单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12941 - 12960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12941 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了新生期暴露于高氧环境的小鼠在成年期的肺细胞景观变化 | 首次揭示了新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观的持久影响，并发现了类型II细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究仅在动物模型中进行，结果需要进一步在人类中验证 | 探究新生期高氧暴露对成年期肺细胞景观和功能的长远影响 | 新生期暴露于高氧环境的小鼠的肺细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个细胞，分为45个集群和32个细胞状态 |
| 12942 | 2024-08-07 |
Clinical and therapeutic relevance of cancer-associated fibroblasts
2021-12, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00546-5
PMID:34489603
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤发展和治疗中的临床相关性和治疗意义 | 通过单细胞RNA测序和新型小鼠模型，增加了对CAF多样性的理解 | 不同CAF群体的上下文依赖角色及其可互换的可塑性仍大多未知 | 探讨CAFs在癌症进展中的作用及其作为预后因子和治疗靶点的价值 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的复杂相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12943 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-related molecular biomarkers for Alzheimer's disease
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00714-8
PMID:34880454
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自4名阿尔茨海默病（AD）患者和2名正常对照的外周血单个核细胞（PBMCs），探索了AD患者PBMCs中的差异细胞亚群，并发现了B细胞的显著减少。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了与AD进展相关的B细胞分子标志物，并通过功能实验验证了B细胞在AD早期阶段的作用。 | 研究样本量较小，且仅限于AD患者和正常对照，未来研究需要扩大样本量并考虑更多疾病阶段和人群。 | 探索阿尔茨海默病中与B细胞相关的分子标志物，以促进AD进展的临床识别。 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和B细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名AD患者（早期2名，晚期2名）和2名正常对照，以及43名AD患者和41名正常受试者 |
| 12944 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.650
PMID:34965030
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研究论文 | 本研究利用大规模并行多重单细胞RNA测序技术，构建了超过13万个单个间充质干细胞的转录组图谱，以评估其异质性 | 首次构建了人类间充质干细胞的综合单细胞图谱，并发现了七个组织特异性和五个保守的MSC亚群，这些亚群具有不同的基因表达特征 | NA | 探索间充质干细胞的细胞异质性，以促进基于MSC的治疗效果的潜在改进 | 人类间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过13万个单个间充质干细胞转录组，来自多个组织和供体，包括正常骨髓（3个）、脂肪组织（3个）、脐带（2个）和真皮（3个） |
| 12945 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Seq reveals cellular landscape-specific characteristics and potential etiologies for adolescent idiopathic scoliosis
2021-Dec, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1184
PMID:35005449
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，比较了青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观，揭示了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断，并通过细胞通信分析提供了骨细胞和软骨细胞分化功能障碍的可能发病机制。 | 首次通过单细胞分析揭示了AIS患者与健康受试者在细胞状态上的差异，并发现了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断。 | NA | 探讨青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者在脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观差异及其潜在的病因。 | 青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者的脊椎松质骨组织。 | 数字病理学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 基因组范围的转录组数据 | AIS患者与健康受试者的脊椎松质骨组织样本 |
| 12946 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics at subspot resolution with BayesSpace
2021-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00935-2
PMID:34083791
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research paper | 本文介绍了BayesSpace，一种完全贝叶斯统计方法，用于增强空间转录组数据的分辨率和聚类分析 | BayesSpace利用空间邻域信息提高空间转录组数据的分辨率，并改进对组织内转录组特征的识别 | NA | 提高空间转录组数据的分辨率和聚类分析的准确性 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本的转录组特征 | digital pathology | NA | 空间转录组技术 | 贝叶斯统计方法 | 转录组数据 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本 |
| 12947 | 2024-08-07 |
Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells
2021-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00927-2
PMID:34083792
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASAP-seq的新工具，能够在单细胞水平上同时分析染色质可及性和蛋白质水平 | ASAP-seq结合了scATAC-seq数据和多种细胞表面及细胞内蛋白质标记物的检测，以及可选的线粒体DNA捕获，实现了单细胞中三种不同模态的同步分析 | NA | 展示系统性多组学分析在揭示基因调控中心法则中染色质、RNA和表面蛋白质协调及不同变化方面的应用 | 染色质可及性、基因表达和蛋白质水平在单细胞中的变化 | 基因组学 | NA | scATAC-seq, ASAP-seq | NA | 染色质可及性数据、蛋白质标记物数据、线粒体DNA | NA |
