单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12881 2024-08-04
Unraveling the hidden complexity: Exploring dental tissues through single-cell transcriptional profiling
2024-Dec, Regenerative therapy IF:3.4Q2
综述 本研究探讨了使用单细胞转录组技术对牙齿及周围组织的细胞组成进行分析 本文创新地采用单细胞转录组技术,揭示了哺乳动物牙齿和牙周组织的细胞复杂性 本综述主要集中在现有的单细胞转录组研究上,可能未涵盖所有相关研究 揭示牙齿生物学的复杂性以及相关细胞的组成和功能 对小鼠及人类牙齿和牙周组织进行单细胞转录组分析 数字病理学 NA 单细胞转录组 NA 细胞 涉及小鼠和人类的健康及龋齿牙齿的单细胞样本
12882 2024-08-07
The Impact of FBN1-α5β1 Axis in Fibro/Adipogenic Progenitor Cells (FAPCD9-) on Intramuscular Fat Content in Pigs
2024-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序分析了广东小耳花猪(高IMF)和约克夏猪(低IMF)的背最长肌,发现高IMF猪具有更多的纤维/脂肪生成祖细胞(FAPs),而低IMF猪则表现出更高的FBN1-整合素α5β1轴表达,抑制了脂肪生成分化。 本研究首次揭示了FBN1-α5β1轴在纤维/脂肪生成祖细胞中的作用,及其对猪肌肉内脂肪含量的影响。 NA 探讨纤维/脂肪生成祖细胞及其相关分子轴在猪肌肉内脂肪含量中的作用。 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌。 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 广东小耳花猪和约克夏猪的背最长肌样本
12883 2024-08-04
Single-cell multiomics reveals the interplay of clonal evolution and cellular plasticity in hepatoblastoma
2024-Apr-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞多组学策略揭示了肝母细胞瘤中克隆演变与细胞可塑性之间的相互作用 通过单细胞测序,研究了HB细胞状态的连续性及其差异化极性,并揭示了基因调控网络与转录因子激活序列 具体的机制尚不完全明了,且对临床结果的影响仍需进一步研究 解析肝母细胞瘤细胞可塑性的分子决定因素 肝母细胞瘤中的不同基因亚克隆及其细胞状态变化 数字病理学 肝癌 单细胞多组学 NA 基因组数据,空间转录组数据 NA
12884 2024-08-07
Drug repositioning for immunotherapy in breast cancer using single-cell analysis
2024-Apr-08, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
meta-analysis 本研究利用单细胞RNA测序数据和已知治疗性肽,调查了恶性与正常人类乳腺上皮细胞中这些肽的失调情况,并通过ATAC-seq在染色质水平上验证了这些发现,同时评估了不同BC细胞系中的蛋白质水平。此外,采用内部药物再定位方法,识别可能对BC患者无复发生存期产生积极影响的潜在药物。 本研究通过整合药物再定位流程与单细胞分析,提出了一种免疫治疗乳腺癌的新方法,并确定了潜在的药物和药物靶点,以强化免疫系统对抗乳腺癌。 NA 研究旨在通过免疫调节肽的失调作为免疫治疗策略,增强乳腺癌的免疫反应。 研究对象包括恶性与正常人类乳腺上皮细胞,以及不同乳腺癌细胞系中的蛋白质水平。 digital pathology breast cancer single-cell RNA sequencing, ATAC-seq NA RNA sequencing data, chromatin data, protein levels 具体样本数量未在摘要中提及
12885 2024-08-07
Differentiation of type 17 MAIT cells in circulation contributes to the severity of sepsis
2024-Apr-08, The American journal of pathology
研究论文 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在脓毒症严重程度中的作用 首次发现循环中的MAIT17细胞在脓毒症患者中比例较高,且与疾病严重程度相关 NA 揭示MAIT17细胞在脓毒症中的新作用及其分子机制 MAIT17细胞在脓毒症中的作用及相关的信号通路 免疫学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
12886 2024-08-04
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究报告了抑制ATR可以通过干扰细胞骨架网络和整合素内吞作用来减少胶质母细胞瘤的侵袭 首次提出ATR在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的新角色,并且聚焦于ATR的药物靶向对临床的潜在益处 未明确描述临床应用的具体措施和时间框架 探讨ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的影响 胶质母细胞瘤细胞的运动和侵袭性 数字病理 胶质母细胞瘤 时间延迟显微镜、超分辨率成像和体内成像 正交胶质母细胞瘤模型 图像 具体样本量未提供,使用胶质母细胞瘤肿瘤标本进行研究
12887 2024-08-04
CD200+ fibroblasts form a pro-resolving mesenchymal network in arthritis
