单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 12961 - 12980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12961 | 2024-08-07 |
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101946
PMID:36525348
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研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码标记和混合多个愈合伤口样本的单细胞RNA测序协议 | 提出了使用寡核苷酸条形码技术降低单细胞RNA测序成本的方法 | 目前仅适用于小鼠，但可扩展到其他物种如大鼠、猪和人类 | 开发一种成本效益高的方法来研究复杂组织的单细胞RNA测序 | 愈合伤口组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个样本 |
| 12962 | 2024-08-07 |
Editorial: Spatial single-cell sequencing in studying solid cancer development
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1342989
PMID:38149241
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12963 | 2024-08-07 |
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100465
PMID:38586548
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research paper | 本文探讨了单细胞技术在解析环境暴露对生殖细胞跨代影响的现状与应用 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学方法，深入理解毒物对生殖细胞功能的影响及其在不同组织和细胞类型中的差异响应 | NA | 探讨单细胞技术在生殖毒理学研究中的应用，并展示其在不同模型生物和环境暴露中的价值 | 生殖细胞及其对环境暴露的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 12964 | 2024-08-04 |
Ablation of Brg1 in fibroblast/myofibroblast lineages attenuates renal fibrosis in mice with diabetic nephropathy
2024-May-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122578
PMID:38537899
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研究论文 | 本研究探讨了Brg1在糖尿病肾病小鼠中对肾纤维化的影响 | 提供了Brg1与成纤维细胞-肌成纤维细胞转化之间的新遗传联系 | 尚未明确与Brg1相关的所有表观遗传机制 | 探讨Brg1在糖尿病肾病相关肾纤维化中的作用 | C57B6/j小鼠中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 定量PCR和西方印迹 | NA | 基因表达数据 | C57B6/j小鼠的样本数量未明确提及 |
| 12965 | 2024-08-05 |
Role of crosstalk between synovial cells and chondrocytes in osteoarthritis (Review)
2024-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2024.12490
PMID:38590580
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综述 | 本文全面探讨了滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用及其机制 | 本综述更新了单细胞测序技术在研究滑膜与软骨细胞相互作用中的应用 | 未提及特定实验数据或临床试验的应用 | 阐明滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用机制 | 滑膜细胞与软骨细胞在骨关节炎中的相互作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 组织学与病理学数据 | NA |
| 12966 | 2024-08-07 |
Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases
2024-May, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463
PMID:38485095
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq技术分析野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜，揭示了NR2E3基因在调节光感受器细胞分化中的作用。 | 发现了先前未报道的产生混合锥细胞的锥途径，这些混合锥细胞同时表达锥和杆相关基因。 | NA | 解析NR2E3基因在杆和锥转录网络中的精确作用。 | NR2E3基因突变相关的视网膜疾病。 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 野生型和两种Nr2e3基因突变小鼠模型的视网膜样本 |
| 12967 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations reveal neutrophil extracellular trap involvement in hepatic ischemia-reperfusion injury and early allograft dysfunction
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111874
PMID:38493695
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研究论文 | 本研究分析了中性粒细胞外网在肝脏缺血再灌注损伤及早期移植物功能障碍中的作用 | 新发现了两种明显的肝脏缺血再灌注损伤亚型，并建立了一种早期移植物功能障碍预测模型 | 研究主要依赖于公开数据库，可能存在数据选择偏倚的风险 | 综合分析肝脏缺血再灌注损伤中的中性粒细胞外网相关基因表达模式 | 肝脏缺血再灌注损伤相关样本及其基因表达模式 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA-seq | NMF算法 | 基因表达数据 | 101个样本 |
| 12968 | 2024-08-07 |
MGP+ and IDO1+ tumor-associated macrophages facilitate immunoresistance in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111818
PMID:38460300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了31名接受PD-1免疫治疗的乳腺癌患者的肿瘤组织中髓系细胞的变化，揭示了MGP+和IDO1+肿瘤相关巨噬细胞在乳腺癌中的免疫抵抗机制 | 本研究发现了MGP TAMs和IDO1 TAMs在乳腺癌患者中影响免疫治疗效果的新机制，并提供了新的生物标志物以预测治疗反应和克服免疫治疗抵抗 | NA | 探讨乳腺癌患者在接受PD-1免疫治疗后肿瘤相关巨噬细胞的变化及其对免疫治疗效果的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织中的髓系细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 |
| 12969 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling of infrapatellar fat pad highlights the role of interstitial inflammatory fibroblasts in osteoarthritis
2024-Apr-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111888
PMID:38522139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了髌下脂肪垫（IFP）的细胞异质性，揭示了间质炎症性成纤维细胞（iiFBs）在骨关节炎（OA）中的作用。 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了髌下脂肪垫中间质炎症性成纤维细胞的特性和其在骨关节炎中的作用。 | NA | 探索髌下脂肪垫在骨关节炎发病机制中的作用，并识别潜在的治疗靶点。 | 髌下脂肪垫的细胞异质性及其在骨关节炎中的作用。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞和单核RNA测序 | NA | 转录组 | 10个髌下脂肪垫样本，包括5个来自骨关节炎患者和5个来自健康对照。 |
| 12970 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies FBXO2 as a candidate biomarker associated with chemoresistance in HGSOC
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28490
PMID:38590858
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研究论文 | 这项研究确定了FBXO2作为与HGSOC化疗抗药性相关的潜在生物标志物 | 首次通过结合单细胞RNA测序和整体RNA测序数据集识别出FBXO2在化疗抗药性中的作用 | 在体外验证中可能受限于细胞系的选择，临床适用性还有待进一步研究 | 研究HGSOC中与化疗抗药性相关的生物标志物 | 高等级浆液性卵巢癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 8871个恶性上皮细胞 |
| 12971 | 2024-08-07 |
Gene features of tumor-specific T cells relevant to immunotherapy, targeted therapy and chemotherapy in lung cancer
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28374
PMID:38590880
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序定义了肿瘤特异性T细胞（TSTs）及其特征（TSTGs），并应用LASSO回归筛选出与生存最相关的TSTGs，构建了肿瘤特异性T细胞评分（TSTS），以预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗的反应。 | 本文创新性地通过单细胞RNA测序技术筛选出肿瘤特异性T细胞的特征基因，并构建了一个新的评分系统（TSTS），用于预测肺癌患者对不同治疗方式的反应。 | NA | 研究旨在寻找能够预测肺癌患者对免疫疗法、靶向疗法和化疗反应的生物标志物，以优化临床治疗选择。 | 肺癌患者的肿瘤特异性T细胞及其特征基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA |
| 12972 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acids synthesis and metabolism-related gene signature and prediction of prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03306-4
PMID:38584256
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达综合数据库（GEO）、癌症基因组图谱（TCGA）和国际癌症基因组联盟（ICGC）的数据，识别了与肝细胞癌（HCC）中脂肪酸合成与代谢（FASM）相关的基因特征，并构建了预测预后模型。 | 本研究首次揭示了FASM相关基因特征在HCC中的分子特性、生理功能和临床预后价值，并通过一系列功能实验验证了FASM效应基因在促进肿瘤进展中的作用。 | NA | 旨在理解肝细胞癌中脂肪酸合成与代谢的异质性，并评估其对患者预后和治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者及其脂肪酸合成与代谢相关的基因特征。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归分析 | 转录组数据 | 涉及来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者数据 |
| 12973 | 2024-08-07 |
Locally delivered hydrogels with controlled release of nanoscale exosomes promote cardiac repair after myocardial infarction
2024-Apr, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.02.035
PMID:38417558
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研究论文 | 本文介绍了一种生物工程化的可注射透明质酸水凝胶，用于优化滋养层干细胞衍生外泌体的局部递送效率，以促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 该水凝胶通过精心设计的超支化聚合物交联剂，增强了生物降解性和独特的控释能力，同时保留了纳米级外泌体的生物活性。 | NA | 旨在通过局部递送含有控释纳米级外泌体的水凝胶，促进心肌梗塞后的心脏修复。 | 研究对象为心肌梗塞后的心脏修复。 | 生物工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12974 | 2024-08-07 |
Canopy2: tumor phylogeny inference by bulk DNA and single-cell RNA sequencing
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585595
PMID:38562795
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架，利用批量DNA和单细胞RNA测序数据来推断肿瘤谱系并进行突变分析 | Canopy2通过马尔可夫链蒙特卡洛方法处理单细胞数据的稀疏性和随机性，能够区分不同类型的零值（非癌细胞、随机突变和测序技术导致的零值） | NA | 研究旨在通过构建肿瘤细胞的谱系树来深入了解肿瘤的复杂性和异质性 | 肿瘤细胞的遗传组成和功能差异 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量DNA测序 | 贝叶斯框架 | DNA, RNA | 涉及乳腺癌和胶质母细胞瘤的数据 |
| 12975 | 2024-08-07 |
miR-644a is a tumor cell-intrinsic mediator of sex bias in glioblastoma
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584443
PMID:38559056
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研究论文 | 本文研究了miR-644a在胶质母细胞瘤（GBM）中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | 首次揭示了miR-644a在GBM中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | NA | 探讨miR-644a在胶质母细胞瘤中性别偏倚的机制 | miR-644a及其在GBM中的性别偏倚作用 | NA | 脑瘤 | miRNA和mRNA测序 | NA | 测序数据 | 39名GBM患者（22名男性，17名女性）和110名GBM患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12976 | 2024-08-07 |
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07144-2
PMID:38448588
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研究论文 | 本文研究了一种由气道闭合引发的迷走神经反射，该反射导致喘息现象 | 发现了由表达PVALB的迷走神经元介导的气道闭合反应，并揭示了神经上皮小体（NEBs）在肺机械感觉中的关键作用 | NA | 探讨气道闭合引发的迷走神经反射及其对呼吸功能的维持作用 | 迷走神经反射、神经上皮小体（NEBs）、表达PVALB的迷走神经元 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 12977 | 2024-08-07 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文理论性地展示了细胞分化过程中存在的动态振荡现象如何限制了伪时间重建算法的质量和分辨率 | 首次揭示了细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法分辨率的内在限制 | 指出了当前伪时间重建方法的固有局限性 | 探讨细胞分化过程中振荡动态对伪时间重建算法的影响 | 细胞分化过程中的动态振荡现象及其对伪时间重建算法的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12978 | 2024-08-04 |
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023254
PMID:38186223
|
研究论文 | 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 | 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联，并筛选出5个关键基因 | 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少，可能影响研究的全面性 | 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 | 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12979 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
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research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 |
| 12980 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |