单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 12941 - 12960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12941 | 2024-08-07 |
Canopy2: tumor phylogeny inference by bulk DNA and single-cell RNA sequencing
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585595
PMID:38562795
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架，利用批量DNA和单细胞RNA测序数据来推断肿瘤谱系并进行突变分析 | Canopy2通过马尔可夫链蒙特卡洛方法处理单细胞数据的稀疏性和随机性，能够区分不同类型的零值（非癌细胞、随机突变和测序技术导致的零值） | NA | 研究旨在通过构建肿瘤细胞的谱系树来深入了解肿瘤的复杂性和异质性 | 肿瘤细胞的遗传组成和功能差异 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量DNA测序 | 贝叶斯框架 | DNA, RNA | 涉及乳腺癌和胶质母细胞瘤的数据 |
| 12942 | 2024-08-07 |
miR-644a is a tumor cell-intrinsic mediator of sex bias in glioblastoma
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584443
PMID:38559056
|
研究论文 | 本文研究了miR-644a在胶质母细胞瘤（GBM）中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | 首次揭示了miR-644a在GBM中性别偏倚的肿瘤细胞内在介导作用 | NA | 探讨miR-644a在胶质母细胞瘤中性别偏倚的机制 | miR-644a及其在GBM中的性别偏倚作用 | NA | 脑瘤 | miRNA和mRNA测序 | NA | 测序数据 | 39名GBM患者（22名男性，17名女性）和110名GBM患者的单细胞RNA测序数据 |
| 12943 | 2024-08-07 |
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07144-2
PMID:38448588
|
研究论文 | 本文研究了一种由气道闭合引发的迷走神经反射，该反射导致喘息现象 | 发现了由表达PVALB的迷走神经元介导的气道闭合反应，并揭示了神经上皮小体（NEBs）在肺机械感觉中的关键作用 | NA | 探讨气道闭合引发的迷走神经反射及其对呼吸功能的维持作用 | 迷走神经反射、神经上皮小体（NEBs）、表达PVALB的迷走神经元 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 12944 | 2024-08-07 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
|
研究论文 | 本文理论性地展示了细胞分化过程中存在的动态振荡现象如何限制了伪时间重建算法的质量和分辨率 | 首次揭示了细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法分辨率的内在限制 | 指出了当前伪时间重建方法的固有局限性 | 探讨细胞分化过程中振荡动态对伪时间重建算法的影响 | 细胞分化过程中的动态振荡现象及其对伪时间重建算法的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12945 | 2024-08-04 |
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023254
PMID:38186223
|
研究论文 | 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 | 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联，并筛选出5个关键基因 | 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少，可能影响研究的全面性 | 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 | 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12946 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
|
research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析，以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析，并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 |
| 12947 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
|
研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性，并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植（PDX）模型和细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤（MCL）及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级耐药细胞系4个，耐药PDX模型若干 |
| 12948 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
|
研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因，并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集，可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制，以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 |
| 12949 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
|
研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调，揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型，可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 |
| 12950 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
|
研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因，构建了一个针对黑色素瘤的预后模型，并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型，并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型，并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 12951 | 2024-08-05 |
Human monoclonal antibodies against Staphylococcus aureus A protein identified by high-throughput single-cell sequencing of phase I clinical volunteers' B cells
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109843
PMID:37981106
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞测序识别出对抗金黄色葡萄球菌A蛋白的人源单克隆抗体 | 发现了一种特异性针对金黄色葡萄球菌A蛋白的高表达的人单克隆抗体IgG-6 | 本研究仅在I期临床试验中进行，样本量相对较小，长期效果尚未验证 | 研究人源单克隆抗体作为对付金黄色葡萄球菌感染的新策略 | 从64名志愿者的外周血淋巴细胞中分离的抗原特异性记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 64名临床志愿者的外周血淋巴细胞 |
| 12952 | 2024-08-07 |
Ruxolitinib attenuates acute rejection and can serve as an immune induction therapy in heart transplantation
2023-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109851
PMID:38008145
|
研究论文 | 研究探讨了IL2RA拮抗剂在心脏移植患者中的效果，并发现鲁索利替尼可能是一种新的免疫诱导治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了IL2RA拮抗剂治疗后免疫细胞的动态变化，并发现鲁索利替尼可作为新的免疫诱导治疗药物，不影响调节性T细胞的激活 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明IL2RA拮抗剂的效果并寻找优于IL2RA拮抗剂的治疗目标 | 心脏移植患者及IL2RA拮抗剂治疗后的免疫细胞 | NA | 心脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十九种细胞类型 |
| 12953 | 2024-08-07 |
Single-cell dissection, hdWGCNA and deep learning reveal the role of oxidatively stressed plasma cells in ulcerative colitis
2023-11-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023237
PMID:37814814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高级加权基因共表达网络分析，揭示了氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的作用，并利用深度学习模型进行诊断 | 首次通过单细胞水平分析和多种机器学习方法，识别出氧化应激浆细胞在溃疡性结肠炎中的关键作用，并开发了用于诊断的深度学习模型 | NA | 阐明溃疡性结肠炎在单细胞水平的发病机制及其临床意义 | 溃疡性结肠炎中的氧化应激浆细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 转录组数据 | NA |
| 12954 | 2024-08-07 |
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad546
PMID:37672035
|
research paper | 本文提出了一种名为scAce的自适应嵌入和聚类方法，用于单细胞基因表达数据的分析 | scAce方法通过构建变分自编码器同时学习细胞嵌入和聚类分配，并开发了一种自适应聚类合并方法，无需预先估计聚类数量 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，区分细胞类型并发现新的细胞类型 | 单细胞基因表达数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | variational autoencoder | gene expression data | NA |
| 12955 | 2024-08-07 |
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545370
PMID:37398372
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，通过GPU加速提高了计算效率 | 实现了基于NMF的聚类方法在GPU计算节点上的运行，使用Cupy库和消息传递接口（MPI），显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决非负矩阵分解在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 基因表达数据，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的高维数据集 |
| 12956 | 2024-08-04 |
Cellular states are coupled to genomic and viral heterogeneity in HPV-related oropharyngeal carcinoma
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01357-3
PMID:37012457
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析HPV阳性和阴性口咽肿瘤，揭示肿瘤内外的细胞多样性。 | 首次揭示了口咽癌细胞状态与基因组和病毒异质性的关系 | 研究中未明确涉及样本的具体数量和来源 | 探索HPV相关的口咽癌细胞的多样性及其对预后影响 | HPV阳性和阴性口咽肿瘤 | 数字病理学 | 其他癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12957 | 2024-08-04 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
|
研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官应用，鉴定并验证胰腺导管腺癌患者的抗肿瘤T细胞受体 | 结合超深度单细胞测序和类器官技术，快速特征化肿瘤响应的TCR，对于制定实用个性化TCR-T疗法具有潜在意义 | 仅在两个PDAC患者中进行，结果可能无法代表更广泛的患者群体 | 识别和验证胰腺导管腺癌患者的抗肿瘤TCRs，以促进个性化TCR-T细胞疗法的发展 | 两名代表性的胰腺导管腺癌患者的T细胞受体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序，类器官技术 | NA | 细胞 | 超过82,000个细胞 |
| 12958 | 2024-08-04 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）之间明显不同的肿瘤免疫微环境 | 研究首次系统性评估了HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的相似性和差异性 | 未提及研究的局限性 | 旨在揭示HCC和ICC的肿瘤免疫微环境的细胞组成和相互作用 | 研究对象为来自四种不同组织类型的HCC和ICC的41个单细胞RNA-seq样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 41个单细胞RNA-seq样本 |
| 12959 | 2024-08-04 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
|
研究论文 | 本研究旨在探讨可改善结直肠肝转移患者预后预测的生物标志物 | 本研究首次将术前天冬氨酸氨基转移酶与血小板比率指数(APRI)与结直肠肝转移患者的预后及肿瘤微环境关联起来 | 研究可能受到多中心数据的异质性影响，需注意结果的普遍适用性 | 旨在识别可应用的 robust 生物标志物以改善结直肠肝转移患者的预后预测 | 纳入了1323名接受同期切除手术的结直肠肝转移患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞 RNA 测序，复合免疫组化/免疫荧光 | IPTW调整的Cox风险回归分析 | 血液样本，肿瘤样本 | 1323名结直肠肝转移患者 |
| 12960 | 2024-08-07 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
|
研究论文 | 本研究揭示了CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20赋予乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 发现CD63 CAFs通过外泌体miR-20促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性，并设计合成了cRGD-miR-20海绵纳米粒子以增强CDK4/6抑制剂的治疗效果 | NA | 探讨CDK4/6抑制剂耐药性的机制并寻找新的治疗策略 | 乳腺癌细胞、CD63癌症相关成纤维细胞及外泌体miR-20 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |