单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 12901 - 12920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12901 | 2024-08-04 |
Tumoral and stromal hMENA isoforms impact tertiary lymphoid structure localization in lung cancer and predict immune checkpoint blockade response in patients with cancer
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105003
PMID:38340557
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞中的hMENA亚型与三次淋巴结构（TLS）的关系及其对肺癌患者结果的影响 | 发现hMENA的选择性剪接是TLS相关肿瘤免疫微环境的重要未探索因素，且hMENA亚型可作为临床结果和ICB响应的潜在生物标志物 | 研究主要基于回顾性观察，可能存在样本选择偏倚 | 本研究旨在了解hMENA亚型如何影响肺癌的三次淋巴结构及其与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 研究对象为非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，免疫组化，空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | N0 NSCLC患者的手术切除组织 |
| 12902 | 2024-08-04 |
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01326-2023
PMID:38212077
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研究论文 | 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 | 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本，可能限制结果的普遍适用性 | 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 | 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 组织样本 | 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 |
| 12903 | 2024-08-04 |
Identifying specific TLS-associated genes as potential biomarkers for predicting prognosis and evaluating the efficacy of immunotherapy in soft tissue sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372692
PMID:38720884
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研究论文 | 本研究探讨了TLS相关基因作为软组织肉瘤预后和免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 本研究系统性地探索了TLS及其相关基因，并建立了与预后和免疫治疗反应相关的风险评分和标志基因 | 研究仍需进一步验证TLS分数和生物标志物在临床中的有效性 | 探讨TLS结构在软组织肉瘤中的作用以及相关生物标志物 | 从TCGA-SARC和GSE212527队列收集的RNAseq和单细胞测序样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序、单细胞测序 | 无 | RNA测序数据 | 256个RNAseq样本和7个单细胞测序样本 |
| 12904 | 2024-08-05 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
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研究论文 | 本文开发了一种新的人脑类器官技术，能够在早期时间点生成自组织的单星状皮层类器官 | 提出了一种基于人诱导多能干细胞的单层培养方法，能够有效生成单星状皮层类器官 | 未提及具体的样本限制和对比分析的局限性 | 研究人脑发育及相关疾病模型 | 人诱导多能干细胞转化为皮层类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 化学诱导 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 |
| 12905 | 2024-08-05 |
Distinct secretomes in p16- and p21- positive senescent cells across tissues
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569858
PMID:38106149
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研究论文 | 本文综合研究了不同组织中p16和p21阳性衰老细胞的独特分泌组 | 揭示了p21和p16转录本在不同细胞类型和组织中的重大异质性，强调了细胞衰老及其分泌表型的多样性 | 部分SASP因子持续贡献于共享的“核心”SASP，仍需在更广泛的生物学背景下进行更细致的研究 | 探讨p21和p16在衰老细胞及其分泌表型中的作用 | 多个小鼠和人类组织的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠和人类组织的数据集 |
| 12906 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12907 | 2024-08-05 |
Systemic Alterations in Type-2 Conventional Dendritic Cells Lead to Impaired Tumor Immunity in Pancreatic Cancer
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0946
PMID:37229629
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌患者的外周血和骨髓中常规树突状细胞（cDC2）的变化 | 揭示了胰腺癌对系统性cDC2发育和功能的影响 | 未充分研究PDAC对系统性cDC1的影响 | 探讨胰腺癌对树突状细胞功能的影响及其对肿瘤免疫的影响 | 胰腺癌患者的外周血和骨髓样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和骨髓样本 | 106个样本 |
| 12908 | 2024-08-05 |
Dedifferentiation and Proliferation of Artery Endothelial Cells Drive Coronary Collateral Development in Mice
2023-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319319
PMID:37345524
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠冠状动脉的再生潜力与其去分化能力的关系 | 首次阐明了成年心脏内皮细胞在冠状动脉侧支发展中的去分化和增殖能力受限的原因 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果可能不适用于人类 | 研究冠状动脉的再生潜力是否由其去分化能力决定 | 小鼠的新生和成年冠状动脉内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的新生和成年内皮细胞 |
| 12909 | 2024-08-04 |
Dissection and Integration of Bursty Transcriptional Dynamics for Complex Systems
2023-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544828
PMID:37398022
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研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过概率主题模型解构并整合单细胞RNA-seq数据中的转录动力学 | 采用概率主题模型来推断与个别过程相关的细胞和基因，以准确估计过程特定的速度 | 缺乏先进的代谢标记技术，可能影响RNA速度估计的准确性 | 研究单细胞RNA-seq数据中转录变化的方向性 | 聚焦于与过程相关的细胞和基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 12910 | 2024-08-05 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究整合了胰岛单细胞和整体RNA测序数据，以识别与糖尿病相关的β细胞亚群。 | 通过整合单细胞和整体胰岛转录组，该研究探索了β细胞异质性，识别出新的亚群和与肥胖相关的遗传通路。 | 本研究的限制在于主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的β细胞功能。 | 研究不同β细胞功能对糖尿病的影响，为疗法开发提供信息。 | 本研究主要针对胰腺β细胞亚群在肥胖小鼠中的基因表达特征。 | 数字病理学 | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了SM/J小鼠的单细胞和整体RNA测序数据 |
| 12911 | 2024-08-05 |
Prognostic subtypes of thyroid cancer was constructed based on single cell and bulk-RNA sequencing data and verified its authenticity
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01027-x
PMID:36933059
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研究论文 | 通过单细胞和大规模RNA测序数据构建了甲状腺癌的预后亚型并验证其真实性 | 创新性地结合了单细胞RNA测序和全局RNA测序数据，构建了有效的预后模型并揭示了甲状腺癌的细胞微环境及肿瘤异质性 | 研究主要基于样本数据，对于临床广泛应用的验证仍需进一步研究 | 研究甲状腺癌的预后因素及其细胞微环境 | 23个甲状腺癌肿瘤样本的细胞类型及其微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | RNA数据 | 23个甲状腺癌肿瘤样本 |
| 12912 | 2024-08-05 |
Neurons burdened by DNA double-strand breaks incite microglia activation through antiviral-like signaling in neurodegeneration
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo4662
PMID:36170369
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研究论文 | 该文章研究了含有DNA双链断裂的神经元如何通过抗病毒信号激活小胶质细胞，从而影响与神经退行性变相关的神经炎症 | 首次揭示了含有双链断裂的神经元在疾病相关神经炎症机制中的新作用 | 研究的模型仅限于CK-p25小鼠，可能限制了结果的普适性 | 探索含有DNA双链断裂的神经元对神经炎症的影响 | CK-p25小鼠模型中的含有DNA双链断裂的神经元 | 数字病理学 | 老年痴呆症 | 单核、整体和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | CK-p25小鼠脑组织 |
| 12913 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of immune cell transcriptome during HIV-1 infection and therapy
2022-09-29, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00523-2
PMID:36175869
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研究论文 | 本研究对HIV-1感染和治疗期间免疫细胞转录组进行了单细胞分析 | 通过单细胞转录组测序，我们识别了HIV-1感染后免疫细胞中关键的分子通路和基因，揭示了HIV-1感染和疗法中的潜在治疗靶点 | 研究主要集中在特定的免疫细胞类型，可能无法全面反映所有免疫细胞的动态变化 | 理解HIV-1感染及其治疗过程中免疫细胞功能的变化 | 慢性未治疗HIV-1个体、接受ART的HIV-1感染者以及HIV-1阴性个体的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个HIV-1感染者和健康供体的免疫细胞样本 |
| 12914 | 2024-08-05 |
Decoding the olfactory map through targeted transcriptomics links murine olfactory receptors to glomeruli
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32267-3
PMID:36050313
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠嗅觉系统中嗅觉受体与嗅球小球之间的映射关系 | 采用了序列切片结合目标捕获富集测序的方法，成功克服了低丰度嗅觉受体表达的问题 | 过去低丰度的嗅觉受体表达限制了高通量映射的可能性 | 理解嗅觉受体如何映射到嗅球小球，以进一步探索嗅觉机制 | 小鼠的嗅觉受体及其在嗅球小球中的分布 | 数字病理学 | NA | 目标捕获富集测序 | NA | NA | 映射了86%的嗅觉受体 |
| 12915 | 2024-08-05 |
Spatial profiling of early primate gastrulation in utero
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04953-1
PMID:35709828
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研究论文 | 这篇文章展示了早期猕猴胚胎在体内的胚胎层化过程 | 首次使用空间转录组学概念揭示早期猕猴胚胎的发育过程 | 研究仅限于猕猴胚胎，可能无法完全推及人类发育 | 探讨早期胚胎发育中细胞多样性和轴向模式形成的分子机制 | 猕猴胚胎及其相关的干细胞模型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 高斯过程回归模型 | 转录组数据 | 猕猴胚胎样本 |
| 12916 | 2024-08-05 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 转录变异通过细胞多样化和蛋白质合成干扰促进了前白血病的发展 | 探讨了转录变异在前白血病进展中的作用，揭示了其通过影响细胞命运转变促进癌症演变的机制 | 主要研究集中在小鼠细胞模型中，尚未在人体细胞中验证 | 研究转录变异如何促进前癌症向癌症的进展 | 小鼠细胞中的转录变异和前白血病的形成 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 12917 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of the human surfactant air-liquid interface culture reveals alveolar type II cell-like transcriptome
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.11.006
PMID:34977273
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研究论文 | 该文章描述了一种基于H441细胞的空气-液体界面培养模型的转录组特征 | 提出了一种新的细胞培养平台SALI模型，能在长时间内维持多种生理特性，并与人类肺泡II型细胞相似 | 未提及研究模型的长期可持续性和实际应用中的局限性 | 旨在为研究和修正肺表面活性蛋白B缺乏症提供可靠的细胞培养模型 | 主要研究H441细胞在空气-液体界面培养下的转录组特征 | 数字病理学 | 间质性肺病 | RNA-seq | SALI培养模型 | 转录组数据 | 未提供具体样本数量 |
| 12918 | 2024-08-05 |
Salivary ZG16B expression loss follows exocrine gland dysfunction related to oral chronic graft-versus-host disease
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103592
PMID:35005541
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研究论文 | 本研究探讨了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)与唾液腺功能障碍相关的唾液ZG16B表达损失 | 发现ZG16B在口腔cGVHD唾液中显著降低，并可能指示特定的cGVHD活动和唾液腺功能障碍 | 本文未使用切口活检，因此没有确诊口腔cGVHD的诊断测试 | 旨在发现口腔cGVHD的生物标志物，以改善早期诊断和治疗 | 研究对象为唾液和人类唾液腺中的蛋白质表达 | 数字病理学 | 慢性移植物抗宿主病 | 液相色谱-串联质谱 | 单细胞RNA测序 | 蛋白质数据 | 569种蛋白质，其中77种在丰度上显著变化 |
| 12919 | 2024-08-05 |
Virally encoded connectivity transgenic overlay RNA sequencing (VECTORseq) defines projection neurons involved in sensorimotor integration
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110131
PMID:34936877
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研究论文 | 本研究开发了一种新的RNA测序方法，用于定义参与感觉运动整合的投射神经元 | 提出了一种简便的、多重的RNA测序方法VECTORseq，能够高通量确定神经元亚型 | 现有的测序方法通量较低，操作复杂且成本高 | 定义不同脑区间连接的投射神经元的生理和行为角色 | 参与感觉运动整合的投射神经元 | 神经科学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据集 | NA |
| 12920 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of human anti-viral immunity shaped by virus, tissue, age, and sex
2021-11-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110071
PMID:34852222
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研究论文 | 本文揭示了病毒、组织、年龄和性别如何影响抗病毒T细胞免疫的维持和功能 | 通过综合分析病毒特异性T细胞，首次揭示了多种因素对抗病毒免疫的异质性影响 | 研究主要基于器官捐献者的样本，可能未能全面代表所有人群 | 探讨影响抗病毒免疫的多种因素及其相互作用 | 针对流感和巨细胞病毒的特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、T细胞受体测序、单细胞转录组学和细胞因子分析 | NA | 血液、淋巴器官和粘膜组织的细胞样本 | 基于器官捐献者的综合样本 |