2024-Apr, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 这篇文章探讨了在关节炎中成纤维细胞的表型变化及其在炎症解决过程中的作用。 文章首次使用正电子发射断层扫描技术检测成纤维细胞激活蛋白,并展示了成纤维细胞在炎症解决过程中的动态分子调控。 这项研究主要集中在实验性关节炎模型中,可能不完全适用于人类的所有疾病状态。 研究成纤维细胞在炎症解决过程中的表型变化及其功能。 研究对象为在实验性关节炎中活化的成纤维细胞。 数字病理学 关节炎 正电子发射断层扫描(PET),单细胞RNA测序 NA 生物样本(活检) 实验性关节炎的小鼠模型和人类关节活检样本
12888 2024-08-04
Tracking the immune response profiles elicited by the BNT162b2 vaccine in COVID-19 unexperienced and experienced individuals
2024-04, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本文对BNT162b2疫苗在COVID-19经历和未经历感染个体中的免疫反应进行了纵向分析 研究揭示了疫苗接种后免疫反应的动态变化,在经历自然感染与否的个体中有不同的克隆扩展模式。 研究可能未考虑其他因素如个体遗传背景和免疫系统的差异对免疫反应的影响 旨在分析BNT162b2疫苗在不同感染经历个体中的免疫反应 针对曾经历和未经历SARS-CoV-2感染的个体进行了免疫学分析 数字病理学 NA CITE-seq, LIBRA-seq, VDJ-seq NA 单细胞转录组数据 NA
12889 2024-08-07
Cannabidiol protects against acute aortic dissection by inhibiting macrophage infiltration and PMAIP1-induced vascular smooth muscle cell apoptosis
2024-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 研究探讨了大麻二酚(CBD)对急性主动脉夹层(AAD)的保护作用及其机制 首次揭示了CBD通过抑制巨噬细胞浸润和PMAIP1诱导的血管平滑肌细胞凋亡来减轻AAD的进展 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 探索CBD作为AAD治疗药物的潜在效果及其作用机制 急性主动脉夹层、巨噬细胞、血管平滑肌细胞 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA RNA 包括人类和鼠类的AAD样本
12890 2024-08-04
[Exploring the Role of PCDHGB4 in the Occurrence of Lung Squamous Cell Carcinoma Based on Bioinformatics Analysis]
2024-Mar-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
研究论文 本研究探讨了PCDHGB4在肺鳞癌发生中的作用及其潜在的预后价值 首次系统分析了PCDHGB4在肺鳞癌中的表达特征及其与肿瘤免疫和预后的关联 目前数据主要来源于单一数据库,可能存在样本选择偏倚 研究PCDHGB4在肺鳞癌发展中的作用及其预后潜力 主要研究对象为肺鳞癌患者中PCDHGB4的表达和相关临床特征 数字病理学 肺癌 生物信息学分析 NA 基因表达数据 通过TCGA等数据库分析了大量肺鳞癌样本
12891 2024-08-07
Advanced patient-specific microglia cell models for pre-clinical studies in Alzheimer's disease
2024-Feb-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究开发了一种基于Matrigel的三维单层培养和与神经胶质细胞共培养的单核细胞衍生的微胶质样细胞(MDMi)模型,用于阿尔茨海默病(AD)的临床前研究 本研究首次开发了一种生理相关且具有AD患者特异性的三维微胶质细胞模型,该模型能够更好地模拟人微胶质的形态和功能 本研究仅在体外模型中进行了实验,尚未在动物模型或临床试验中验证其有效性 开发一种新型的、生理相关的AD患者特异性微胶质细胞模型,以改进AD个性化药物开发策略 单核细胞衍生的微胶质样细胞(MDMi)及其在AD中的应用 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNAseq) 3D细胞培养模型 细胞 十六名AD患者及匹配的健康对照
12892 2024-08-04
Comprehending the cuproptosis and cancer-immunity cycle network: delving into the immune landscape and its predictive role in breast cancer immunotherapy responses and clinical endpoints
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探索了cuproptosis与乳腺癌免疫反应和预后结果之间的关系 提出了基于cuproptosis-CICs的影响因素,并建立了预测模型以个性化乳腺癌治疗 缺乏临床试验结果来进一步验证模型的实际应用效果 探讨cuproptosis-CIC网络对乳腺癌患者免疫反应和预后结果的影响 使用TCGA、GEO及ICGC数据对乳腺癌患者进行研究 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, LASSO-Cox模型 Cox比例风险回归模型 基因组数据 研究中使用了TCGA、GEO和ICGC数据,样本数量NA
12893 2024-08-04
Molecular mechanisms of pancreatic cancer liver metastasis: the role of PAK2
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究深入探讨了胰腺癌肝转移的分子机制,强调了PAK2的作用。 发现PAK2作为胰腺癌肝转移的关键基因,并揭示其通过激活TGF-β信号通路促进转移。 本研究的局限性在于主要依赖于生物信息学分析,缺乏大规模临床验证。 研究胰腺癌肝转移的机制,以为未来治疗方法和药物的发展提供科学依据。 研究对象为胰腺癌细胞及其肝转移相关基因。 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序, 批量数据分析, 药物敏感性分析 无特定模型 基因表达数据 多个数据集(GSE155698, GSE154778, GSE71729, GSE19279, TCGA-PAAD)
12894 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics and heterogeneity of lymph node immune cells during acute and chronic viral infections
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序、scTCR-seq和scBCR-seq技术,探讨了急性与慢性病毒感染下淋巴结CD45+免疫细胞的动态变化和异质性 首次在单细胞水平上全面比较了急性与慢性病毒感染下淋巴组织免疫细胞的差异 NA 探索急性与慢性病毒感染下免疫反应的景观 淋巴结CD45+免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq), scTCR-seq, scBCR-seq NA 基因表达数据 使用小鼠模型进行急性(LCMV Armstrong)和慢性(LCMV clone 13)病毒感染的研究
12895 2024-08-07
Comparison of the single-cell and single-nucleus hepatic myeloid landscape within decompensated cirrhosis patients
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)技术,对比了失代偿期肝硬化患者经颈静脉肝穿刺(TJB)获取的肝组织中的肝髓系细胞景观。 首次通过单核转录组测序技术,有效克服了临床标本采集的复杂性,并能够充分分析所有主要的肝细胞类型,包括所有髓系细胞亚群。 scRNA-seq平台未能恢复足够的枯否细胞数量,且其他单核细胞/巨噬细胞表现出应激相关参数的高表达。 旨在通过比较单细胞和单核RNA测序技术,全面理解失代偿期肝硬化患者的肝髓系细胞景观。 失代偿期肝硬化患者的肝组织中的髓系细胞。 数字病理学 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA 3名失代偿期肝硬化患者的肝组织样本
12896 2024-08-07
Prognostic stratification of sepsis through DNA damage response based RiskScore system: insights from single-cell RNA-sequencing and transcriptomic profiling
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过基于DNA损伤反应(DDR)的风险评分系统,利用单细胞RNA测序和转录组分析,对脓毒症进行预后分层 开发了一种基于DNA损伤反应的新型风险评分系统,用于提高脓毒症预后预测的准确性,并可能指导更有效的治疗方案的创建 NA 旨在通过基于DNA损伤反应的风险评分系统,提高脓毒症预后预测的准确性,并探索个性化治疗策略 脓毒症患者的预后分层和治疗策略 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) LASSO回归 转录组数据 涉及多种细胞亚型,包括单核细胞、巨核细胞、CD4+ T细胞和中性粒细胞
12897 2024-08-07
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码标记和混合多个愈合伤口样本的单细胞RNA测序协议 提出了使用寡核苷酸条形码技术降低单细胞RNA测序成本的方法 目前仅适用于小鼠,但可扩展到其他物种如大鼠、猪和人类 开发一种成本效益高的方法来研究复杂组织的单细胞RNA测序 愈合伤口组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 多个样本
12898 2024-08-07
Editorial: Spatial single-cell sequencing in studying solid cancer development
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12899 2024-08-07
Inter- and trans-generational impacts of environmental exposures on the germline resolved at the single-cell level
2024-Jun, Current opinion in toxicology IF:6.1Q1
research paper 本文探讨了单细胞技术在解析环境暴露对生殖细胞跨代影响的现状与应用 利用单细胞RNA测序、ATAC测序和多组学方法,深入理解毒物对生殖细胞功能的影响及其在不同组织和细胞类型中的差异响应 NA 探讨单细胞技术在生殖毒理学研究中的应用,并展示其在不同模型生物和环境暴露中的价值 生殖细胞及其对环境暴露的响应 NA NA 单细胞RNA测序、ATAC测序、多组学 NA 单细胞数据 NA
12900 2024-08-04
Ablation of Brg1 in fibroblast/myofibroblast lineages attenuates renal fibrosis in mice with diabetic nephropathy
2024-May-01, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究探讨了Brg1在糖尿病肾病小鼠中对肾纤维化的影响 提供了Brg1与成纤维细胞-肌成纤维细胞转化之间的新遗传联系 尚未明确与Brg1相关的所有表观遗传机制 探讨Brg1在糖尿病肾病相关肾纤维化中的作用 C57B6/j小鼠中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 数字病理学 糖尿病肾病 定量PCR和西方印迹 NA 基因表达数据 C57B6/j小鼠的样本数量未明确提及
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