单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12881 - 12900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12881 | 2024-08-07 |
Ferroptosis biomarkers predict tumor mutation burden's impact on prognosis in HER2-positive breast cancer
2024-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i3.391
PMID:38576597
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研究论文 | 本研究旨在识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物，并探讨其与肿瘤突变负荷对预后的影响。 | 开发了一个包含PROM2、SLC7A11、FANCD2和FH的四基因预测模型，并在TCGA和METABRIC队列中验证了其有效性。 | NA | 识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物。 | HER2阳性乳腺癌患者。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | TCGA和METABRIC数据库中的HER2阳性乳腺癌患者。 |
| 12882 | 2024-08-07 |
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02824-y
PMID:38374347
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研究论文 | 研究评估了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌（uHCC）的疗效和安全性 | 首次在多中心、单臂、II期RENOBATE试验中测试了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合作为uHCC一线治疗的疗效 | 研究为单臂试验，且样本量较小，需要进一步的大规模随机对照试验验证 | 评估瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌的疗效和安全性 | 不可切除的肝细胞癌患者 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液单个核细胞 | 42名患者 |
| 12883 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
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研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12884 | 2024-08-04 |
The significance of single-cell transcriptome analysis in epididymis research
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1357370
PMID:38577504
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组分析在附睾研究中的重要性 | 通过单细胞测序技术揭示了附睾不同区域的细胞组成和特定基因表达模式 | 对附睾的重要性认识仍然有限 | 重新评估附睾对男性生育能力的重要性 | 附睾不同区域的细胞组成及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12885 | 2024-08-07 |
Bulk and single-cell transcriptome sequencing reveal the metabolic feature in chronic rhinosinusitis with polyps
2024-01, Clinical and experimental allergy : journal of the British Society for Allergy and Clinical Immunology
IF:6.3Q1
DOI:10.1111/cea.14396
PMID:37749764
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12886 | 2024-08-07 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
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研究论文 | 研究探讨了间质性肺疾病中肺上皮细胞的衰老标记物p16的定位及其与基底上皮细胞标记物的关系 | 首次在单细胞RNA测序数据集中识别出特定于间质性肺疾病的衰老基底上皮细胞群体，并发现其基因表达与分层上皮中的终末分化细胞显著重叠 | 研究主要基于体外模型和单细胞RNA测序数据，未来需要进一步的功能性研究来验证这些发现 | 揭示间质性肺疾病中衰老细胞的起源和身份，并开发用于人类肺部特定环境下细胞衰老特征的工具 | 肺上皮细胞的衰老标记物及其在间质性肺疾病中的分布和作用 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自对照组、特发性肺纤维化（IPF）和系统性硬化症相关间质性肺疾病（SSc-ILD）的肺组织样本 |
| 12887 | 2024-08-07 |
Transdifferentiation of tumor infiltrating innate lymphoid cells during progression of colorectal cancer
2020-07, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0312-y
PMID:32367039
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了结直肠癌进展过程中肿瘤浸润性先天淋巴细胞（ILCs）的特征和功能变化 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤浸润性ILCs的六个不同集群及其独特的功能转换，包括ILC1s的抑制性功能转换、ILC2s的子集分类及其对肿瘤进展的影响，以及ILC3s向ILCregs的转分化 | NA | 探究肿瘤浸润性先天淋巴细胞在结直肠癌进展中的作用及其潜在的免疫治疗策略 | 结直肠癌中的肿瘤浸润性先天淋巴细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肿瘤浸润性ILCs样本 |
| 12888 | 2024-08-07 |
An integrative approach for building personalized gene regulatory networks for precision medicine
2018-12-19, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0608-4
PMID:30567569
|
研究论文 | 本文提出了一种综合方法，利用单细胞数据和批量数据的敏感性，重建个性化、细胞类型和上下文特定的基因调控网络 | 利用RNA速度、同时研究数十万细胞的能力和单细胞测序成本的下降，构建基因调控网络 | NA | 开发一种综合方法，以实现精准医疗 | 个性化基因调控网络 | 精准医疗 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 数十万细胞 |
| 12889 | 2024-08-07 |
Cellular and molecular characteristics of stromal Lkb1 deficiency-induced gastrointestinal polyposis based on single-cell RNA sequencing
2024-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6259
PMID:38389501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基于成像的谱系追踪，探讨了与Peutz-Jeghers综合征相关的胃肠道息肉的细胞复杂性。 | 本研究揭示了Lkb1相关息肉的异常干细胞样特征，并识别了Spp1-Cd44或Spp1-Itga8/Itgb1轴在息肉中的重要相互作用。 | NA | 研究Lkb1缺乏引起的胃肠道息肉的细胞和分子特征。 | Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型中的胃肠道息肉。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型 |
| 12890 | 2024-08-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究揭示了心脏免疫学的整体情况，并确定了一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞在心肌缺血再灌注损伤中的作用 | 首次识别心肌缺血再灌注损伤中具保护作用的新型 Ym-1hi 中性粒细胞亚型 | 未提供人类样本的详细分析，主要集中在小鼠实验上 | 研究心肌缺血再灌注损伤中中性粒细胞的亚型及其动态变化 | 小鼠心脏中隔离的CD45阳性细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 在六个时间点对小鼠心脏进行取样，具体样本量未明确说明 |
| 12891 | 2024-08-04 |
Macrophage diversity in human cancers: New insight provided by single-cell resolution and spatial context
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28332
PMID:38571605
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研究论文 | 本文总结了最近研究中使用先进技术揭示的人类癌症中肿瘤相关巨噬细胞的新功能亚群 | 该研究强调了特定肿瘤相关巨噬细胞亚群的转录组特征及其临床意义，并利用空间转录组学技术揭示了巨噬细胞与其他细胞类型之间的空间相互作用 | 对特定肿瘤类型中肿瘤相关巨噬细胞状态的知识仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中巨噬细胞表型的多样性及其在不同人类癌症中的功能 | 研究肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞及其特定亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个不同类型人类癌症的巨噬细胞 |
| 12892 | 2024-08-07 |
Identification and validation of mutual hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis and rheumatoid arthritis-associated usual interstitial pneumonia
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28088
PMID:38571583
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析探索特发性肺纤维化（IPF）和类风湿关节炎相关寻常间质性肺炎（RA-UIP）中的共同枢纽基因和通路 | 筛选出四个共同枢纽基因（THBS2, TIMP1, POSTN, 和 CD19），并验证这些基因在IPF和RA-UIP中的潜在生物标志物作用 | NA | 探索IPF和RA-UIP中的共同枢纽基因和通路 | IPF和RA-UIP患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE199152数据集中的IPF和RA-UIP患者肺组织样本 |
| 12893 | 2024-08-04 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2024-Apr-05, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
|
研究论文 | 本研究描述了人类不育单细胞睾丸图谱（HISTA）的生成和使用，这是一个通过scRNA-Seq分析理解人类精子生成的交互式Web工具 | HISTA整合了来自不同供体和不育状态的scRNA-Seq数据，并提供了交互式工具以支持数据探索和基因表达分析 | HISTA依赖于现有数据集的质量和多样性，可能无法涵盖所有人类睾丸的转录组特征 | 研究人类睾丸的高维转录组特征，以帮助理解精子生成 | 12名捐赠者的scRNA-Seq数据，包括健康成人对照、青少年及多个不育案例 | 数字病理学 | 不育 | scRNA-Seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 12名捐赠者的样本 |
| 12894 | 2024-08-04 |
Virus-reactive T cells expanded in aplastic anemia eliminate hematopoietic progenitor cells by molecular mimicry
2024-Apr-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023142
PMID:38277625
|
研究论文 | 本研究探讨了反应性T细胞在再生障碍性贫血中的作用。 | 新发现的病毒相关T细胞通过分子模仿机制消除造血前体细胞的作用。 | 尚未明确T细胞克隆的具体贡献及其抗原特异性。 | 研究再生障碍性贫血患者中T细胞的分化状态及其对造血前体细胞的影响。 | 对15名获得性再生障碍性贫血患者的T细胞克隆进行分析。 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞测序和免疫表型分析 | NA | 细胞 | 15名获得性再生障碍性贫血患者 |
| 12895 | 2024-08-04 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | CITEViz是一个交互式R-Shiny应用程序，用于在CITE-Seq数据中高效分类细胞群体 | CITEViz通过简化CITE-Seq数据的流式细胞术门控工作流程，实现了对细胞群体的标准化分类 | 目前CITEViz的功能可能不覆盖所有类型的多组学数据处理 | 开发一个工具以优化和标准化CITE-Seq数据的门控过程 | 外周血单核细胞的CITE-Seq数据集及主要血细胞群体 | 数字病理学 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞测序数据 | 涉及外周血单核细胞的CITE-Seq数据集 |
| 12896 | 2024-08-07 |
Single cell analysis reveals the roles and regulatory mechanisms of type-I interferons in Parkinson's disease
2024-Apr-02, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01590-1
PMID:38566100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了帕金森病中I型干扰素的作用及其调控机制 | 首次详细描述了不同细胞类型中I型干扰素的具体特征及其在帕金森病中的作用机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需更多实验验证 | 揭示I型干扰素在帕金森病中的作用及其调控机制 | 帕金森病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 39,024个单细胞RNA测序结果，包括5名帕金森病患者和6名健康对照 |
| 12897 | 2024-08-04 |
Dissecting the spatiotemporal diversity of adult neural stem cells
2024-Apr, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00022-z
PMID:38365956
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研究论文 | 本研究探讨了成体神经干细胞的时空多样性 | 该研究结合单细胞转录组学和在体RNA代谢标记技术，揭示了成体神经干细胞的组织原则 | 本研究主要集中于斑马鱼大脑，限制了其对其他类型动物的适用性 | 研究成体神经干细胞的功能状态及其在空间和时间上的调节 | 成体斑马鱼大脑中的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、在体RNA代谢标记 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼大脑不同区域的单细胞样本 |
| 12898 | 2024-08-04 |
Deciphering cutaneous melanoma prognosis through LDL metabolism: Single-cell transcriptomics analysis via 101 machine learning algorithms
2024-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15070
PMID:38570935
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研究论文 | 本文探讨了低密度脂蛋白（LDL）代谢与皮肤黑色素瘤之间的关系 | 结合机器学习算法构建的LDL相关特征，可以用于评估皮肤黑色素瘤患者的预后和免疫状态 | 未提及具体的临床验证和应用，可能限制了结果的广泛适用性 | 调查低密度脂蛋白在皮肤黑色素瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 分析与低密度脂蛋白代谢相关的基因及其在皮肤黑色素瘤细胞中的表现 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序、bulk-RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 使用了多个数据集，包括GSE215120，TCGA，GSE19234，GSE22153和GSE65904 |
| 12899 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of rosmarinic acid on diabetic nephropathy-induced kidney injury by modulating oxidative stress and inflammation
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.01.003
PMID:38572101
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研究论文 | 本研究探讨了迷迭香酸对糖尿病肾病诱导的肾损伤的改善作用 | 揭示了单细胞层次上迷迭香酸对肾损伤的多样性反应及其机制 | 研究可能未涵盖所有与糖尿病肾病相关的细胞反应 | 探讨迷迭香酸在糖尿病肾病中改善肾脏损伤的作用 | 糖尿病肾病诱导的肾损伤及迷迭香酸的治疗效果 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12900 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染后的免疫反应 | 揭示了灭活疫苗与自然感染在免疫细胞比例和转录组方面的细微差异，以及细胞间通讯模式的独特变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 理解COVID-19免疫学中灭活疫苗与自然感染的免疫反应 | 灭活SARS-CoV-2疫苗接种者与COVID-19患者的PBMC样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者 |