单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28614 篇文献，本页显示第 12901 - 12920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12901 | 2024-08-04 |
Characterizing dysregulations via cell-cell communications in Alzheimer's brains using single-cell transcriptomes
2024-May-13, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-024-00867-y
PMID:38741048
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组研究阿尔茨海默病大脑中细胞间通信的失调。 | 该研究通过单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病大脑中细胞间通信网络的特征和失调机制。 | 该研究主要集中于大脑前额叶区域，可能无法全面代表阿尔茨海默病的所有相关区域。 | 探讨在阿尔茨海默病和健康脑中细胞间通信的差异。 | 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据。 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了大量公共的单核RNA测序数据 |
| 12902 | 2024-08-05 |
Bioinformatic Analysis of Gene Expression Related to Sialic Acid Biosynthesis in Patients With Medulloblastoma
2024-May, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59997
PMID:38854216
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨与小脑胶质瘤患者中唾液酸代谢相关的基因表达。 | 首次在小脑胶质瘤中揭示了唾液酸代谢相关基因的异常表达及其与整体生存率的关联。 | 本研究依赖于公开数据库，需进一步实验验证其结果。 | 探讨唾液酸相关基因在小脑胶质瘤患者中的表达及其对生存率的影响。 | 小脑胶质瘤患者的基因表达及其与唾液酸代谢的关系。 | 数字病理学 | 小脑胶质瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 文本 | 包含来自不同分子亚组的大量小脑胶质瘤样本 |
| 12903 | 2024-08-05 |
Identification of a Prognostic Model Based on NK Cell-Related Genes in Multiple Myeloma Using Single-Cell and Transcriptomic Data Analysis
2024, Blood and lymphatic cancer : targets and therapy
DOI:10.2147/BLCTT.S461529
PMID:38854627
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研究论文 | 这项研究开发了一个基于NK细胞相关基因的预后模型，以评估多发性骨髓瘤患者的预后。 | 该研究首次利用单细胞和转录组数据分析提出了一种针对多发性骨髓瘤的新的预后模型。 | 样本量和特定临床特征的限制可能影响结果的普遍适用性。 | 研究NK细胞相关基因与多发性骨髓瘤临床因素的关系。 | 研究对象为健康供体和多发性骨髓瘤患者的外周血单核细胞中的NK细胞相关基因。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组数据分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA） | Cox回归模型和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | NA |
| 12904 | 2024-08-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-Dec-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 该研究探讨了DNA甲基化介导的Rbpjk抑制如何保护骨折不愈合患者免受全身性炎症的影响 | 发现Rbpjk是Dnmt3b的直接靶标，并阐明了NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症骨再生中的共同机制 | 未明确说明样本数量和临床相关性 | 研究全身性炎症对骨折愈合的影响及其机制 | 干细胞和前体细胞在骨折不愈合中的反应 | 数字病理学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因组数据 | NA |
| 12905 | 2024-08-05 |
Non-classical circulating monocytes expressing high levels of microsomal prostaglandin E2 synthase-1 tag an aberrant IFN-response in systemic sclerosis
2023-Nov, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103097
PMID:37633117
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研究论文 | 该研究探讨了在系统性硬化症中，外周血单核细胞的组成和活化异变 | 首次揭示了非经典单核细胞在系统性硬化症患者中的过度表达及其异常IFN反应 | 样本数量较小，仅包括8名系统性硬化症患者和8名对照组 | 了解CD14外周血单核细胞在系统性硬化症中的作用 | 系统性硬化症患者与健康对照患者的外周血单核细胞 | 数字病理 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组分析 (scRNA-seq) | NA | 血液样本 | 共16个样本，8名系统性硬化症患者和8名对照组 |
| 12906 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the nervous system at small and large scales with instant partitions
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549051
PMID:37503160
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIPseq在神经科学中进行单细胞RNA测序的应用。 | 引入PIPseq方法，能够在不同规模和神经科学实验中收集和序列化单细胞基因表达变化。 | 样本输入大小和初始资本投入的限制可能会排除一些研究者的应用。 | 研究PIPseq在单细胞RNA测序中的有效性和应用。 | 涉及多种样本和实验，包括小鼠模型和非传统模型物种的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数十个样本（每个样本1,000-100,000个细胞） |
| 12907 | 2024-08-05 |
Microglial sex differences in innate high anxiety and modulatory effects of minocycline
2024-Jul, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.03.035
PMID:38552926
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研究论文 | 研究了微胶质细胞在先天性高焦虑小鼠中性别差异以及美诺环素的调节作用 | 首次揭示了先天高焦虑小鼠中性别在微胶质细胞功能和表达上的显著差异 | 主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 分析微胶质细胞在性别差异影响下对先天高焦虑行为的作用 | 先天高焦虑（HAB）与正常焦虑（NAB）小鼠模型的微胶质细胞 | 神经科学 | 焦虑障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 包含不同性别的先天高焦虑和正常焦虑小鼠 |
| 12908 | 2024-08-04 |
S100A16 is a potential target for reshaping the tumor microenvironment in the hypoxic context of liver cancer
2024-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112076
PMID:38733818
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研究论文 | 本文研究了S100A16在肝癌肿瘤微环境中的作用，尤其是在缺氧条件下的表现 | 首次揭示了S100A16与肝癌缺氧微环境中免疫细胞浸润的显著关联 | 尚需进一步研究以明确S100A16在肝癌不同阶段的具体功能及机制 | 探讨S100A16在肝癌肿瘤微环境中，特别是在缺氧背景下的作用 | 肝癌肿瘤组织及其免疫细胞浸润的特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 武汉队列的样本 |
| 12909 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the role of YAP1 in prefrontal cortex microglia in depression
2024-Jun-07, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-024-03685-1
PMID:38849737
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的致病机制 | 识别YAP1作为抑郁症发展中的关键分子，并提出其作为预测抑郁症发作的生物标志物的潜力 | NA | 探讨YAP1在抑郁症前额叶皮层小胶质细胞中的作用 | 正常和抑郁前额叶皮层组织的小胶质细胞 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据集以及临床样本 |
| 12910 | 2024-08-04 |
The curses of performing differential expression analysis using single-cell data
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596315
PMID:38853843
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞转录组学中进行差异表达分析的挑战与局限性 | 提出了一种新的范式来应对单细胞差异表达分析中的多个问题 | 现有工作流程在归一化、过多零值、供体效应和累积偏差等方面存在显著缺陷 | 研究单细胞转录组学中的差异表达分析的挑战 | 单细胞数据中的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12911 | 2024-08-05 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.595971
PMID:38853821
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研究论文 | 本研究探讨了先锋因子ETV2在血管内皮细胞谱系特化中的作用机制 | 文章创新性地揭示了ETV2在招募转录抑制因子REST以限制替代谱系承诺中的重要作用 | 本研究的局限性包括对ETV2调控机制的进一步验证仍然需要更多实验支持 | 研究ETV2驱动的细胞命运特化机制 | 研究人类诱导性多能干细胞衍生的中胚层祖细胞向内皮细胞的转化 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) | NA | 基因组数据 | 参与研究的样本数量和类型尚未具体列出 |
| 12912 | 2024-08-05 |
Fourteen years of cellular deconvolution: methodology, applications, technical evaluation and outstanding challenges
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae267
PMID:38619038
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综述 | 本文提供了关于53种细胞去卷积方法的全面综述 | 本文通过对53种方法进行基准测试，填补了细胞去卷积方法选择的空白 | 缺乏足够的文档和性能评估，使得生命科学家难以选择合适的方法 | 研究细胞去卷积方法及其在生物医学研究中的应用 | 对53种细胞去卷积方法的技术评估和应用现状进行综述 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA数据 | 63名个体的30种组织中283种细胞类型 |
| 12913 | 2024-08-04 |
PRKDC-Mediated NHEJ May Play a Crucial Role in Aneuploidy of Chromosome 8-Driven Progression of Ovarian Cancer
2024-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094825
PMID:38732044
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研究论文 | 本研究探讨了PRKDC介导的非同源末端连接（NHEJ）在卵巢癌染色体8非整倍体进展中的重要作用 | 该研究揭示了剪接的功能分析和非同源末端连接途径如何影响卵巢癌的后期非整倍体特征，具有重要的创新意义 | 该研究的局限性在于缺乏对其他染色体非整倍体的全面分析 | 研究卵巢癌进展中的非整倍体特征及其分子机制 | 卵巢上皮癌中的非整倍体和拷贝数变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序和荧光原位杂交（FISH） | NA | 基因组数据 | 使用了癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）中的相关数据 |
| 12914 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptional Profile Construction of Rat Pituitary Glands before and after Sexual Maturation and Identification of Novel Marker Spp1 in Gonadotropes
2024-Apr-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094694
PMID:38731915
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组技术构建了大鼠垂体在性成熟前后的转录谱并识别出新的标记物Spp1。 | 首次研究了性成熟前后大鼠垂体组织的单细胞差异，发现106个差异表达基因并确认Spp1作为新标记物。 | 未涉及不同物种或性别在性成熟前后的细胞差异。 | 探讨性成熟对大鼠垂体细胞转录组特征的影响。 | 大鼠垂体细胞，特别是促性腺细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12915 | 2024-08-05 |
The nociceptive activity of peripheral sensory neurons is modulated by the neuronal membrane proteasome
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114058
PMID:38614084
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研究论文 | 本研究调查了周围神经系统中的神经膜蛋白酶体对感觉神经元的痛觉活动的调节作用 | 揭示了神经膜蛋白酶体在小鼠后爪远端神经纤维上的特定抑制及其对机械和疼痛敏感性减少的影响 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的情况 | 探讨周围神经系统中神经膜蛋白酶体的功能及其对疼痛信号的调节 | 研究对象为表达神经膜蛋白酶体的背根神经节（DRG）神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞信号传导数据 | 小鼠模型中使用的特定DRG神经元 |
| 12916 | 2024-08-04 |
Investigating the basis of lineage decisions and developmental trajectories in the dorsal spinal cord through pseudotime analyses
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550380
PMID:37546781
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研究论文 | 本研究探讨了背侧脊髓内部神经元的发展轨迹和谱系决策的基础 | 开发了一种结合单细胞RNA测序与伪时间分析的资源，以识别影响背侧内部神经元不同谱系的基因 | 对背侧内部神经元产生的分子细节仍不完全 | 探索背侧脊髓内部神经元的命运特征和发育时间 | 小鼠胚胎干细胞衍生的背侧内部神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12917 | 2024-08-05 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.24.577060
PMID:38328114
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研究论文 | 本文建立了小鼠视网膜的综合单细胞图谱 | 生成了迄今为止最大的视网膜单细胞RNA测序数据集，并整合了公共数据集以构建小鼠视网膜细胞图谱 | 样本可能局限于特定小鼠品系，可能无法代表全部生物学变异 | 建立小鼠视网膜的统一参考数据集 | C57BL/6J小鼠全视网膜中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 大约190,000个单细胞 |
| 12918 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303914
PMID:38809858
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的F0筛选，识别与肠神经系统建立相关的基因 | 提出了一种新颖且高效的CRISPR筛选方法，专注于肠神经系统的发展 | 该研究未详细探讨所识别基因的功能机制 | 旨在揭示参与肠神经系统建立的基因 | 主要研究对象为斑马鱼中的肠神经嵴细胞及其相关基因 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用斑马鱼作为模型生物，具体样本数量未说明 |
| 12919 | 2024-08-05 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573581
PMID:38234831
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 | 使用高效的CRISPR筛查方法，发现新基因进而推动肠神经系统的研究 | 研究仅限于斑马鱼模型，可能不完全适用于其他脊椎动物 | 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 | 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12920 | 2024-08-04 |
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 该研究显示近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声联合可检测易损的动脉粥样硬化斑块 | 创新点在于首次将近红外自发光声成像与超声成像结合，用于区分稳定与易损斑块 | 研究的局限性在于仅在25名患者的切除斑块上进行的体外研究 | 研究旨在通过成像技术有效管理动脉粥样硬化疾病 | 研究对象为25例患者的切除动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声成像 | NA | 图像 | 25个切除的动脉粥样硬化斑块样本 |