| 12948 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了AML初始细胞在疾病进展中的RNA变化 | 首次在AML初始细胞中识别出RNA克隆进化现象 | NA | 深入理解AML复发机制，开发新的预后生物标志物和治疗策略 | AML初始细胞（LICs）在诊断和复发样本中的RNA变化 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 匹配的AML患者诊断和复发样本 |
| 12949 | 2024-08-07 |
Loss of Adam10 Disrupts Ion Transport in Immortalized Kidney Collecting Duct Cells
2021, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab024
PMID:34131651
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研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9技术敲除mCCD细胞中的Adam10基因，观察其对钠转运能力和醛固酮反应的影响 | 首次揭示了Adam10基因敲除对肾皮质集合管细胞中钠转运和细胞标记物分布的影响 | 仅限于mCCD细胞系和特定基因敲除，可能不完全代表体内情况 | 探讨Adam10基因在肾皮质集合管细胞中的功能及其对离子转运的影响 | 自永生化的肾皮质集合管细胞系mCCD | NA | NA | CRISPR-Cas9技术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫染色图像 | 多个独立的mCCD细胞克隆 |
| 12950 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Hepatocellular Carcinoma Reveals Cell Interactions and Cell Heterogeneity in the Microenvironment
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S338090
PMID:34992435
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本，揭示了微环境中的细胞相互作用和细胞异质性 | 本研究通过单细胞测序数据识别了新的HCC预后标志物，包括ALDOB, APOC3, APOH等10个关键基因 | NA | 旨在基于单细胞测序数据识别肝细胞癌的新预后标志物 | 肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 21个HCC样本和256个正常肝组织样本 |
| 12951 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Anterior Kidney Leukocytes From Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783196
PMID:35027916
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，对尼罗罗非鱼前肾中的白细胞进行了转录模式分析 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究尼罗罗非鱼前肾白细胞的异质性，并识别出多种免疫细胞亚群 | 未能根据已知的特定标记物更详细地识别髓系细胞亚群 | 揭示尼罗罗非鱼前肾白细胞的亚群及其潜在标记物 | 尼罗罗非鱼前肾中的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11,388个前肾白细胞 |
| 12952 | 2024-08-07 |
Natural Barcodes for Longitudinal Single Cell Tracking of Leukemic and Immune Cell Dynamics
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788891
PMID:35046946
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review | 本文综述了利用染色体拷贝数变化、体细胞核和线粒体DNA突变、单核苷酸多态性以及T和B细胞受体序列作为个人自然条形码，在单细胞分析工作流程中的技术实现及其应用 | 介绍了多模态单细胞测序技术的新平台，以及如何利用分子事件作为条形码追踪恶性细胞和免疫细胞群体随时间的变化 | NA | 探讨血液恶性肿瘤治疗瓶颈后疾病演变的纵向追踪以及抗肿瘤免疫变化监测的新方法 | 血液恶性肿瘤中的恶性细胞和免疫细胞动态 | digital pathology | 血液恶性肿瘤 | multi-modal single-cell sequencing | NA | DNA 和 RNA 序列 | NA |
| 12953 | 2024-08-07 |
Deciphering the Immune-Tumor Interplay During Early-Stage Lung Cancer Development via Single-Cell Technology
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.716042
PMID:35047383
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术解码早期肺癌发展过程中的免疫-肿瘤相互作用 | 利用单细胞测序技术探索早期肺癌中肿瘤免疫微环境的详细机制 | 目前主要集中在肿瘤临床可检测的“逃逸”阶段，早期阶段的机制尚不明确 | 深入理解早期肺癌发展过程中免疫反应及其动态变化 | 早期肺癌的免疫-肿瘤相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 未具体说明 |
| 12954 | 2024-08-07 |
Principles of Spatial Transcriptomics Analysis: A Practical Walk-Through in Kidney Tissue
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.809346
PMID:35069263
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review | 本文综述了空间转录组技术及其在肾脏组织中的应用，特别是Slide-seqV2技术的使用 | 介绍了Slide-seqV2技术在近单细胞分辨率下收集空间转录组数据的能力 | NA | 探讨空间转录组技术在肾脏组织中的应用，并展示如何通过这些技术进行细胞类型映射和空间细胞类型及转录组特征分析 | 肾脏组织及其空间结构中的细胞和基因表达特征 | digital pathology | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12955 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 12956 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Apr-04, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤内异质性 | 利用单细胞转录组测序技术，深入研究了ESCC肿瘤微环境的分子机制，并构建了预测ESCC患者预后的风险模型 | NA | 探究食管鳞状细胞癌的发病机制，并识别潜在的关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境和细胞类型分布 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 |
| 12957 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 12958 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
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综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现，包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA |
| 12959 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 12960 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |