类算法 | 基因表达数据 | 模拟和真实世界的scRNA-seq数据集 |
| 1298 | 2025-04-19 |
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Apr-17, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03015-3
PMID:40246985
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research paper | 本研究探讨了中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）在Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗晚期胃癌中的预后价值，并阐明了治疗抵抗的分子机制 | 首次发现循环中性粒细胞亚群（NE-3）与疾病进展相关，并揭示了其通过表达促肿瘤因子（如MMP-9）和IL-17信号通路富集介导治疗抵抗的机制 | 需要进一步验证并探索减轻中性粒细胞诱导的免疫抑制的策略 | 评估NLR在CAR-T细胞治疗中的预后价值并阐明治疗抵抗的分子机制 | 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者 | digital pathology | gastric cancer | single-cell RNA sequencing | NA | clinical data, RNA sequencing data | 未明确提及具体样本数量，但涉及接受CAR-T细胞治疗的胃癌患者 |
| 1299 | 2025-04-19 |
Circular RNA discovery with emerging sequencing and deep learning technologies
2025-Apr-17, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02157-7
PMID:40247051
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review | 本文综述了环状RNA（circRNA）的发现、特征及功能分析算法的最新突破 | 结合长读长和单细胞RNA测序技术与深度学习算法，革命性地提高了circRNA研究的解析度和规模 | 整合大规模circRNA测序数据仍面临挑战 | 探索circRNA在基因调控和疾病发病机制中的作用 | circRNA及其在生物医学应用中的潜力 | 自然语言处理 | NA | 长读长和单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA |
| 1300 | 2025-04-19 |
Progranulin deficiency in the brain: the interplay between neuronal and non-neuronal cells
2025-Apr-16, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-025-00475-8
PMID:40234992
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综述 | 本文综述了脑内颗粒蛋白前体（PGRN）缺乏的临床表型及其在额颞叶痴呆（FTD）中的作用，探讨了神经元与非神经元细胞之间的相互作用 | 强调了PGRN缺乏在多种细胞类型中的特异性表现及其对神经退行性变的影响，特别是脂滴积累的小胶质细胞和髓鞘脂质含量的改变 | 综述性文章，未提出新的实验数据，主要基于现有研究的总结和分析 | 探讨PGRN缺乏如何通过神经元与非神经元细胞的相互作用导致神经退行性变和神经炎症 | 神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞、内皮细胞和周细胞 | 神经科学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学、诱导多能干细胞技术 | NA | 患者脑组织、生物流体数据 | NA |