单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30851 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2025-08-02 |
Glucokinase activators contribute to gastrointestinal disease risks through metabolic-immune interplay in the gut-liver axis: insights from a multi-omics study
2025-Aug-01, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02571-7
PMID:40748365
|
研究论文 | 本研究探讨了葡萄糖激酶激活剂（GKAs）通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的影响 | 揭示了GK-GKRP解离通过代谢-免疫互作增加IBD和MASLD风险的机制，并识别了关键介质和细胞间通讯信号 | 研究基于遗传变异作为代理，可能无法完全反映药物直接作用 | 探究两种GK激活方式对胃肠道疾病的差异化影响机制 | 葡萄糖激酶激活剂（GKAs）及其对胃肠道疾病的影响 | 代谢组学与免疫学 | 炎症性肠病（IBD）和代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 孟德尔随机化、多组学分析（包括scRNA-seq和Cellchat） | NA | 遗传变异数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA（基于公开数据库的遗传和组学数据） |
| 1282 | 2025-08-01 |
Pan-cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Jul-31, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3595
PMID:40742316
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研究论文 | 通过整合33种癌症类型中超过2500个样本的单细胞RNA测序数据，建立了人类树突状细胞（DCs）的全面蓝图，揭示了肿瘤浸润DCs的异质性及其功能潜力 | 发现了肿瘤中罕见的DCs亚群（如AXL+SIGLEC6+ DCs和Langerhans细胞样DCs），并展示了它们的功能潜力及其转录组特征，同时开发了机器学习模型以指导DCs注释 | 研究主要基于计算分析，需要进一步的实验验证来确认DCs亚群的功能及其在免疫治疗中的应用潜力 | 探索肿瘤微环境中DCs的异质性及其在抗肿瘤免疫中的作用，为开发基于DCs的免疫疗法提供见解 | 肿瘤浸润的树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 超过2500个样本，涵盖33种癌症类型 |
| 1283 | 2025-08-01 |
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Jul-31, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02557-5
PMID:40742465
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析，识别并验证了三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 | 首次将三羧酸循环相关基因作为糖尿病肾病的诊断生物标志物进行研究，并构建了诊断模型 | 研究依赖于公开数据集，未进行独立队列验证 | 探索三羧酸循环相关基因在糖尿病肾病诊断中的潜力 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单样本基因集富集分析(ssGSEA), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE131882和GSE30122数据集中的样本 |
| 1284 | 2025-07-31 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
|
研究论文 | 通过整合转录组分析，研究结直肠癌中的干细胞景观并鉴定与干性相关的基因ENY2 | 首次通过单细胞转录组数据整合分析，鉴定出ENY2作为结直肠癌干细胞的关键标志物，并探索其在肿瘤发生和转移中的潜在作用 | 研究样本量较小（9个原发性结直肠癌样本），且ENY2在结直肠癌中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌干细胞的异质性及其潜在机制，为开发有效的治疗方法提供依据 | 结直肠癌干细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个原发性结直肠癌样本 |
| 1285 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1286 | 2025-07-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 发现了一个可能通过下调SEC16B促进肺转移的新细胞亚群，并揭示了肿瘤微环境中成纤维细胞和内皮细胞在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 样本量相对较小，仅包含6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本和4个正常骨组织样本 | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移组织、正常骨组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR、Transwell实验 | hdWGCNA分析 | RNA测序数据 | 6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本、4个正常骨组织样本 |
| 1287 | 2025-07-31 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Jul-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，识别了桥本甲状腺炎（HT）与甲状腺癌（TC）之间的共享遗传因素 | 首次通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型，揭示了PRDX2作为HT和TC的关键保护因子及其作用机制 | 样本来源主要基于FinnGen数据库，可能无法代表所有人群 | 探究桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的遗传关联及其分子机制 | 桥本甲状腺炎和甲状腺癌患者 | 基因组学 | 甲状腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、机器学习分类模型 | 机器学习分类模型 | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 76,243个甲状腺细胞 |
| 1288 | 2025-07-31 |
Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning
2025, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2025.1623449
PMID:40735022
|
研究论文 | 本研究基于生物信息学和机器学习探讨了消银解毒饮治疗银屑病的作用机制 | 首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了消银解毒饮通过多靶点协同作用治疗银屑病的机制，并鉴定AKR1B10为核心治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型，缺乏动物模型或临床试验验证 | 探究消银解毒饮治疗银屑病的药理机制 | 银屑病患者皮肤组织样本和IL-17A诱导的HaCaT细胞模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 网络药理学、机器学习靶点筛选、scRNA-seq、空间转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及银屑病患者皮肤组织和HaCaT细胞系 |
| 1289 | 2025-07-31 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
|
研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中cGAS和STING表达与新辅助化疗免疫疗法（NACI）疗效的相关性 | 首次揭示了cGAS和STING表达与NACI疗效的正相关性，并提出了它们作为预测生物标志物的潜力 | 样本量较小（仅38例患者），且为回顾性研究 | 探究cGAS和STING表达与HNSCC患者NACI疗效的关系 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据 | 38例HNSCC患者 |
| 1290 | 2025-07-31 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了PM2.5对幼鼠肺部不同细胞类型的转录组影响 | 首次在幼鼠模型中利用scRNA-seq技术揭示了PM2.5对不同肺部细胞类型的特异性转录组改变 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 探究PM2.5对儿童肺部健康的细胞特异性影响及其分子机制 | 幼鼠肺部细胞 | 生物医学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), GO和KEGG富集分析, 苏木精-伊红染色 | 幼鼠PM2.5气道暴露模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 未明确说明数量的幼鼠肺部样本 |
| 1291 | 2025-07-31 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
|
research paper | 该研究通过分析扩张型心肌病（DCM）患者与健康对照中24个二硫键死亡相关基因（DiGs）的表达，构建了预测模型并验证了核心基因的作用 | 首次将二硫键死亡机制与DCM发病联系起来，并鉴定出ACTN4、MYH10、TLN1、DSTN和NCKAP1作为核心预测基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索二硫键死亡相关基因在扩张型心肌病中的作用机制及治疗靶点 | 扩张型心肌病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的DCM患者和健康对照样本 |
| 1292 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1293 | 2025-07-31 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
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研究论文 | 本研究探讨了KLF5/PI3K/AKT轴作为克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5在化疗耐药性中的作用，并提出了KLF5/PI3K/AKT轴作为新的治疗靶点 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的机制和潜在治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、InferCNV、差异表达基因分析、通路富集分析、细胞通讯分析、SCENIC、高通量药物筛选 | 动物模型 | RNA测序数据 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及)和动物模型 |
| 1294 | 2025-07-31 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
|
研究论文 | 本文开发了一种湿实验室和计算框架，用于在同一组织切片上进行空间转录组学（ST）和空间蛋白质组学（SP）的整合分析 | 首次在同一组织切片上整合ST和SP分析，实现了RNA和蛋白质表达的单细胞水平比较 | 未提及样本量是否足够大以覆盖广泛的肿瘤异质性 | 开发一种整合空间多组学数据的方法，以更深入地理解肿瘤-免疫微环境 | 人类肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST）、空间蛋白质组学（SP）、H&E染色 | Weave软件 | 空间多组学数据 | NA |
| 1295 | 2025-07-31 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的牛生长卵母细胞的收集和文库制备方案 | 提供了针对牛生长卵母细胞的详细scRNA-seq分析方案，有助于识别物种特异性转录特征和发育轨迹 | NA | 研究牛卵母细胞的基因表达和发育过程 | 牛生长卵母细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1296 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
|
研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |
| 1297 | 2025-07-30 |
Inhibition of FAK promotes pancreatic cancer immunotherapy by mediating CXCL10 secretion to enhance CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2539442
PMID:40726089
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研究论文 | 本研究探讨了FAK在胰腺癌免疫治疗中的作用及其通过促进CXCL10分泌增强CD8+ T细胞浸润的机制 | 揭示了FAK在胰腺癌免疫抑制微环境中的具体作用及其抑制剂与免疫检查点抑制剂的协同抗肿瘤效应 | FAK在胰腺癌发展和进展中的具体作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制尚未完全阐明 | 探索FAK作为胰腺癌免疫治疗靶点的潜力及其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胰腺癌患者来源的类器官、免疫细胞、小鼠胰腺癌模型及双人源化模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞测序、患者来源类器官(PDO)与免疫细胞的共培养系统 | 小鼠胰腺癌模型、双人源化模型 | 单细胞测序数据、临床标本数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及患者来源类器官、小鼠模型及临床标本 |
| 1298 | 2025-07-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered immune and stromal landscape in primary and liver metastasis of gastric cancer
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102163
PMID:40727437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌原发灶和肝转移灶中免疫和基质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上比较了胃癌原发灶和肝转移灶的肿瘤微环境差异，并识别出与肝转移相关的特定细胞类型 | 样本量相对较小（7例GC，5例LM），且为回顾性研究 | 鉴定与胃癌肝转移相关的基质细胞 | 胃癌组织、邻近正常组织、肝转移灶和健康肝组织 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 7例GC、2例NT、5例LM和3例HL组织样本，共计107,875个细胞 |
| 1299 | 2025-07-30 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
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研究论文 | 该研究通过分析B细胞和T细胞受体序列，揭示了ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在ocrelizumab治疗背景下，对多发性硬化症患者的B细胞和T细胞受体库进行了全面分析，并发现了组织驻留记忆细胞的基因表达特征和初始治疗抵抗现象 | 样本量相对较小，未来需要更大规模的研究验证发现 | 阐明ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 35名多发性硬化症患者、11名健康供体和14名接受natalizumab治疗的多发性硬化症患者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞和T细胞受体测序、单细胞转录组学 | NA | 序列数据、转录组数据 | 35名MS患者(ocrelizumab治疗组)、11名健康供体、14名MS患者(natalizumab治疗组)、29名供体的脑脊液和血液样本 |
| 1300 | 2025-07-30 |
From iPSCs to myotubes: Identifying potential biomarkers for human FSHD by single-cell transcriptomics
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70423
PMID:40726336
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |