单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12941 - 12960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12941 | 2024-08-07 |
PNOC Expressed by B Cells in Cholangiocarcinoma Was Survival Related and LAIR2 Could Be a T Cell Exhaustion Biomarker in Tumor Microenvironment: Characterization of Immune Microenvironment Combining Single-Cell and Bulk Sequencing Technology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.647209
PMID:33841428
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研究论文 | 本研究通过结合批量测序和单细胞测序技术，探讨了胆管癌中的免疫浸润相关基因，特别是PNOC和LAIR2的作用 | 首次通过单细胞和批量测序技术结合，揭示了PNOC和LAIR2在胆管癌免疫浸润中的作用及其与患者生存的关系 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；未涉及临床干预性试验 | 探索胆管癌中的免疫浸润相关基因及其对患者生存的影响 | 胆管癌患者的免疫浸润状态及相关基因PNOC和LAIR2的表达 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序和批量测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA CHOL, GSE32225, GSE26566和GSE138709的数据集 |
| 12942 | 2024-08-07 |
The Physiology of Reproduction - Quo vadis?
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.650550
PMID:33859571
|
研究论文 | 本文探讨了男性和女性生殖系统的生理动态性，并强调了当前对这一系统理解的不完整性 | 文章提出了微流控技术、干细胞生物学和单细胞转录组学与组织动态的整合作为解决当前理解不足的可能方法 | 尽管分子科学的进步有助于更详细地描述生殖系统的组成部分，但这些组件如何在时间和空间维度上相互作用和功能仍不清楚 | 旨在深入理解生殖系统的正常功能以及其在疾病、环境内分泌干扰物影响和衰老中的作用 | 研究对象包括生殖系统的生理动态性、信息网络和过程的质与量维度，以及其在整个生命周期中的作用 | NA | NA | 微流控技术、干细胞生物学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 12943 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis of Antigen-Specific CD8+ T-Cell Transcripts Reveals Profiles Specific to mRNA or Adjuvanted Protein Vaccines
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757151
PMID:34777370
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研究论文 | 本研究使用单细胞分析技术，通过小鼠模型研究了针对核酸和蛋白质基流感疫苗候选物的免疫优势血凝素（HA）特异性CD8+ T细胞反应 | 本研究通过单细胞转录组分析，发现了独特的CD8+ T细胞亚群，这些细胞在接种疫苗后共表达细胞毒性基因，并揭示了先前未检测到的抗原特异性CD8+ T细胞 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 深入理解T细胞分化的分子机制，并探索单细胞分析在免疫反应研究中的应用 | CD8+ T细胞在接种核酸和蛋白质基流感疫苗后的反应 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 12944 | 2024-08-07 |
scNetViz: from single cells to networks using Cytoscape
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.52460.1
PMID:34912541
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scNetViz的Cytoscape应用程序，用于通过网络分析帮助解释scRNA-seq数据中的细胞集群 | scNetViz通过计算每个基因在集群间的差异表达，并创建集群特异性的基因功能交互网络，为scRNA-seq数据分析提供了新的工具 | NA | 开发一个工具，通过网络生物学方法分析scRNA-seq数据，以深入理解驱动组织细胞类型异质性的基因 | scRNA-seq数据中的细胞集群及其基因表达模式 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12945 | 2024-08-07 |
A curated database reveals trends in single-cell transcriptomics
2020-11-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaa073
PMID:33247933
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研究论文 | 本文构建了一个详尽的手动筛选单细胞转录组学研究数据库，包含关键信息如数据类型、技术使用及研究生物系统的描述 | 提供了对已发表单细胞转录组学数据的全面汇总，便于发现相关趋势和信息 | NA | 旨在促进对已发表单细胞转录组学数据的发现和利用 | 单细胞转录组学研究及其相关数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涵盖超过1000项研究 |
| 12946 | 2024-08-07 |
The differential immune responses to COVID-19 in peripheral and lung revealed by single-cell RNA sequencing
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00225-2
PMID:33101705
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周血单个核细胞和支气管肺泡灌洗液中的细胞，揭示了COVID-19患者免疫反应的差异 | 首次详细描述了COVID-19患者外周和肺部免疫细胞景观的扰动，特别是树突状细胞和单核细胞的变化 | NA | 探究COVID-19患者免疫功能障碍的机制，为开发有效治疗提供依据 | COVID-19患者的外周血单个核细胞和支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | COVID-19患者和健康对照组的外周血单个核细胞及支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 12947 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 |
| 12948 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
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研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白（LDL）的失调作为肺纤维化的新风险因素，揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制，特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 12949 | 2024-08-04 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-Apr-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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研究论文 | 本研究探讨了导管内癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）转变的分子特征及其临床意义 | 本研究系统总结了关于DCIS的关键信号通路和分子特征，并探索了肿瘤细胞内部变化及肿瘤微环境的影响 | 文中未提及具体的研究限制 | 深入理解DCIS及其向IDC转变的生物学特性以促进临床管理 | 主要关注DCIS和IDC的分子特征及其进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | 前临床模型 | NA | NA |
| 12950 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 12951 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
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research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法，研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制，对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 12952 | 2024-08-07 |
Self-assembly of differentiated dental pulp stem cells facilitates spheroid human dental organoid formation and prevascularization
2024-Mar-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i3.287
PMID:38577232
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研究论文 | 本研究展示了成人干细胞和人牙髓干细胞在体外低氧和条件培养基下的三维自组装，形成新型球形牙髓类器官并促进其血管化 | 本研究创新性地建立了体外血管化牙髓类器官模型，并阐明了再生过程中血管生成的新机制 | 牙髓类器官缺乏血管限制了其应用 | 提高干细胞移植后的存活率和恢复能力 | 成人干细胞、人牙髓干细胞和内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定比例的预处理人牙髓干细胞与内皮细胞混合 |
| 12953 | 2024-08-07 |
Ferroptosis biomarkers predict tumor mutation burden's impact on prognosis in HER2-positive breast cancer
2024-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i3.391
PMID:38576597
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研究论文 | 本研究旨在识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物，并探讨其与肿瘤突变负荷对预后的影响。 | 开发了一个包含PROM2、SLC7A11、FANCD2和FH的四基因预测模型，并在TCGA和METABRIC队列中验证了其有效性。 | NA | 识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物。 | HER2阳性乳腺癌患者。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | TCGA和METABRIC数据库中的HER2阳性乳腺癌患者。 |
| 12954 | 2024-08-07 |
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02824-y
PMID:38374347
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研究论文 | 研究评估了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌（uHCC）的疗效和安全性 | 首次在多中心、单臂、II期RENOBATE试验中测试了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合作为uHCC一线治疗的疗效 | 研究为单臂试验，且样本量较小，需要进一步的大规模随机对照试验验证 | 评估瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌的疗效和安全性 | 不可切除的肝细胞癌患者 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液单个核细胞 | 42名患者 |
| 12955 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
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研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12956 | 2024-08-04 |
The significance of single-cell transcriptome analysis in epididymis research
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1357370
PMID:38577504
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组分析在附睾研究中的重要性 | 通过单细胞测序技术揭示了附睾不同区域的细胞组成和特定基因表达模式 | 对附睾的重要性认识仍然有限 | 重新评估附睾对男性生育能力的重要性 | 附睾不同区域的细胞组成及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12957 | 2024-08-07 |
Bulk and single-cell transcriptome sequencing reveal the metabolic feature in chronic rhinosinusitis with polyps
2024-01, Clinical and experimental allergy : journal of the British Society for Allergy and Clinical Immunology
IF:6.3Q1
DOI:10.1111/cea.14396
PMID:37749764
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12958 | 2024-08-07 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
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研究论文 | 研究探讨了间质性肺疾病中肺上皮细胞的衰老标记物p16的定位及其与基底上皮细胞标记物的关系 | 首次在单细胞RNA测序数据集中识别出特定于间质性肺疾病的衰老基底上皮细胞群体，并发现其基因表达与分层上皮中的终末分化细胞显著重叠 | 研究主要基于体外模型和单细胞RNA测序数据，未来需要进一步的功能性研究来验证这些发现 | 揭示间质性肺疾病中衰老细胞的起源和身份，并开发用于人类肺部特定环境下细胞衰老特征的工具 | 肺上皮细胞的衰老标记物及其在间质性肺疾病中的分布和作用 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自对照组、特发性肺纤维化（IPF）和系统性硬化症相关间质性肺疾病（SSc-ILD）的肺组织样本 |
| 12959 | 2024-08-07 |
Transdifferentiation of tumor infiltrating innate lymphoid cells during progression of colorectal cancer
2020-07, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0312-y
PMID:32367039
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了结直肠癌进展过程中肿瘤浸润性先天淋巴细胞（ILCs）的特征和功能变化 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤浸润性ILCs的六个不同集群及其独特的功能转换，包括ILC1s的抑制性功能转换、ILC2s的子集分类及其对肿瘤进展的影响，以及ILC3s向ILCregs的转分化 | NA | 探究肿瘤浸润性先天淋巴细胞在结直肠癌进展中的作用及其潜在的免疫治疗策略 | 结直肠癌中的肿瘤浸润性先天淋巴细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肿瘤浸润性ILCs样本 |
| 12960 | 2024-08-07 |
An integrative approach for building personalized gene regulatory networks for precision medicine
2018-12-19, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0608-4
PMID:30567569
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研究论文 | 本文提出了一种综合方法，利用单细胞数据和批量数据的敏感性，重建个性化、细胞类型和上下文特定的基因调控网络 | 利用RNA速度、同时研究数十万细胞的能力和单细胞测序成本的下降，构建基因调控网络 | NA | 开发一种综合方法，以实现精准医疗 | 个性化基因调控网络 | 精准医疗 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 数十万细胞 |